seq1 = pF1KB3065.tfa, 1416 bp
seq2 = pF1KB3065/gi568815592r_88043859.tfa (gi568815592r:88043859_88245274), 201416 bp

>pF1KB3065 1416
>gi568815592r:88043859_88245274 (Chr6)

(complement)

1-1416  (100001-101416)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAGTCGATCCTAGATGGCCTTGCAGATACCACCTTCCGCACCATCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAGTCGATCCTAGATGGCCTTGCAGATACCACCTTCCGCACCATCAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CACTGACCTCCTGTACGTGGGCTCAAATGACATTCAGTACGAAGACATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CACTGACCTCCTGTACGTGGGCTCAAATGACATTCAGTACGAAGACATCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AAGGTGACATGGCATCCAAATTAGGGTACTTCCCACAGAAATTCCCTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AAGGTGACATGGCATCCAAATTAGGGTACTTCCCACAGAAATTCCCTTTA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ACTTCCTTTAGGGGAAGTCCCTTCCAAGAGAAGATGACTGCGGGAGACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ACTTCCTTTAGGGGAAGTCCCTTCCAAGAGAAGATGACTGCGGGAGACAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCCCCAGCTAGTCCCAGCAGACCAGGTGAACATTACAGAATTTTACAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCCCCAGCTAGTCCCAGCAGACCAGGTGAACATTACAGAATTTTACAACA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGTCTCTCTCGTCCTTCAAGGAGAATGAGGAGAACATCCAGTGTGGGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 AGTCTCTCTCGTCCTTCAAGGAGAATGAGGAGAACATCCAGTGTGGGGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AACTTCATGGACATAGAGTGTTTCATGGTCCTGAACCCCAGCCAGCAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 AACTTCATGGACATAGAGTGTTTCATGGTCCTGAACCCCAGCCAGCAGCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GGCCATTGCAGTCCTGTCCCTCACGCTGGGCACCTTCACGGTCCTGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GGCCATTGCAGTCCTGTCCCTCACGCTGGGCACCTTCACGGTCCTGGAGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ACCTCCTGGTGCTGTGCGTCATCCTCCACTCCCGCAGCCTCCGCTGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 ACCTCCTGGTGCTGTGCGTCATCCTCCACTCCCGCAGCCTCCGCTGCAGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CCTTCCTACCACTTCATCGGCAGCCTGGCGGTGGCAGACCTCCTGGGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CCTTCCTACCACTTCATCGGCAGCCTGGCGGTGGCAGACCTCCTGGGGAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TGTCATTTTTGTCTACAGCTTCATTGACTTCCACGTGTTCCACCGCAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TGTCATTTTTGTCTACAGCTTCATTGACTTCCACGTGTTCCACCGCAAAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 ATAGCCGCAACGTGTTTCTGTTCAAACTGGGTGGGGTCACGGCCTCCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 ATAGCCGCAACGTGTTTCTGTTCAAACTGGGTGGGGTCACGGCCTCCTTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ACTGCCTCCGTGGGCAGCCTGTTCCTCACAGCCATCGACAGGTACATATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 ACTGCCTCCGTGGGCAGCCTGTTCCTCACAGCCATCGACAGGTACATATC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CATTCACAGGCCCCTGGCCTATAAGAGGATTGTCACCAGGCCCAAGGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CATTCACAGGCCCCTGGCCTATAAGAGGATTGTCACCAGGCCCAAGGCCG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TGGTGGCGTTTTGCCTGATGTGGACCATAGCCATTGTGATCGCCGTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TGGTGGCGTTTTGCCTGATGTGGACCATAGCCATTGTGATCGCCGTGCTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CCTCTCCTGGGCTGGAACTGCGAGAAACTGCAATCTGTTTGCTCAGACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 CCTCTCCTGGGCTGGAACTGCGAGAAACTGCAATCTGTTTGCTCAGACAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TTTCCCACACATTGATGAAACCTACCTGATGTTCTGGATCGGGGTCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TTTCCCACACATTGATGAAACCTACCTGATGTTCTGGATCGGGGTCACCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 GCGTACTGCTTCTGTTCATCGTGTATGCGTACATGTATATTCTCTGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 GCGTACTGCTTCTGTTCATCGTGTATGCGTACATGTATATTCTCTGGAAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 GCTCACAGCCACGCCGTCCGCATGATTCAGCGTGGCACCCAGAAGAGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 GCTCACAGCCACGCCGTCCGCATGATTCAGCGTGGCACCCAGAAGAGCAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 CATCATCCACACGTCTGAGGATGGGAAGGTACAGGTGACCCGGCCAGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 CATCATCCACACGTCTGAGGATGGGAAGGTACAGGTGACCCGGCCAGACC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 AAGCCCGCATGGACATTAGGTTAGCCAAGACCCTGGTCCTGATCCTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 AAGCCCGCATGGACATTAGGTTAGCCAAGACCCTGGTCCTGATCCTGGTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 GTGTTGATCATCTGCTGGGGCCCTCTGCTTGCAATCATGGTGTATGATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 GTGTTGATCATCTGCTGGGGCCCTCTGCTTGCAATCATGGTGTATGATGT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 CTTTGGGAAGATGAACAAGCTCATTAAGACGGTGTTTGCATTCTGCAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 CTTTGGGAAGATGAACAAGCTCATTAAGACGGTGTTTGCATTCTGCAGTA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 TGCTCTGCCTGCTGAACTCCACCGTGAACCCCATCATCTATGCTCTGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 TGCTCTGCCTGCTGAACTCCACCGTGAACCCCATCATCTATGCTCTGAGG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 AGTAAGGACCTGCGACACGCTTTCCGGAGCATGTTTCCCTCTTGTGAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 AGTAAGGACCTGCGACACGCTTTCCGGAGCATGTTTCCCTCTTGTGAAGG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 CACTGCGCAGCCTCTGGATAACAGCATGGGGGACTCGGACTGCCTGCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 CACTGCGCAGCCTCTGGATAACAGCATGGGGGACTCGGACTGCCTGCACA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 AACACGCAAACAATGCAGCCAGTGTTCACAGGGCCGCAGAAAGCTGCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 AACACGCAAACAATGCAGCCAGTGTTCACAGGGCCGCAGAAAGCTGCATC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 AAGAGCACGGTCAAGATTGCCAAGGTAACCATGTCTGTGTCCACAGACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 AAGAGCACGGTCAAGATTGCCAAGGTAACCATGTCTGTGTCCACAGACAC

   1400     .    :    .
   1401 GTCTGCCGAGGCTCTG
        ||||||||||||||||
 101401 GTCTGCCGAGGCTCTG