seq1 = pF1KB3004.tfa, 3150 bp
seq2 = pF1KB3004/gi568815583f_40065051.tfa (gi568815583f:40065051_40320756), 255706 bp

>pF1KB3004 3150
>gi568815583f:40065051_40320756 (Chr15)

1-35  (96171-96205)   100% ->
36-179  (100003-100146)   100% ->
180-239  (105012-105071)   100% ->
240-384  (105487-105631)   100% ->
385-581  (111427-111623)   100% ->
582-751  (118664-118833)   100% ->
752-966  (120115-120329)   100% ->
967-1058  (120501-120592)   100% ->
1059-1288  (131495-131724)   100% ->
1289-1401  (134565-134677)   100% ->
1402-1517  (135194-135309)   100% ->
1518-1567  (135881-135930)   100% ->
1568-1628  (137355-137415)   100% ->
1629-1734  (137539-137644)   100% ->
1735-2009  (141134-141408)   100% ->
2010-2143  (143587-143720)   100% ->
2144-2284  (144585-144725)   100% ->
2285-2385  (145060-145160)   100% ->
2386-2535  (147449-147598)   100% ->
2536-2678  (148282-148424)   100% ->
2679-2850  (152446-152617)   100% ->
2851-2957  (153406-153512)   100% ->
2958-3150  (155514-155706)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGCGGTGAAGAAGGAAGGGGGTGCTCTGAG         TGAAGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
  96171 ATGGCGGCGGTGAAGAAGGAAGGGGGTGCTCTGAGGTA...CAGTGAAGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 CATGTCCCTGGAGGGAGATGAATGGGAACTGAGTAAAGAAAATGTACAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100009 CATGTCCCTGGAGGGAGATGAATGGGAACTGAGTAAAGAAAATGTACAAC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CTTTAAGGCAAGGGCGGATCATGTCCACGCTTCAGGGAGCACTGGCACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100059 CTTTAAGGCAAGGGCGGATCATGTCCACGCTTCAGGGAGCACTGGCACAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GAATCTGCCTGTAACAATACTCTTCAGCAGCAGAAACG         GGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 100109 GAATCTGCCTGTAACAATACTCTTCAGCAGCAGAAACGGTG...CAGGGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 ATTTGAATATGAAATTCGATTTTACACTGGAAATGACCCTCTGGATGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105015 ATTTGAATATGAAATTCGATTTTACACTGGAAATGACCCTCTGGATGTTT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GGGATAG         GTATATCAGCTGGACAGAGCAGAACTATCCTCAA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105065 GGGATAGGTG...TAGGTATATCAGCTGGACAGAGCAGAACTATCCTCAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 GGTGGGAAGGAGAGTAATATGTCAACGTTATTAGAAAGAGCTGTAGAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105521 GGTGGGAAGGAGAGTAATATGTCAACGTTATTAGAAAGAGCTGTAGAAGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 ACTACAAGGAGAAAAACGATATTATAGTGATCCTCGATTTCTCAATCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105571 ACTACAAGGAGAAAAACGATATTATAGTGATCCTCGATTTCTCAATCTCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 GGCTTAAATTA         GGGCGTTTATGCAATGAGCCTTTGGATATG
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 105621 GGCTTAAATTAGTA...CAGGGGCGTTTATGCAATGAGCCTTTGGATATG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 TACAGTTACTTGCACAACCAAGGGATTGGTGTTTCACTTGCTCAGTTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111457 TACAGTTACTTGCACAACCAAGGGATTGGTGTTTCACTTGCTCAGTTCTA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 TATCTCATGGGCAGAAGAATATGAAGCTAGAGAAAACTTTAGGAAAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111507 TATCTCATGGGCAGAAGAATATGAAGCTAGAGAAAACTTTAGGAAAGCAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 ATGCGATATTTCAGGAAGGGATTCAACAGAAGGCTGAACCACTAGAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111557 ATGCGATATTTCAGGAAGGGATTCAACAGAAGGCTGAACCACTAGAAAGA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 CTACAGTCCCAGCACCG         ACAATTCCAAGCTCGAGTGTCTCG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 111607 CTACAGTCCCAGCACCGGTA...TAGACAATTCCAAGCTCGAGTGTCTCG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 GCAAACTCTGTTGGCACTTGAGAAAGAAGAAGAGGAGGAAGTTTTTGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118688 GCAAACTCTGTTGGCACTTGAGAAAGAAGAAGAGGAGGAAGTTTTTGAGT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 CTTCTGTACCACAACGAAGCACACTAGCTGAACTAAAGAGCAAAGGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118738 CTTCTGTACCACAACGAAGCACACTAGCTGAACTAAAGAGCAAAGGGAAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 AAGACAGCAAGAGCTCCAATCATCCGTGTAGGAGGTGCTCTCAAGG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 118788 AAGACAGCAAGAGCTCCAATCATCCGTGTAGGAGGTGCTCTCAAGGGTA.

