seq1 = pF1KB3319.tfa, 2418 bp
seq2 = pF1KB3319/gi568815586r_112999932.tfa (gi568815586r:112999932_113235462), 235531 bp

>pF1KB3319 2418
>gi568815586r:112999932_113235462 (Chr12)

(complement)

1-65  (100001-100065)   100% ->
66-122  (104522-104578)   100% ->
123-236  (107285-107398)   100% ->
237-298  (107590-107651)   100% ->
299-428  (113825-113954)   100% ->
429-510  (116020-116101)   100% ->
511-642  (116204-116335)   100% ->
643-731  (118302-118390)   100% ->
732-849  (119412-119529)   100% ->
850-1003  (119675-119828)   99% ->
1004-1068  (120199-120263)   100% ->
1069-1181  (120551-120663)   100% ->
1182-1374  (123185-123377)   100% ->
1375-1515  (127238-127378)   100% ->
1516-1660  (128222-128366)   100% ->
1661-1833  (129577-129749)   100% ->
1834-1971  (131165-131302)   100% ->
1972-2107  (131382-131517)   100% ->
2108-2228  (133454-133574)   100% ->
2229-2281  (134783-134835)   100% ->
2282-2418  (135395-135531)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCAAGAGCAGCTCCCTGAATGTTCGCGTGGTGGAGGGCCGCGCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCAAGAGCAGCTCCCTGAATGTTCGCGTGGTGGAGGGCCGCGCGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCCTGCCAAGGACGT         GTCTGGGAGCAGCGACCCCTACTGCC
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCCTGCCAAGGACGTGTG...CAGGTCTGGGAGCAGCGACCCCTACTGCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TAGTGAAAGTGGACGACGAGGTGGTGGCCAG         GACAGCTACT
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 104548 TAGTGAAAGTGGACGACGAGGTGGTGGCCAGGTG...CAGGACAGCTACT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 GTCTGGAGGAGCCTGGGCCCCTTCTGGGGGGAGGAGTACACGGTGCACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107295 GTCTGGAGGAGCCTGGGCCCCTTCTGGGGGGAGGAGTACACGGTGCACCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GCCTCTGGATTTCCACCAGCTGGCCTTCTACGTGCTGGATGAGGACACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107345 GCCTCTGGATTTCCACCAGCTGGCCTTCTACGTGCTGGATGAGGACACTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TCGG         GCACGACGACATCATCGGCAAGATCTCGCTGAGCAGG
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107395 TCGGGTT...CAGGCACGACGACATCATCGGCAAGATCTCGCTGAGCAGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 GAGGCGATTACAGCCGACCCCCGAG         GGATTGACAGCTGGAT
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 107627 GAGGCGATTACAGCCGACCCCCGAGGTG...CAGGGATTGACAGCTGGAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    315 TAACTTGAGCCGAGTGGACCCAGATGCAGAAGTGCAGGGTGAGATCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113841 TAACTTGAGCCGAGTGGACCCAGATGCAGAAGTGCAGGGTGAGATCTGCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 TGTCAGTGCAGATGCTGGAGGATGGGCAGGGCCGCTGCCTTCGCTGCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113891 TGTCAGTGCAGATGCTGGAGGATGGGCAGGGCCGCTGCCTTCGCTGCCAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 GTGCTTCAGGCCAG         GGACCTGGCTCCCAGAGACATCTCTGG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 113941 GTGCTTCAGGCCAGGTA...CAGGGACCTGGCTCCCAGAGACATCTCTGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 CACATCTGACCCATTTGCACGTGTGTTTTGGGGCAGCCAGAGCTTGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116047 CACATCTGACCCATTTGCACGTGTGTTTTGGGGCAGCCAGAGCTTGGAGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 CCTCA         ACCATCAAGAAGACTCGCTTCCCGCACTGGGATGAA
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116097 CCTCAGTG...CAGACCATCAAGAAGACTCGCTTCCCGCACTGGGATGAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    547 GTGCTGGAGCTGCGGGAGATGCCAGGTGCCCCGTCCCCACTGCGGGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116240 GTGCTGGAGCTGCGGGAGATGCCAGGTGCCCCGTCCCCACTGCGGGTGGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 GCTCTGGGACTGGGACATGGTGGGCAAGAATGACTTCTTGGGCATG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 116290 GCTCTGGGACTGGGACATGGTGGGCAAGAATGACTTCTTGGGCATGGTG.

