Result of SIM4 for
pF1KB3028
seq1 = pF1KB3028.tfa, 3552 bp
seq2 = pF1KB3028/gi568815593r_141845410.tfa (gi568815593r:141845410_142057851), 212442 bp
>pF1KB3028 3552
>gi568815593r:141845410_142057851 (Chr5)
(complement)
1-2880 (100001-102880) 99% ->
2881-2978 (106262-106359) 100% ->
2979-3130 (108269-108420) 100% ->
3131-3552 (112047-112468) 99%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGATGCAACTTCTGCAACTTCTGCTGGGGCTTTTGGGGCCAGGTGGCTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100001 ATGATGCAACTTCTGCAACTTCTGCTGGGGCTTTTGGGGCCAGGTGGCTA
50 . : . : . : . : . :
51 CTTATTTCTTTTAGGGGATTGTCAGGAGGTGACCACTCTCACGGTGAAAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100051 CTTATTTCTTTTAGGGGATTGTCAGGAGGTGACCACTCTCACGGTGAAAT
100 . : . : . : . : . :
101 ACCAAGTGTCAGAGGAAGTGCCATCTGGTACAGTGATCGGGAAGCTGTCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100101 ACCAAGTGTCAGAGGAAGTGCCATCTGGTACAGTGATCGGGAAGCTGTCC
150 . : . : . : . : . :
151 CAGGAACTGGGCCGGGAGGAGAGGCGGAGGCAAGCTGGGGCCGCCTTCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
100151 CAGGAACTGGGCCGGGAGGAGAGGCGGAGGCAAGCTGGGGCTGCCTTCCA
200 . : . : . : . : . :
201 GGTGTTGCAGCTGCCTCAGGCGCTCCCCATTCAGGTGGACTCTGAGGAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100201 GGTGTTGCAGCTGCCTCAGGCGCTCCCCATTCAGGTGGACTCTGAGGAAG
250 . : . : . : . : . :
251 GCTTGCTCAGCACAGGCAGGCGGCTGGATCGAGAGCAGCTGTGCCGACAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100251 GCTTGCTCAGCACAGGCAGGCGGCTGGATCGAGAGCAGCTGTGCCGACAG
300 . : . : . : . : . :
301 TGGGATCCCTGCCTGGTTTCCTTTGATGTGCTTGCCACAGGGGATTTGGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100301 TGGGATCCCTGCCTGGTTTCCTTTGATGTGCTTGCCACAGGGGATTTGGC
350 . : . : . : . : . :
351 TCTGATCCATGTGGAGATCCAAGTGCTGGACATCAATGACCACCAGCCAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100351 TCTGATCCATGTGGAGATCCAAGTGCTGGACATCAATGACCACCAGCCAC
400 . : . : . : . : . :
401 GGTTTCCCAAAGGCGAGCAGGAGCTGGAAATCTCTGAGAGCGCCTCTCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100401 GGTTTCCCAAAGGCGAGCAGGAGCTGGAAATCTCTGAGAGCGCCTCTCTG
450 . : . : . : . : . :
451 CGAACCCGGATCCCCCTGGACAGAGCTCTTGACCCAGACACAGGCCCTAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100451 CGAACCCGGATCCCCCTGGACAGAGCTCTTGACCCAGACACAGGCCCTAA
500 . : . : . : . : . :
501 CACCCTGCACACCTACACTCTGTCTCCCAGTGAGCACTTTGCCTTGGATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100501 CACCCTGCACACCTACACTCTGTCTCCCAGTGAGCACTTTGCCTTGGATG
550 . : . : . : . : . :
551 TCATTGTGGGCCCTGATGAGACCAAACATGCAGAACTCATAGTGGTGAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100551 TCATTGTGGGCCCTGATGAGACCAAACATGCAGAACTCATAGTGGTGAAG
600 . : . : . : . : . :
601 GAGCTGGACAGGGAAATCCATTCATTTTTTGATCTGGTGTTAACTGCCTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100601 GAGCTGGACAGGGAAATCCATTCATTTTTTGATCTGGTGTTAACTGCCTA
