Result of SIM4 for
pF1KB3047
seq1 = pF1KB3047.tfa, 3441 bp
seq2 = pF1KB3047/gi568815594r_39189852.tfa (gi568815594r:39189852_39451477), 261626 bp
>pF1KB3047 3441
>gi568815594r:39189852_39451477 (Chr4)
(complement)
1-132 (100000-100130) 99% ->
133-208 (106002-106077) 100% ->
209-331 (109011-109133) 100% ->
332-564 (123722-123954) 100% ->
565-642 (124838-124915) 100% ->
643-720 (128061-128138) 100% ->
721-808 (130104-130191) 100% ->
809-1095 (130809-131095) 100% ->
1096-1203 (134456-134563) 100% ->
1204-1383 (138547-138726) 100% ->
1384-1488 (139929-140033) 100% ->
1489-1885 (142446-142842) 100% ->
1886-1995 (144777-144886) 100% ->
1996-2110 (146550-146664) 100% ->
2111-2202 (148327-148418) 100% ->
2203-2340 (148604-148741) 100% ->
2341-2436 (148883-148978) 100% ->
2437-2535 (149102-149200) 100% ->
2536-2690 (151064-151218) 99% ->
2691-2808 (151340-151457) 100% ->
2809-2954 (155719-155864) 100% ->
2955-3168 (159626-159839) 100% ->
3169-3360 (161439-161630) 100% ->
3361-3441 (162634-162714) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGGACATTCGGAAATTCTTTGGAGTAATACCAAGTGGAAAGAAACTTGT
|-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100000 A GGACATTCGGAAATTCTTTGGAGTAATACCAAGTGGAAAGAAACTTGT
50 . : . : . : . : . :
51 AAGTGAAACAGTAAAGAAGAATGAGAAAACAAAGTCTGATGAAGAAACTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100049 AAGTGAAACAGTAAAGAAGAATGAGAAAACAAAGTCTGATGAAGAAACTT
100 . : . : . : . : . :
101 TAAAAGCAAAGAAAGGAATAAAGGAAATCAAG GTAAATAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
100099 TAAAAGCAAAGAAAGGAATAAAGGAAATCAAGGTT...TAGGTAAATAGC
150 . : . : . : . : . :
142 TCCCGTAAAGAGGATGACTTCAAACAAAAGCAACCAAGCAAGAAAAAGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106011 TCCCGTAAAGAGGATGACTTCAAACAAAAGCAACCAAGCAAGAAAAAGAG
200 . : . : . : . : . :
192 GATCATCTATGATTCAG ATTCAGAGTCAGAGGAGACGTTGC
|||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
106061 GATCATCTATGATTCAGGTA...CAGATTCAGAGTCAGAGGAGACGTTGC
250 . : . : . : . : . :
233 AGGTAAAAAATGCCAAAAAGCCACCAGAAAAACTGCCAGTATCTTCTAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
109035 AGGTAAAAAATGCCAAAAAGCCACCAGAAAAACTGCCAGTATCTTCTAAA
300 . : . : . : . : . :
283 CCTGGTAAAATTTCACGGCAGGATCCTGTTACATACATTTCAGAAACAG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
109085 CCTGGTAAAATTTCACGGCAGGATCCTGTTACATACATTTCAGAAACAGG
350 . : . : . : . : . :
332 ATGAAGAAGATGACTTTATGTGTAAGAAGGCGGCCTCTAAAT
>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
109135 TA...AAGATGAAGAAGATGACTTTATGTGTAAGAAGGCGGCCTCTAAAT
400 . : . : . : . : . :
374 CAAAAGAGAATGGAAGATCTACAAATAGTCATCTTGGAACATCAAACATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
123764 CAAAAGAGAATGGAAGATCTACAAATAGTCATCTTGGAACATCAAACATG
450 . : . : . : . : . :
424 AAAAAGAATGAAGAAAACACTAAGACCAAGAATAAGCCTTTATCACCAAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
123814 AAAAAGAATGAAGAAAACACTAAGACCAAGAATAAGCCTTTATCACCAAT
500 . : . : . : . : . :