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    752      CTCCAAGCCAGAACAGAGGACTCCAAAATCCATTTCCTCAACAGA
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118838 ..TAGCTCCAAGCCAGAACAGAGGACTCCAAAATCCATTTCCTCAACAGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 TGCAAAATAATAGTAGAATTACTGTTTTTGATGAAAATGCTGATGAGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120160 TGCAAAATAATAGTAGAATTACTGTTTTTGATGAAAATGCTGATGAGGCT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 TCTACAGCAGAGTTGTCTAAGCCTACAGTCCAGCCATGGATAGCACCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120210 TCTACAGCAGAGTTGTCTAAGCCTACAGTCCAGCCATGGATAGCACCCCC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 CATGCCCAGGGCCAAAGAGAATGAGCTGCAAGCAGGCCCTTGGAACACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120260 CATGCCCAGGGCCAAAGAGAATGAGCTGCAAGCAGGCCCTTGGAACACAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 GCAGGTCCTTGGAACACAGG         CCTCGTGGCAATACAGCTTCA
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 120310 GCAGGTCCTTGGAACACAGGGTA...CAGCCTCGTGGCAATACAGCTTCA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 CTGATAGCTGTACCCGCTGTGCTTCCCAGTTTCACTCCATATGTGGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120522 CTGATAGCTGTACCCGCTGTGCTTCCCAGTTTCACTCCATATGTGGAAGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 GACTGCACGACAGCCAGTTAT         GACACCATGTAAAATTGAAC
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 120572 GACTGCACGACAGCCAGTTATGTG...TAGGACACCATGTAAAATTGAAC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 CTAGTATAAACCACATCCTAAGCACCAGAAAGCCTGGAAAGGAAGAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131515 CTAGTATAAACCACATCCTAAGCACCAGAAAGCCTGGAAAGGAAGAAGGA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 GATCCTCTACAAAGGGTTCAGAGCCATCAGCAAGCGTCTGAGGAGAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131565 GATCCTCTACAAAGGGTTCAGAGCCATCAGCAAGCGTCTGAGGAGAAGAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 AGAGAAGATGATGTATTGTAAGGAGAAGATTTATGCAGGAGTAGGGGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131615 AGAGAAGATGATGTATTGTAAGGAGAAGATTTATGCAGGAGTAGGGGAAT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 TCTCCTTTGAAGAAATTCGGGCTGAAGTTTTCCGGAAGAAATTAAAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131665 TCTCCTTTGAAGAAATTCGGGCTGAAGTTTTCCGGAAGAAATTAAAAGAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 CAAAGGGAAG         CCGAGCTATTGACCAGTGCAGAGAAGAGAGC
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 131715 CAAAGGGAAGGTG...TAGCCGAGCTATTGACCAGTGCAGAGAAGAGAGC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 AGAAATGCAGAAACAGATTGAAGAGATGGAGAAGAAGCTAAAAGAAATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134596 AGAAATGCAGAAACAGATTGAAGAGATGGAGAAGAAGCTAAAAGAAATCC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 AAACTACTCAGCAAGAAAGAACAGGTGATCAG         CAAGAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 134646 AAACTACTCAGCAAGAAAGAACAGGTGATCAGGTA...CAGCAAGAAGAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1411 