Result of SIM4 for
pF1KB3039
seq1 = pF1KB3039.tfa, 3372 bp
seq2 = pF1KB3039/gi568815589f_27009591.tfa (gi568815589f:27009591_27329229), 319639 bp
>pF1KB3039 3372
>gi568815589f:27009591_27329229 (Chr9)
1-52 (100001-100052) 100% ->
53-364 (148241-148552) 100% ->
365-475 (158905-159015) 100% ->
476-628 (159887-160039) 100% ->
629-760 (163026-163157) 100% ->
761-901 (163632-163772) 100% ->
902-1030 (170650-170778) 100% ->
1031-1182 (173869-174020) 99% ->
1183-1327 (175895-176039) 100% ->
1328-1489 (180939-181100) 100% ->
1490-1624 (182899-183033) 100% ->
1625-1909 (187725-188009) 100% ->
1910-2209 (193230-193529) 100% ->
2210-2364 (195321-195475) 100% ->
2365-2575 (196992-197202) 100% ->
2576-2686 (199531-199641) 100% ->
2687-2877 (203117-203307) 100% ->
2878-2991 (203894-204007) 100% ->
2992-3062 (208098-208168) 100% ->
3063-3103 (209187-209227) 100% ->
3104-3200 (210459-210555) 100% ->
3201-3300 (218616-218715) 100% ->
3301-3372 (219568-219639) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGGACTCTTTAGCCAGCTTAGTTCTCTGTGGAGTCAGCTTGCTCCTTTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100001 ATGGACTCTTTAGCCAGCTTAGTTCTCTGTGGAGTCAGCTTGCTCCTTTC
50 . : . : . : . : . :
51 TG GAACTGTGGAAGGTGCCATGGACTTGATCTTGATCAATT
||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100051 TGGTA...TAGGAACTGTGGAAGGTGCCATGGACTTGATCTTGATCAATT
100 . : . : . : . : . :
92 CCCTACCTCTTGTATCTGATGCTGAAACATCTCTCACCTGCATTGCCTCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
148280 CCCTACCTCTTGTATCTGATGCTGAAACATCTCTCACCTGCATTGCCTCT
150 . : . : . : . : . :
142 GGGTGGCGCCCCCATGAGCCCATCACCATAGGAAGGGACTTTGAAGCCTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
148330 GGGTGGCGCCCCCATGAGCCCATCACCATAGGAAGGGACTTTGAAGCCTT
200 . : . : . : . : . :
192 AATGAACCAGCACCAGGATCCGCTGGAAGTTACTCAAGATGTGACCAGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
148380 AATGAACCAGCACCAGGATCCGCTGGAAGTTACTCAAGATGTGACCAGAG
250 . : . : . : . : . :
242 AATGGGCTAAAAAAGTTGTTTGGAAGAGAGAAAAGGCTAGTAAGATCAAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
148430 AATGGGCTAAAAAAGTTGTTTGGAAGAGAGAAAAGGCTAGTAAGATCAAT
300 . : . : . : . : . :
292 GGTGCTTATTTCTGTGAAGGGCGAGTTCGAGGAGAGGCAATCAGGATACG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
148480 GGTGCTTATTTCTGTGAAGGGCGAGTTCGAGGAGAGGCAATCAGGATACG
350 . : . : . : . : . :
342 AACCATGAAGATGCGTCAACAAG CTTCCTTCCTACCAGCTA
|||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
148530 AACCATGAAGATGCGTCAACAAGGTA...AAGCTTCCTTCCTACCAGCTA
400 . : . : . : . : . :
383 CTTTAACTATGACTGTGGACAAGGGAGATAACGTGAACATATCTTTCAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
158923 CTTTAACTATGACTGTGGACAAGGGAGATAACGTGAACATATCTTTCAAA
450 . : . : . : . : . :
433 AAGGTATTGATTAAAGAAGAAGATGCAGTGATTTACAAAAATG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