650 . : . : . : . : . :
651 TGACAATGGGAACCCCCCCAAGTCAGGTACCAGCTTGGTCAAGGTCAACG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100651 TGACAATGGGAACCCCCCCAAGTCAGGTACCAGCTTGGTCAAGGTCAACG
700 . : . : . : . : . :
701 TCTTGGACTCCAATGACAATAGCCCTGCGTTTGCTGAGAGTTCACTGGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100701 TCTTGGACTCCAATGACAATAGCCCTGCGTTTGCTGAGAGTTCACTGGCA
750 . : . : . : . : . :
751 CTGGAAATCCAAGAAGATGCTGCACCTGGTACGCTTCTCATAAAACTGAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100751 CTGGAAATCCAAGAAGATGCTGCACCTGGTACGCTTCTCATAAAACTGAC
800 . : . : . : . : . :
801 CGCCACAGACCCTGACCAAGGCCCCAATGGGGAGGTGGAGTTCTTCCTCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100801 CGCCACAGACCCTGACCAAGGCCCCAATGGGGAGGTGGAGTTCTTCCTCA
850 . : . : . : . : . :
851 GTAAGCACATGCCTCCAGAGGTGCTGGACACCTTCAGTATTGATGCCAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100851 GTAAGCACATGCCTCCAGAGGTGCTGGACACCTTCAGTATTGATGCCAAG
900 . : . : . : . : . :
901 ACAGGCCAGGTCATTCTGCGTCGACCTCTAGACTATGAAAAGAACCCTGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100901 ACAGGCCAGGTCATTCTGCGTCGACCTCTAGACTATGAAAAGAACCCTGC
950 . : . : . : . : . :
951 CTACGAGGTGGATGTTCAGGCAAGGGACCTGGGTCCCAATCCTATCCCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100951 CTACGAGGTGGATGTTCAGGCAAGGGACCTGGGTCCCAATCCTATCCCAG
1000 . : . : . : . : . :
1001 CCCATTGCAAAGTTCTCATCAAGGTTCTGGATGTCAATGACAACATCCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101001 CCCATTGCAAAGTTCTCATCAAGGTTCTGGATGTCAATGACAACATCCCA
1050 . : . : . : . : . :
1051 AGCATCCACGTCACATGGGCCTCCCAGCCATCACTGGTGTCAGAAGCTCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101051 AGCATCCACGTCACATGGGCCTCCCAGCCATCACTGGTGTCAGAAGCTCT
1100 . : . : . : . : . :
1101 TCCCAAGGACAGTTTTATTGCTCTTGTCATGGCAGATGACTTGGATTCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101101 TCCCAAGGACAGTTTTATTGCTCTTGTCATGGCAGATGACTTGGATTCAG
1150 . : . : . : . : . :
1151 GACACAATGGTTTGGTCCACTGCTGGCTGAGCCAAGAGCTGGGCCACTTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101151 GACACAATGGTTTGGTCCACTGCTGGCTGAGCCAAGAGCTGGGCCACTTC
1200 . : . : . : . : . :
1201 AGGCTGAAAAGAACTAATGGCAACACATACATGTTGCTAACCAATGCCAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101201 AGGCTGAAAAGAACTAATGGCAACACATACATGTTGCTAACCAATGCCAC
1250 . : . : . : . : . :
1251 ACTGGACAGAGAGCAGTGGCCCAAATATACCCTCACTCTGTTAGCCCAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101251 ACTGGACAGAGAGCAGTGGCCCAAATATACCCTCACTCTGTTAGCCCAAG
1300 . : . : . : . : . :
1301 ACCAAGGACTCCAGCCCTTATCAGCCAAGAAACAGCTCAGCATTCAGATC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101301 ACCAAGGACTCCAGCCCTTATCAGCCAAGAAACAGCTCAGCATTCAGATC
1350 . : . : . : . : . :
1351 AGTGACATCAACGACAATGCACCTGTGTTTGAGAAAAGCAGGTATGAAGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101351 AGTGACATCAACGACAATGCACCTGTGTTTGAGAAAAGCAGGTATGAAGT
