Result of SIM4 for
pF1KB3037
seq1 = pF1KB3037.tfa, 3450 bp
seq2 = pF1KB3037/gi568815595f_135901499.tfa (gi568815595f:135901499_136245163), 343665 bp
>pF1KB3037 3450
>gi568815595f:135901499_136245163 (Chr3)
1-1995 (100001-101995) 100% ->
1996-2262 (125334-125600) 100% ->
2263-2366 (139361-139464) 100% ->
2367-2469 (147761-147863) 100% ->
2470-2544 (168980-169054) 100% ->
2545-2631 (176869-176955) 100% ->
2632-2788 (180767-180923) 100% ->
2789-2837 (186385-186433) 100% ->
2838-2927 (189080-189169) 100% ->
2928-3103 (200509-200684) 100% ->
3104-3222 (201760-201878) 100% ->
3223-3329 (204718-204824) 100% ->
3330-3450 (243545-243665) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGGCAGCAACTTACAGACTTGTGGTTAGTACTGTGAACCACTACAGCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100001 ATGGCAGCAACTTACAGACTTGTGGTTAGTACTGTGAACCACTACAGCAG
50 . : . : . : . : . :
51 CGTGGTGATAGACCGGCGTTTTGAACAAGCTATACATTATTGCACTGGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100051 CGTGGTGATAGACCGGCGTTTTGAACAAGCTATACATTATTGCACTGGAA
100 . : . : . : . : . :
101 CCTGCCACACCTTCACACATGGAATTGACTGCATTGTGGTACACCATAGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100101 CCTGCCACACCTTCACACATGGAATTGACTGCATTGTGGTACACCATAGT
150 . : . : . : . : . :
151 GTTTGTGCAGACCTCTTGCACATCCCTGTGTCTCAGTTCAAAGATGCAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100151 GTTTGTGCAGACCTCTTGCACATCCCTGTGTCTCAGTTCAAAGATGCAGA
200 . : . : . : . : . :
201 TCTGAACTCTATGTTTCTACCCCATGAAAATGGGCTTTCTTCGGCTGAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100201 TCTGAACTCTATGTTTCTACCCCATGAAAATGGGCTTTCTTCGGCTGAAG
250 . : . : . : . : . :
251 GAGACTATCCCCAACAGGCCTTCACAGGCATACCCAGGGTCAAGAGAGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100251 GAGACTATCCCCAACAGGCCTTCACAGGCATACCCAGGGTCAAGAGAGGA
300 . : . : . : . : . :
301 TCTACATTTCAGAATACCTACAACTTAAAGGATATTGCAGGAGAAGCAAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100301 TCTACATTTCAGAATACCTACAACTTAAAGGATATTGCAGGAGAAGCAAT
350 . : . : . : . : . :
351 CAGTTTTGCCAGTGGGAAAATAAAAGAATTTTCCTTTGAAAAACTCAAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100351 CAGTTTTGCCAGTGGGAAAATAAAAGAATTTTCCTTTGAAAAACTCAAAA
400 . : . : . : . : . :
401 ACTCTAACCATGCAGCTTACAGAAAGGGAAGGAAAGTTAAGTCTGACTCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100401 ACTCTAACCATGCAGCTTACAGAAAGGGAAGGAAAGTTAAGTCTGACTCA
450 . : . : . : . : . :
451 TTTAATAGGAGGTCAGTTGATTTGGACTTGCTTTGTGGCCATTATAACAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100451 TTTAATAGGAGGTCAGTTGATTTGGACTTGCTTTGTGGCCATTATAACAA
500 . : . : . : . : . :
501 CGATGGGAACGCCCCATCCTTTGGTTTACTGCGGAGTTCCTCAGTTGAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100501 CGATGGGAACGCCCCATCCTTTGGTTTACTGCGGAGTTCCTCAGTTGAGG