ACGATGCCTACAAAGGAGACAACTAAACTGCAAATTGCTTCCGAGTCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135203 ACGATGCCTACAAAGGAGACAACTAAACTGCAAATTGCTTCCGAGTCTCA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1461 GAAAATACCAGGAATGACTCTATCCAGTTCTGTTTGTCAAGTAAACTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135253 GAAAATACCAGGAATGACTCTATCCAGTTCTGTTTGTCAAGTAAACTGTT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1511 GTGCCAG         AGAAACTTCACTTGCGGAGAACATTTGGCAGGAA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135303 GTGCCAGGTA...CAGAGAAACTTCACTTGCGGAGAACATTTGGCAGGAA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1552 CAACCTCATTCTAAAG         GTCCCAGTGTACCTTTCTCCATTTT
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 135915 CAACCTCATTCTAAAGGTG...TAGGTCCCAGTGTACCTTTCTCCATTTT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1593 TGATGAGTTTCTTCTTTCAGAAAAGAAGAATAAAAG         TCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 137380 TGATGAGTTTCTTCTTTCAGAAAAGAAGAATAAAAGGTA...CAGTCCTC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1634 CTGCAGATCCCCCACGAGTTTTAGCTCAACGAAGACCCCTTGCAGTTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137544 CTGCAGATCCCCCACGAGTTTTAGCTCAACGAAGACCCCTTGCAGTTCTC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1684 AAAACCTCAGAAAGCATCACCTCAAATGAAGATGTGTCTCCAGATGTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137594 AAAACCTCAGAAAGCATCACCTCAAATGAAGATGTGTCTCCAGATGTTTG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1734 T         GATGAATTTACAGGAATTGAACCCTTGAGCGAGGATGCCA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137644 TGTA...CAGGATGAATTTACAGGAATTGAACCCTTGAGCGAGGATGCCA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1775 TTATCACAGGCTTCAGAAATGTAACAATTTGTCCTAACCCAGAAGACACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141174 TTATCACAGGCTTCAGAAATGTAACAATTTGTCCTAACCCAGAAGACACT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1825 TGTGACTTTGCCAGAGCAGCTCGTTTTGTATCCACTCCTTTTCATGAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141224 TGTGACTTTGCCAGAGCAGCTCGTTTTGTATCCACTCCTTTTCATGAGAT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1875 AATGTCCTTGAAGGATCTCCCTTCTGATCCTGAGAGACTGTTACCGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141274 AATGTCCTTGAAGGATCTCCCTTCTGATCCTGAGAGACTGTTACCGGAAG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1925 AAGATCTAGATGTAAAGACCTCTGAGGACCAGCAGACAGCTTGTGGCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141324 AAGATCTAGATGTAAAGACCTCTGAGGACCAGCAGACAGCTTGTGGCACT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1975 ATCTACAGTCAGACTCTCAGCATCAAGAAGCTGAG         CCCAAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 141374 ATCTACAGTCAGACTCTCAGCATCAAGAAGCTGAGGTG...TAGCCCAAT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2016 TATTGAAGACAGTCGTGAAGCCACACACTCCTCTGGCTTCTCTGGTTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143593 TATTGAAGACAGTCGTGAAGCCACACACTCCTCTGGCTTCTCTGGTTCTT