474 AAAACTTACACCCACATCAGTACTTGATTATTTTGGAACTGGAAGTGTCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
123864 AAAACTTACACCCACATCAGTACTTGATTATTTTGGAACTGGAAGTGTCC
550 . : . : . : . : . :
524 AAAGATCTAATAAGAAGATGGTGGCAAGCAAAAGAAAAGAG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
123914 AAAGATCTAATAAGAAGATGGTGGCAAGCAAAAGAAAAGAGGTA...TAG
600 . : . : . : . : . :
565 CTTTCACAAAATACAGATGAGTCTGGATTAAATGATGAAGCCATCGCCAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
124838 CTTTCACAAAATACAGATGAGTCTGGATTAAATGATGAAGCCATCGCCAA
650 . : . : . : . : . :
615 GCAATTACAGCTTGATGAAGATGCGGAG CTGGAGAGGCAGT
||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
124888 GCAATTACAGCTTGATGAAGATGCGGAGGTA...CAGCTGGAGAGGCAGT
700 . : . : . : . : . :
656 TGCATGAAGATGAAGAGTTTGCCAGAACATTAGCCATGTTGGATGAAGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
128074 TGCATGAAGATGAAGAGTTTGCCAGAACATTAGCCATGTTGGATGAAGAA
750 . : . : . : . : . :
706 CCCAAGACCAAAAAG GCTCGAAAGGACACAGAAGCGGGAGA
|||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
128124 CCCAAGACCAAAAAGGTG...TAGGCTCGAAAGGACACAGAAGCGGGAGA
800 . : . : . : . : . :
747 AACGTTTTCATCTGTCCAAGCCAATTTAAGTAAAGCAGAAAAACATAAAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
130130 AACGTTTTCATCTGTCCAAGCCAATTTAAGTAAAGCAGAAAAACATAAAT
850 . : . : . : . : . :
797 ATCCTCATAAAG TAAAAACAGCACAAGTTTCAGATGAAAGA
||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
130180 ATCCTCATAAAGGTA...TAGTAAAAACAGCACAAGTTTCAGATGAAAGA
900 . : . : . : . : . :
838 AAGAGCTACAGTCCTAGGAAGCAAAGTAAATATGAAAGTTCAAAAGAATC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
130838 AAGAGCTACAGTCCTAGGAAGCAAAGTAAATATGAAAGTTCAAAAGAATC
950 . : . : . : . : . :
888 TCAGCAACATTCCAAGTCATCAGCTGACAAAATAGGAGAAGTCTCTTCTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
130888 TCAGCAACATTCCAAGTCATCAGCTGACAAAATAGGAGAAGTCTCTTCTC
1000 . : . : . : . : . :
938 CCAAGGCCAGTTCTAAGCTGGCAATTATGAAAAGAAAAGAAGAGAGCTCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
130938 CCAAGGCCAGTTCTAAGCTGGCAATTATGAAAAGAAAAGAAGAGAGCTCT
1050 . : . : . : . : . :
988 TATAAAGAAATAGAGCCTGTGGCCTCAAAAAGAAAAGAAAATGCCATTAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
130988 TATAAAGAAATAGAGCCTGTGGCCTCAAAAAGAAAAGAAAATGCCATTAA
1100 . : . : . : . : . :
1038 ATTGAAAGGAGAGACAAAAACTCCTAAGAAAACCAAAAGTTCTCCAGCTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
131038 ATTGAAAGGAGAGACAAAAACTCCTAAGAAAACCAAAAGTTCTCCAGCTA
1150 . : . : . : . : . :
1088 AAAAAGAG TCTGTAAGTCCTGAAGATTCTGAAAAGAAACGC
||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
131088 AAAAAGAGGTA...AAGTCTGTAAGTCCTGAAGATTCTGAAAAGAAACGC
1200 . : . : . : . : . :
1129 ACTAATTATCAAGCTTATCGAAGCTACTTAAATCGAGAAGGTCCCAAGGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
134489 ACTAATTATCAAGCTTATCGAAGCTACTTAAATCGAGAAGGTCCCAAGGC
1250 . : . : . : . : . :
1179 TCTGGGCTCCAAAGAAATACCAAAG GGAGCTGAAAATTGCT
|||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
134539 TCTGGGCTCCAAAGAAATACCAAAGGTA...TAGGGAGCTGAAAATTGCT
1300 . : . : . : . : . :