550 . : . : . : . : . :
551 AAAAACCTTTGTCTCATAGAAACTCACTGGATACGAACCTGACTTCCATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100551 AAAAACCTTTGTCTCATAGAAACTCACTGGATACGAACCTGACTTCCATG
600 . : . : . : . : . :
601 TTTCTTCAAAACTTTTCTGAAGAAGACTTGGTTACTCAGATTTTGGAAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100601 TTTCTTCAAAACTTTTCTGAAGAAGACTTGGTTACTCAGATTTTGGAAAA
650 . : . : . : . : . :
651 ACATAAAATAGATAATTTTTCTTCTGGGACAGACATAAAGATGTGCTTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100651 ACATAAAATAGATAATTTTTCTTCTGGGACAGACATAAAGATGTGCTTGG
700 . : . : . : . : . :
701 ACATCTTATTGAAATGCTCCGAGGATTTAAAAAAATGCACAGACATCATA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100701 ACATCTTATTGAAATGCTCCGAGGATTTAAAAAAATGCACAGACATCATA
750 . : . : . : . : . :
751 AAACAATGCATAAAGAAAAAATCAGGGAGTAGCATCAGTGAAGGAAGTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100751 AAACAATGCATAAAGAAAAAATCAGGGAGTAGCATCAGTGAAGGAAGTGG
800 . : . : . : . : . :
801 TAATGATACAATTTCTAGCTCTGAAACTGTCTATATGAATGTAATGACCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100801 TAATGATACAATTTCTAGCTCTGAAACTGTCTATATGAATGTAATGACCA
850 . : . : . : . : . :
851 GGTTAGCATCCTATCTGAAAAAGTTACCATTTGAATTCATGCAGTCTGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100851 GGTTAGCATCCTATCTGAAAAAGTTACCATTTGAATTCATGCAGTCTGGG
900 . : . : . : . : . :
901 AATAATGAGGCTCTAGATTTAACAGAACTGATCAGTAATATGCCTAGCTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100901 AATAATGAGGCTCTAGATTTAACAGAACTGATCAGTAATATGCCTAGCTT
950 . : . : . : . : . :
951 ACAACTGACTCCCTTCTCCCCAGTGTTTGGCACTGAACAACCCCCTAAAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100951 ACAACTGACTCCCTTCTCCCCAGTGTTTGGCACTGAACAACCCCCTAAAT
1000 . : . : . : . : . :
1001 ATGAAGATGTTGTCCAGCTCTCAGCTTCTGACTCTGGACGATTTCAAACT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101001 ATGAAGATGTTGTCCAGCTCTCAGCTTCTGACTCTGGACGATTTCAAACT
1050 . : . : . : . : . :
1051 ATTGAATTGCAAAATGACAAGCCTAATTCTAGGAAGATGGACACTGTACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101051 ATTGAATTGCAAAATGACAAGCCTAATTCTAGGAAGATGGACACTGTACA
1100 . : . : . : . : . :
1101 ATCCATTCCAAACAACTCCACAAATTCCTTATATAACTTAGAGGTAAATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101101 ATCCATTCCAAACAACTCCACAAATTCCTTATATAACTTAGAGGTAAATG
1150 . : . : . : . : . :
1151 ATCCTAGAACTCTAAAAGCTGTCCAGGTCCAATCACAGTCATTAACCATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101151 ATCCTAGAACTCTAAAAGCTGTCCAGGTCCAATCACAGTCATTAACCATG
1200 . : . : . : . : . :
1201 AATCCTTTAGAAAATGTTTCTTCTGACGACTTAATGGAAACTCTTTATAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101201 AATCCTTTAGAAAATGTTTCTTCTGACGACTTAATGGAAACTCTTTATAT
