seq1 = pF1KB3158.tfa, 2772 bp
seq2 = pF1KB3158/gi568815585r_61311246.tfa (gi568815585r:61311246_61515077), 203832 bp

>pF1KB3158 2772
>gi568815585r:61311246_61515077 (Chr13)

(complement)

1-51  (100001-100051)   100% ->
52-2772  (101112-103832)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGGCGTCTACATCGTCCCAGGAGCAGCACCAGCTACAGGAACCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGGCGTCTACATCGTCCCAGGAGCAGCACCAGCTACAGGAACCTGCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 G         CATCTGTTTCTGTTTTTCCTCTTCGTGGGACCCTTCAGCT
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGTA...CAGCATCTGTTTCTGTTTTTCCTCTTCGTGGGACCCTTCAGCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GCCTCGGGAGTTACAGCCGGGCCACCGAGCTTCTGTACAGCCTAAACGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101152 GCCTCGGGAGTTACAGCCGGGCCACCGAGCTTCTGTACAGCCTAAACGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GGACTACCCGCGGGGGTGCTCATCGGCAGCCTGGCCGAGGACCTGCGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101202 GGACTACCCGCGGGGGTGCTCATCGGCAGCCTGGCCGAGGACCTGCGGCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GCTGCCCAGGTCTGCAGGGAGGCCGGACCCGCAGTCGCAGCTGCCAGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101252 GCTGCCCAGGTCTGCAGGGAGGCCGGACCCGCAGTCGCAGCTGCCAGAGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GCACCGGTGCTGAGTGGAACCCCCCTCTCTCCTTCAGCCTGGCCTCCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101302 GCACCGGTGCTGAGTGGAACCCCCCTCTCTCCTTCAGCCTGGCCTCCCGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GGACTGAGTGGCCAGTACGTGACCCTAGACAACCGCTCTGGGGAGCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101352 GGACTGAGTGGCCAGTACGTGACCCTAGACAACCGCTCTGGGGAGCTGCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CACTTCAGCTCAGGAGATCGACAGGGAGGCCCTGTGTGTTGAAGGGGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101402 CACTTCAGCTCAGGAGATCGACAGGGAGGCCCTGTGTGTTGAAGGGGGTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 GAGGGACTGCGTGGAGCGGCAGCGTTTCCATCTCCTCCTCTCCTTCTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101452 GAGGGACTGCGTGGAGCGGCAGCGTTTCCATCTCCTCCTCTCCTTCTGAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 TCTTGTCTTTTGCTGCTGGATGTGCTTGTCCTGCCTCAGGAATACTTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101502 TCTTGTCTTTTGCTGCTGGATGTGCTTGTCCTGCCTCAGGAATACTTCAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 GTTTGTGAAGGTGAAGATCGCCATCAGAGACATCAATGACAACGCCCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101552 GTTTGTGAAGGTGAAGATCGCCATCAGAGACATCAATGACAACGCCCCGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 AGTTCCCTGTTTCCCAGATCTCGGTGTGGGTCCCGGAAAATGCACCTGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101602 AGTTCCCTGTTTCCCAGATCTCGGTGTGGGTCCCGGAAAATGCACCTGTA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 AACACCCGACTGGCCATAGAGCATCCTGCTGTGGACCCAGATGTAGGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101652 AACACCCGACTGGCCATAGAGCATCCTGCTGTGGACCCAGATGTAGGCAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 TAATGGGGTACAGACCTATCGCTTACTGGACTACCATGGTATGTTCACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101702 TAATGGGGTACAGACCTATCGCTTACTGGACTACCATGGTATGTTCACCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 TGGACGTGGAGGAGAATGAGAATGGGGAGCGCACCCCCTACCTAATTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101752 TGGACGTGGAGGAGAATGAGAATGGGGAGCGCACCCCCTACCTAATTGTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 ATGGGTGCTTTGGACAGGGAAACCCAGGACCAGTATGTGAGCATCATCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101802 ATGGGTGCTTTGGACAGGGAAACCCAGGACCAGTATGTGAGCATCATCAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 AGCTGAGGATGGTGGGTCTCCACCACTTTTGGGCAGTGCCACTCTCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101852 AGCTGAGGATGGTGGGTCTCCACCACTTTTGGGCAGTGCCACTCTCACCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 TTGGCATCAGTGACATTAATGACAATTGCCCTCTCTTCACAGACTCACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101902 TTGGCATCAGTGACATTAATGACAATTGCCCTCTCTTCACAGACTCACAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 ATCAATGTCACTGTGTATGGGAATGCTACAGTGGGCACCCCAATTGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101952 ATCAATGTCACTGTGTATGGGAATGCTACAGTGGGCACCCCAATTGCAGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 TGTCCAGGCTGTGGATAAAGACTTGGGGACCAATGCTCAAATTACTTATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102002 TGTCCAGGCTGTGGATAAAGACTTGGGGACCAATGCTCAAATTACTTATT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 