seq1 = pF1KB3003.tfa, 1899 bp
seq2 = pF1KB3003/gi568815579r_43443399.tfa (gi568815579r:43443399_43675458), 232060 bp

>pF1KB3003 1899
>gi568815579r:43443399_43675458 (Chr19)

(complement)

1-51  (100001-100051)   100% ->
52-144  (100457-100549)   100% ->
145-255  (114439-114549)   100% ->
256-414  (120655-120813)   100% ->
415-489  (121776-121850)   100% ->
490-601  (121947-122058)   100% ->
602-711  (122368-122477)   100% ->
712-823  (122551-122662)   100% ->
824-1082  (123184-123442)   100% ->
1083-1199  (123772-123888)   100% ->
1200-1293  (128482-128575)   100% ->
1294-1426  (128732-128864)   100% ->
1427-1481  (129353-129407)   100% ->
1482-1621  (129502-129641)   100% ->
1622-1712  (131225-131315)   100% ->
1713-1788  (131772-131847)   100% ->
1789-1899  (131954-132064)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCGGAGATCCGCCTCCGCCATGTCGTGTCCTGCAGCAGCCAGGACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCGGAGATCCGCCTCCGCCATGTCGTGTCCTGCAGCAGCCAGGACTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 G         ACTCACTGTGCAGAAAATCTTCTCAAGGCAGACACTTACC
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGTG...CAGACTCACTGTGCAGAAAATCTTCTCAAGGCAGACACTTACC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GAAAATGGCGGGCAGCCAAGGCAGGCGAGAAGACCATCTCTGTGGTCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100497 GAAAATGGCGGGCAGCCAAGGCAGGCGAGAAGACCATCTCTGTGGTCCTA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CAG         TTGGAGAAGGAGGAGCAGATACACAGTGTGGACATTGG
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100547 CAGGTG...CAGTTGGAGAAGGAGGAGCAGATACACAGTGTGGACATTGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GAATGATGGCTCAGCTTTCGTGGAGGTGCTGGTGGGCAGTTCAGCTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114477 GAATGATGGCTCAGCTTTCGTGGAGGTGCTGGTGGGCAGTTCAGCTGGAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GCGCTGGGGAGCAAGACTATGAG         GTCCTTCTGGTCACCTCA
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 114527 GCGCTGGGGAGCAAGACTATGAGGTA...CAGGTCCTTCTGGTCACCTCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 TCTTTCATGTCCCCTTCCGAGAGCCGCAGTGGCTCAAACCCCAACCGCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120673 TCTTTCATGTCCCCTTCCGAGAGCCGCAGTGGCTCAAACCCCAACCGCGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 TCGCATGTTTGGGCCTGACAAGCTGGTCCGGGCAGCCGCCGAGAAGCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120723 TCGCATGTTTGGGCCTGACAAGCTGGTCCGGGCAGCCGCCGAGAAGCGCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 GGGACCGGGTCAAAATTGTTTGCAGCCAGCCCTACAGCAAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 120773 GGGACCGGGTCAAAATTGTTTGCAGCCAGCCCTACAGCAAGGTA...CAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 GACTCCCCCTTTGGCTTGAGTTTTGTACGGTTTCATAGCCCCCCAGACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121776 GACTCCCCCTTTGGCTTGAGTTTTGTACGGTTTCATAGCCCCCCAGACAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 AGATGAGGCAGAGGCCCCGTCCCAG         AAGGTGACAGTGACCA
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 121826 AGATGAGGCAGAGGCCCCGTCCCAGGTA...TAGAAGGTGACAGTGACCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 AGCTTGGCCAGTTCCGTGTGAAGGAGGAGGATGAGAGCGCCAACTCTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121963 AGCTTGGCCAGTTCCGTGTGAAGGAGGAGGATGAGAGCGCCAACTCTCTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 AGGCCGGGGGCTCTCTTCTTCAGCCGGATCAACAAGACATCCCCAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 122013 AGGCCGGGGGCTCTCTTCTTCAGCCGGATCAACAAGACATCCCCAGGTG.