1400 . : . : . : . : . :
1401 CTCCACGCGGGAAAACAACTTACCCTCTCTTCACCTCATTACCATCAAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101401 CTCCACGCGGGAAAACAACTTACCCTCTCTTCACCTCATTACCATCAAGG
1450 . : . : . : . : . :
1451 CTCATGATGCAGACTTGGGCATTAATGGAAAAGTCTCATACCGCATCCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101451 CTCATGATGCAGACTTGGGCATTAATGGAAAAGTCTCATACCGCATCCAG
1500 . : . : . : . : . :
1501 GACTCCCCAGTTGCTCACTTAGTAGCTATTGACTCCAACACAGGAGAGGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101501 GACTCCCCAGTTGCTCACTTAGTAGCTATTGACTCCAACACAGGAGAGGT
1550 . : . : . : . : . :
1551 CACTGCTCAGAGGTCACTGAACTATGAAGAGATGGCCGGCTTTGAGTTCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101551 CACTGCTCAGAGGTCACTGAACTATGAAGAGATGGCCGGCTTTGAGTTCC
1600 . : . : . : . : . :
1601 AGGTGATCGCAGAGGACAGCGGGCAACCCATGCTTGCATCCAGTGTCTCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101601 AGGTGATCGCAGAGGACAGCGGGCAACCCATGCTTGCATCCAGTGTCTCT
1650 . : . : . : . : . :
1651 GTGTGGGTCAGCCTCTTGGATGCCAATGATAATGCCCCAGAGGTGGTCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101651 GTGTGGGTCAGCCTCTTGGATGCCAATGATAATGCCCCAGAGGTGGTCCA
1700 . : . : . : . : . :
1701 GCCTGTGCTCAGCGATGGAAAAGCCAGCCTCTCCGTGCTTGTGAATGCCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101701 GCCTGTGCTCAGCGATGGAAAAGCCAGCCTCTCCGTGCTTGTGAATGCCT
1750 . : . : . : . : . :
1751 CCACAGGCCACCTGCTGGTGCCCATCGAGACTCCCAATGGCTTGGGCCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101751 CCACAGGCCACCTGCTGGTGCCCATCGAGACTCCCAATGGCTTGGGCCCA
1800 . : . : . : . : . :
1801 GCGGGCACTGACACACCTCCACTGGCCACTCACAGCTCCCGGCCATTCCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101801 GCGGGCACTGACACACCTCCACTGGCCACTCACAGCTCCCGGCCATTCCT
1850 . : . : . : . : . :
1851 TTTGACAACCATTGTGGCAAGAGATGCAGACTCGGGGGCAAATGGAGAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101851 TTTGACAACCATTGTGGCAAGAGATGCAGACTCGGGGGCAAATGGAGAGC
1900 . : . : . : . : . :
1901 CCCTCTACAGCATCCGCAATGGAAATGAAGCCCACCTCTTCATCCTCAAC
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
101901 CCCTCTACAGCATCCGCAGTGGAAATGAAGCCCACCTCTTCATCCTCAAC
1950 . : . : . : . : . :
1951 CCTCATACGGGGCAGCTGTTCGTCAATGTCACCAATGCCAGCAGCCTCAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101951 CCTCATACGGGGCAGCTGTTCGTCAATGTCACCAATGCCAGCAGCCTCAT
2000 . : . : . : . : . :
2001 TGGGAGTGAGTGGGAGCTGGAGATAGTAGTAGAGGACCAGGGAAGCCCCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102001 TGGGAGTGAGTGGGAGCTGGAGATAGTAGTAGAGGACCAGGGAAGCCCCC
2050 . : . : . : . : . :
2051 CCTTACAGACCCGAGCCCTGTTGAGGGTCATGTTTGTCACCAGTGTGGAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102051 CCTTACAGACCCGAGCCCTGTTGAGGGTCATGTTTGTCACCAGTGTGGAC
2100 . : . : . : . : . :
