Result of SIM4 for
pF1KB3118
seq1 = pF1KB3118.tfa, 2544 bp
seq2 = pF1KB3118/gi568815591f_17199265.tfa (gi568815591f:17199265_17443061), 243797 bp
>pF1KB3118 2544
>gi568815591f:17199265_17443061 (Chr7)
1-65 (100001-100065) 100% ->
66-253 (110672-110859) 100% ->
254-360 (123237-123343) 100% ->
361-450 (128495-128584) 100% ->
451-574 (130688-130811) 100% ->
575-705 (131492-131622) 100% ->
706-908 (134648-134850) 100% ->
909-1018 (135623-135732) 100% ->
1019-1160 (136381-136522) 100% ->
1161-2403 (139722-140964) 99% ->
2404-2544 (143657-143797) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGAACAGCAGCAGCGCCAACATCACCTACGCCAGTCGCAAGCGGCGGAA
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100001 ATGAACAGCAGCAGCGCCAACATCACCTACGCCAGTCGCAAGCGGCGGAA
50 . : . : . : . : . :
51 GCCGGTGCAGAAAAC AGTAAAGCCAATCCCAGCTGAAGGAA
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100051 GCCGGTGCAGAAAACGTG...CAGAGTAAAGCCAATCCCAGCTGAAGGAA
100 . : . : . : . : . :
92 TCAAGTCAAATCCTTCCAAGCGGCATAGAGACCGACTTAATACAGAGTTG
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110698 TCAAGTCAAATCCTTCCAAGCGGCATAGAGACCGACTTAATACAGAGTTG
150 . : . : . : . : . :
142 GACCGTTTGGCTAGCCTGCTGCCTTTCCCACAAGATGTTATTAATAAGTT
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110748 GACCGTTTGGCTAGCCTGCTGCCTTTCCCACAAGATGTTATTAATAAGTT
200 . : . : . : . : . :
192 GGACAAACTTTCAGTTCTTAGGCTCAGCGTCAGTTACCTGAGAGCCAAGA
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110798 GGACAAACTTTCAGTTCTTAGGCTCAGCGTCAGTTACCTGAGAGCCAAGA
250 . : . : . : . : . :
242 GCTTCTTTGATG TTGCATTAAAATCCTCCCCTACTGAAAGA
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110848 GCTTCTTTGATGGTA...TAGTTGCATTAAAATCCTCCCCTACTGAAAGA
300 . : . : . : . : . :
283 AACGGAGGCCAGGATAACTGTAGAGCAGCAAATTTCAGAGAAGGCCTGAA
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123266 AACGGAGGCCAGGATAACTGTAGAGCAGCAAATTTCAGAGAAGGCCTGAA
350 . : . : . : . : . :
333 CTTACAAGAAGGAGAATTCTTATTACAG GCTCTGAATGGCT
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123316 CTTACAAGAAGGAGAATTCTTATTACAGGTA...TAGGCTCTGAATGGCT
400 . : . : . : . : . :
374 TTGTATTAGTTGTCACTACAGATGCTTTGGTCTTTTATGCTTCTTCTACT
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128508 TTGTATTAGTTGTCACTACAGATGCTTTGGTCTTTTATGCTTCTTCTACT
450 . : . : . : . : . :
424 ATACAAGATTATCTAGGGTTTCAGCAG TCTGATGTCATACA
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128558 ATACAAGATTATCTAGGGTTTCAGCAGGTA...TAGTCTGATGTCATACA
500 . : . : . : . : . :
465 TCAGAGTGTATATGAACTTATCCATACCGAAGACCGAGCTGAATTTCAGC
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130702 TCAGAGTGTATATGAACTTATCCATACCGAAGACCGAGCTGAATTTCAGC
550 . : . : . : . : . :
515 GTCAGCTACACTGGGCATTAAATCCTTCTCAGTGTACAGAGTCTGGACAA
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130752 GTCAGCTACACTGGGCATTAAATCCTTCTCAGTGTACAGAGTCTGGACAA
600 . : . : . : . : . :
565 GGAATTGAAG AAGCCACTGGTCTCCCCCAGACAGTAGTCTG
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130802 GGAATTGAAGGTA...CAGAAGCCACTGGTCTCCCCCAGACAGTAGTCTG
650 . : . : . : . : . :
606 TTATAACCCAGACCAGATTCCTCCAGAAAACTCTCCTTTAATGGAGAGGT
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131523 TTATAACCCAGACCAGATTCCTCCAGAAAACTCTCCTTTAATGGAGAGGT
700 . : . : . : . : . :
656 GCTTCATATGTCGTCTAAGGTGTCTGCTGGATAATTCATCTGGTTTTCTG
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131573 GCTTCATATGTCGTCTAAGGTGTCTGCTGGATAATTCATCTGGTTTTCTG
750 . : . : . : . : . :
706 GCAATGAATTTCCAAGGGAAGTTAAAGTATCTTCATGGACA
>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