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    602      TCACAGCCAGCGACCCAGCAGGACCTAGCTATGCAGCTGCTACCC
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122063 ..TAGTCACAGCCAGCGACCCAGCAGGACCTAGCTATGCAGCTGCTACCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 TCCAGGCTTCTAGTGCTGCCTCCTCAGCCTCTCCAGTCTCCAGGGCCATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122413 TCCAGGCTTCTAGTGCTGCCTCCTCAGCCTCTCCAGTCTCCAGGGCCATA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 GGCAGCACCTCCAAG         CCCCAGGAGTCTCCCAAAGGGAAGAG
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 122463 GGCAGCACCTCCAAGGTG...CAGCCCCAGGAGTCTCCCAAAGGGAAGAG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 GAAGTTGGATTTGAACCAAGAAGAAAAGAAGACCCCCAGCAAACCACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122577 GAAGTTGGATTTGAACCAAGAAGAAAAGAAGACCCCCAGCAAACCACCAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 CCCAGCTGTCGCCATCTGTTCCCAAGAGACCTAAAT         TGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 122627 CCCAGCTGTCGCCATCTGTTCCCAAGAGACCTAAATGTG...CAGTGCCA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 GCTCCAACTCGTACCCCAGCCACAGCCCCAGTCCCTGCCCGAGCACAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123189 GCTCCAACTCGTACCCCAGCCACAGCCCCAGTCCCTGCCCGAGCACAGGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 GGCAGTGACAGGCAAACCCCGAGGAGAAGGCACCGAGCCCAGACGACCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123239 GGCAGTGACAGGCAAACCCCGAGGAGAAGGCACCGAGCCCAGACGACCCC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 GAGCTGGCCCAGAGGAGCTGGGGAAGATCCTTCAGGGTGTGGTAGTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123289 GAGCTGGCCCAGAGGAGCTGGGGAAGATCCTTCAGGGTGTGGTAGTGGTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 CTGAGTGGCTTCCAGAACCCCTTCCGCTCCGAGCTGCGAGATAAGGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123339 CTGAGTGGCTTCCAGAACCCCTTCCGCTCCGAGCTGCGAGATAAGGCCCT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 AGAGCTTGGGGCCAAGTATCGGCCAGACTGGACCCGGGACAGCACGCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123389 AGAGCTTGGGGCCAAGTATCGGCCAGACTGGACCCGGGACAGCACGCACC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 TCAT         CTGTGCCTTTGCCAACACCCCCAAGTACAGCCAGGTC
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123439 TCATGTA...CAGCTGTGCCTTTGCCAACACCCCCAAGTACAGCCAGGTC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 CTAGGCCTGGGAGGCCGCATCGTGCGTAAGGAGTGGGTGCTGGACTGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123809 CTAGGCCTGGGAGGCCGCATCGTGCGTAAGGAGTGGGTGCTGGACTGTCA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 CCGCATGCGTCGGCGGCTGCCCTCCCAGAG         GTACCTCATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 123859 CCGCATGCGTCGGCGGCTGCCCTCCCAGAGGTA...TAGGTACCTCATGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 CAGGGCCAGGTTCCAGCAGTGAGGAGGATGAGGCCTCTCACAGCGGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128493 CAGGGCCAGGTTCCAGCAGTGAGGAGGATGAGGCCTCTCACAGCGGTGGC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 AGCGGAGATGAAGCCCCCAAGCTTCCTCAGAAG         CAACCCCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 128543 AGCGGAGATGAAGCCCCCAAGCTTCCTCAGAAGGTC...TAGCAACCCCA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1302 GACCAAAACCAAGCCCACTCAGGCAGCTGGACCCAGCTCACCCCAGAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128740 GACCAAAACCAAGCCCACTCAGGCAGCTGGACCCAGCTCACCCCAGAAGC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1352 CCCCAACCCCTGAAGAGACCAAAGCAGCCTCACCAGTGCTCCAGGAAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128790 CCCCAACCCCTGAAGAGACCAAAGCAGCCTCACCAGTGCTCCAGGAAGAT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1402 ATAGACATTGAGGGGGTACAGTCAG         AAGGACAGGACAATGG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 128840 ATAGACATTGAGGGGGTACAGTCAGGTC...CAGAAGGACAGGACAATGG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1443 GGCGGAAGATTCTGGGGACACAGAGGATGAGCTGAGGAG         GG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 129369 GGCGGAAGATTCTGGGGACACAGAGGATGAGCTGAGGAGGTA...CAGGG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1484 TGGCAGAGCAGAAGGAACACAGACTGCCCCCTGGCCAGGAGGAGAATGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129504 TGGCAGAGCAGAAGGAACACAGACTGCCCCCTGGCCAGGAGGAGAATGGG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1534 GAAGACCCGTATGCAGGCTCCACGGATGAGAACACGGACAGTGAGGAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129554 GAAGACCCGTATGCAGGCTCCACGGATGAGAACACGGACAGTGAGGAACA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1584 CCAGGAGCCTCCTGATCTGCCAGTCCCTGAGCTCCCAG         ATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 129604 CCAGGAGCCTCCTGATCTGCCAGTCCCTGAGCTCCCAGGTG...CAGATT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1625 TCTTCCAGGGCAAGCACTTCTTTCTTTACGGGGAGTTCCCTGGGGACGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131228 TCTTCCAGGGCAAGCACTTCTTTCTTTACGGGGAGTTCCCTGGGGACGAG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1675 CGGCGGAAACTCATCCGATACGTCACAGCCTTCAATGG         GGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 131278 CGGCGGAAACTCATCCGATACGTCACAGCCTTCAATGGGTG...CAGGGA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1716 GCTCGAGGACTATATGAGTGACCGGGTTCAGTTTGTGATCACAGCACAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131775 GCTCGAGGACTATATGAGTGACCGGGTTCAGTTTGTGATCACAGCACAGG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1766 AATGGGATCCCAGCTTTGAGGAG         GCCCTGATGGACAACCCC
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 131825 AATGGGATCCCAGCTTTGAGGAGGTG...CAGGCCCTGATGGACAACCCC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1807 TCCCTGGCATTCGTTCGTCCCCGATGGATCTACAGTTGCAATGAGAAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131972 TCCCTGGCATTCGTTCGTCCCCGATGGATCTACAGTTGCAATGAGAAGCA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :
   1857 GAAGTTACTTCCTCACCAGCTCTATGGGGTGGTGCCGCAGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
 132022 GAAGTTACTTCCTCACCAGCTCTATGGGGTGGTGCCGCAAGCC