158973 AAGGTATTGATTAAAGAAGAAGATGCAGTGATTTACAAAAATGGTG...T
500 . : . : . : . : . :
476 GTTCCTTCATCCATTCAGTGCCCCGGCATGAAGTACCTGATATTCTAG
>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
159885 AGGTTCCTTCATCCATTCAGTGCCCCGGCATGAAGTACCTGATATTCTAG
550 . : . : . : . : . :
524 AAGTACACCTGCCTCATGCTCAGCCCCAGGATGCTGGAGTGTACTCGGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
159935 AAGTACACCTGCCTCATGCTCAGCCCCAGGATGCTGGAGTGTACTCGGCC
600 . : . : . : . : . :
574 AGGTATATAGGAGGAAACCTCTTCACCTCGGCCTTCACCAGGCTGATAGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
159985 AGGTATATAGGAGGAAACCTCTTCACCTCGGCCTTCACCAGGCTGATAGT
650 . : . : . : . : . :
624 CCGGA GATGTGAAGCCCAGAAGTGGGGACCTGAATGCAACC
|||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
160035 CCGGAGTA...AAGGATGTGAAGCCCAGAAGTGGGGACCTGAATGCAACC
700 . : . : . : . : . :
665 ATCTCTGTACTGCTTGTATGAACAATGGTGTCTGCCATGAAGATACTGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
163062 ATCTCTGTACTGCTTGTATGAACAATGGTGTCTGCCATGAAGATACTGGA
750 . : . : . : . : . :
715 GAATGCATTTGCCCTCCTGGGTTTATGGGAAGGACGTGTGAGAAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
163112 GAATGCATTTGCCCTCCTGGGTTTATGGGAAGGACGTGTGAGAAGGGTA.
800 . : . : . : . : . :
761 CTTGTGAACTGCACACGTTTGGCAGAACTTGTAAAGAAAGGTGCA
..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
163162 ..AAGCTTGTGAACTGCACACGTTTGGCAGAACTTGTAAAGAAAGGTGCA
850 . : . : . : . : . :
806 GTGGACAAGAGGGATGCAAGTCTTATGTGTTCTGTCTCCCTGACCCCTAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
163677 GTGGACAAGAGGGATGCAAGTCTTATGTGTTCTGTCTCCCTGACCCCTAT
900 . : . : . : . : . :
856 GGGTGTTCCTGTGCCACAGGCTGGAAGGGTCTGCAGTGCAATGAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
163727 GGGTGTTCCTGTGCCACAGGCTGGAAGGGTCTGCAGTGCAATGAAGGTA.
950 . : . : . : . : . :
902 CATGCCACCCTGGTTTTTACGGGCCAGATTGTAAGCTTAGGTGCA
..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
163777 ..CAGCATGCCACCCTGGTTTTTACGGGCCAGATTGTAAGCTTAGGTGCA
1000 . : . : . : . : . :
947 GCTGCAACAATGGGGAGATGTGTGATCGCTTCCAAGGATGTCTCTGCTCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
170695 GCTGCAACAATGGGGAGATGTGTGATCGCTTCCAAGGATGTCTCTGCTCT
1050 . : . : . : . : . :
997 CCAGGATGGCAGGGGCTCCAGTGTGAGAGAGAAG GCATACC
||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
170745 CCAGGATGGCAGGGGCTCCAGTGTGAGAGAGAAGGTA...CAGGCATACA
1100 . : . : . : . : . :
1038 GAGGATGACCCCAAAGATAGTGGATTTGCCAGATCATATAGAAGTAAACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
173876 GAGGATGACCCCAAAGATAGTGGATTTGCCAGATCATATAGAAGTAAACA
1150 . : . : . : . : . :
1088 GTGGTAAATTTAATCCCATTTGCAAAGCTTCTGGCTGGCCGCTACCTACT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
173926 GTGGTAAATTTAATCCCATTTGCAAAGCTTCTGGCTGGCCGCTACCTACT
1200 . : . : . : . : . :