131623 GTA...AAGGCAATGAATTTCCAAGGGAAGTTAAAGTATCTTCATGGACA
800 . : . : . : . : . :
747 GAAAAAGAAAGGGAAAGATGGATCAATACTTCCACCTCAGTTGGCTTTGT
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134689 GAAAAAGAAAGGGAAAGATGGATCAATACTTCCACCTCAGTTGGCTTTGT
850 . : . : . : . : . :
797 TTGCGATAGCTACTCCACTTCAGCCACCATCCATACTTGAAATCCGGACC
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134739 TTGCGATAGCTACTCCACTTCAGCCACCATCCATACTTGAAATCCGGACC
900 . : . : . : . : . :
847 AAAAATTTTATCTTTAGAACCAAACACAAACTAGACTTCACACCTATTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
134789 AAAAATTTTATCTTTAGAACCAAACACAAACTAGACTTCACACCTATTGG
950 . : . : . : . : . :
897 TTGTGATGCCAA AGGAAGAATTGTTTTAGGATATACTGAAG
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134839 TTGTGATGCCAAGTA...CAGAGGAAGAATTGTTTTAGGATATACTGAAG
1000 . : . : . : . : . :
938 CAGAGCTGTGCACGAGAGGCTCAGGTTATCAGTTTATTCATGCAGCTGAT
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135652 CAGAGCTGTGCACGAGAGGCTCAGGTTATCAGTTTATTCATGCAGCTGAT
1050 . : . : . : . : . :
988 ATGCTTTATTGTGCCGAGTCCCATATCCGAA TGATTAAGAC
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135702 ATGCTTTATTGTGCCGAGTCCCATATCCGAAGTA...TAGTGATTAAGAC
1100 . : . : . : . : . :
1029 TGGAGAAAGTGGCATGATAGTTTTCCGGCTTCTTACAAAAAACAACCGAT
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136391 TGGAGAAAGTGGCATGATAGTTTTCCGGCTTCTTACAAAAAACAACCGAT
1150 . : . : . : . : . :
1079 GGACTTGGGTCCAGTCTAATGCACGCCTGCTTTATAAAAATGGAAGACCA
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136441 GGACTTGGGTCCAGTCTAATGCACGCCTGCTTTATAAAAATGGAAGACCA
1200 . : . : . : . : . :
1129 GATTATATCATTGTAACTCAGAGACCACTAAC AGATGAGGA
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136491 GATTATATCATTGTAACTCAGAGACCACTAACGTA...TAGAGATGAGGA
1250 . : . : . : . : . :
1170 AGGAACAGAGCATTTACGAAAACGAAATACGAAGTTGCCTTTTATGTTTA
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139731 AGGAACAGAGCATTTACGAAAACGAAATACGAAGTTGCCTTTTATGTTTA
1300 . : . : . : . : . :
1220 CCACTGGAGAAGCTGTGTTGTATGAGGCAACCAACCCTTTTCCTGCCATA
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139781 CCACTGGAGAAGCTGTGTTGTATGAGGCAACCAACCCTTTTCCTGCCATA
1350 . : . : . : . : . :
1270 ATGGATCCCTTACCACTAAGGACTAAAAATGGCACTAGTGGAAAAGACTC
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139831 ATGGATCCCTTACCACTAAGGACTAAAAATGGCACTAGTGGAAAAGACTC
1400 . : . : . : . : . :
1320 TGCTACCACATCCACTCTAAGCAAGGACTCTCTCAATCCTAGTTCCCTCC
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139881 TGCTACCACATCCACTCTAAGCAAGGACTCTCTCAATCCTAGTTCCCTCC
1450 . : . : . : . : . :
1370 TGGCTGCCATGATGCAACAAGATGAGTCTATTTATCTCTATCCTGCTTCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
139931 TGGCTGCCATGATGCAACAAGATGAGTCTATTTATCTCTATCCTGCTTCA
1500 . : . : . : . : . :
1420 AGTACTTCAAGTACTGCACCTTTTGAAAACAACTTTTTCAACGAATCTAT
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139981 AGTACTTCAAGTACTGCACCTTTTGAAAACAACTTTTTCAACGAATCTAT
1550 . : . : . : . : . :
1470 GAATGAATGCAGAAATTGGCAAGATAATACTGCACCGATGGGAAATGATA
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140031 GAATGAATGCAGAAATTGGCAAGATAATACTGCACCGATGGGAAATGATA
1600 . : . : . : . : . :
1520 CTATCCTGAAACATGAGCAAATTGACCAGCCTCAGGATGTGAACTCATTT
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140081 CTATCCTGAAACATGAGCAAATTGACCAGCCTCAGGATGTGAACTCATTT
1650 . : . : . : . : . :
1570 GCTGGAGGTCACCCAGGGCTCTTTCAAGATAGTAAAAACAGTGACTTGTA
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140131 GCTGGAGGTCACCCAGGGCTCTTTCAAGATAGTAAAAACAGTGACTTGTA
1700 . : . : . : . : . :
1620 CAGCATAATGAAAAACCTAGGCATTGATTTTGAAGACATCAGACACATGC