1220 TGGAAGGCCTTATATTTGTAATCACAGGCGTGCTGGAGTCTATTGAACGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
138563 TGGAAGGCCTTATATTTGTAATCACAGGCGTGCTGGAGTCTATTGAACGA
1350 . : . : . : . : . :
1270 GATGAGGCCAAGTCTCTAATTGAACGTTATGGGGGAAAAGTAACAGGAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
138613 GATGAGGCCAAGTCTCTAATTGAACGTTATGGGGGAAAAGTAACAGGAAA
1400 . : . : . : . : . :
1320 TGTCAGCAAGAAAACAAATTATCTTGTCATGGGTCGTGATAGTGGACAGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
138663 TGTCAGCAAGAAAACAAATTATCTTGTCATGGGTCGTGATAGTGGACAGT
1450 . : . : . : . : . :
1370 CCAAGAGTGATAAG GCCGCAGCCTTGGGGACAAAAATTATT
||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
138713 CCAAGAGTGATAAGGTG...CAGGCCGCAGCCTTGGGGACAAAAATTATT
1500 . : . : . : . : . :
1411 GATGAAGATGGCCTGTTGAATCTGATTCGGACTATGCCAGGCAAGAAATC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
139956 GATGAAGATGGCCTGTTGAATCTGATTCGGACTATGCCAGGCAAGAAATC
1550 . : . : . : . : . :
1461 CAAGTATGAAATAGCAGTTGAAACTGAG ATGAAGAAAGAGT
||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
140006 CAAGTATGAAATAGCAGTTGAAACTGAGGTT...AAGATGAAGAAAGAGT
1600 . : . : . : . : . :
1502 CCAAACTGGAGAGAACACCCCAAAAAAATGTCCAAGGAAAAAGAAAAATT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
142459 CCAAACTGGAGAGAACACCCCAAAAAAATGTCCAAGGAAAAAGAAAAATT
1650 . : . : . : . : . :
1552 AGTCCATCTAAAAAGGAATCAGAATCTAAAAAGAGCAGGCCGACTTCCAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
142509 AGTCCATCTAAAAAGGAATCAGAATCTAAAAAGAGCAGGCCGACTTCCAA
1700 . : . : . : . : . :
1602 AAGGGACAGTTTGGCAAAGACAATAAAAAAGGAAACAGATGTGTTTTGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
142559 AAGGGACAGTTTGGCAAAGACAATAAAAAAGGAAACAGATGTGTTTTGGA
1750 . : . : . : . : . :
1652 AAAGCCTGGATTTCAAGGAGCAGGTGGCTGAGGAGACAAGTGGTGACAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
142609 AAAGCCTGGATTTCAAGGAGCAGGTGGCTGAGGAGACAAGTGGTGACAGC
1800 . : . : . : . : . :
1702 AAGGCTAGGAATTTGGCTGATGACAGCAGTGAAAACAAAGTGGAAAATTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
142659 AAGGCTAGGAATTTGGCTGATGACAGCAGTGAAAACAAAGTGGAAAATTT
1850 . : . : . : . : . :
1752 GCTCTGGGTGGATAAATATAAGCCAACCTCGCTCAAGACCATAATTGGAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
142709 GCTCTGGGTGGATAAATATAAGCCAACCTCGCTCAAGACCATAATTGGAC
1900 . : . : . : . : . :
1802 AGCAAGGTGACCAGAGCTGTGCCAACAAACTCCTACGCTGGCTCCGAAAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
142759 AGCAAGGTGACCAGAGCTGTGCCAACAAACTCCTACGCTGGCTCCGAAAC
1950 . : . : . : . : . :
1852 TGGCAAAAGAGTTCTTCCGAAGATAAAAAACACG CAAAGTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
142809 TGGCAAAAGAGTTCTTCCGAAGATAAAAAACACGGTG...CAGCAAAGTT
2000 . : . : . : . : . :
1893 TGGTAAATTTTCCGGCAAAGATGATGGCTCTAGTTTTAAAGCAGCGTTGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
144784 TGGTAAATTTTCCGGCAAAGATGATGGCTCTAGTTTTAAAGCAGCGTTGC
2050 . : . : . : . : . :
1943 TGTCAGGCCCTCCTGGTGTTGGCAAAACCACCACAGCTTCCCTGGTGTGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
