seq1 = pF1KB3129.tfa, 717 bp
seq2 = pF1KB3129/gi568815580r_63028628.tfa (gi568815580r:63028628_63418666), 390039 bp

>pF1KB3129 717
>gi568815580r:63028628_63418666 (Chr18)

(complement)

1-585  (100001-100585)   100% ->
586-717  (289908-290039)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGCACGCTGGGAGAACAGGGTACGATAACCGGGAGATAGTGATGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGCACGCTGGGAGAACAGGGTACGATAACCGGGAGATAGTGATGAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GTACATCCATTATAAGCTGTCGCAGAGGGGCTACGAGTGGGATGCGGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GTACATCCATTATAAGCTGTCGCAGAGGGGCTACGAGTGGGATGCGGGAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ATGTGGGCGCCGCGCCCCCGGGGGCCGCCCCCGCACCGGGCATCTTCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ATGTGGGCGCCGCGCCCCCGGGGGCCGCCCCCGCACCGGGCATCTTCTCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TCCCAGCCCGGGCACACGCCCCATCCAGCCGCATCCCGGGACCCGGTCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TCCCAGCCCGGGCACACGCCCCATCCAGCCGCATCCCGGGACCCGGTCGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CAGGACCTCGCCGCTGCAGACCCCGGCTGCCCCCGGCGCCGCCGCGGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CAGGACCTCGCCGCTGCAGACCCCGGCTGCCCCCGGCGCCGCCGCGGGGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CTGCGCTCAGCCCGGTGCCACCTGTGGTCCACCTGACCCTCCGCCAGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CTGCGCTCAGCCCGGTGCCACCTGTGGTCCACCTGACCCTCCGCCAGGCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GGCGACGACTTCTCCCGCCGCTACCGCCGCGACTTCGCCGAGATGTCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GGCGACGACTTCTCCCGCCGCTACCGCCGCGACTTCGCCGAGATGTCCAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CCAGCTGCACCTGACGCCCTTCACCGCGCGGGGACGCTTTGCCACGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CCAGCTGCACCTGACGCCCTTCACCGCGCGGGGACGCTTTGCCACGGTGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGGAGGAGCTCTTCAGGGACGGGGTGAACTGGGGGAGGATTGTGGCCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TGGAGGAGCTCTTCAGGGACGGGGTGAACTGGGGGAGGATTGTGGCCTTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TTTGAGTTCGGTGGGGTCATGTGTGTGGAGAGCGTCAACCGGGAGATGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TTTGAGTTCGGTGGGGTCATGTGTGTGGAGAGCGTCAACCGGGAGATGTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GCCCCTGGTGGACAACATCGCCCTGTGGATGACTGAGTACCTGAACCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GCCCCTGGTGGACAACATCGCCCTGTGGATGACTGAGTACCTGAACCGGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 ACCTGCACACCTGGATCCAGGATAACGGAGGCTGG         GATGCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 100551 ACCTGCACACCTGGATCCAGGATAACGGAGGCTGGGTA...CAGGATGCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 TTTGTGGAACTGTACGGCCCCAGCATGCGGCCTCTGTTTGATTTCTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 289914 TTTGTGGAACTGTACGGCCCCAGCATGCGGCCTCTGTTTGATTTCTCCTG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 GCTGTCTCTGAAGACTCTGCTCAGTTTGGCCCTGGTGGGAGCTTGCATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 289964 GCTGTCTCTGAAGACTCTGCTCAGTTTGGCCCTGGTGGGAGCTTGCATCA

    700     .    :    .    :    .
    692 CCCTGGGTGCCTATCTGGGCCACAAG
        ||||||||||||||||||||||||||
 290014 CCCTGGGTGCCTATCTGGGCCACAAG