seq1 = pF1KB3002.tfa, 1725 bp
seq2 = pF1KB3002/gi568815588r_101479456.tfa (gi568815588r:101479456_101687360), 207905 bp

>pF1KB3002 1725
>gi568815588r:101479456_101687360 (Chr10)

(complement)

1-115  (100001-100115)   100% ->
116-410  (101205-101499)   100% ->
411-573  (101883-102045)   100% ->
574-891  (102442-102759)   100% ->
892-1065  (103680-103853)   100% ->
1066-1194  (104470-104598)   100% ->
1195-1363  (106945-107113)   100% ->
1364-1725  (107544-107905)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGATCCCAGGGGTATCTTGAAGGCATTTCCCAAGCGGCAGAAAATTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGATCCCAGGGGTATCTTGAAGGCATTTCCCAAGCGGCAGAAAATTCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGCTGATGCATCATCAAAAGTACTTGCAAAGATTCCTAGGAGGGAAGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGCTGATGCATCATCAAAAGTACTTGCAAAGATTCCTAGGAGGGAAGAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GAGAAGAAGCAGAAG         AGTGGCTGAGCTCCCTTCGGGCCCAT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 100101 GAGAAGAAGCAGAAGGTG...CAGAGTGGCTGAGCTCCCTTCGGGCCCAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GTTGTGCGCACTGGCATTGGACGAGCCCGGGCAGAACTCTTTGAGAAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101231 GTTGTGCGCACTGGCATTGGACGAGCCCGGGCAGAACTCTTTGAGAAGCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GATTGTTCAGCATGGCGGCCAGCTATGCCCTGCCCAGGGCCCAGGTGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101281 GATTGTTCAGCATGGCGGCCAGCTATGCCCTGCCCAGGGCCCAGGTGTCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CTCACATTGTGGTGGATGAAGGCATGGACTATGAGCGAGCCCTCCGCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101331 CTCACATTGTGGTGGATGAAGGCATGGACTATGAGCGAGCCCTCCGCCTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CTCAGACTACCCCAGCTGCCCCCGGGTGCTCAGCTGGTGAAGTCAGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101381 CTCAGACTACCCCAGCTGCCCCCGGGTGCTCAGCTGGTGAAGTCAGCCTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GCTGAGCTTGTGCCTTCAGGAGAGGAGGCTGGTGGATGTAGCTGGATTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101431 GCTGAGCTTGTGCCTTCAGGAGAGGAGGCTGGTGGATGTAGCTGGATTCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 GCATCTTCATCCCCAGTAG         GTACTTGGACCATCCACAGCCC
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 101481 GCATCTTCATCCCCAGTAGGTG...CAGGTACTTGGACCATCCACAGCCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 AGCAAGGCAGAGCAGGATGCTTCTATTCCTCCTGGCACCCATGAGGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101905 AGCAAGGCAGAGCAGGATGCTTCTATTCCTCCTGGCACCCATGAGGCCCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GCTTCAGACAGCCCTTTCTCCTCCTCCTCCTCCCACCAGGCCTGTGTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101955 GCTTCAGACAGCCCTTTCTCCTCCTCCTCCTCCCACCAGGCCTGTGTCTC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 CTCCCCAAAAGGCAAAAGAGGCACCAAACACCCAAGCCCAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 102005 CTCCCCAAAAGGCAAAAGAGGCACCAAACACCCAAGCCCAGGTC...AAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 CCCATCTCTGATGATGAAGCCAGTGATGGGGAAGAAACCCAGGTTAGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102442 CCCATCTCTGATGATGAAGCCAGTGATGGGGAAGAAACCCAGGTTAGTGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 AGCTGATCTGGAAGCCCTCATCAGTGGCCACTACCCCACCTCCCTTGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102492 AGCTGATCTGGAAGCCCTCATCAGTGGCCACTACCCCACCTCCCTTGAGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 GAGATTGTGAGCCTAGCCCAGCCCCTGCTGTCCTGGATAAGTGGGTCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102542 GAGATTGTGAGCCTAGCCCAGCCCCTGCTGTCCTGGATAAGTGGGTCTGT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 GCACAGCCCTCAAGCCAGAAGGCGACCAATCACAACCTCCATATCACAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102592 GCACAGCCCTCAAGCCAGAAGGCGACCAATCACAACCTCCATATCACAGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 GAAGCTGGAAGTTCTGGCCAAAGCCTACAGTGTTCAGGGAGACAAGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102642 GAAGCTGGAAGTTCTGGCCAAAGCCTACAGTGTTCAGGGAGACAAGTGGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 GGGCCCTGGGCTATGCCAAGGCCATCAATGCCCTCAAGAGCTTCCATAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102692 GGGCCCTGGGCTATGCCAAGGCCATCAATGCCCTCAAGAGCTTCCATAAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 CCTGTCACCTCGTACCAG         GAGGCCTGCAGTATCCCTGGGAT