CTTACAGTCAGAAAGTTCCACAAGCATCTAAGGATTTATTTCACCTGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102052 CTTACAGTCAGAAAGTTCCACAAGCATCTAAGGATTTATTTCACCTGGAT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1042 GAAAACACTGGAGTCATTAAACTTTTCAGTAAGATTGGAGGAAGTGTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102102 GAAAACACTGGAGTCATTAAACTTTTCAGTAAGATTGGAGGAAGTGTTCT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1092 GGAGTCCCACAAGCTCACCATCCTTGCTAATGGACCAGGCTGCATCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102152 GGAGTCCCACAAGCTCACCATCCTTGCTAATGGACCAGGCTGCATCCCTG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1142 CTGTAATCACTGCTCTTGTGTCCATTATTAAAGTTATTTTCAGACCCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102202 CTGTAATCACTGCTCTTGTGTCCATTATTAAAGTTATTTTCAGACCCCCT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1192 GAAATTGTCCCTCGTTACATAGCAAACGAGATAGATGGTGTTGTTTATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
 102252 GAAATTGTCCCTCGTTACATAGCAAACGAGATAGATGGTGTGGTTTATCT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1242 GAAAGAACTGGAACCCGTTAACACTCCCATTGCGTTTTTCACCATAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102302 GAAAGAACTGGAACCCGTTAACACTCCCATTGCGTTTTTCACCATAAGAG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1292 ATCCAGAAGGTAAATACAAGGTTAACTGCTACCTGGATGGTGAAGGGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102352 ATCCAGAAGGTAAATACAAGGTTAACTGCTACCTGGATGGTGAAGGGCCG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1342 TTTAGGTTATCACCTTACAAACCATACAATAATGAATATTTACTAGAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102402 TTTAGGTTATCACCTTACAAACCATACAATAATGAATATTTACTAGAGAC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1392 CACAAAACCTATGGACTATGAGCTACAGCAGTTCTATGAAGTAGCTGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102452 CACAAAACCTATGGACTATGAGCTACAGCAGTTCTATGAAGTAGCTGTGG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1442 TGGCTTGGAACTCTGAGGGATTTCATGTCAAAAGGGTCATTAAAGTGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102502 TGGCTTGGAACTCTGAGGGATTTCATGTCAAAAGGGTCATTAAAGTGCAA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1492 CTTTTAGATGACAATGATAATGCTCCAATTTTCCTTCAACCCTTAATAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102552 CTTTTAGATGACAATGATAATGCTCCAATTTTCCTTCAACCCTTAATAGA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1542 ACTAACCATCGAAGAGAACAACTCACCCAATGCCTTTTTGACTAAGCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102602 ACTAACCATCGAAGAGAACAACTCACCCAATGCCTTTTTGACTAAGCTGT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1592 ATGCTACAGATGCCGACAGCGAGGAGAGAGGCCAAGTTTCATATTTTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102652 ATGCTACAGATGCCGACAGCGAGGAGAGAGGCCAAGTTTCATATTTTCTG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1642 GGACCTGATGCTCCATCATATTTTTCCTTAGACAGTGTCACAGGAATTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102702 GGACCTGATGCTCCATCATATTTTTCCTTAGACAGTGTCACAGGAATTCT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1692 GACAGTTTCTACTCAGCTGGACCGAGAAGAGAAAGAAAAGTACAGATACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102752 GACAGTTTCTACTCAGCTGGACCGAGAAGAGAAAGAAAAGTACAGATACA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1742 CTGTCAGAGCTGTTGACTGTGGGAAGCCACCCAGAGAATCAGTAGCCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102802 CTGTCAGAGCTGTTGACTGTGGGAAGCCACCCAGAGAATCAGTAGCCACT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1792 GTGGCCCTCACAGTGTTGGATAAAAATGACAACAGTCCTCGGTTTATCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102852 GTGGCCCTCACAGTGTTGGATAAAAATGACAACAGTCCTCGGTTTATCAA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1842 CAAGGACTTCAGCTTTTTTGTGCCTGAAAACTTTCCAGGCTATGGTGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102902 CAAGGACTTCAGCTTTTTTGTGCCTGAAAACTTTCCAGGCTATGGTGAGA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1892 TTGGAGTAATTAGTGTAACAGATGCTGACGCTGGACGAAATGGATGGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102952 TTGGAGTAATTAGTGTAACAGATGCTGACGCTGGACGAAATGGATGGGTC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1942 GCCCTCTCTGTGGTGAACCAGAGTGATATTTTTGTCATAGATACAGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103002 GCCCTCTCTGTGGTGAACCAGAGTGATATTTTTGTCATAGATACAGGAAA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1992 GGGTATGCTGAGGGCTAAAGTCTCTTTGGACAGAGAGCAGCAAAGCTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103052 GGGTATGCTGAGGGCTAAAGTCTCTTTGGACAGAGAGCAGCAAAGCTCCT

