seq1 = pF1KB3014.tfa, 3030 bp
seq2 = pF1KB3014/gi568815577r_33404127.tfa (gi568815577r:33404127_33639315), 235189 bp

>pF1KB3014 3030
>gi568815577r:33404127_33639315 (Chr21)

(complement)

1-145  (100001-100145)   100% ->
146-241  (103996-104091)   100% ->
242-416  (104563-104737)   100% ->
417-528  (106860-106971)   100% ->
529-597  (107759-107827)   100% ->
598-723  (108432-108557)   100% ->
724-811  (110379-110466)   100% ->
812-897  (110712-110797)   100% ->
898-1066  (110981-111149)   100% ->
1067-1298  (114316-114547)   99% ->
1299-1393  (117034-117128)   100% ->
1394-1503  (118301-118410)   100% ->
1504-1702  (118754-118952)   100% ->
1703-1954  (121708-121959)   100% ->
1955-2107  (122175-122327)   100% ->
2108-2314  (127858-128064)   100% ->
2315-2452  (129396-129533)   100% ->
2453-2583  (133212-133342)   100% ->
2584-2725  (133614-133755)   100% ->
2726-2841  (134789-134904)   100% ->
2842-3030  (135001-135189)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCAGCCCGAGTACTTATAATTGGCAGTGGAGGAAGGGAACATACGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCAGCCCGAGTACTTATAATTGGCAGTGGAGGAAGGGAACATACGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCCTGGAAACTTGCACAGTCTCATCATGTCAAACAAGTGTTGGTTGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGCCTGGAAACTTGCACAGTCTCATCATGTCAAACAAGTGTTGGTTGCCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CAGGAAACGCAGGCACTGCCTGCTCTGAAAAGATTTCAAATACCG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 100101 CAGGAAACGCAGGCACTGCCTGCTCTGAAAAGATTTCAAATACCGGTA..

