seq1 = pF1KB3253.tfa, 1863 bp
seq2 = pF1KB3253/gi568815585r_25149235.tfa (gi568815585r:25149235_25374189), 224955 bp

>pF1KB3253 1863
>gi568815585r:25149235_25374189 (Chr13)

(complement)

1-24  (86943-86966)   100% ->
25-141  (100003-100119)   100% ->
142-304  (106249-106411)   100% ->
305-462  (107904-108061)   100% ->
463-591  (108243-108371)   100% ->
592-726  (112388-112522)   100% ->
727-859  (115498-115630)   100% ->
860-969  (116345-116454)   99% ->
970-1095  (116869-116994)   100% ->
1096-1145  (119756-119805)   100% ->
1146-1346  (120226-120426)   100% ->
1347-1478  (122206-122337)   100% ->
1479-1605  (122415-122541)   99% ->
1606-1863  (124698-124955)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGCATATCCGGACGACCAAG         GTCGAACAAGTAAAATT
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
  86943 ATGGAGCATATCCGGACGACCAAGGTA...TAGGTCGAACAAGTAAAATT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 ACTTGACCGATTCAGTACCAGCAACAAGTCATTAACAGGAACACTGTATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100020 ACTTGACCGATTCAGTACCAGCAACAAGTCATTAACAGGAACACTGTATC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TTACGGCTACACATCTATTATTTATCGACTCTCATCAAAAAGAAACCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100070 TTACGGCTACACATCTATTATTTATCGACTCTCATCAAAAAGAAACCTGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142          ATATTACACCACCATATTGCCTCAGTAGAGAAACTTGCTTT
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100120 GTA...TAGATATTACACCACCATATTGCCTCAGTAGAGAAACTTGCTTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GACTACTTCTGGATGCCCCCTTGTGATACAGTGCAAGAACTTCAGAACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106290 GACTACTTCTGGATGCCCCCTTGTGATACAGTGCAAGAACTTCAGAACTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TGCATTTCATTGTTCCCAGAGAAAGAGATTGCCATGATATTTACAACTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106340 TGCATTTCATTGTTCCCAGAGAAAGAGATTGCCATGATATTTACAACTCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TTGCTACAACTGTCAAAACAAG         CAAAATATGAAGATCTCTA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 106390 TTGCTACAACTGTCAAAACAAGGTA...TAGCAAAATATGAAGATCTCTA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 TGCATTTTCTTATAATCCCAAACAAAATGATTCAGAACGACTACAAGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107923 TGCATTTTCTTATAATCCCAAACAAAATGATTCAGAACGACTACAAGGCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 GGCAGCTCATTGATCTCGCTGAGGAATATAAGAGGATGGGAGTGCCAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107973 GGCAGCTCATTGATCTCGCTGAGGAATATAAGAGGATGGGAGTGCCAAAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 TCACACTGGCAGTTGTCTGATGCCAACCGGGACTACAAG         AT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 108023 TCACACTGGCAGTTGTCTGATGCCAACCGGGACTACAAGGTA...CAGAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 TTGTGAAACTTACCCCAGAGAACTTTATGTTCCCCGGATAGCAAGCAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108245 TTGTGAAACTTACCCCAGAGAACTTTATGTTCCCCGGATAGCAAGCAAAC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 CAATAATTGTTGGTAGTTCCAAGTTCCGGAGCAAGGGAAGATTCCCAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108295 CAATAATTGTTGGTAGTTCCAAGTTCCGGAGCAAGGGAAGATTCCCAGTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 CTTTCCTACTATCATCAAGATAAGGAG         GCTGCCATTTGTCG
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 108345 CTTTCCTACTATCATCAAGATAAGGAGGTA...TAGGCTGCCATTTGTCG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 ATGTAGTCAGCCACTCTCTGGATTCAGTGCCAGGTGCCTGGAGGATGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112402 ATGTAGTCAGCCACTCTCTGGATTCAGTGCCAGGTGCCTGGAGGATGAAC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 ATTTGCTTCAAGCCATTAGTAAAGCCAATCCAGTCAATCGCTATATGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112452 ATTTGCTTCAAGCCATTAGTAAAGCCAATCCAGTCAATCGCTATATGTAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 GTCATGGATACCAGGCCAAAA         CTGAATGCAATGGCCAACAG
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 112502 GTCATGGATACCAGGCCAAAAGTA...TAGCTGAATGCAATGGCCAACAG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 AGCAGCTGGAAAAGGTTATGAAAATGAAGACAACTATTCCAATATTAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115518 AGCAGCTGGAAAAGGTTATGAAAATGAAGACAACTATTCCAATATTAGAT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 TTCAGTTTGTTGGAATTGAAAATATTCATGTCATGAGGTCCAGCCTTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115568 TTCAGTTTGTTGGAATTGAAAATATTCATGTCATGAGGTCCAGCCTTCAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 AAATTATTGGAAG         TCAATGGCACTAAAGGGCTTTCTGTCAA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 115618 AAATTATTGGAAGGTA...CAGTCAATGGCACTAAAGGGCTTTCTGTCAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 TGATTTCTACTCCGGTTTGGAGAGCTCGGGATGGCTTCGCCATATCAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116373 TGATTTCTACTCCGGTTTGGAGAGCTCGGGATGGCTTCGCCATATCAAAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 CTGTTATGGATGCTGCAGTCTTCTTGGCCAAA         GCAATAACA