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140181 CAGCATAATGAAAAACCTAGGCATTGATTTTGAAGACATCAGACACATGC
1750 . : . : . : . : . :
1670 AGAATGAAAAATTTTTCAGAAATGATTTTTCTGGTGAGGTTGACTTCAGA
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140231 AGAATGAAAAATTTTTCAGAAATGATTTTTCTGGTGAGGTTGACTTCAGA
1800 . : . : . : . : . :
1720 GACATTGACTTAACGGATGAAATCCTGACGTATGTCCAAGATTCTTTAAG
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140281 GACATTGACTTAACGGATGAAATCCTGACGTATGTCCAAGATTCTTTAAG
1850 . : . : . : . : . :
1770 TAAGTCTCCCTTCATACCTTCAGATTATCAACAGCAACAGTCCTTGGCTC
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140331 TAAGTCTCCCTTCATACCTTCAGATTATCAACAGCAACAGTCCTTGGCTC
1900 . : . : . : . : . :
1820 TGAACTCAAGCTGTATGGTACAGGAACACCTACATCTAGAACAGCAACAG
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140381 TGAACTCAAGCTGTATGGTACAGGAACACCTACATCTAGAACAGCAACAG
1950 . : . : . : . : . :
1870 CAACATCACCAAAAGCAAGTAGTAGTGGAGCCACAGCAACAGCTGTGTCA
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140431 CAACATCACCAAAAGCAAGTAGTAGTGGAGCCACAGCAACAGCTGTGTCA
2000 . : . : . : . : . :
1920 GAAGATGAAGCACATGCAAGTTAATGGCATGTTTGAAAATTGGAACTCTA
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140481 GAAGATGAAGCACATGCAAGTTAATGGCATGTTTGAAAATTGGAACTCTA
2050 . : . : . : . : . :
1970 ACCAATTCGTGCCTTTCAATTGTCCACAGCAAGACCCACAACAATATAAT
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140531 ACCAATTCGTGCCTTTCAATTGTCCACAGCAAGACCCACAACAATATAAT
2100 . : . : . : . : . :
2020 GTCTTTACAGATTTACATGGGATCAGTCAAGAGTTCCCCTACAAATCTGA
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140581 GTCTTTACAGACTTACATGGGATCAGTCAAGAGTTCCCCTACAAATCTGA
2150 . : . : . : . : . :
2070 AATGGATTCTATGCCTTATACACAGAACTTTATTTCCTGTAATCAGCCTG
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140631 AATGGATTCTATGCCTTATACACAGAACTTTATTTCCTGTAATCAGCCTG
2200 . : . : . : . : . :
2120 TATTACCACAACATTCCAAATGTACAGAGCTGGACTACCCTATGGGGAGT
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140681 TATTACCACAACATTCCAAATGTACAGAGCTGGACTACCCTATGGGGAGT
2250 . : . : . : . : . :
2170 TTTGAACCATCCCCATACCCCACTACTTCTAGTTTAGAAGATTTTGTCAC
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140731 TTTGAACCATCCCCATACCCCACTACTTCTAGTTTAGAAGATTTTGTCAC
2300 . : . : . : . : . :
2220 TTGTTTACAACTTCCTGAAAACCAAAAGCATGGATTAAATCCACAGTCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
140781 TTGTTTACAACTTCCTGAAAACCAAAAGCATGGATTAAATCCACAGTCAG
2350 . : . : . : . : . :
2270 CCATAATAACTCCTCAGACATGTTATGCTGGGGCCGTGTCGATGTATCAG
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140831 CCATAATAACTCCTCAGACATGTTATGCTGGGGCCGTGTCGATGTATCAG
2400 . : . : . : . : . :
2320 TGCCAGCCAGAACCTCAGCACACCCACGTGGGTCAGATGCAGTACAATCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
140881 TGCCAGCCAGAACCTCAGCACACCCACGTGGGTCAGATGCAGTACAATCC
2450 . : . : . : . : . :
2370 AGTACTGCCAGGCCAACAGGCATTTTTAAACAAG TTTCAGA
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140931 AGTACTGCCAGGCCAACAGGCATTTTTAAACAAGGTA...CAGTTTCAGA
2500 . : . : . : . : . :
2411 ATGGAGTTTTAAATGAAACATATCCAGCTGAATTAAATAACATAAATAAC
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143664 ATGGAGTTTTAAATGAAACATATCCAGCTGAATTAAATAACATAAATAAC
2550 . : . : . : . : . :
2461 ACTCAGACTACCACACATCTTCAGCCACTTCATCATCCGTCAGAAGCCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
143714 ACTCAGACTACCACACATCTTCAGCCACTTCATCATCCGTCAGAAGCCAG
2600 . : . : . :
2511 ACCTTTTCCTGATTTGACATCCAGTGGATTCCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||
143764 ACCTTTTCCTGATTTGACATCCAGTGGATTCCTG