seq1 = pF1KB3191.tfa, 1767 bp
seq2 = pF1KB3191/gi568815579f_52090097.tfa (gi568815579f:52090097_52325808), 235712 bp

>pF1KB3191 1767
>gi568815579f:52090097_52325808 (Chr19)

1-78  (100001-100078)   100% ->
79-169  (111848-111938)   100% ->
170-270  (115867-115967)   100% ->
271-503  (121164-121396)   100% ->
504-651  (122590-122737)   100% ->
652-807  (122859-123014)   100% ->
808-922  (125683-125797)   100% ->
923-993  (125908-125978)   100% ->
994-1128  (126433-126567)   100% ->
1129-1302  (129595-129768)   100% ->
1303-1363  (130093-130153)   100% ->
1364-1518  (130883-131037)   100% ->
1519-1661  (132003-132145)   100% ->
1662-1753  (135621-135712)   100% ->
1754-1767  (135869-135882)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGCGGCCGACGGCGACGACTCGCTGTACCCCATCGCGGTGCTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGCGGCCGACGGCGACGACTCGCTGTACCCCATCGCGGTGCTCAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGACGAACTCCGCAATGAGGACGTTCAG         CTTCGCCTCAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 100051 AGACGAACTCCGCAATGAGGACGTTCAGGTC...TAGCTTCGCCTCAACA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GCATCAAGAAGCTGTCCACCATCGCCTTGGCCCTTGGGGTTGAAAGGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111861 GCATCAAGAAGCTGTCCACCATCGCCTTGGCCCTTGGGGTTGAAAGGACC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CGAAGTGAGCTTCTGCCTTTCCTTACAG         ATACCATCTATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 111911 CGAAGTGAGCTTCTGCCTTTCCTTACAGGTA...CAGATACCATCTATGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TGAAGATGAGGTCCTCCTGGCCCTGGCAGAACAGCTGGGAACCTTCACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115880 TGAAGATGAGGTCCTCCTGGCCCTGGCAGAACAGCTGGGAACCTTCACTA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CCCTGGTGGGAGGCCCAGAGTACGTGCACTGCCTGCTG         CCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 115930 CCCTGGTGGGAGGCCCAGAGTACGTGCACTGCCTGCTGGTG...CAGCCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 CCGCTGGAGTCGCTGGCCACAGTGGAGGAGACAGTGGTGCGGGACAAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121167 CCGCTGGAGTCGCTGGCCACAGTGGAGGAGACAGTGGTGCGGGACAAGGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 AGTGGAGTCCTTACGGGCCATCTCACACGAGCACTCGCCCTCTGACCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121217 AGTGGAGTCCTTACGGGCCATCTCACACGAGCACTCGCCCTCTGACCTGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AGGCGCACTTTGTGCCGCTAGTGAAGCGGCTGGCGGGCGGCGACTGGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121267 AGGCGCACTTTGTGCCGCTAGTGAAGCGGCTGGCGGGCGGCGACTGGTTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 ACCTCCCGCACCTCGGCCTGCGGCCTCTTCTCCGTCTGCTACCCCCGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121317 ACCTCCCGCACCTCGGCCTGCGGCCTCTTCTCCGTCTGCTACCCCCGAGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GTCCAGTGCTGTGAAGGCGGAACTTCGACA         GTACTTCCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 121367 GTCCAGTGCTGTGAAGGCGGAACTTCGACAGTG...CAGGTACTTCCGGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 ACCTGTGCTCAGATGACACCCCCATGGTGCGGCGGGCCGCAGCCTCCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122601 ACCTGTGCTCAGATGACACCCCCATGGTGCGGCGGGCCGCAGCCTCCAAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 CTGGGGGAGTTTGCCAAGGTGCTGGAGCTGGACAACGTCAAGAGTGAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122651 CTGGGGGAGTTTGCCAAGGTGCTGGAGCTGGACAACGTCAAGAGTGAGAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CATCCCCATGTTCTCCAACCTGGCCTCTGACGAGCAG         GACT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 122701 CATCCCCATGTTCTCCAACCTGGCCTCTGACGAGCAGGTG...TAGGACT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 CGGTGCGGCTGCTGGCGGTGGAGGCGTGCGTGAACATCGCCCAGCTTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122863 CGGTGCGGCTGCTGGCGGTGGAGGCGTGCGTGAACATCGCCCAGCTTCTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 CCCCAGGAGGATCTGGAGGCCCTGGTGATGCCCACTCTGCGCCAGGCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122913 CCCCAGGAGGATCTGGAGGCCCTGGTGATGCCCACTCTGCGCCAGGCCGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 TGAAGACAAGTCCTGGCGCGTCCGCTACATGGTGGCTGACAAGTTCACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122963 TGAAGACAAGTCCTGGCGCGTCCGCTACATGGTGGCTGACAAGTTCACAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 AG         CTCCAGAAAGCAGTGGGGCCTGAGATCACCAAGACAGAC
