seq1 = pF1KB3092.tfa, 2148 bp
seq2 = pF1KB3092/gi568815588r_27011980.tfa (gi568815588r:27011980_27249042), 237063 bp

>pF1KB3092 2148
>gi568815588r:27011980_27249042 (Chr10)

(complement)

1-33  (94833-94865)   100% ->
34-168  (100003-100137)   100% ->
169-331  (103453-103615)   100% ->
332-430  (106558-106656)   100% ->
431-540  (112658-112767)   100% ->
541-691  (114062-114212)   100% ->
692-775  (114921-115004)   100% ->
776-858  (117102-117184)   100% ->
859-949  (122257-122347)   100% ->
950-1102  (125344-125496)   100% ->
1103-1235  (126070-126202)   100% ->
1236-1298  (127595-127657)   100% ->
1299-1411  (128496-128608)   100% ->
1412-1567  (129594-129749)   100% ->
1568-1719  (131316-131467)   100% ->
1720-1846  (132698-132824)   100% ->
1847-1920  (132910-132983)   100% ->
1921-2007  (134436-134522)   100% ->
2008-2148  (136923-137063)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTTTTCCTTGTCGAGCACGGTGCAACCCCAG         GTTACAGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
  94833 ATGTTTTCCTTGTCGAGCACGGTGCAACCCCAGGTA...TAGGTTACAGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 TCCTCTGAGTCATCTCATCAATGCCTTCCATACACCAAAAAACACTTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100011 TCCTCTGAGTCATCTCATCAATGCCTTCCATACACCAAAAAACACTTCTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TTTCTCTCAGTGGAGTGTCAGTTTCTCAAAACCAGCATCGAGATGTAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100061 TTTCTCTCAGTGGAGTGTCAGTTTCTCAAAACCAGCATCGAGATGTAGTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CCTGAGCATGAGGCTCCCAGCAGTGAG         CCTTCACTTAACTT
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 100111 CCTGAGCATGAGGCTCCCAGCAGTGAGGTA...CAGCCTTCACTTAACTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 AAGGGACCTTGGATTATCTGAACTAAAAATTGGACAGATTGATCAGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103467 AAGGGACCTTGGATTATCTGAACTAAAAATTGGACAGATTGATCAGCTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TAGAAAATCTACTTCCTGGATTTTGTAAAGGCAAAAACATTTCTTCCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103517 TAGAAAATCTACTTCCTGGATTTTGTAAAGGCAAAAACATTTCTTCCCAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TGGCATACATCCCATGTCTCTGCACAATCCTTCTTTGAAAATAAATATG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 103567 TGGCATACATCCCATGTCTCTGCACAATCCTTCTTTGAAAATAAATATGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    332         GTAACTTAGATATATTTAGTACATTACGTTCCTCTTGCTTGT
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103617 TA...CAGGTAACTTAGATATATTTAGTACATTACGTTCCTCTTGCTTGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 ATCGACATCATTCAAGAGCTCTTCAAAGCATTTGTTCAGATCTTCAGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106600 ATCGACATCATTCAAGAGCTCTTCAAAGCATTTGTTCAGATCTTCAGTAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 TGGCCAG         TTTTCATACAGTCTCGGGGTTTTAAAACTTTGAA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106650 TGGCCAGGTA...TAGTTTTCATACAGTCTCGGGGTTTTAAAACTTTGAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 ATCAAGGACACGACGTCTCCAGTCTACCTCCGAGAGATTAGCTGAAACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112692 ATCAAGGACACGACGTCTCCAGTCTACCTCCGAGAGATTAGCTGAAACAC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 AGAATATAGCGCCATCATTCGTGAAG         GGGTTTCTTTTGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 112742 AGAATATAGCGCCATCATTCGTGAAGGTA...CAGGGGTTTCTTTTGCGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 GACAGAGGATCAGATGTTGAGAGTTTGGACAAACTCATGAAAACCAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114077 GACAGAGGATCAGATGTTGAGAGTTTGGACAAACTCATGAAAACCAAAAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 TATACCTGAAGCTCACCAAGATGCATTTAAAACTGGTTTTGCGGAAGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114127 TATACCTGAAGCTCACCAAGATGCATTTAAAACTGGTTTTGCGGAAGGTT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 TTCTGAAAGCTCAAGCACTCACACAAAAAACCAATG         ATTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 114177 TTCTGAAAGCTCAAGCACTCACACAAAAAACCAATGGTA...TAGATTCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 CTAAGGCGAACCCGTCTGATTCTCTTCGTTCTGCTGCTATTCGGCATTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114926 CTAAGGCGAACCCGTCTGATTCTCTTCGTTCTGCTGCTATTCGGCATTTA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 TGGACTTCTAAAAAACCCATTTTTATCTG         TCCGCTTCCGGA