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2042 ATACTTTGTGGGTTGAAGCTGTTGATGGGGGTGAGCCTGCCCTCTCCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103102 ATACTTTGTGGGTTGAAGCTGTTGATGGGGGTGAGCCTGCCCTCTCCTCT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2092 ACAGCAAAAATCACAATTCTCCTTCTAGATATCAATGACAACCCTCCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103152 ACAGCAAAAATCACAATTCTCCTTCTAGATATCAATGACAACCCTCCTCT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2142 TGTTTTGTTTCCTCAGTCTAATATGTCTTATCTGTTAGTACTGCCTTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103202 TGTTTTGTTTCCTCAGTCTAATATGTCTTATCTGTTAGTACTGCCTTCTA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2192 CTCTGCCAGGCTCCCCGGTTACAGAAGTCTATGCTGTCGACAAAGACACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103252 CTCTGCCAGGCTCCCCGGTTACAGAAGTCTATGCTGTCGACAAAGACACA

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2242 GGCATGAATGCTGTCATAGCTTACAGCATCATAGGGAGAAGAGGTCCTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103302 GGCATGAATGCTGTCATAGCTTACAGCATCATAGGGAGAAGAGGTCCTAG

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2292 GCCTGAGTCCTTCAGGATTGACCCTAAAACTGGCAACATTACTTTGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103352 GCCTGAGTCCTTCAGGATTGACCCTAAAACTGGCAACATTACTTTGGAAG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2342 AGGCATTGCTGCAGACAGATTATGGGCTCCATCGCTTACTGGTGAAAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103402 AGGCATTGCTGCAGACAGATTATGGGCTCCATCGCTTACTGGTGAAAGTG

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2392 AGTGATCATGGTTATCCCGAGCCTCTCCACTCCACAGTCATGGTGAACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103452 AGTGATCATGGTTATCCCGAGCCTCTCCACTCCACAGTCATGGTGAACCT

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2442 ATTTGTCAATGACACTGTCAGTAATGAGAGTTACATTGAGAGTCTTTTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103502 ATTTGTCAATGACACTGTCAGTAATGAGAGTTACATTGAGAGTCTTTTAA

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2492 GAAAAGAACCAGAGATTAATATAGAGGAGAAAGAACCACAAATCTCAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103552 GAAAAGAACCAGAGATTAATATAGAGGAGAAAGAACCACAAATCTCAATA

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2542 GAACCGACTCATAGGAAGGTAGAATCTGTGTCTTGTATGCCCACCTTAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103602 GAACCGACTCATAGGAAGGTAGAATCTGTGTCTTGTATGCCCACCTTAGT

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2592 AGCTCTGTCTGTAATAAGCTTGGGTTCCATCACACTGGTCACAGGGATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103652 AGCTCTGTCTGTAATAAGCTTGGGTTCCATCACACTGGTCACAGGGATGG

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2642 GCATATACATCTGTTTAAGGAAAGGGGAAAAGCATCCCAGGGAAGATGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103702 GCATATACATCTGTTTAAGGAAAGGGGAAAAGCATCCCAGGGAAGATGAA

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2692 AATTTGGAAGTACAGATTCCACTGAAAGGAAAAATTGACTTGCATATGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103752 AATTTGGAAGTACAGATTCCACTGAAAGGAAAAATTGACTTGCATATGCG

   2750     .    :    .    :    .    :
   2742 AGAGAGAAAGCCAATGGATATTTCTAATATT
        |||||||||||||||||||||||||||||||
 103802 AGAGAGAAAGCCAATGGATATTTCTAATATT