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123013 AGGTA...CAGCTCCAGAAAGCAGTGGGGCCTGAGATCACCAAGACAGAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 CTGGTCCCTGCCTTCCAGAACCTGATGAAAGACTGTGAGGCCGAGGTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125722 CTGGTCCCTGCCTTCCAGAACCTGATGAAAGACTGTGAGGCCGAGGTGAG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 GGCCGCAGCCTCCCACAAGGTCAAAG         AGTTCTGTGAAAACC
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 125772 GGCCGCAGCCTCCCACAAGGTCAAAGGTT...CAGAGTTCTGTGAAAACC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 TCTCAGCTGACTGTCGGGAGAATGTGATCATGTCCCAGATCTTGCCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125923 TCTCAGCTGACTGTCGGGAGAATGTGATCATGTCCCAGATCTTGCCCTGC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 ATCAAG         GAGCTGGTGTCCGATGCCAACCAACATGTCAAGTC
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125973 ATCAAGGTA...CAGGAGCTGGTGTCCGATGCCAACCAACATGTCAAGTC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 TGCCCTGGCCTCAGTCATCATGGGTCTCTCTCCCATCTTGGGCAAAGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126468 TGCCCTGGCCTCAGTCATCATGGGTCTCTCTCCCATCTTGGGCAAAGACA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 ACACCATCGAGCACCTCTTGCCCCTCTTCCTGGCTCAGCTGAAGGATGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126518 ACACCATCGAGCACCTCTTGCCCCTCTTCCTGGCTCAGCTGAAGGATGAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129          TGCCCTGAGGTACGGCTGAACATCATCTCTAACCTGGACTG
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126568 GTA...CAGTGCCCTGAGGTACGGCTGAACATCATCTCTAACCTGGACTG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 TGTGAACGAGGTGATTGGCATCCGGCAGCTGTCCCAGTCCCTGCTCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129636 TGTGAACGAGGTGATTGGCATCCGGCAGCTGTCCCAGTCCCTGCTCCCTG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 CCATTGTGGAGCTGGCTGAGGACGCCAAGTGGCGGGTGCGGCTGGCCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129686 CCATTGTGGAGCTGGCTGAGGACGCCAAGTGGCGGGTGCGGCTGGCCATC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 ATTGAGTACATGCCCCTCCTGGCTGGACAGCTG         GGAGTGGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 129736 ATTGAGTACATGCCCCTCCTGGCTGGACAGCTGGTG...TAGGGAGTGGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 GTTCTTTGATGAGAAACTTAACTCCTTGTGCATGGCCTGGCTTGTGGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130101 GTTCTTTGATGAGAAACTTAACTCCTTGTGCATGGCCTGGCTTGTGGATC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 ATG         TATATGCCATCCGCGAGGCAGCCACCAGCAACCTGAAG
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130151 ATGGTG...CAGTATATGCCATCCGCGAGGCAGCCACCAGCAACCTGAAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1402 AAGCTAGTGGAAAAGTTTGGGAAGGAGTGGGCCCATGCCACAATCATCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130921 AAGCTAGTGGAAAAGTTTGGGAAGGAGTGGGCCCATGCCACAATCATCCC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1452 CAAGGTCTTGGCCATGTCCGGAGACCCCAACTACCTGCACCGCATGACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130971 CAAGGTCTTGGCCATGTCCGGAGACCCCAACTACCTGCACCGCATGACTA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1502 CGCTCTTCTGCATCAAT         GTGCTGTCTGAGGTCTGTGGGCAG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 131021 CGCTCTTCTGCATCAATGTG...CAGGTGCTGTCTGAGGTCTGTGGGCAG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1543 GACATCACCACCAAGCACATGCTACCCACGGTTCTGCGCATGGCTGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132027 GACATCACCACCAAGCACATGCTACCCACGGTTCTGCGCATGGCTGGGGA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1593 CCCGGTTGCCAATGTCCGCTTCAATGTGGCCAAGTCTCTGCAGAAGATAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132077 CCCGGTTGCCAATGTCCGCTTCAATGTGGCCAAGTCTCTGCAGAAGATAG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1643 GGCCCATCCTGGACAACAG         CACCTTGCAGAGTGAAGTCAAG
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 132127 GGCCCATCCTGGACAACAGGTG...CAGCACCTTGCAGAGTGAAGTCAAG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1684 CCCATCCTAGAGAAGCTGACCCAGGACCAGGATGTGGACGTCAAATACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135643 CCCATCCTAGAGAAGCTGACCCAGGACCAGGATGTGGACGTCAAATACTT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :
   1734 TGCCCAGGAGGCTCTGACTG         TTCTGTCTCTCGCC
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 135693 TGCCCAGGAGGCTCTGACTGGTA...TAGTTCTGTCTCTCGCC