seq1 = pF1KB3013.tfa, 1368 bp
seq2 = pF1KB3013/gi568815581r_67240846.tfa (gi568815581r:67240846_67466519), 225674 bp

>pF1KB3013 1368
>gi568815581r:67240846_67466519 (Chr17)

(complement)

1-108  (100001-100108)   100% ->
109-168  (108942-109001)   100% ->
169-297  (109089-109217)   100% ->
298-405  (116184-116291)   100% ->
406-510  (117866-117970)   100% ->
511-660  (119035-119184)   100% ->
661-795  (119270-119404)   100% ->
796-908  (120663-120775)   100% ->
909-1083  (121740-121914)   100% ->
1084-1161  (124257-124334)   100% ->
1162-1368  (125468-125674)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGACGGCGGCTCGGAGCGGGCTGACGGGCGCATCGTCAAGATGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGACGGCGGCTCGGAGCGGGCTGACGGGCGCATCGTCAAGATGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGTGGACTACAGCGCCACGGTGGATCAGCGCCTACCCGAGTGTGCGAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGTGGACTACAGCGCCACGGTGGATCAGCGCCTACCCGAGTGTGCGAAGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TAGCCAAG         GAAGGAAGACTTCAAGAAGTCATTGAAACCCTT
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TAGCCAAGGTG...TAGGAAGGAAGACTTCAAGAAGTCATTGAAACCCTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CTCTCTCTGGAAAAGCAGACTCGTACT         GCTTCCGATATGGT
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 108975 CTCTCTCTGGAAAAGCAGACTCGTACTGTG...CAGGCTTCCGATATGGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 ATCGACATCCCGTATCTTAGTTGCAGTAGTGAAGATGTGCTATGAGGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109103 ATCGACATCCCGTATCTTAGTTGCAGTAGTGAAGATGTGCTATGAGGCTA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AAGAATGGGATTTACTTAATGAAAATATTATGCTTTTGTCCAAAAGGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109153 AAGAATGGGATTTACTTAATGAAAATATTATGCTTTTGTCCAAAAGGCGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AGTCAGTTAAAACAA         GCTGTTGCCAAAATGGTTCAACAGTG
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 109203 AGTCAGTTAAAACAAGTG...TAGGCTGTTGCCAAAATGGTTCAACAGTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CTGTACTTATGTTGAGGAAATCACAGACCTTCCTATCAAACTTCGATTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116210 CTGTACTTATGTTGAGGAAATCACAGACCTTCCTATCAAACTTCGATTAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TTGATACTCTACGAATGGTTACCGAAGGCAAG         ATTTATGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 116260 TTGATACTCTACGAATGGTTACCGAAGGCAAGGTA...TAGATTTATGTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 GAAATTGAGCGTGCGCGACTGACTAAAACATTAGCAACTATAAAAGAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117875 GAAATTGAGCGTGCGCGACTGACTAAAACATTAGCAACTATAAAAGAACA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 AAATGGTGATGTGAAAGAGGCAGCCTCCATTTTACAGGAGTTACAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 117925 AAATGGTGATGTGAAAGAGGCAGCCTCCATTTTACAGGAGTTACAGGTA.

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    511      GTGGAAACCTACGGGTCAATGGAAAAGAAAGAGCGAGTGGAATTT
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117975 ..TAGGTGGAAACCTACGGGTCAATGGAAAAGAAAGAGCGAGTGGAATTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 ATTTTGGAGCAAATGAGGCTCTGCCTAGCTGTGAAGGATTACATTCGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119080 ATTTTGGAGCAAATGAGGCTCTGCCTAGCTGTGAAGGATTACATTCGAAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 ACAAATCATCAGCAAGAAAATTAACACCAAATTTTTCCAGGAAGAAAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119130 ACAAATCATCAGCAAGAAAATTAACACCAAATTTTTCCAGGAAGAAAATA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 CAGAG         AAATTAAAGTTGAAGTACTATAATTTAATGATTCAG
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119180 CAGAGGTG...CAGAAATTAAAGTTGAAGTACTATAATTTAATGATTCAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 CTGGATCAACATGAGGGATCCTATTTGTCTATTTGTAAGCACTACAGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119306 CTGGATCAACATGAGGGATCCTATTTGTCTATTTGTAAGCACTACAGAGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 AATATATGATACTCCCTGTATACAGGCAGAAAGTGAAAAATGGCAGCAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 119356 AATATATGATACTCCCTGTATACAGGCAGAAAGTGAAAAATGGCAGCAGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    796         GCTCTGAAGAGTGTTGTACTCTATGTTATCCTGGCTCCTTTT
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119406 TA...TAGGCTCTGAAGAGTGTTGTACTCTATGTTATCCTGGCTCCTTTT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 GACAATGAACAGTCAGATTTGGTTCACCGAATAAGTGGTGACAAGAAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120705 GACAATGAACAGTCAGATTTGGTTCACCGAATAAGTGGTGACAAGAAGTT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 AGAAGAAATTCCCAAATACAA         GGATCTTTTAAAGCTTTTTA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 120755 AGAAGAAATTCCCAAATACAAGTA...CAGGGATCTTTTAAAGCTTTTTA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 CCACAATGGAGTTGATGCGTTGGTCCACACTTGTTGAGGACTATGGAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121760 CCACAATGGAGTTGATGCGTTGGTCCACACTTGTTGAGGACTATGGAATG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 GAATTAAGAAAAGGTTCCCTTGAGAGTCCTGCAACGGATGTTTTTGGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121810 GAATTAAGAAAAGGTTCCCTTGAGAGTCCTGCAACGGATGTTTTTGGTTC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 TACAGAGGAAGGTGAAAAAAGGTGGAAAGACTTGAAGAACAGAGTTGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121860 TACAGAGGAAGGTGAAAAAAGGTGGAAAGACTTGAAGAACAGAGTTGTTG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 AACAT         AATATTAGAATAATGGCCAAGTATTATACTCGGATA
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121910 AACATGTA...CAGAATATTAGAATAATGGCCAAGTATTATACTCGGATA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 ACAATGAAAAGGATGGCACAGCTTCTGGATCTATCTGTTGAT        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 124293 ACAATGAAAAGGATGGCACAGCTTCTGGATCTATCTGTTGATGTA...CA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1162  GAGTCCGAAGCCTTTCTCTCAAATCTAGTAGTTAACAAGACCATCTTTG
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125467 GGAGTCCGAAGCCTTTCTCTCAAATCTAGTAGTTAACAAGACCATCTTTG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 CTAAAGTAGACAGATTAGCAGGAATTATCAACTTCCAGAGACCCAAGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125517 CTAAAGTAGACAGATTAGCAGGAATTATCAACTTCCAGAGACCCAAGGAT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 CCAAATAATTTATTAAATGACTGGTCTCAGAAACTGAACTCATTAATGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125567 CCAAATAATTTATTAAATGACTGGTCTCAGAAACTGAACTCATTAATGTC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 TCTGGTTAACAAAACTACGCATCTCATAGCCAAAGAGGAGATGATACATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125617 TCTGGTTAACAAAACTACGCATCTCATAGCCAAAGAGGAGATGATACATA

   1450     .
   1361 ATCTACAA
        ||||||||
 125667 ATCTACAA