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    643      GTGGAGTTCTCTCCAAAGACCCTCCAGCAGAAGCCACCTAAAGGC
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116340 ..AAGGTGGAGTTCTCTCCAAAGACCCTCCAGCAGAAGCCACCTAAAGGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    688 TGGTTCCGCCTCCTGCCCTTTCCCAGAGCCGAGGAGGATTCTGG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 118347 TGGTTCCGCCTCCTGCCCTTTCCCAGAGCCGAGGAGGATTCTGGGTA...

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    732    GGGGAACCTGGGTGCCCTGCGAGTGAAGGTACGCCTGATTGAGGACC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119409 CAGGGGGAACCTGGGTGCCCTGCGAGTGAAGGTACGCCTGATTGAGGACC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    779 GCGTCCTGCCCTCCCAGTGCTACCAGCCTCTCATGGAGCTGCTCATGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119459 GCGTCCTGCCCTCCCAGTGCTACCAGCCTCTCATGGAGCTGCTCATGGAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 TCTGTGCAGGGGCCAGCAGAG         GAGGACACTGCTAGCCCCTT
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 119509 TCTGTGCAGGGGCCAGCAGAGGTG...CAGGAGGACACTGCTAGCCCCTT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    870 GGCTTTGCTGGAAGAGCTGACCTTGGGGGACTGCCGCCAGGACCTTGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119695 GGCTTTGCTGGAAGAGCTGACCTTGGGGGACTGCCGCCAGGACCTTGCCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    920 CCAAGCTGGTGAAACTCTTTCTTGGCCGGGGACTGGCTGGGCACTTTCTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
 119745 CCAAGCTGGTGAAACTCTTTCTTGGCCGGGGACTGGCTGGGCGCTTTCTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 GACTATCTCACCCGGCGTGAGGTGGCTCGGACCA         TGGACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 119795 GACTATCTCACCCGGCGTGAGGTGGCTCGGACCAGTG...CAGTGGACCC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1011 CAACACCCTCTTCCGTTCTAACTCCCTGGCATCCAAGTCGATGGAACAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120206 CAACACCCTCTTCCGTTCTAACTCCCTGGCATCCAAGTCGATGGAACAGT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1061 TTATGAAG         CTCGTGGGCATGCCCTACCTGCACGAGGTCCTG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 120256 TTATGAAGGTG...CAGCTCGTGGGCATGCCCTACCTGCACGAGGTCCTG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1102 AAGCCTGTGATTAGCCGTGTCTTTGAGGAGAAGAAGTACATGGAGCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120584 AAGCCTGTGATTAGCCGTGTCTTTGAGGAGAAGAAGTACATGGAGCTGGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1152 TCCCTGCAAGATGGACCTGGGCCGCACCCG         GAGGATCTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 120634 TCCCTGCAAGATGGACCTGGGCCGCACCCGGTG...CAGGAGGATCTCCT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1193 TCAAAGGCGCACTCTCGGAGGAGCAGATGCGGGAGACCAGCCTGGGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123196 TCAAAGGCGCACTCTCGGAGGAGCAGATGCGGGAGACCAGCCTGGGGCTG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1243 CTGACGGGCTACCTGGGGCCCATCGTGGACGCCATCGTGGGCTCCGTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123246 CTGACGGGCTACCTGGGGCCCATCGTGGACGCCATCGTGGGCTCCGTGGG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1293 GCGCTGCCCGCCCGCCATGCGCCTCGCCTTCAAGCAGCTGCACCGGCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123296 GCGCTGCCCGCCCGCCATGCGCCTCGCCTTCAAGCAGCTGCACCGGCGAG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1343 TGGAGGAGCGCTTCCCCCAGGCCGAGCACCAG         CAGGATGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 123346 TGGAGGAGCGCTTCCCCCAGGCCGAGCACCAGGTG...CAGCAGGATGTG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1384 AAGTACCTGGCCATCAGTGGATTTCTCTTCTTGCGATTCTTCGCACCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127247 AAGTACCTGGCCATCAGTGGATTTCTCTTCTTGCGATTCTTCGCACCTGC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1434 CATCCTTACCCCAAAGCTGTTTGACCTTCGGGACCAACACGCGGACCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127297 CATCCTTACCCCAAAGCTGTTTGACCTTCGGGACCAACACGCGGACCCCC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1484 AGACTAGCCGCTCACTGCTGTTGCTTGCCAAG         GCTGTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 127347 AGACTAGCCGCTCACTGCTGTTGCTTGCCAAGGTG...CAGGCTGTGCAG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1525 AGCATTGGAAACCTGGGCCAGCAGCTGGGCCAAGGCAAGGAACTGTGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128231 AGCATTGGAAACCTGGGCCAGCAGCTGGGCCAAGGCAAGGAACTGTGGAT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1575 GGCCCCCCTGCACCCCTTCCTGCTGCAGTGTGTCTCACGTGTGAGAGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128281 GGCCCCCCTGCACCCCTTCCTGCTGCAGTGTGTCTCACGTGTGAGAGACT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1625 TCCTGGACCGGCTGGTGGATGTGGATGGGGATGAAG         AAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 128331 TCCTGGACCGGCTGGTGGATGTGGATGGGGATGAAGGTG...TAGAAGCT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1666 GGTGTCCCAGCCAGGGCCCTGTTCCCGCCCTCGGCCATTGTTCGAGAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129582 GGTGTCCCAGCCAGGGCCCTGTTCCCGCCCTCGGCCATTGTTCGAGAAGG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1716 CTATCTGCTGAAGCGCAAGGAGGAGCCTGCCGGCCTGGCCACGCGCTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129632 CTATCTGCTGAAGCGCAAGGAGGAGCCTGCCGGCCTGGCCACGCGCTTTG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1766 CCTTCAAGAAGCGCTACGTCTGGCTCAGCGGGGAGACCCTCTCCTTCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129682 CCTTCAAGAAGCGCTACGTCTGGCTCAGCGGGGAGACCCTCTCCTTCTCC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1816 AAGAGTCCTGAGTGGCAG         ATGTGTCACTCCATCCCCGTGTC
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 129732 AAGAGTCCTGAGTGGCAGGTG...CAGATGTGTCACTCCATCCCCGTGTC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1857 TCACATCCGCGCCGTGGAGCGCGTAGACGAGGGCGCCTTCCAACTGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131188 TCACATCCGCGCCGTGGAGCGCGTAGACGAGGGCGCCTTCCAACTGCCCC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1907 ACGTGATGCAGGTGGTGACGCAGGACGGCACGGGGGCGCTGCACACCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131238 ACGTGATGCAGGTGGTGACGCAGGACGGCACGGGGGCGCTGCACACCACC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1957 TACCTCCAGTGCAAG         AATGTGAATGAGCTCAACCAGTGGCT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 131288 TACCTCCAGTGCAAGGTG...CAGAATGTGAATGAGCTCAACCAGTGGCT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1998 CTCGGCCTTGCGCAAGGCCAGCGCCCCCAACCCGAACAAGCTGGCCGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131408 CTCGGCCTTGCGCAAGGCCAGCGCCCCCAACCCGAACAAGCTGGCCGCCT