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    146     CCATCTCAATCAGTGACCACACTGCCCTTGCTCAATTCTGCAAAGA
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 .CAGCCATCTCAATCAGTGACCACACTGCCCTTGCTCAATTCTGCAAAGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GAAGAAAATTGAATTTGTAGTTGTTGGACCAGAAGCACCTCTGGCTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104042 GAAGAAAATTGAATTTGTAGTTGTTGGACCAGAAGCACCTCTGGCTGCTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242          GGATTGTTGGGAACCTGAGGTCTGCAGGAGTGCAATGCTTT
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104092 GTA...TAGGGATTGTTGGGAACCTGAGGTCTGCAGGAGTGCAATGCTTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GGCCCAACAGCAGAAGCGGCTCAGTTAGAGTCCAGCAAAAGGTTTGCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104604 GGCCCAACAGCAGAAGCGGCTCAGTTAGAGTCCAGCAAAAGGTTTGCCAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 AGAGTTTATGGACAGACATGGAATCCCAACCGCACAATGGAAGGCTTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104654 AGAGTTTATGGACAGACATGGAATCCCAACCGCACAATGGAAGGCTTTCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CCAAACCTGAAGAAGCCTGCAGCTTCATTTTGAG         TGCAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 104704 CCAAACCTGAAGAAGCCTGCAGCTTCATTTTGAGGTA...CAGTGCAGAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 TTCCCTGCTTTGGTTGTGAAGGCCAGTGGTCTTGCAGCTGGAAAAGGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106867 TTCCCTGCTTTGGTTGTGAAGGCCAGTGGTCTTGCAGCTGGAAAAGGGGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GATTGTTGCAAAGAGCAAAGAAGAGGCCTGCAAAGCTGTACAAGAGATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106917 GATTGTTGCAAAGAGCAAAGAAGAGGCCTGCAAAGCTGTACAAGAGATCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TGCAG         GAGAAAGCCTTTGGGGCAGCTGGAGAAACAATTGTC
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106967 TGCAGGTA...CAGGAGAAAGCCTTTGGGGCAGCTGGAGAAACAATTGTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 ATTGAAGAACTTCTTGACGGAGAAGAGGTGTCG         TGTCTGTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 107795 ATTGAAGAACTTCTTGACGGAGAAGAGGTGTCGGTA...TAGTGTCTGTG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 TTTCACTGATGGCAAGACTGTGGCCCCCATGCCCCCAGCACAGGACCATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108440 TTTCACTGATGGCAAGACTGTGGCCCCCATGCCCCCAGCACAGGACCATA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 AGCGATTACTGGAGGGAGATGGTGGCCCTAACACAGGGGGAATGGGAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108490 AGCGATTACTGGAGGGAGATGGTGGCCCTAACACAGGGGGAATGGGAGCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 TATTGTCCAGCCCCTCAG         GTTTCTAATGATCTATTACTAAA
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 108540 TATTGTCCAGCCCCTCAGGTA...CAGGTTTCTAATGATCTATTACTAAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 AATTAAAGATACTGTTCTTCAGAGGACAGTGGATGGCATGCAGCAAGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110402 AATTAAAGATACTGTTCTTCAGAGGACAGTGGATGGCATGCAGCAAGAGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 GTACTCCATATACAG         GTATTCTCTATGCTGGAATAATGCTG
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 110452 GTACTCCATATACAGGTA...AAGGTATTCTCTATGCTGGAATAATGCTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 ACCAAGAATGGCCCAAAAGTTCTAGAGTTTAATTGCCGTTTTGGTGATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110738 ACCAAGAATGGCCCAAAAGTTCTAGAGTTTAATTGCCGTTTTGGTGATCC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 AGAGTGCCAA         GTAATCCTCCCACTTCTTAAAAGTGATCTTT
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 110788 AGAGTGCCAAGTG...CAGGTAATCCTCCCACTTCTTAAAAGTGATCTTT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 ATGAAGTGATTCAGTCCACCTTAGATGGACTGCTCTGCACATCTCTGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111012 ATGAAGTGATTCAGTCCACCTTAGATGGACTGCTCTGCACATCTCTGCCT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 GTTTGGCTAGAAAACCACACCGCCCTAACTGTTGTCATGGCAAGTAAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111062 GTTTGGCTAGAAAACCACACCGCCCTAACTGTTGTCATGGCAAGTAAAGG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 TTATCCTGGAGACTACACCAAGGGTGTAGAGATAACAG         GGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 111112 TTATCCTGGAGACTACACCAAGGGTGTAGAGATAACAGGTG...TAGGGT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 TTCCTGAGGCTCAAGCTCTAGGACTGGAGGTGTTCCATGCAGGCACTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114319 TTCCTGAGGCTCAAGCTCTAGGACTGGAGGTGTTCCATGCAGGCACTGCC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 CTCAAAAATGGCAAAGTAGTAACTCATGGGGGTAGAGTTCTTGCAGTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114369 CTCAAAAATGGCAAAGTAGTAACTCATGGGGGTAGAGTTCTTGCAGTCAC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 AGCCATCCGGGAAAATCTCATATCAGCCCTTGAGGAAGCCAAGAAAGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114419 AGCCATCCGGGAAAATCTCATATCAGCCCTTGAGGAAGCCAAGAAAGGAC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 TAGCTGCTATAAAGTTTGAGGGAGCAATTTATAGGAAAGACATCGGCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