144834 TGTCAGGCCCTCCTGGTGTTGGCAAAACCACCACAGCTTCCCTGGTGTGT
2100 . : . : . : . : . :
1993 CAG GAGTTGGGATACAGCTACGTGGAACTGAATGCAAGTGA
|||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
144884 CAGGTG...TAGGAGTTGGGATACAGCTACGTGGAACTGAATGCAAGTGA
2150 . : . : . : . : . :
2034 CACCCGGAGTAAGAGCAGTTTGAAGGCGATTGTTGCTGAGTCACTGAACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
146588 CACCCGGAGTAAGAGCAGTTTGAAGGCGATTGTTGCTGAGTCACTGAACA
2200 . : . : . : . : . :
2084 ATACCAGCATCAAAGGCTTTTATTCAA ATGGAGCAGCCTCT
|||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
146638 ATACCAGCATCAAAGGCTTTTATTCAAGTA...CAGATGGAGCAGCCTCT
2250 . : . : . : . : . :
2125 TCAGTAAGCACGAAACATGCTCTCATCATGGATGAAGTAGATGGCATGGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
148341 TCAGTAAGCACGAAACATGCTCTCATCATGGATGAAGTAGATGGCATGGC
2300 . : . : . : . : . :
2175 AGGCAATGAGGATAGGGGAGGAATTCAG GAATTAATTGGCC
||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
148391 AGGCAATGAGGATAGGGGAGGAATTCAGGTA...CAGGAATTAATTGGCC
2350 . : . : . : . : . :
2216 TGATAAAACATACTAAAATTCCCATTATTTGTATGTGCAATGATAGAAAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
148617 TGATAAAACATACTAAAATTCCCATTATTTGTATGTGCAATGATAGAAAT
2400 . : . : . : . : . :
2266 CATCCCAAGATTCGCTCTCTGGTTCATTATTGTTTTGATCTTCGTTTTCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
148667 CATCCCAAGATTCGCTCTCTGGTTCATTATTGTTTTGATCTTCGTTTTCA
2450 . : . : . : . : . :
2316 AAGACCTCGGGTTGAACAGATTAAG GGTGCTATGATGTCTA
|||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
148717 AAGACCTCGGGTTGAACAGATTAAGGTA...CAGGGTGCTATGATGTCTA
2500 . : . : . : . : . :
2357 TTGCATTTAAAGAAGGTTTAAAGATTCCCCCTCCAGCTATGAATGAAATA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
148899 TTGCATTTAAAGAAGGTTTAAAGATTCCCCCTCCAGCTATGAATGAAATA
2550 . : . : . : . : . :
2407 ATTTTGGGAGCCAATCAAGATATCAGACAG GTTTTACATAA
||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
148949 ATTTTGGGAGCCAATCAAGATATCAGACAGGTA...TAGGTTTTACATAA
2600 . : . : . : . : . :
2448 TCTGAGTATGTGGTGTGCACGAAGTAAAGCATTAACCTATGACCAGGCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
149113 TCTGAGTATGTGGTGTGCACGAAGTAAAGCATTAACCTATGACCAGGCCA
2650 . : . : . : . : . :
2498 AAGCTGATTCTCACAGAGCCAAAAAGGATATCAAAATG GGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
149163 AAGCTGATTCTCACAGAGCCAAAAAGGATATCAAAATGGTA...CAGGGC
2700 . : . : . : . : . :
2539 CCGTTTGATGTTGCCCGGAAAGTGTTTGCAGCTGGAGAGGAGACTGCTCA
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
151067 CCATTTGATGTTGCCCGGAAAGTGTTTGCAGCTGGAGAGGAGACTGCTCA
2750 . : . : . : . : . :
2589 CATGTCACTTGTGGACAAGTCAGATCTCTTTTTTCATGATTATTCAATAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
151117 CATGTCACTTGTGGACAAGTCAGATCTCTTTTTTCATGATTATTCAATAG
2800 . : . : . : . : . :
2639 CACCCCTCTTCGTCCAGGAAAATTACATACACGTGAAGCCTGTAGCAGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
151167 CACCCCTCTTCGTCCAGGAAAATTACATACACGTGAAGCCTGTAGCAGCA
2850 . : . : . : . : . :
2689 GG GGGTGACATGAAAAAGCACCTGATGCTTTTAAGCAGAGC