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2048 GCCACCCCGGTGCCTTCCGCAGCGCGCGCTGGACCTGCTGCCTCCAGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131458 GCCACCCCGGTGCCTTCCGCAGCGCGCGCTGGACCTGCTGCCTCCAGGCT

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2098 GAGCGCTCAG         CCGCCGGCTGCAGCCGTACACACTCAGCTGT
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 131508 GAGCGCTCAGGTG...CAGCCGCCGGCTGCAGCCGTACACACTCAGCTGT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2139 CACCCTGGGGGACTGGAGTGACCCACTGGATCCTGATGCTGAGGCCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133485 CACCCTGGGGGACTGGAGTGACCCACTGGATCCTGATGCTGAGGCCCAGA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2189 CAGTGTATCGGCAGCTGCTCCTGGGGCGGGACCAGCTCAG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 133535 CAGTGTATCGGCAGCTGCTCCTGGGGCGGGACCAGCTCAGGTG...CAGG

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2230 CTGAAATTACTGGAGGATTCTAACATGGATACAACTCTGGAGGCAGACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134784 CTGAAATTACTGGAGGATTCTAACATGGATACAACTCTGGAGGCAGACAC

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2280 AG         GGGCCTGTCCTGAGGTCCTGGCCCGGCAAAGAGCAGCAA
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134834 AGGTA...TAGGGGCCTGTCCTGAGGTCCTGGCCCGGCAAAGAGCAGCAA

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2321 CTGCCCGCCTGCTGGAGGTGCTCGCAGACCTGGATCGTGCCCACGAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135434 CTGCCCGCCTGCTGGAGGTGCTCGCAGACCTGGATCGTGCCCACGAGGAG

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   2371 TTCCAGCAGCAGGAGCGAGGGAAGGCGGCCCTGGGCCCCCTTGGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135484 TTCCAGCAGCAGGAGCGAGGGAAGGCGGCCCTGGGCCCCCTTGGCCCC