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2066 CTGCCTCGGTTGCAAGCACCTCCTCCATCAAATGTCTTCAAATTCCTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143643 CTGCCTCGGTTGCAAGCACCTCCTCCATCAAATGTCTTCAAATTCCTGAG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2116 AAACTAGAACTTACTAATGAGACTTCAG         AAAACCCTACTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 143693 AAACTAGAACTTACTAATGAGACTTCAGGTA...CAGAAAACCCTACTCA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2157 GTCACCATGGTGTTCACAGTATCGCAGACAGCTACTGAAGTCCCTACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144598 GTCACCATGGTGTTCACAGTATCGCAGACAGCTACTGAAGTCCCTACCAG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2207 AGTTAAGTGCCTCTGCAGAGTTGTGTATAGAAGACAGACCAATGCCTAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144648 AGTTAAGTGCCTCTGCAGAGTTGTGTATAGAAGACAGACCAATGCCTAAG

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2257 TTGGAAATTGAGAAGGAAATTGAATTAG         GTAATGAGGATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 144698 TTGGAAATTGAGAAGGAAATTGAATTAGGTA...CAGGTAATGAGGATTA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2298 CTGCATTAAACGAGAATACCTAATATGTGAAGATTACAAGTTATTCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145073 CTGCATTAAACGAGAATACCTAATATGTGAAGATTACAAGTTATTCTGGG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2348 TGGCGCCAAGAAACTCTGCAGAATTAACAGTAATAAAG         GTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 145123 TGGCGCCAAGAAACTCTGCAGAATTAACAGTAATAAAGGTG...CAGGTA

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2389 TCTTCTCAACCTGTCCCATGGGACTTTTATATCAACCTCAAGTTAAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147452 TCTTCTCAACCTGTCCCATGGGACTTTTATATCAACCTCAAGTTAAAGGA

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2439 ACGTTTAAATGAAGATTTTGATCATTTTTGCAGCTGTTATCAATATCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147502 ACGTTTAAATGAAGATTTTGATCATTTTTGCAGCTGTTATCAATATCAAG

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2489 ATGGCTGTATTGTTTGGCACCAATATATAAACTGCTTCACCCTTCAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 147552 ATGGCTGTATTGTTTGGCACCAATATATAAACTGCTTCACCCTTCAGGTC

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2536       GATCTTCTCCAACACAGTGAATATATTACCCATGAAATAACAGT
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147602 ...CAGGATCTTCTCCAACACAGTGAATATATTACCCATGAAATAACAGT

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2580 GTTGATTATTTATAACCTTTTGACAATAGTGGAGATGCTACACAAAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148326 GTTGATTATTTATAACCTTTTGACAATAGTGGAGATGCTACACAAAGCAG

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2630 AAATAGTCCATGGTGACTTGAGTCCAAGGTGTCTGATTCTCAGAAACAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 148376 AAATAGTCCATGGTGACTTGAGTCCAAGGTGTCTGATTCTCAGAAACAGG

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2679         AATCCACGATCCCTATGATTGTAACAAGAACAATCAAGCTTT
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148426 TT...CAGAATCCACGATCCCTATGATTGTAACAAGAACAATCAAGCTTT

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2721 GAAGATAGTGGACTTTTCCTACAGTGTTGACCTTAGGGTGCAGCTGGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152488 GAAGATAGTGGACTTTTCCTACAGTGTTGACCTTAGGGTGCAGCTGGATG

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2771 TTTTTACCCTCAGCGGCTTTCGGACTGTACAGATCCTGGAAGGACAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152538 TTTTTACCCTCAGCGGCTTTCGGACTGTACAGATCCTGGAAGGACAAAAG

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2821 ATCCTGGCTAACTGTTCTTCTCCCTACCAG         GTAGACCTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 152588 ATCCTGGCTAACTGTTCTTCTCCCTACCAGGTA...CAGGTAGACCTGTT

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2862 TGGTATAGCAGATTTAGCACATTTACTATTGTTCAAGGAACACCTACAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153417 TGGTATAGCAGATTTAGCACATTTACTATTGTTCAAGGAACACCTACAGG

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2912 TCTTCTGGGATGGGTCCTTCTGGAAACTTAGCCAAAATATTTCTGA    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 153467 TCTTCTGGGATGGGTCCTTCTGGAAACTTAGCCAAAATATTTCTGAGTA.

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2958      GCTAAAAGATGGTGAATTGTGGAATAAATTCTTTGTGCGGATTCT
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153517 ..TAGGCTAAAAGATGGTGAATTGTGGAATAAATTCTTTGTGCGGATTCT

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3003 GAATGCCAATGATGAGGCCACAGTGTCTGTTCTTGGGGAGCTTGCAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155559 GAATGCCAATGATGAGGCCACAGTGTCTGTTCTTGGGGAGCTTGCAGCAG

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3053 AAATGAATGGGGTTTTTGACACTACATTCCAAAGTCACCTGAACAAAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155609 AAATGAATGGGGTTTTTGACACTACATTCCAAAGTCACCTGAACAAAGCC

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   3103 TTATGGAAGGTAGGGAAGTTAACTAGTCCTGGGGCTTTGCTCTTTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155659 TTATGGAAGGTAGGGAAGTTAACTAGTCCTGGGGCTTTGCTCTTTCAG