1250 . : . : . : . : . :
1251 TGAAGAAGAGTCAGATGGAAAGAAAGCATTAGATAAAGGACAAAAGACAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101251 TGAAGAAGAGTCAGATGGAAAGAAAGCATTAGATAAAGGACAAAAGACAG
1300 . : . : . : . : . :
1301 AGAATGGACCTAGTCATGAGTTATTAAAGGTAAATGAACATAGAGCAGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101301 AGAATGGACCTAGTCATGAGTTATTAAAGGTAAATGAACATAGAGCAGAA
1350 . : . : . : . : . :
1351 TTTCCAGAACATGCTACTCATCTTAAAAAATGCCCCACCCCAATGCAAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101351 TTTCCAGAACATGCTACTCATCTTAAAAAATGCCCCACCCCAATGCAAAA
1400 . : . : . : . : . :
1401 TGAAATTGGTAAGATATTTGAGAAATCATTTGTTAATCTACCTAAGGAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101401 TGAAATTGGTAAGATATTTGAGAAATCATTTGTTAATCTACCTAAGGAAG
1450 . : . : . : . : . :
1451 ACTGTAAATCAAAAGTTTCTAAATTTGAAGAGGGAGACCAGAGAGATTTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101451 ACTGTAAATCAAAAGTTTCTAAATTTGAAGAGGGAGACCAGAGAGATTTT
1500 . : . : . : . : . :
1501 ACAAATTCCAGTAGCCAGGAAGAGATAGATAAATTGTTAATGGATTTGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101501 ACAAATTCCAGTAGCCAGGAAGAGATAGATAAATTGTTAATGGATTTGGA
1550 . : . : . : . : . :
1551 ATCTTTTTCACAGAAGATGGAGACCTCTCTAAGAGAGCCACTTGCGAAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101551 ATCTTTTTCACAGAAGATGGAGACCTCTCTAAGAGAGCCACTTGCGAAGG
1600 . : . : . : . : . :
1601 GTAAAAACTCTAATTTTTTAAATAGTCACAGTCAGTTGACCGGTCAGACC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101601 GTAAAAACTCTAATTTTTTAAATAGTCACAGTCAGTTGACCGGTCAGACC
1650 . : . : . : . : . :
1651 CTTGTAGATCTTGAGCCTAAATCTAAAGTCTCTTCACCCATAGAAAAAGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101651 CTTGTAGATCTTGAGCCTAAATCTAAAGTCTCTTCACCCATAGAAAAAGT
1700 . : . : . : . : . :
1701 CTCACCTTCCTGTCTAACAAGGATTATTGAAACCAATGGACACAAAATAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101701 CTCACCTTCCTGTCTAACAAGGATTATTGAAACCAATGGACACAAAATAG
1750 . : . : . : . : . :
1751 AGGAAGAGGATCGAGCCCTCTTACTGCGAATCCTGGAAAGCATTGAAGAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101751 AGGAAGAGGATCGAGCCCTCTTACTGCGAATCCTGGAAAGCATTGAAGAC
1800 . : . : . : . : . :
1801 TTTGCTCAAGAACTAGTTGAATGCAAATCAAGCAGAGGGAGCCTATCACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101801 TTTGCTCAAGAACTAGTTGAATGCAAATCAAGCAGAGGGAGCCTATCACA
1850 . : . : . : . : . :
1851 AGAAAAGGAAATGATGCAAATTCTACAGGAAACCTTGACAACTTCCTCCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101851 AGAAAAGGAAATGATGCAAATTCTACAGGAAACCTTGACAACTTCCTCCC
1900 . : . : . : . : . :
1901 AGGCCAATTTATCAGTCTGTAGAAGTCCTGTTGGTGATAAAGCCAAAGAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101901 AGGCCAATTTATCAGTCTGTAGAAGTCCTGTTGGTGATAAAGCCAAAGAT
1950 . : . : . : . : . :
