seq1 = pF1KB3110.tfa, 891 bp
seq2 = pF1KB3110/gi568815576f_36924216.tfa (gi568815576f:36924216_37129511), 205296 bp

>pF1KB3110 891
>gi568815576f:36924216_37129511 (Chr22)

1-595  (100001-100595)   100% ->
596-891  (105001-105296)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTTCGCCGCAGCTCTGCCGCGCGCTGGTGTCGGCGCAATGGGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTTCGCCGCAGCTCTGCCGCGCGCTGGTGTCGGCGCAATGGGTGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGAGGCGCTGCGGGCCCCGCGCGCTGGGCAGCCTCTGCAGCTGCTGGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGAGGCGCTGCGGGCCCCGCGCGCTGGGCAGCCTCTGCAGCTGCTGGACG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCTCCTGGTACCTGCCGAAGCTGGGGCGCGACGCGCGACGCGAGTTCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCTCCTGGTACCTGCCGAAGCTGGGGCGCGACGCGCGACGCGAGTTCGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GAGCGCCACATCCCGGGCGCCGCTTTCTTCGACATCGACCAGTGCAGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GAGCGCCACATCCCGGGCGCCGCTTTCTTCGACATCGACCAGTGCAGCGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCGCACCTCGCCCTACGACCACATGCTGCCCGGGGCCGAGCATTTCGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCGCACCTCGCCCTACGACCACATGCTGCCCGGGGCCGAGCATTTCGCGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGTACGCAGGCCGCCTGGGCGTGGGCGCGGCCACCCACGTCGTGATCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 AGTACGCAGGCCGCCTGGGCGTGGGCGCGGCCACCCACGTCGTGATCTAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GACGCCAGCGACCAGGGCCTCTACTCCGCCCCGCGCGTCTGGTGGATGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GACGCCAGCGACCAGGGCCTCTACTCCGCCCCGCGCGTCTGGTGGATGTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CCGCGCCTTCGGCCACCACGCCGTGTCACTGCTTGATGGCGGCCTCCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CCGCGCCTTCGGCCACCACGCCGTGTCACTGCTTGATGGCGGCCTCCGCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ACTGGCTGCGCCAGAACCTCCCGCTCAGCTCCGGCAAGAGCCAACCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 ACTGGCTGCGCCAGAACCTCCCGCTCAGCTCCGGCAAGAGCCAACCTGCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CCCGCCGAGTTCCGCGCTCAGCTCGACCCCGCCTTCATCAAGACCTACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CCCGCCGAGTTCCGCGCTCAGCTCGACCCCGCCTTCATCAAGACCTACGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GGACATCAAGGAGAACCTGGAATCCCGGCGCTTCCAGGTGGTGGACTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GGACATCAAGGAGAACCTGGAATCCCGGCGCTTCCAGGTGGTGGACTCCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GAGCCACTGGCAGGTTCCGCGGCACCGAGCCCGAGCCCCGAGACG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 100551 GAGCCACTGGCAGGTTCCGCGGCACCGAGCCCGAGCCCCGAGACGGTA..

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    596     GCATTGAACCTGGCCACATCCCAGGTACCGTGAACATCCCCTTCAC
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 .TAGGCATTGAACCTGGCCACATCCCAGGTACCGTGAACATCCCCTTCAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 AGACTTCCTGAGCCAGGAGGGGCTGGAGAAGAGCCCTGAGGAGATCCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105047 AGACTTCCTGAGCCAGGAGGGGCTGGAGAAGAGCCCTGAGGAGATCCGCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 ATCTGTTCCAGGAGAAGAAAGTGGACCTGTCTAAGCCACTGGTGGCCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105097 ATCTGTTCCAGGAGAAGAAAGTGGACCTGTCTAAGCCACTGGTGGCCACG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 TGTGGCTCTGGCGTCACAGCCTGCCACGTGGCACTAGGGGCCTACCTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105147 TGTGGCTCTGGCGTCACAGCCTGCCACGTGGCACTAGGGGCCTACCTCTG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 CGGCAAGCCAGACGTGCCCATCTACGATGGCTCCTGGGTGGAGTGGTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105197 CGGCAAGCCAGACGTGCCCATCTACGATGGCTCCTGGGTGGAGTGGTACA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 TGCGCGCCCGGCCCGAGGATGTCATCTCAGAGGGCCGGGGGAAGACCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105247 TGCGCGCCCGGCCCGAGGATGTCATCTCAGAGGGCCGGGGGAAGACCCAC