seq1 = pF1KB3060.tfa, 1878 bp
seq2 = pF1KB3060/gi568815591r_135581566.tfa (gi568815591r:135581566_135827496), 245931 bp

>pF1KB3060 1878
>gi568815591r:135581566_135827496 (Chr7)

(complement)

1-99  (100001-100099)   100% ->
100-228  (105974-106102)   100% ->
229-365  (119247-119383)   100% ->
366-538  (121197-121369)   100% ->
539-593  (121847-121901)   100% ->
594-630  (124616-124652)   100% ->
631-711  (125737-125817)   100% ->
712-896  (127949-128133)   99% ->
897-1016  (132010-132129)   100% ->
1017-1118  (133259-133360)   100% ->
1119-1220  (135073-135174)   100% ->
1221-1318  (135852-135949)   100% ->
1319-1443  (136172-136296)   100% ->
1444-1605  (141814-141975)   100% ->
1606-1743  (143236-143373)   100% ->
1744-1878  (145797-145931)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGCCTGCTGCAGGGCCTGCTCCGAGTCCGGAAGCTGCTGCTGGTCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGCCTGCTGCAGGGCCTGCTCCGAGTCCGGAAGCTGCTGCTGGTCGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTGCGTCCCGCTCCTGCTGCTGCCTCTGCCCGTCCTCCACCCCAGCAGC 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 100051 CTGCGTCCCGCTCCTGCTGCTGCCTCTGCCCGTCCTCCACCCCAGCAGCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    100         GAGGCCTCGTGTGCTTACGTGCTGATCGTGACTGCTGTGTAC
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TG...CAGGAGGCCTCGTGTGCTTACGTGCTGATCGTGACTGCTGTGTAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TGGGTGTCGGAGGCAGTGCCTCTGGGAGCTGCAGCCCTGGTGCCGGCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106016 TGGGTGTCGGAGGCAGTGCCTCTGGGAGCTGCAGCCCTGGTGCCGGCCTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CCTTTACCCGTTCTTCGGAGTCCTCCGGTCCAATGAG         GTGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 106066 CCTTTACCCGTTCTTCGGAGTCCTCCGGTCCAATGAGGTT...CAGGTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CGGCGGAGTACTTCAAGAACACCACGCTGCTGCTGGTGGGGGTCATCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119251 CGGCGGAGTACTTCAAGAACACCACGCTGCTGCTGGTGGGGGTCATCTGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GTGGCGGCTGCCGTGGAGAAGTGGAACCTGCATAAGCGCATTGCTCTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119301 GTGGCGGCTGCCGTGGAGAAGTGGAACCTGCATAAGCGCATTGCTCTGCG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CATGGTCTTGATGGCCGGAGCCAAGCCGGGCAT         GCTGCTGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 119351 CATGGTCTTGATGGCCGGAGCCAAGCCGGGCATGTA...CAGGCTGCTGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TCTGCTTCATGTGCTGTACCACGTTGCTGTCCATGTGGCTGTCCAACACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121205 TCTGCTTCATGTGCTGTACCACGTTGCTGTCCATGTGGCTGTCCAACACC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 TCCACCACCGCCATGGTGATGCCCATCGTGGAGGCCGTGCTGCAGGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121255 TCCACCACCGCCATGGTGATGCCCATCGTGGAGGCCGTGCTGCAGGAGCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GGTCAGTGCTGAGGACGAGCAGCTCGTGGCGGGCAACTCCAACACCGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121305 GGTCAGTGCTGAGGACGAGCAGCTCGTGGCGGGCAACTCCAACACCGAAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 AGGCCGAACCCATCA         GTCTGGATGTAAAGAACAGCCAACCT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 121355 AGGCCGAACCCATCAGTA...TAGGTCTGGATGTAAAGAACAGCCAACCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 TCTCTGGAACTCATCTTTGTCAATGAAGA         GTCCAACGCAGA
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 121873 TCTCTGGAACTCATCTTTGTCAATGAAGAGTG...CAGGTCCAACGCAGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 CCTCACCACTCTGATGCACAACGAG         AACCTGAATGGTGTGC
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 124628 CCTCACCACTCTGATGCACAACGAGGTA...CAGAACCTGAATGGTGTGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 CCTCGATCACCAACCCCATCAAAACTGCAAACCAACACCAGGGCAAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125753 CCTCGATCACCAACCCCATCAAAACTGCAAACCAACACCAGGGCAAGAAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 CAACACCCATCCCAG         GAAAAGCCACAAGTCCTGACCCGCAG
        |||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||| |||
 125803 CAACACCCATCCCAGGTA...TAGGAAAAGCCACAAGTCCTGACCCCCAG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 CCCCAGGAAGCAGAAGCTGAACAGAAAGTACAGGTCCCACCATGACCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127975 CCCCAGGAAGCAGAAGCTGAACAGAAAGTACAGGTCCCACCATGACCAGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 TGATCTGCAAGTGCCTCTCCCTGAGCATATCCTACTCCGCTACCATTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128025 TGATCTGCAAGTGCCTCTCCCTGAGCATATCCTACTCCGCTACCATTGGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 GGCCTGACCACCATCATCGGCACCTCCACCAGCCTCATCTTCCTGGAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128075 GGCCTGACCACCATCATCGGCACCTCCACCAGCCTCATCTTCCTGGAACA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 CTTCAACAA         CCAGTATCCAGCCGCAGAGGTGGTGAACTTTG