        ||||||||||||||||| ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 116423 CTGTTATGGATGCTGCAATCTTCTTGGCCAAAGTA...CAGGCAATAACA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 GTTGAAAATGCAAGTGTGTTGGTGCATTGTTCCGATGGTTGGGATAGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116878 GTTGAAAATGCAAGTGTGTTGGTGCATTGTTCCGATGGTTGGGATAGGAC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 TTCCCAGGTTTGTTCCCTGGGTTCTCTTTTATTGGATTCCTACTACAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116928 TTCCCAGGTTTGTTCCCTGGGTTCTCTTTTATTGGATTCCTACTACAGGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 CAATCAAAGGATTCATG         GTTTTAATAGAAAAGGATTGGATC
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 116978 CAATCAAAGGATTCATGGTA...AAGGTTTTAATAGAAAAGGATTGGATC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 TCTTTTGGACATAAATTTTCAGAGAG         GTGTGGCCAGTTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 119780 TCTTTTGGACATAAATTTTCAGAGAGGTG...TAGGTGTGGCCAGTTGGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1161 TGGTGACCCAAAGGAAGTCTCACCAGTGTTTACTCAGTTCTTGGAATGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120241 TGGTGACCCAAAGGAAGTCTCACCAGTGTTTACTCAGTTCTTGGAATGTG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 TGTGGCATTTGACCGAACAGTTTCCACAAGCCTTTGAATTCAGTGAAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120291 TGTGGCATTTGACCGAACAGTTTCCACAAGCCTTTGAATTCAGTGAAGCA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 TTTCTTCTTCAGATCCATGAGCATATTCATTCATGCCAGTTTGGAAACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120341 TTTCTTCTTCAGATCCATGAGCATATTCATTCATGCCAGTTTGGAAACTT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 CCTTGGAAATTGTCAGAAGGAAAGAGAAGAGCTCAA         GTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 120391 CCTTGGAAATTGTCAGAAGGAAAGAGAAGAGCTCAAGTA...AAGGTTGA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1352 AGGAGAAGACTTATTCCCTGTGGCCATTTCTTTTGGAAGACCAAAAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122211 AGGAGAAGACTTATTCCCTGTGGCCATTTCTTTTGGAAGACCAAAAGAAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1402 TACTTAAATCCTCTCTACAGTTCCGAATCTCACAGATTTACAGTTTTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122261 TACTTAAATCCTCTCTACAGTTCCGAATCTCACAGATTTACAGTTTTGGA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1452 GCCAAATACAGTATCTTTCAATTTTAA         GTTTTGGAGGAACA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 122311 GCCAAATACAGTATCTTTCAATTTTAAGTA...AAGGTTTTGGAGGAACA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1493 TGTACCATCAGTTTGATCGAACACTGCATCCTAGGCAGTCTGTATTTAAT
        |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122429 TGTACCATCAATTTGATCGAACACTGCATCCTAGGCAGTCTGTATTTAAT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1543 ATAATTATGAATATGAATGAGCAAAATAAACAATTAGAGAAAGATATTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122479 ATAATTATGAATATGAATGAGCAAAATAAACAATTAGAGAAAGATATTAA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1593 AGACCTAGAATCT         AAAATTAAACAACGCAAAAATAAGCAAA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 122529 AGACCTAGAATCTGTA...TAGAAAATTAAACAACGCAAAAATAAGCAAA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1634 CAGATGGCATCCTCACCAAGGAATTGTTACATTCAGTTCATCCTGAATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124726 CAGATGGCATCCTCACCAAGGAATTGTTACATTCAGTTCATCCTGAATCA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1684 CCTAACCTCAAAACTTCCCTGTGTTTTAAAGAGCAGACTCTGCTACCCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124776 CCTAACCTCAAAACTTCCCTGTGTTTTAAAGAGCAGACTCTGCTACCCGT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1734 AAATGATGCTCTTCGAACTATAGAGGGCAGCAGCCCGGCAGATAATCGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124826 AAATGATGCTCTTCGAACTATAGAGGGCAGCAGCCCGGCAGATAATCGTT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1784 ATAGTGAATATGCAGAAGAGTTTTCTAAATCAGAACCTGCTGTGGTCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124876 ATAGTGAATATGCAGAAGAGTTTTCTAAATCAGAACCTGCTGTGGTCAGC

   1950     .    :    .    :    .    :
   1834 TTAGAGTATGGTGTGGCAAGAATGACTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||
 124926 TTAGAGTATGGTGTGGCAAGAATGACTTGT