1951 ACTACTTCAGCAGTTTTGATTCAGCAGACTCCAGAGGTGATCAAG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
101951 ACTACTTCAGCAGTTTTGATTCAGCAGACTCCAGAGGTGATCAAGGTA..
2000 . : . : . : . : . :
1996 ATTCAAAATAAACCAGAAAAGAAACCTGGAACACCACTCCCACCTC
.>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102001 .TAGATTCAAAATAAACCAGAAAAGAAACCTGGAACACCACTCCCACCTC
2050 . : . : . : . : . :
2042 CAGCCACCTCTCCAAGTAGTCCCCGACCTCTCTCCCCGGTTCCCCATGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
125380 CAGCCACCTCTCCAAGTAGTCCCCGACCTCTCTCCCCGGTTCCCCATGTG
2100 . : . : . : . : . :
2092 AATAATGTTGTGAATGCGCCATTGTCCATAAACATTCCACGGTTCTACTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
125430 AATAATGTTGTGAATGCGCCATTGTCCATAAACATTCCACGGTTCTACTT
2150 . : . : . : . : . :
2142 TCCTGAAGGACTCCCAGATACCTGTAGTAATCATGAACAAACTCTAAGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
125480 TCCTGAAGGACTCCCAGATACCTGTAGTAATCATGAACAAACTCTAAGCA
2200 . : . : . : . : . :
2192 GAATTGAAACTGCTTTCATGGATATTGAAGAACAGAAAGCAGACATTTAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
125530 GAATTGAAACTGCTTTCATGGATATTGAAGAACAGAAAGCAGACATTTAT
2250 . : . : . : . : . :
2242 GAAATGGGGAAAATTGCAAAG GTCTGTGGCTGTCCTCTCTA
|||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
125580 GAAATGGGGAAAATTGCAAAGGTA...CAGGTCTGTGGCTGTCCTCTCTA
2300 . : . : . : . : . :
2283 TTGGAAAGCCCCCATGTTCAGGGCTGCAGGGGGAGAGAAGACAGGATTTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
139381 TTGGAAAGCCCCCATGTTCAGGGCTGCAGGGGGAGAGAAGACAGGATTTG
2350 . : . : . : . : . :
2333 TGACAGCACAGTCATTCATTGCCATGTGGAGAAA GTTGCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
139431 TGACAGCACAGTCATTCATTGCCATGTGGAGAAAGTA...TAGGTTGCTG
2400 . : . : . : . : . :
2374 AATAACCATCATGATGATGCCTCTAAATTCATCTGTCTTCTAGCAAAGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
147768 AATAACCATCATGATGATGCCTCTAAATTCATCTGTCTTCTAGCAAAGCC
2450 . : . : . : . : . :
2424 CAACTGCAGCTCTCTAGAACAGGAGGATTTCATCCCTCTACTTCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
147818 CAACTGCAGCTCTCTAGAACAGGAGGATTTCATCCCTCTACTTCAGGTA.
2500 . : . : . : . : . :
2470 GATGTGGTGGATACCCACCCTGGTCTCACGTTCCTGAAAGATGCT
..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
147868 ..CAGGATGTGGTGGATACCCACCCTGGTCTCACGTTCCTGAAAGATGCT
2550 . : . : . : . : . :
2515 CCAGAATTCCACTCCCGCTACATCACCACG GTTATTCAGAG
||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
169025 CCAGAATTCCACTCCCGCTACATCACCACGGTA...CAGGTTATTCAGAG
2600 . : . : . : . : . :
2556 AATATTCTACACAGTCAACAGATCTTGGAGTGGAAAAATTACTTCGACAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
176880 AATATTCTACACAGTCAACAGATCTTGGAGTGGAAAAATTACTTCGACAG
2650 . : . : . : . : . :
2606 AGATAAGAAAAAGCAACTTTTTGCAA ACCCTAGCACTTTTG
||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
176930 AGATAAGAAAAAGCAACTTTTTGCAAGTA...CAGACCCTAGCACTTTTG
2700 . : . : . : . : . :
2647 GAAGAAGAGGAAGATATAAACCAAATTACAGATTACTTCTCCTATGAACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
180782 GAAGAAGAGGAAGATATAAACCAAATTACAGATTACTTCTCCTATGAACA
2750 . : . : . : . : . :