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 102742 CCTGTCACCTCGTACCAGGTA...TAGGAGGCCTGCAGTATCCCTGGGAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 TGGGAAGCGGATGGCTGAGAAAATCATAGAGATCCTGGAGAGCGGGCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103703 TGGGAAGCGGATGGCTGAGAAAATCATAGAGATCCTGGAGAGCGGGCATT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 TGCGGAAGCTGGACCATATCAGTGAGAGCGTGCCTGTCTTGGAGCTCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103753 TGCGGAAGCTGGACCATATCAGTGAGAGCGTGCCTGTCTTGGAGCTCTTC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1015 TCCAACATCTGGGGAGCTGGGACCAAGACTGCCCAGATGTGGTACCAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103803 TCCAACATCTGGGGAGCTGGGACCAAGACTGCCCAGATGTGGTACCAACA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1065 G         GGCTTCCGAAGTCTGGAAGACATCCGCAGCCAGGCCTCCC
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103853 GGTC...CAGGGCTTCCGAAGTCTGGAAGACATCCGCAGCCAGGCCTCCC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106 TGACAACCCAGCAGGCCATCGGCCTGAAGCATTACAGTGACTTCCTGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104510 TGACAACCCAGCAGGCCATCGGCCTGAAGCATTACAGTGACTTCCTGGAA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1156 CGTATGCCCAGGGAGGAGGCTACAGAGATTGAGCAGACA         GT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 104560 CGTATGCCCAGGGAGGAGGCTACAGAGATTGAGCAGACAGTA...CAGGT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1197 CCAGAAAGCAGCCCAGGCCTTTAACTCTGGGCTGCTGTGTGTGGCATGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106947 CCAGAAAGCAGCCCAGGCCTTTAACTCTGGGCTGCTGTGTGTGGCATGTG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1247 GTTCATACCGACGGGGAAAGGCGACCTGTGGTGATGTCGACGTGCTCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106997 GTTCATACCGACGGGGAAAGGCGACCTGTGGTGATGTCGACGTGCTCATC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1297 ACTCACCCAGATGGCCGGTCCCACCGGGGTATCTTCAGCCGCCTCCTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107047 ACTCACCCAGATGGCCGGTCCCACCGGGGTATCTTCAGCCGCCTCCTTGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1347 CAGTCTTCGGCAGGAAG         GGTTCCTCACAGATGACTTGGTGA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 107097 CAGTCTTCGGCAGGAAGGTA...CAGGGTTCCTCACAGATGACTTGGTGA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1388 GCCAAGAGGAGAATGGTCAGCAACAGAAGTACTTGGGGGTGTGCCGGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107568 GCCAAGAGGAGAATGGTCAGCAACAGAAGTACTTGGGGGTGTGCCGGCTC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1438 CCAGGGCCAGGGCGGCGGCACCGGCGCCTGGACATCATCGTGGTGCCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107618 CCAGGGCCAGGGCGGCGGCACCGGCGCCTGGACATCATCGTGGTGCCCTA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1488 TAGCGAGTTTGCCTGTGCCCTGCTCTACTTCACCGGCTCTGCACACTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107668 TAGCGAGTTTGCCTGTGCCCTGCTCTACTTCACCGGCTCTGCACACTTCA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1538 ACCGCTCCATGCGAGCCCTGGCCAAAACCAAGGGCATGAGTCTGTCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107718 ACCGCTCCATGCGAGCCCTGGCCAAAACCAAGGGCATGAGTCTGTCAGAA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1588 CATGCCCTCAGCACTGCTGTGGTCCGGAACACCCATGGCTGCAAGGTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107768 CATGCCCTCAGCACTGCTGTGGTCCGGAACACCCATGGCTGCAAGGTGGG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1638 GCCTGGCCGAGTGCTGCCCACTCCCACTGAGAAGGATGTCTTCAGGCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107818 GCCTGGCCGAGTGCTGCCCACTCCCACTGAGAAGGATGTCTTCAGGCTCT

   1750     .    :    .    :    .    :    .
   1688 TAGGCCTCCCCTACCGAGAACCTGCTGAGCGGGACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107868 TAGGCCTCCCCTACCGAGAACCTGCTGAGCGGGACTGG