 114469 TAGCTGCTATAAAGTTTGAGGGAGCAATTTATAGGAAAGACGTCGGCTTT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 CGTGCCATAGCTTTCCTCCAGCAGCCCAG         GAGTTTGACTTA
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 114519 CGTGCCATAGCTTTCCTCCAGCAGCCCAGGTA...TAGGAGTTTGACTTA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 CAAGGAATCTGGAGTAGATATCGCAGCTGGAAATATGCTGGTCAAGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117046 CAAGGAATCTGGAGTAGATATCGCAGCTGGAAATATGCTGGTCAAGAAAA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 TTCAGCCTTTAGCAAAAGCCACTTCCAGATCAG         GCTGTAAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 117096 TTCAGCCTTTAGCAAAAGCCACTTCCAGATCAGGTC...CAGGCTGTAAA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1402 GTTGATCTTGGAGGTTTTGCTGGTCTTTTTGATTTAAAAGCAGCTGGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118309 GTTGATCTTGGAGGTTTTGCTGGTCTTTTTGATTTAAAAGCAGCTGGTTT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1452 CAAAGATCCCCTTCTGGCCTCTGGAACAGATGGCGTTGGAACTAAACTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118359 CAAAGATCCCCTTCTGGCCTCTGGAACAGATGGCGTTGGAACTAAACTAA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1502 AG         ATTGCCCAGCTATGCAATAAACATGATACCATTGGTCAA
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118409 AGGTA...TAGATTGCCCAGCTATGCAATAAACATGATACCATTGGTCAA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1543 GATTTGGTAGCAATGTGTGTTAATGATATTCTGGCACAAGGAGCAGAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118793 GATTTGGTAGCAATGTGTGTTAATGATATTCTGGCACAAGGAGCAGAGCC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1593 CCTCTTCTTCCTTGATTACTTTTCCTGTGGAAAACTTGACCTCAGTGTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118843 CCTCTTCTTCCTTGATTACTTTTCCTGTGGAAAACTTGACCTCAGTGTAA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1643 CTGAAGCTGTTGTTGCTGGAATTGCTAAAGCTTGTGGAAAAGCTGGATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118893 CTGAAGCTGTTGTTGCTGGAATTGCTAAAGCTTGTGGAAAAGCTGGATGT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1693 GCTCTCCTTG         GAGGTGAAACAGCAGAAATGCCTGACATGTA
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 118943 GCTCTCCTTGGTA...CAGGAGGTGAAACAGCAGAAATGCCTGACATGTA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1734 TCCCCCTGGAGAGTATGACCTAGCTGGGTTTGCCGTTGGTGCCATGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121739 TCCCCCTGGAGAGTATGACCTAGCTGGGTTTGCCGTTGGTGCCATGGAGC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1784 GAGATCAGAAACTCCCTCACCTGGAAAGAATCACTGAGGGTGATGTTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121789 GAGATCAGAAACTCCCTCACCTGGAAAGAATCACTGAGGGTGATGTTGTT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1834 GTTGGAATAGCTTCATCTGGTCTTCATAGCAATGGATTTAGCCTTGTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121839 GTTGGAATAGCTTCATCTGGTCTTCATAGCAATGGATTTAGCCTTGTGAG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1884 GAAAATCGTGGCAAAATCTTCCCTCCAGTACTCCTCTCCAGCACCTGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121889 GAAAATCGTGGCAAAATCTTCCCTCCAGTACTCCTCTCCAGCACCTGATG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1934 GTTGTGGTGACCAGACTTTAG         GGGACTTACTTCTCACGCCT
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 121939 GTTGTGGTGACCAGACTTTAGGTA...CAGGGGACTTACTTCTCACGCCT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1975 ACCAGAATCTACAGCCATTCACTGTTACCTGTCCTACGTTCAGGACATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122195 ACCAGAATCTACAGCCATTCACTGTTACCTGTCCTACGTTCAGGACATGT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2025 CAAAGCCTTTGCCCATATTACTGGTGGAGGATTACTAGAGAACATCCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122245 CAAAGCCTTTGCCCATATTACTGGTGGAGGATTACTAGAGAACATCCCCA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2075 GAGTCCTCCCTGAGAAACTTGGGGTAGATTTAG         ATGCCCAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 122295 GAGTCCTCCCTGAGAAACTTGGGGTAGATTTAGGTA...CAGATGCCCAG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2116 ACCTGGAGGATCCCCAGGGTCTTCTCATGGTTGCAGCAGGAAGGACACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127866 ACCTGGAGGATCCCCAGGGTCTTCTCATGGTTGCAGCAGGAAGGACACCT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2166 CTCTGAGGAAGAGATGGCCAGAACATTTAACTGTGGGGTTGGCGCTGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127916 CTCTGAGGAAGAGATGGCCAGAACATTTAACTGTGGGGTTGGCGCTGTCC