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 114976 TGGACTTCTAAAAAACCCATTTTTATCTGGTA...TAGTCCGCTTCCGGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 CAACAACAGGGCTTGATTCTGCAGTAGATCCTGTCCAGATGAAAAATGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117114 CAACAACAGGGCTTGATTCTGCAGTAGATCCTGTCCAGATGAAAAATGTC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 ACCTTTGAACATGTTAAAGGG         GTGGAGGAAGCTAAACAAGA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 117164 ACCTTTGAACATGTTAAAGGGGTA...TAGGTGGAGGAAGCTAAACAAGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 ATTACAGGAAGTTGTTGAATTCTTGAAAAATCCACAAAAATTTACTATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122277 ATTACAGGAAGTTGTTGAATTCTTGAAAAATCCACAAAAATTTACTATTC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 TTGGAGGTAAACTTCCAAAAG         GAATTCTTTTAGTTGGACCC
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 122327 TTGGAGGTAAACTTCCAAAAGGTA...TAGGAATTCTTTTAGTTGGACCC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 CCAGGGACTGGAAAGACACTTCTTGCCCGAGCTGTGGCGGGAGAAGCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125364 CCAGGGACTGGAAAGACACTTCTTGCCCGAGCTGTGGCGGGAGAAGCTGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 TGTTCCTTTTTATTATGCTTCTGGATCCGAATTTGATGAGATGTTTGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125414 TGTTCCTTTTTATTATGCTTCTGGATCCGAATTTGATGAGATGTTTGTGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 GTGTGGGAGCCAGCCGTATCAGAAATCTTTTTA         GGGAAGCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 125464 GTGTGGGAGCCAGCCGTATCAGAAATCTTTTTAGTA...TAGGGGAAGCA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1111 AAGGCGAATGCTCCTTGTGTTATATTTATTGATGAATTAGATTCTGTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126078 AAGGCGAATGCTCCTTGTGTTATATTTATTGATGAATTAGATTCTGTTGG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1161 TGGGAAGAGAATTGAATCTCCAATGCATCCATATTCAAGGCAGACCATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126128 TGGGAAGAGAATTGAATCTCCAATGCATCCATATTCAAGGCAGACCATAA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 ATCAACTTCTTGCTGAAATGGATGG         TTTTAAACCCAATGAA
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 126178 ATCAACTTCTTGCTGAAATGGATGGGTA...TAGTTTTAAACCCAATGAA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1252 GGAGTTATCATAATAGGAGCCACAAACTTCCCAGAGGCATTAGATAA   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 127611 GGAGTTATCATAATAGGAGCCACAAACTTCCCAGAGGCATTAGATAAGTA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1299       TGCCTTAATACGTCCTGGTCGTTTTGACATGCAAGTTACAGTTC
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127661 ...TAGTGCCTTAATACGTCCTGGTCGTTTTGACATGCAAGTTACAGTTC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1343 CAAGGCCAGATGTAAAAGGTCGAACAGAAATTTTGAAATGGTATCTCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128540 CAAGGCCAGATGTAAAAGGTCGAACAGAAATTTTGAAATGGTATCTCAAT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1393 AAAATAAAGTTTGATCAAT         CCGTTGATCCAGAAATTATAGC
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 128590 AAAATAAAGTTTGATCAATGTA...TAGCCGTTGATCCAGAAATTATAGC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1434 TCGAGGTACTGTTGGCTTTTCCGGAGCAGAGTTGGAGAATCTTGTGAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129616 TCGAGGTACTGTTGGCTTTTCCGGAGCAGAGTTGGAGAATCTTGTGAACC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1484 AGGCTGCATTAAAAGCAGCTGTTGATGGAAAAGAAATGGTTACCATGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129666 AGGCTGCATTAAAAGCAGCTGTTGATGGAAAAGAAATGGTTACCATGAAG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1534 GAGCTGGAGTTTTCCAAAGACAAAATTCTAATGG         GGCCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 129716 GAGCTGGAGTTTTCCAAAGACAAAATTCTAATGGGTA...TAGGGCCTGA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1575 AAGAAGAAGTGTGGAAATTGATAACAAAAACAAAACCATCACAGCATATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131323 AAGAAGAAGTGTGGAAATTGATAACAAAAACAAAACCATCACAGCATATC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1625 ATGAATCTGGTCATGCCATTATTGCATATTACACAAAAGATGCAATGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131373 ATGAATCTGGTCATGCCATTATTGCATATTACACAAAAGATGCAATGCCT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1675 ATCAACAAAGCTACAATCATGCCACGGGGGCCAACACTTGGACAT     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 131423 ATCAACAAAGCTACAATCATGCCACGGGGGCCAACACTTGGACATGTA..

