seq1 = pF1KB3232.tfa, 2139 bp
seq2 = pF1KB3232/gi568815597r_204517854.tfa (gi568815597r:204517854_204719992), 202139 bp

>pF1KB3232 2139
>gi568815597r:204517854_204719992 (Chr1)

(complement)

1-2139  (100001-102139)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGGCTTCTCGTGGCCCCACTCTTGCTAGCTTGGGTGGCTGGTGCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGGCTTCTCGTGGCCCCACTCTTGCTAGCTTGGGTGGCTGGTGCCAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGCCACTGTGCCCGTGGTACCCTGGCATGTTCCCTGCCCCCCTCAGTGTG
        |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGCCGCTGTGCCCGTGGTACCCTGGCATGTTCCCTGCCCCCCTCAGTGTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCTGCCAGATCCGGCCCTGGTATACGCCCCGCTCGTCCTACCGCGAGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCTGCCAGATCCGGCCCTGGTATACGCCCCGCTCGTCCTACCGCGAGGCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ACCACTGTGGACTGCAATGACCTATTCCTGACGGCAGTCCCCCCGGCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ACCACTGTGGACTGCAATGACCTATTCCTGACGGCAGTCCCCCCGGCACT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCCCGCAGGCACACAGACCCTGCTCCTGCAGAGCAACAGCATTGTCCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCCCGCAGGCACACAGACCCTGCTCCTGCAGAGCAACAGCATTGTCCGTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGGACCAGAGTGAGCTGGGCTACCTGGCCAATCTCACAGAGCTGGACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGGACCAGAGTGAGCTGGGCTACCTGGCCAATCTCACAGAGCTGGACCTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TCCCAGAACAGCTTTTCGGATGCCCGAGACTGTGATTTCCATGCCCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TCCCAGAACAGCTTTTCGGATGCCCGAGACTGTGATTTCCATGCCCTGCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CCAGCTGCTGAGCCTGCACCTAGAGGAGAACCAGCTGACCCGGCTGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CCAGCTGCTGAGCCTGCACCTAGAGGAGAACCAGCTGACCCGGCTGGAGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ACCACAGCTTTGCAGGGCTGGCCAGCCTACAGGAACTCTATCTCAACCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 ACCACAGCTTTGCAGGGCTGGCCAGCCTACAGGAACTCTATCTCAACCAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AACCAGCTCTACCGCATCGCCCCCAGGGCCTTTTCTGGCCTCAGCAACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 AACCAGCTCTACCGCATCGCCCCCAGGGCCTTTTCTGGCCTCAGCAACTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GCTGCGGCTGCACCTCAACTCCAACCTCCTGAGGGCCATTGACAGCCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GCTGCGGCTGCACCTCAACTCCAACCTCCTGAGGGCCATTGACAGCCGCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GGTTTGAAATGCTGCCCAACTTGGAGATACTCATGATTGGCGGCAACAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GGTTTGAAATGCTGCCCAACTTGGAGATACTCATGATTGGCGGCAACAAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GTAGATGCCATCCTGGACATGAACTTCCGGCCCCTGGCCAACCTGCGTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GTAGATGCCATCCTGGACATGAACTTCCGGCCCCTGGCCAACCTGCGTAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CCTGGTGCTAGCAGGCATGAACCTGCGGGAGATCTCCGACTATGCCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CCTGGTGCTAGCAGGCATGAACCTGCGGGAGATCTCCGACTATGCCCTGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 AGGGGCTGCAAAGCCTGGAGAGCCTCTCCTTCTATGACAACCAGCTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 AGGGGCTGCAAAGCCTGGAGAGCCTCTCCTTCTATGACAACCAGCTGGCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CGGGTGCCCAGGCGGGCACTGGAACAGGTGCCCGGGCTCAAGTTCCTAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 CGGGTGCCCAGGCGGGCACTGGAACAGGTGCCCGGGCTCAAGTTCCTAGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CCTCAACAAGAACCCGCTCCAGCGGGTAGGGCCGGGGGACTTTGCCAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CCTCAACAAGAACCCGCTCCAGCGGGTAGGGCCGGGGGACTTTGCCAACA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TGCTGCACCTTAAGGAGCTGGGACTGAACAACATGGAGGAGCTGGTCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TGCTGCACCTTAAGGAGCTGGGACTGAACAACATGGAGGAGCTGGTCTCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 ATCGACAAGTTTGCCCTGGTGAACCTCCCCGAGCTGACCAAGCTGGACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 ATCGACAAGTTTGCCCTGGTGAACCTCCCCGAGCTGACCAAGCTGGACAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 CACCAATAACCCACGGCTGTCCTTCATCCACCCCCGCGCCTTCCACCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 CACCAATAACCCACGGCTGTCCTTCATCCACCCCCGCGCCTTCCACCACC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 TGCCCCAGATGGAGACCCTCATGCTCAACAACAACGCTCTCAGTGCCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 TGCCCCAGATGGAGACCCTCATGCTCAACAACAACGCTCTCAGTGCCTTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 