1138 AATGAAGAAATGACCCTGGTGAAGCCGGATGGGACAGTGCTCCAT
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
173976 AATGAAGAAATGACCCTGGTGAAGCCGGATGGGACAGTGCTCCATGTA..
1250 . : . : . : . : . :
1183 CCAAAAGACTTTAACCATACGGATCATTTCTCAGTAGCCATATTCA
.>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
174026 .CAGCCAAAAGACTTTAACCATACGGATCATTTCTCAGTAGCCATATTCA
1300 . : . : . : . : . :
1229 CCATCCACCGGATCCTCCCCCCTGACTCAGGAGTTTGGGTCTGCAGTGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
175941 CCATCCACCGGATCCTCCCCCCTGACTCAGGAGTTTGGGTCTGCAGTGTG
1350 . : . : . : . : . :
1279 AACACAGTGGCTGGGATGGTGGAAAAGCCCTTCAACATTTCTGTTAAAG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
175991 AACACAGTGGCTGGGATGGTGGAAAAGCCCTTCAACATTTCTGTTAAAGG
1400 . : . : . : . : . :
1328 TTCTTCCAAAGCCCCTGAATGCCCCAAACGTGATTGACACTG
>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
176041 TA...TAGTTCTTCCAAAGCCCCTGAATGCCCCAAACGTGATTGACACTG
1450 . : . : . : . : . :
1370 GACATAACTTTGCTGTCATCAACATCAGCTCTGAGCCTTACTTTGGGGAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
180981 GACATAACTTTGCTGTCATCAACATCAGCTCTGAGCCTTACTTTGGGGAT
1500 . : . : . : . : . :
1420 GGACCAATCAAATCCAAGAAGCTTCTATACAAACCCGTTAATCACTATGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
181031 GGACCAATCAAATCCAAGAAGCTTCTATACAAACCCGTTAATCACTATGA
1550 . : . : . : . : . :
1470 GGCTTGGCAACATATTCAAG TGACAAATGAGATTGTTACAC
||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
181081 GGCTTGGCAACATATTCAAGGTA...CAGTGACAAATGAGATTGTTACAC
1600 . : . : . : . : . :
1511 TCAACTATTTGGAACCTCGGACAGAATATGAACTCTGTGTGCAACTGGTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
182920 TCAACTATTTGGAACCTCGGACAGAATATGAACTCTGTGTGCAACTGGTC
1650 . : . : . : . : . :
1561 CGTCGTGGAGAGGGTGGGGAAGGGCATCCTGGACCTGTGAGACGCTTCAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
182970 CGTCGTGGAGAGGGTGGGGAAGGGCATCCTGGACCTGTGAGACGCTTCAC
1700 . : . : . : . : . :
1611 AACAGCTTCTATCG GACTCCCTCCTCCAAGAGGTCTAAATC
||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
183020 AACAGCTTCTATCGGTC...TAGGACTCCCTCCTCCAAGAGGTCTAAATC
1750 . : . : . : . : . :
1652 TCCTGCCTAAAAGTCAGACCACTCTAAATTTGACCTGGCAACCAATATTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
187752 TCCTGCCTAAAAGTCAGACCACTCTAAATTTGACCTGGCAACCAATATTT
1800 . : . : . : . : . :
1702 CCAAGCTCGGAAGATGACTTTTATGTTGAAGTGGAGAGAAGGTCTGTGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
187802 CCAAGCTCGGAAGATGACTTTTATGTTGAAGTGGAGAGAAGGTCTGTGCA
1850 . : . : . : . : . :
1752 AAAAAGTGATCAGCAGAATATTAAAGTTCCAGGCAACTTGACTTCGGTGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
187852 AAAAAGTGATCAGCAGAATATTAAAGTTCCAGGCAACTTGACTTCGGTGC
1900 . : . : . : . : . :
1802 TACTTAACAACTTACATCCCAGGGAGCAGTACGTGGTCCGAGCTAGAGTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
187902 TACTTAACAACTTACATCCCAGGGAGCAGTACGTGGTCCGAGCTAGAGTC
1950 . : . : . : . : . :
1852 AACACCAAGGCCCAGGGGGAATGGAGTGAAGATCTCACTGCTTGGACCCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
187952 AACACCAAGGCCCAGGGGGAATGGAGTGAAGATCTCACTGCTTGGACCCT