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 128125 CTTCAACAAGTA...CAGCCAGTATCCAGCCGCAGAGGTGGTGAACTTTG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 GCACCTGGTTCCTCTTCAGCTTCCCCATATCCCTCATCATGCTGGTGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132042 GCACCTGGTTCCTCTTCAGCTTCCCCATATCCCTCATCATGCTGGTGGTC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 AGCTGGTTCTGGATGCACTGGCTGTTCCTGGGCTGCAA         TTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 132092 AGCTGGTTCTGGATGCACTGGCTGTTCCTGGGCTGCAAGTG...CAGTTT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 TAAAGAGACCTGCTCTCTGAGCAAGAAGAAGAAGACCAAAAGGGAACAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133262 TAAAGAGACCTGCTCTCTGAGCAAGAAGAAGAAGACCAAAAGGGAACAGT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 TGTCAGAGAAGAGGATCCAAGAAGAATATGAAAAACTGGGAGACATTAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 133312 TGTCAGAGAAGAGGATCCAAGAAGAATATGAAAAACTGGGAGACATTAGG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1119         CTACCCAGAAATGGTGACTGGATTTTTCTTCATCCTGATGAC
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133362 TA...TAGCTACCCAGAAATGGTGACTGGATTTTTCTTCATCCTGATGAC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1161 CGTACTGTGGTTTACCCGGGAGCCTGGCTTTGTCCCTGGCTGGGATTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135115 CGTACTGTGGTTTACCCGGGAGCCTGGCTTTGTCCCTGGCTGGGATTCTT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 TCTTTGAAAA         GAAAGGCTACCGTACTGATGCCACAGTCTCT
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 135165 TCTTTGAAAAGTA...TAGGAAAGGCTACCGTACTGATGCCACAGTCTCT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1252 GTCTTCCTTGGCTTCCTCCTCTTCCTCATTCCAGCGAAGAAGCCCTGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135883 GTCTTCCTTGGCTTCCTCCTCTTCCTCATTCCAGCGAAGAAGCCCTGCTT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1302 TGGGAAAAAGAATGATG         GAGAGAACCAGGAGCACTCACTGG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 135933 TGGGAAAAAGAATGATGGTG...CAGGAGAGAACCAGGAGCACTCACTGG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1343 GGACCGAGCCCATCATCACGTGGAAGGACTTCCAGAAGACCATGCCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136196 GGACCGAGCCCATCATCACGTGGAAGGACTTCCAGAAGACCATGCCCTGG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1393 GAGATTGTCATTCTGGTTGGGGGAGGCTATGCTCTGGCTTCTGGTAGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136246 GAGATTGTCATTCTGGTTGGGGGAGGCTATGCTCTGGCTTCTGGTAGCAA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1443 G         AGCTCTGGCCTCTCTACATGGATTGGGAACCAGATGTTGT
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136296 GGTA...CAGAGCTCTGGCCTCTCTACATGGATTGGGAACCAGATGTTGT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1484 CCCTGAGCAGCCTCCCACCGTGGGCTGTCACCCTGCTGGCATGCATCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141854 CCCTGAGCAGCCTCCCACCGTGGGCTGTCACCCTGCTGGCATGCATCCTC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1534 GTGTCCATTGTCACTGAGTTTGTGAGCAACCCAGCAACCATCACCATCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141904 GTGTCCATTGTCACTGAGTTTGTGAGCAACCCAGCAACCATCACCATCTT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1584 CCTGCCCATCCTGTGCAGCCTG         TCTGAAACGCTGCACATTA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 141954 CCTGCCCATCCTGTGCAGCCTGGTG...TAGTCTGAAACGCTGCACATTA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1625 ACCCCCTCTACACCCTGATCCCAGTCACCATGTGCATCTCCTTTGCAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143255 ACCCCCTCTACACCCTGATCCCAGTCACCATGTGCATCTCCTTTGCAGTG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1675 ATGCTGCCTGTGGGCAATCCCCCTAATGCCATCGTCTTCAGCTATGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143305 ATGCTGCCTGTGGGCAATCCCCCTAATGCCATCGTCTTCAGCTATGGGCA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1725 CTGCCAGATCAAAGATATG         GTGAAAGCTGGCCTGGGAGTCA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 143355 CTGCCAGATCAAAGATATGGTG...CAGGTGAAAGCTGGCCTGGGAGTCA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1766 ACGTTATTGGACTGGTGATAGTAATGGTGGCCATCAACACCTGGGGAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145819 ACGTTATTGGACTGGTGATAGTAATGGTGGCCATCAACACCTGGGGAGTT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1816 AGCCTCTTCCACCTGGACACTTACCCAGCATGGGCGAGGGTCAGCAACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145869 AGCCTCTTCCACCTGGACACTTACCCAGCATGGGCGAGGGTCAGCAACAT

   2000     .    :
   1866 CACTGATCAAGCC
        |||||||||||||
 145919 CACTGATCAAGCC