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1720     GTGTCCCTGTTACCTGAGAATGACAGATGGAATGAAACTAGAGCCC
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131473 .TAGGTGTCCCTGTTACCTGAGAATGACAGATGGAATGAAACTAGAGCCC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1766 AGCTGCTTGCACAAATGGATGTTAGTATGGGAGGAAGAGTGGCAGAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132744 AGCTGCTTGCACAAATGGATGTTAGTATGGGAGGAAGAGTGGCAGAGGAG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1816 CTTATATTTGGAACCGACCATATTACAACAG         GTGCTTCCAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 132794 CTTATATTTGGAACCGACCATATTACAACAGGTT...TAGGTGCTTCCAG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1857 TGATTTTGATAATGCCACTAAAATAGCAAAGCGGATGGTTACCAAATTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132920 TGATTTTGATAATGCCACTAAAATAGCAAAGCGGATGGTTACCAAATTTG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1907 GAATGAGTGAAAAG         CTTGGAGTTATGACCTACAGTGATACA
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 132970 GAATGAGTGAAAAGGTA...TAGCTTGGAGTTATGACCTACAGTGATACA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1948 GGGAAACTAAGTCCAGAAACCCAATCTGCCATCGAACAAGAAATAAGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134463 GGGAAACTAAGTCCAGAAACCCAATCTGCCATCGAACAAGAAATAAGAAT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1998 CCTTCTAAGG         GACTCATATGAACGAGCAAAACATATCTTGA
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 134513 CCTTCTAAGGGTA...CAGGACTCATATGAACGAGCAAAACATATCTTGA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2039 AAACTCATGCAAAGGAGCATAAGAATCTCGCAGAAGCTTTATTGACCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136954 AAACTCATGCAAAGGAGCATAAGAATCTCGCAGAAGCTTTATTGACCTAT

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2089 GAGACTTTGGATGCCAAAGAGATTCAAATTGTTCTTGAGGGGAAAAAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137004 GAGACTTTGGATGCCAAAGAGATTCAAATTGTTCTTGAGGGGAAAAAGTT

   2300     .    :
   2139 GGAAGTGAGA
        ||||||||||
 137054 GGAAGTGAGA