2000 . : . : . : . : . :
1902 TAGTGACA TTCTTCCTCCTCAACCAGAAAACATCAAGATTT
||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
188002 TAGTGACAGTA...TAGTTCTTCCTCCTCAACCAGAAAACATCAAGATTT
2050 . : . : . : . : . :
1943 CCAACATTACACACTCCTCAGCTGTGATTTCTTGGACAATATTGGATGGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
193263 CCAACATTACACACTCCTCAGCTGTGATTTCTTGGACAATATTGGATGGC
2100 . : . : . : . : . :
1993 TATTCTATTTCTTCTATTACTATCCGTTACAAGGTTCAAGGCAAGAATGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
193313 TATTCTATTTCTTCTATTACTATCCGTTACAAGGTTCAAGGCAAGAATGA
2150 . : . : . : . : . :
2043 AGACCAGCACGTTGATGTGAAGATAAAGAATGCCACCATCACTCAGTATC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
193363 AGACCAGCACGTTGATGTGAAGATAAAGAATGCCACCATCACTCAGTATC
2200 . : . : . : . : . :
2093 AGCTCAAGGGCCTAGAGCCTGAAACAGCATACCAGGTGGACATTTTTGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
193413 AGCTCAAGGGCCTAGAGCCTGAAACAGCATACCAGGTGGACATTTTTGCA
2250 . : . : . : . : . :
2143 GAGAACAACATAGGGTCAAGCAACCCAGCCTTTTCTCATGAACTGGTGAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
193463 GAGAACAACATAGGGTCAAGCAACCCAGCCTTTTCTCATGAACTGGTGAC
2300 . : . : . : . : . :
2193 CCTCCCAGAATCTCAAG CACCAGCGGACCTCGGAGGGGGGA
|||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
193513 CCTCCCAGAATCTCAAGGTT...CAGCACCAGCGGACCTCGGAGGGGGGA
2350 . : . : . : . : . :
2234 AGATGCTGCTTATAGCCATCCTTGGCTCTGCTGGAATGACCTGCCTGACT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
195345 AGATGCTGCTTATAGCCATCCTTGGCTCTGCTGGAATGACCTGCCTGACT
2400 . : . : . : . : . :
2284 GTGCTGTTGGCCTTTCTGATCATATTGCAATTGAAGAGGGCAAATGTGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
195395 GTGCTGTTGGCCTTTCTGATCATATTGCAATTGAAGAGGGCAAATGTGCA
2450 . : . : . : . : . :
2334 AAGGAGAATGGCCCAAGCCTTCCAAAACGTG AGGGAAGAAC
|||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
195445 AAGGAGAATGGCCCAAGCCTTCCAAAACGTGGTA...CAGAGGGAAGAAC
2500 . : . : . : . : . :
2375 CAGCTGTGCAGTTCAACTCAGGGACTCTGGCCCTAAACAGGAAGGTCAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
197002 CAGCTGTGCAGTTCAACTCAGGGACTCTGGCCCTAAACAGGAAGGTCAAA
2550 . : . : . : . : . :
2425 AACAACCCAGATCCTACAATTTATCCAGTGCTTGACTGGAATGACATCAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
197052 AACAACCCAGATCCTACAATTTATCCAGTGCTTGACTGGAATGACATCAA
2600 . : . : . : . : . :
2475 ATTTCAAGATGTGATTGGGGAGGGCAATTTTGGCCAAGTTCTTAAGGCGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
197102 ATTTCAAGATGTGATTGGGGAGGGCAATTTTGGCCAAGTTCTTAAGGCGC
2650 . : . : . : . : . :
2525 GCATCAAGAAGGATGGGTTACGGATGGATGCTGCCATCAAAAGAATGAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
197152 GCATCAAGAAGGATGGGTTACGGATGGATGCTGCCATCAAAAGAATGAAA
2700 . : . : . : . : . :
2575 G AATATGCCTCCAAAGATGATCACAGGGACTTTGCAGGAGA
|>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
197202 GGTC...CAGAATATGCCTCCAAAGATGATCACAGGGACTTTGCAGGAGA
2750 . : . : . : . : . :
2616 ACTGGAAGTTCTTTGTAAACTTGGACACCATCCAAACATCATCAATCTCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