2697 TTTCTATGTTATTTATTGTAAATTCTGGGAACTAGATACTGATCACGACC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
180832 TTTCTATGTTATTTATTGTAAATTCTGGGAACTAGATACTGATCACGACC
2800 . : . : . : . : . :
2747 TCTACATCAGCCAGGCCGATCTGTCTCGATACAATGACCAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
180882 TCTACATCAGCCAGGCCGATCTGTCTCGATACAATGACCAGGGTA...TA
2850 . : . : . : . : . :
2789 CTTCATCAAGCAGGATTATTGAAAGGATATTCTCTGGTGCAGTAACAAG
>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
186384 GCTTCATCAAGCAGGATTATTGAAAGGATATTCTCTGGTGCAGTAACAAG
2900 . : . : . : . : . :
2838 GGGAAAAACAATACAGAAAGAGGGAAGAATGAGCTATGCAG
>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
186434 GTA...TAGGGGAAAAACAATACAGAAAGAGGGAAGAATGAGCTATGCAG
2950 . : . : . : . : . :
2879 ATTTTGTTTGGTTTTTGATCTCTGAAGAAGACAAAAGGAATCCTACCAG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
189121 ATTTTGTTTGGTTTTTGATCTCTGAAGAAGACAAAAGGAATCCTACCAGG
3000 . : . : . : . : . :
2928 CATTGAGTATTGGTTCCGCTGCATGGATGTGGATGGAGACGG
>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
189171 TA...TAGCATTGAGTATTGGTTCCGCTGCATGGATGTGGATGGAGACGG
3050 . : . : . : . : . :
2970 TGTACTCTCCATGTATGAGCTGGAGTACTTCTATGAGGAGCAGTGTGAAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
200551 TGTACTCTCCATGTATGAGCTGGAGTACTTCTATGAGGAGCAGTGTGAAC
3100 . : . : . : . : . :
3020 GGATGGAAGCCATGGGAATTGAGCCCTTGCCATTCCATGATTTACTGTGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
200601 GGATGGAAGCCATGGGAATTGAGCCCTTGCCATTCCATGATTTACTGTGC
3150 . : . : . : . : . :
3070 CAGATGCTTGACCTAGTGAAGCCAGCTGTTGATG GCAAAAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
200651 CAGATGCTTGACCTAGTGAAGCCAGCTGTTGATGGTG...TAGGCAAAAT
3200 . : . : . : . : . :
3111 AACTCTAAGAGATCTGAAGAGGTGCAGAATGGCTCACATCTTCTATGACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
201767 AACTCTAAGAGATCTGAAGAGGTGCAGAATGGCTCACATCTTCTATGACA
3250 . : . : . : . : . :
3161 CTTTCTTTAATCTGGAGAAATACTTAGACCATGAACAGAGAGATCCCTTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
201817 CTTTCTTTAATCTGGAGAAATACTTAGACCATGAACAGAGAGATCCCTTT
3300 . : . : . : . : . :
3211 GCGGTCCAGAAG GATGTTGAGAACGATGGGCCTGAGCCCTC
||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
201867 GCGGTCCAGAAGGTA...CAGGATGTTGAGAACGATGGGCCTGAGCCCTC
3350 . : . : . : . : . :
3252 AGACTGGGACCGGTTTGCCGCTGAGGAGTATGAGACGCTTGTTGCAGAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
204747 AGACTGGGACCGGTTTGCCGCTGAGGAGTATGAGACGCTTGTTGCAGAGG
3400 . : . : . : . : . :
3302 AATCTGCCCAAGCACAATTCCAGGAAGG CTTTGAAGATTAT
||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
204797 AATCTGCCCAAGCACAATTCCAGGAAGGGTG...CAGCTTTGAAGATTAT
3450 . : . : . : . : . :
3343 GAAACAGATGAACCTGCCTCTCCCTCTGAATTTGGAAACAAAAGCAATAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
243558 GAAACAGATGAACCTGCCTCTCCCTCTGAATTTGGAAACAAAAGCAATAA
3500 . : . : . : . : . :
3393 AATATTAAGTGCAAGCCTTCCAGAGAAATGTGGAAAGCTTCAATCAGTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
243608 AATATTAAGTGCAAGCCTTCCAGAGAAATGTGGAAAGCTTCAATCAGTGG
3550 .
3443 ATGAAGAA
||||||||
243658 ATGAAGAA