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2216 TTGTGGTATCAAAGGAGCAGACAGAGCAGATTCTGAGGGATATCCAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127966 TTGTGGTATCAAAGGAGCAGACAGAGCAGATTCTGAGGGATATCCAGCAG

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2266 CACAAGGAAGAAGCCTGGGTGATTGGCAGTGTGGTTGCACGAGCTGAAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 128016 CACAAGGAAGAAGCCTGGGTGATTGGCAGTGTGGTTGCACGAGCTGAAGG

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2315         GTTCCCCACGTGTGAAAGTCAAGAATCTGATTGAAAGCATGC
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128066 TA...AAGGTTCCCCACGTGTGAAAGTCAAGAATCTGATTGAAAGCATGC

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2357 AAATAAATGGGTCAGTGTTGAAGAATGGCTCCCTGACAAATCATTTCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129438 AAATAAATGGGTCAGTGTTGAAGAATGGCTCCCTGACAAATCATTTCTCT

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2407 TTTGAAAAAAAAAAGGCCAGAGTGGCTGTCTTAATATCTGGAACAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 129488 TTTGAAAAAAAAAAGGCCAGAGTGGCTGTCTTAATATCTGGAACAGGTG.

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2453      GATCGAACCTGCAAGCACTTATAGACAGTACTCGGGAACCAAATA
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129538 ..CAGGATCGAACCTGCAAGCACTTATAGACAGTACTCGGGAACCAAATA

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2498 GCTCTGCACAAATTGATATTGTTATCTCCAACAAAGCCGCAGTAGCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133257 GCTCTGCACAAATTGATATTGTTATCTCCAACAAAGCCGCAGTAGCTGGG

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2548 TTAGATAAAGCGGAAAGAGCTGGTATTCCCACTAGA         GTAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 133307 TTAGATAAAGCGGAAAGAGCTGGTATTCCCACTAGAGTA...CAGGTAAT

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2589 TAATCATAAACTGTATAAAAATCGTGTAGAATTTGACAGTGCAATTGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133619 TAATCATAAACTGTATAAAAATCGTGTAGAATTTGACAGTGCAATTGACC

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2639 TAGTCCTTGAAGAGTTCTCCATAGACATAGTCTGTCTTGCAGGATTCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133669 TAGTCCTTGAAGAGTTCTCCATAGACATAGTCTGTCTTGCAGGATTCATG

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2689 AGAATTCTTTCTGGCCCCTTTGTCCAAAAGTGGAATG         GAAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 133719 AGAATTCTTTCTGGCCCCTTTGTCCAAAAGTGGAATGGTA...TAGGAAA

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2730 AATGCTCAATATCCACCCATCCTTGCTCCCTTCTTTTAAGGGTTCAAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134793 AATGCTCAATATCCACCCATCCTTGCTCCCTTCTTTTAAGGGTTCAAATG

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2780 CCCATGAGCAAGCCCTGGAAACCGGAGTCACAGTTACTGGGTGCACTGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134843 CCCATGAGCAAGCCCTGGAAACCGGAGTCACAGTTACTGGGTGCACTGTA

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2830 CACTTTGTAGCT         GAAGATGTGGATGCTGGACAGATTATTTT
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 134893 CACTTTGTAGCTGTG...CAGGAAGATGTGGATGCTGGACAGATTATTTT

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2871 GCAAGAAGCTGTTCCCGTGAAGAGGGGTGATACTGTCGCAACTCTTTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135030 GCAAGAAGCTGTTCCCGTGAAGAGGGGTGATACTGTCGCAACTCTTTCTG

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2921 AAAGAGTAAAATTAGCAGAACATAAAATATTTCCTGCAGCCCTTCAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135080 AAAGAGTAAAATTAGCAGAACATAAAATATTTCCTGCAGCCCTTCAGCTG

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2971 GTGGCCAGTGGAACTGTACAGCTTGGAGAAAATGGCAAGATCTGTTGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135130 GTGGCCAGTGGAACTGTACAGCTTGGAGAAAATGGCAAGATCTGTTGGGT

   3200     .    :
   3021 TAAAGAGGAA
        ||||||||||
 135180 TAAAGAGGAA