199571 ACTGGAAGTTCTTTGTAAACTTGGACACCATCCAAACATCATCAATCTCT
2800 . : . : . : . : . :
2666 TAGGAGCATGTGAACATCGAG GCTACTTGTACCTGGCCATT
|||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
199621 TAGGAGCATGTGAACATCGAGGTA...CAGGCTACTTGTACCTGGCCATT
2850 . : . : . : . : . :
2707 GAGTACGCGCCCCATGGAAACCTTCTGGACTTCCTTCGCAAGAGCCGTGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
203137 GAGTACGCGCCCCATGGAAACCTTCTGGACTTCCTTCGCAAGAGCCGTGT
2900 . : . : . : . : . :
2757 GCTGGAGACGGACCCAGCATTTGCCATTGCCAATAGCACCGCGTCCACAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
203187 GCTGGAGACGGACCCAGCATTTGCCATTGCCAATAGCACCGCGTCCACAC
2950 . : . : . : . : . :
2807 TGTCCTCCCAGCAGCTCCTTCACTTCGCTGCCGACGTGGCCCGGGGCATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
203237 TGTCCTCCCAGCAGCTCCTTCACTTCGCTGCCGACGTGGCCCGGGGCATG
3000 . : . : . : . : . :
2857 GACTACTTGAGCCAAAAACAG TTTATCCACAGGGATCTGGC
|||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
203287 GACTACTTGAGCCAAAAACAGGTT...CAGTTTATCCACAGGGATCTGGC
3050 . : . : . : . : . :
2898 TGCCAGAAACATTTTAGTTGGTGAAAACTATGTGGCAAAAATAGCAGATT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
203914 TGCCAGAAACATTTTAGTTGGTGAAAACTATGTGGCAAAAATAGCAGATT
3100 . : . : . : . : . :
2948 TTGGATTGTCCCGAGGTCAAGAGGTGTATGTGAAAAAGACAATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
203964 TTGGATTGTCCCGAGGTCAAGAGGTGTATGTGAAAAAGACAATGGTA...
3150 . : . : . : . : . :
2992 GGAAGGCTCCCAGTGCGCTGGATGGCCATCGAGTCACTGAATTACAG
>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
208095 CAGGGAAGGCTCCCAGTGCGCTGGATGGCCATCGAGTCACTGAATTACAG
3200 . : . : . : . : . :
3039 TGTGTACACAACCAACAGTGATGT ATGGTCCTATGGTGTGT
||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
208145 TGTGTACACAACCAACAGTGATGTGTG...CAGATGGTCCTATGGTGTGT
3250 . : . : . : . : . :
3080 TACTATGGGAGATTGTTAGCTTAG GAGGCACACCCTACTGC
||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
209204 TACTATGGGAGATTGTTAGCTTAGGTG...CAGGAGGCACACCCTACTGC
3300 . : . : . : . : . :
3121 GGGATGACTTGTGCAGAACTCTACGAGAAGCTGCCCCAGGGCTACAGACT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
210476 GGGATGACTTGTGCAGAACTCTACGAGAAGCTGCCCCAGGGCTACAGACT
3350 . : . : . : . : . :
3171 GGAGAAGCCCCTGAACTGTGATGATGAGGT GTATGATCTAA
||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
210526 GGAGAAGCCCCTGAACTGTGATGATGAGGTGTA...AAGGTATGATCTAA
3400 . : . : . : . : . :
3212 TGAGACAATGCTGGCGGGAGAAGCCTTATGAGAGGCCATCATTTGCCCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
218627 TGAGACAATGCTGGCGGGAGAAGCCTTATGAGAGGCCATCATTTGCCCAG
3450 . : . : . : . : . :
3262 ATATTGGTGTCCTTAAACAGAATGTTAGAGGAGCGAAAG AC
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
218677 ATATTGGTGTCCTTAAACAGAATGTTAGAGGAGCGAAAGGTA...CAGAC
3500 . : . : . : . : . :
3303 CTACGTGAATACCACGCTTTATGAGAAGTTTACTTATGCAGGAATTGACT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
219570 CTACGTGAATACCACGCTTTATGAGAAGTTTACTTATGCAGGAATTGACT
3550 . : . :
3353 GTTCTGCTGAAGAAGCGGCC
||||||||||||||||||||
219620 GTTCTGCTGAAGAAGCGGCC