seq1 = pF1KB3248.tfa, 630 bp
seq2 = pF1KB3248/gi568815591r_81652115.tfa (gi568815591r:81652115_81869971), 217857 bp

>pF1KB3248 630
>gi568815591r:81652115_81869971 (Chr7)

(complement)

1-88  (100001-100088)   100% ->
89-254  (107100-107265)   100% ->
255-367  (111168-111280)   100% ->
368-482  (112669-112783)   100% ->
483-630  (117710-117857)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTGGGTGACCAAACTCCTGCCAGCCCTGCTGCTGCAGCATGTCCTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTGGGTGACCAAACTCCTGCCAGCCCTGCTGCTGCAGCATGTCCTCCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCATCTCCTCCTGCTCCCCATCGCCATCCCCTATGCAG         AGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 100051 GCATCTCCTCCTGCTCCCCATCGCCATCCCCTATGCAGGTT...TAGAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GACAAAGGAAAAGAAGAAATACAATTCATGAATTCAAAAAATCAGCAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107103 GACAAAGGAAAAGAAGAAATACAATTCATGAATTCAAAAAATCAGCAAAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ACTACCCTAATCAAAATAGATCCAGCACTGAAGATAAAAACCAAAAAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107153 ACTACCCTAATCAAAATAGATCCAGCACTGAAGATAAAAACCAAAAAAGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GAATACTGCAGACCAATGTGCTAATAGATGTACTAGGAATAAAGGACTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107203 GAATACTGCAGACCAATGTGCTAATAGATGTACTAGGAATAAAGGACTTC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CATTCACTTGCAA         GGCTTTTGTTTTTGATAAAGCAAGAAAA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 107253 CATTCACTTGCAAGTA...CAGGGCTTTTGTTTTTGATAAAGCAAGAAAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CAATGCCTCTGGTTCCCCTTCAATAGCATGTCAAGTGGAGTGAAAAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111196 CAATGCCTCTGGTTCCCCTTCAATAGCATGTCAAGTGGAGTGAAAAAAGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 ATTTGGCCATGAATTTGACCTCTATGAAAACAAAG         ACTACA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 111246 ATTTGGCCATGAATTTGACCTCTATGAAAACAAAGGTA...TAGACTACA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TTAGAAACTGCATCATTGGTAAAGGACGCAGCTACAAGGGAACAGTATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112675 TTAGAAACTGCATCATTGGTAAAGGACGCAGCTACAAGGGAACAGTATCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 ATCACTAAGAGTGGCATCAAATGTCAGCCCTGGAGTTCCATGATACCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112725 ATCACTAAGAGTGGCATCAAATGTCAGCCCTGGAGTTCCATGATACCACA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CGAACACAG         CTTTTTGCCTTCGAGCTATCGGGGTAAAGACC
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 112775 CGAACACAGGTA...TAGCTTTTTGCCTTCGAGCTATCGGGGTAAAGACC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TACAGGAAAACTACTGTCGAAATCCTCGAGGGGAAGAAGGGGGACCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117742 TACAGGAAAACTACTGTCGAAATCCTCGAGGGGAAGAAGGGGGACCCTGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 TGTTTCACAAGCAATCCAGAGGTACGCTACGAAGTCTGTGACATTCCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117792 TGTTTCACAAGCAATCCAGAGGTACGCTACGAAGTCTGTGACATTCCTCA

    650     .    :    .
    615 GTGTTCAGAAGGTAAA
        ||||||||||||||||
 117842 GTGTTCAGAAGGTAAA