||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
151217 GGGTG...CAGGGGTGACATGAAAAAGCACCTGATGCTTTTAAGCAGAGC
2900 . : . : . : . : . :
2730 AGCAGACAGCATATGCGATGGTGACCTAGTGGACAGCCAGATCCGGAGTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
151379 AGCAGACAGCATATGCGATGGTGACCTAGTGGACAGCCAGATCCGGAGTA
2950 . : . : . : . : . :
2780 AGCAAAACTGGAGTCTTCTGCCTGCGCAG GCCATTTATGCC
|||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
151429 AGCAAAACTGGAGTCTTCTGCCTGCGCAGGTG...CAGGCCATTTATGCC
3000 . : . : . : . : . :
2821 AGTGTTCTTCCTGGAGAGTTGATGAGGGGGTACATGACCCAGTTTCCCAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
155731 AGTGTTCTTCCTGGAGAGTTGATGAGGGGGTACATGACCCAGTTTCCCAC
3050 . : . : . : . : . :
2871 CTTCCCAAGCTGGCTGGGGAAGCACTCGTCTACAGGCAAACATGATCGTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
155781 CTTCCCAAGCTGGCTGGGGAAGCACTCGTCTACAGGCAAACATGATCGTA
3100 . : . : . : . : . :
2921 TTGTTCAGGACCTGGCCTTGCATATGAGTCTCAG AACTTAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
155831 TTGTTCAGGACCTGGCCTTGCATATGAGTCTCAGGTA...CAGAACTTAC
3150 . : . : . : . : . :
2962 TCCAGCAAAAGGACTGTAAACATGGATTATCTGTCGCTTCTAAGGGATGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
159633 TCCAGCAAAAGGACTGTAAACATGGATTATCTGTCGCTTCTAAGGGATGC
3200 . : . : . : . : . :
3012 ACTTGTACAGCCCTTGACCTCACAAGGAGTAGACGGAGTACAGGATGTTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
159683 ACTTGTACAGCCCTTGACCTCACAAGGAGTAGACGGAGTACAGGATGTTG
3250 . : . : . : . : . :
3062 TTGCACTTATGGACACATATTATTTGATGAAAGAAGACTTTGAGAATATC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
159733 TTGCACTTATGGACACATATTATTTGATGAAAGAAGACTTTGAGAATATC
3300 . : . : . : . : . :
3112 ATGGAAATCAGCAGCTGGGGTGGCAAACCTAGTCCCTTTTCAAAGCTGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
159783 ATGGAAATCAGCAGCTGGGGTGGCAAACCTAGTCCCTTTTCAAAGCTGGA
3350 . : . : . : . : . :
3162 TCCCAAG GTGAAAGCAGCCTTCACAAGAGCTTACAATAAGG
|||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
159833 TCCCAAGGTA...TAGGTGAAAGCAGCCTTCACAAGAGCTTACAATAAGG
3400 . : . : . : . : . :
3203 AAGCCCACCTTACTCCATACTCACTTCAAGCTATAAAGGCATCTAGACAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
161473 AAGCCCACCTTACTCCATACTCACTTCAAGCTATAAAGGCATCTAGACAC
3450 . : . : . : . : . :
3253 AGCACAAGCCCATCCCTGGATTCGGAATACAATGAAGAATTAAATGAAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
161523 AGCACAAGCCCATCCCTGGATTCGGAATACAATGAAGAATTAAATGAAGA
3500 . : . : . : . : . :
3303 TGACTCTCAATCTGATGAGAAAGACCAAGATGCTATAGAAACTGATGCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
161573 TGACTCTCAATCTGATGAGAAAGACCAAGATGCTATAGAAACTGATGCCA
3550 . : . : . : . : . :
3353 TGATCAAG AAAAAGACAAAATCTTCAAAGCCTTCAAAACCA
||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
161623 TGATCAAGGTA...CAGAAAAAGACAAAATCTTCAAAGCCTTCAAAACCA
3600 . : . : . : . : .
3394 GAAAAAGATAAGGAGCCCAGAAAAGGAAAAGGAAAAAGTTCGAAGAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
162667 GAAAAAGATAAGGAGCCCAGAAAAGGAAAAGGAAAAAGTTCGAAGAAA