CACCAGCAGACGGTGGAGTCCCTGCCCAACCTGCAGGAGGTAGGTCTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 CACCAGCAGACGGTGGAGTCCCTGCCCAACCTGCAGGAGGTAGGTCTCCA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 CGGCAACCCCATCCGCTGTGACTGTGTCATCCGCTGGGCCAATGCCACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 CGGCAACCCCATCCGCTGTGACTGTGTCATCCGCTGGGCCAATGCCACGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 GCACCCGTGTCCGCTTCATCGAGCCGCAATCCACCCTGTGTGCGGAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 GCACCCGTGTCCGCTTCATCGAGCCGCAATCCACCCTGTGTGCGGAGCCT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 CCGGACCTCCAGCGCCTCCCGGTCCGTGAGGTGCCCTTCCGGGAGATGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 CCGGACCTCCAGCGCCTCCCGGTCCGTGAGGTGCCCTTCCGGGAGATGAC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 GGACCACTGTTTGCCCCTCATCTCCCCACGAAGCTTCCCCCCAAGCCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 GGACCACTGTTTGCCCCTCATCTCCCCACGAAGCTTCCCCCCAAGCCTCC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 AGGTAGCCAGTGGAGAGAGCATGGTGCTGCATTGCCGGGCACTGGCCGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 AGGTAGCCAGTGGAGAGAGCATGGTGCTGCATTGCCGGGCACTGGCCGAA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 CCCGAACCCGAGATCTACTGGGTCACTCCAGCTGGGCTTCGACTGACACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 CCCGAACCCGAGATCTACTGGGTCACTCCAGCTGGGCTTCGACTGACACC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 TGCCCATGCAGGCAGGAGGTACCGGGTGTACCCCGAGGGGACCCTGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 TGCCCATGCAGGCAGGAGGTACCGGGTGTACCCCGAGGGGACCCTGGAGC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1451 TGCGGAGGGTGACAGCAGAAGAGGCAGGGCTATACACCTGTGTGGCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101451 TGCGGAGGGTGACAGCAGAAGAGGCAGGGCTATACACCTGTGTGGCCCAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1501 AACCTGGTGGGGGCTGACACTAAGACGGTTAGTGTGGTTGTGGGCCGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101501 AACCTGGTGGGGGCTGACACTAAGACGGTTAGTGTGGTTGTGGGCCGTGC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1551 TCTCCTCCAGCCAGGCAGGGACGAAGGACAGGGGCTGGAGCTCCGGGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101551 TCTCCTCCAGCCAGGCAGGGACGAAGGACAGGGGCTGGAGCTCCGGGTGC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1601 AGGAGACCCACCCCTATCACATCCTGCTATCTTGGGTCACCCCACCCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101601 AGGAGACCCACCCCTATCACATCCTGCTATCTTGGGTCACCCCACCCAAC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1651 ACAGTGTCCACCAACCTCACCTGGTCCAGTGCCTCCTCCCTCCGGGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101651 ACAGTGTCCACCAACCTCACCTGGTCCAGTGCCTCCTCCCTCCGGGGCCA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1701 GGGGGCCACAGCTCTGGCCCGCCTGCCTCGGGGAACCCACAGCTACAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101701 GGGGGCCACAGCTCTGGCCCGCCTGCCTCGGGGAACCCACAGCTACAACA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1751 TTACCCGCCTCCTTCAGGCCACGGAGTACTGGGCCTGCCTGCAAGTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101751 TTACCCGCCTCCTTCAGGCCACGGAGTACTGGGCCTGCCTGCAAGTGGCC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1801 TTTGCTGATGCCCACACCCAGTTGGCTTGTGTATGGGCCAGGACCAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101801 TTTGCTGATGCCCACACCCAGTTGGCTTGTGTATGGGCCAGGACCAAAGA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1851 GGCCACTTCTTGCCACAGAGCCTTAGGGGATCGTCCTGGGCTCATTGCCA
        |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
 101851 GGCCACTTCTTGCCACAGAGCCTTAGGGGACCGTCCTGGGCTCATTGCCA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1901 TCCTGGCTCTCGCTGTCCTTCTCCTGGCAGCTGGGCTAGCGGCCCACCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101901 TCCTGGCTCTCGCTGTCCTTCTCCTGGCAGCTGGGCTAGCGGCCCACCTT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1951 GGCACAGGCCAACCCAGGAAGGGTGTGGGTGGGAGGCGGCCTCTCCCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101951 GGCACAGGCCAACCCAGGAAGGGTGTGGGTGGGAGGCGGCCTCTCCCTCC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2001 AGCCTGGGCTTTCTGGGGCTGGAGTGCCCCTTCTGTCCGGGTTGTGTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102001 AGCCTGGGCTTTCTGGGGCTGGAGTGCCCCTTCTGTCCGGGTTGTGTCTG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2051 CTCCCCTCGTCCTGCCCTGGAATCCAGGGAGGAAGCTGCCCAGATCCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102051 CTCCCCTCGTCCTGCCCTGGAATCCAGGGAGGAAGCTGCCCAGATCCTCA

   2100     .    :    .    :    .    :    .
   2101 GAAGGGGAGACACTGTTGCCACCATTGTCTCAAAATTCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102101 GAAGGGGAGACACTGTTGCCACCATTGTCTCAAAATTCT