2101 CACCTGAGGGACTCAGCCCGCAAGCCTGGGGCCTTGAGCATGTCGATGCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102101 CACCTGAGGGACTCAGCCCGCAAGCCTGGGGCCTTGAGCATGTCGATGCT
2150 . : . : . : . : . :
2151 GACGGTGATCTGCCTGGCTGTACTGTTGGGCATCTTCGGGTTGATCCTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102151 GACGGTGATCTGCCTGGCTGTACTGTTGGGCATCTTCGGGTTGATCCTGG
2200 . : . : . : . : . :
2201 CTTTGTTCATGTCCATCTGCCGGACAGAAAAGAAGGACAACAGGGCCTAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102201 CTTTGTTCATGTCCATCTGCCGGACAGAAAAGAAGGACAACAGGGCCTAC
2250 . : . : . : . : . :
2251 AACTGTCGGGAGGCCGAGTCCACCTACCGCCAGCAGCCCAAGAGGCCCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102251 AACTGTCGGGAGGCCGAGTCCACCTACCGCCAGCAGCCCAAGAGGCCCCA
2300 . : . : . : . : . :
2301 GAAACACATTCAGAAGGCAGACATCCACCTCGTGCCTGTGCTCAGGGGTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102301 GAAACACATTCAGAAGGCAGACATCCACCTCGTGCCTGTGCTCAGGGGTC
2350 . : . : . : . : . :
2351 AGGCAGGTGAGCCTTGTGAAGTCGGGCAGTCCCACAAAGATGTGGACAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102351 AGGCAGGTGAGCCTTGTGAAGTCGGGCAGTCCCACAAAGATGTGGACAAG
2400 . : . : . : . : . :
2401 GAGGCGATGATGGAAGCAGGCTGGGACCCCTGCCTGCAGGCCCCCTTCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102401 GAGGCGATGATGGAAGCAGGCTGGGACCCCTGCCTGCAGGCCCCCTTCCA
2450 . : . : . : . : . :
2451 CCTCACCCCGACCCTGTACAGGACGCTGCGTAATCAAGGCAACCAGGGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102451 CCTCACCCCGACCCTGTACAGGACGCTGCGTAATCAAGGCAACCAGGGAG
2500 . : . : . : . : . :
2501 CACCGGCGGAGAGCCGAGAGGTGCTGCAAGACACGGTCAACCTCCTTTTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102501 CACCGGCGGAGAGCCGAGAGGTGCTGCAAGACACGGTCAACCTCCTTTTC
2550 . : . : . : . : . :
2551 AACCATCCCAGGCAGAGGAATGCCTCCCGGGAGAACCTGAACCTTCCCGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102551 AACCATCCCAGGCAGAGGAATGCCTCCCGGGAGAACCTGAACCTTCCCGA
2600 . : . : . : . : . :
2601 GCCCCAGCCTGCCACAGGCCAGCCACGTTCCAGGCCTCTGAAGGTTGCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102601 GCCCCAGCCTGCCACAGGCCAGCCACGTTCCAGGCCTCTGAAGGTTGCAG
2650 . : . : . : . : . :
2651 GCAGCCCCACAGGGAGGCTGGCTGGAGACCAGGGCAGTGAGGAAGCCCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102651 GCAGCCCCACAGGGAGGCTGGCTGGAGACCAGGGCAGTGAGGAAGCCCCA
2700 . : . : . : . : . :
2701 CAGAGGCCACCAGCCTCCTCTGCAACCCTGAGACGGCAGCGACATCTCAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102701 CAGAGGCCACCAGCCTCCTCTGCAACCCTGAGACGGCAGCGACATCTCAA
2750 . : . : . : . : . :
2751 TGGCAAAGTGTCCCCTGAGAAAGAATCAGGGCCCCGTCAGATCCTGCGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102751 TGGCAAAGTGTCCCCTGAGAAAGAATCAGGGCCCCGTCAGATCCTGCGGA
2800 . : . : . : . : . :
2801 GCCTGGTCCGGCTGTCTGTGGCTGCCTTCGCCGAGCGGAACCCCGTGGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102801 GCCTGGTCCGGCTGTCTGTGGCTGCCTTCGCCGAGCGGAACCCCGTGGAG
2850 . : . : . : . : . :
2851 GAGCTCACTGTGGATTCTCCTCCTGTTCAG CAAATCTCCCA
||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
102851 GAGCTCACTGTGGATTCTCCTCCTGTTCAGGTA...TAGCAAATCTCCCA
2900 . : . : . : . : . :
2892 GCTGCTGTCCTTGCTGCATCAGGGCCAATTCCAGCCCAAACCAAACCACC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106273 GCTGCTGTCCTTGCTGCATCAGGGCCAATTCCAGCCCAAACCAAACCACC
2950 . : . : . : . : . :
2942 GAGGAAATAAGTACTTGGCCAAGCCAGGAGGCAGCAG GAGT
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
106323 GAGGAAATAAGTACTTGGCCAAGCCAGGAGGCAGCAGGTA...CAGGAGT
3000 . : . : . : . : . :
2983 GCAATCCCAGACACAGATGGCCCAAGTGCAAGGGCTGGAGGCCAGACAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
108273 GCAATCCCAGACACAGATGGCCCAAGTGCAAGGGCTGGAGGCCAGACAGA
3050 . : . : . : . : . :
3033 CCCAGAACAGGAGGAAGGGCCTTTGGATCCTGAAGAGGACCTCTCTGTGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
108323 CCCAGAACAGGAGGAAGGGCCTTTGGATCCTGAAGAGGACCTCTCTGTGA
3100 . : . : . : . : . :
3083 AGCAACTGCTAGAAGAAGAGCTGTCAAGTCTGCTGGACCCCAGCACAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
108373 AGCAACTGCTAGAAGAAGAGCTGTCAAGTCTGCTGGACCCCAGCACAGGT
3150 . : . : . : . : . :
3131 GTCTGGCCCTGGACCGGCTGAGCGCCCCTGACCCGGCCTGGAT
>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
108423 A...CAGGTCTGGCCCTGGACCGGCTGAGCGCCCCTGACCCGGCCTGGAT
3200 . : . : . : . : . :
3174 GGCGAGACTCTCTTTGCCCCTCACCACCAACTACCGTGACAATGTGATCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
112090 GGCGAGACTCTCTTTGCCCCTCACCACCAACTACCGTGACAATGTGATCT
3250 . : . : . : . : . :
3224 CCCCGGATGCTGCAGCCACGGAGGAGCCGAGGACCTTCCAGACGTTCGGC
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
112140 CCCCGGATGCTGCAGCCACGGAGGAGCCAAGGACCTTCCAGACGTTCGGC
3300 . : . : . : . : . :
3274 AAGGCAGAGGCACCAGAGCTGAGCCCAACAGGCACGAGGCTGGCCAGCAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
112190 AAGGCAGAGGCACCAGAGCTGAGCCCAACAGGCACGAGGCTGGCCAGCAC
3350 . : . : . : . : . :
3324 CTTTGTCTCGGAGATGAGCTCACTGCTGGAGATGCTGCTGGAACAGCGCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
112240 CTTTGTCTCGGAGATGAGCTCACTGCTGGAGATGCTGCTGGAACAGCGCT
3400 . : . : . : . : . :
3374 CCAGCATGCCCGTGGAGGCCGCCTCCGAGGCGCTGCGGCGGCTCTCGGTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
112290 CCAGCATGCCCGTGGAGGCCGCCTCCGAGGCGCTGCGGCGGCTCTCGGTC
3450 . : . : . : . : . :
3424 TGCGGGAGGACCCTCAGTTTAGACTTGGCCACCAGTGCAGCCTCAGGCAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
112340 TGCGGGAGGACCCTCAGTTTAGACTTGGCCACCAGTGCAGCCTCAGGCAT
3500 . : . : . : . : . :
3474 GAAAGTGCAAGGGGACCCAGGTGGAAAGACGGGGACTGAGGGCAAGAGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
112390 GAAAGTGCAAGGGGACCCAGGTGGAAAGACGGGGACTGAGGGCAAGAGCA
3550 . : . : .
3524 GAGGCAGCAGCAGCAGCAGCAGGTGCCTG
|||||||||||||||||||||||||||||
112440 GAGGCAGCAGCAGCAGCAGCAGGTGCCTG