seq1 = pF1KB2501.tfa, 1914 bp
seq2 = pF1KB2501/gi568815586r_74943108.tfa (gi568815586r:74943108_75307983), 364876 bp

>pF1KB2501 1914
>gi568815586r:74943108_75307983 (Chr12)

(complement)

1-687  (100001-100687)   100% ->
688-1615  (256667-257594)   99% ->
1616-1780  (259667-259831)   100% ->
1781-1914  (264743-264876)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGCAAGATCGAGAACAACGAGAGGGTGATCCTCAATGTCGGGGGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGCAAGATCGAGAACAACGAGAGGGTGATCCTCAATGTCGGGGGCAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCGGCACGAAACCTACCGCAGCACCCTCAAGACCCTGCCTGGAACACGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCGGCACGAAACCTACCGCAGCACCCTCAAGACCCTGCCTGGAACACGCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGGCCCTTCTTGCCTCCTCCGAGCCCCCAGGCGACTGCTTGACCACGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGGCCCTTCTTGCCTCCTCCGAGCCCCCAGGCGACTGCTTGACCACGGCG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGCGACAAGCTGCAGCCGTCGCCGCCTCCACTGTCGCCGCCGCCGAGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GGCGACAAGCTGCAGCCGTCGCCGCCTCCACTGTCGCCGCCGCCGAGAGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCCCCCGCTGTCCCCCGGGCCAGGCGGCTGCTTCGAGGGCGGCGCGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GCCCCCGCTGTCCCCCGGGCCAGGCGGCTGCTTCGAGGGCGGCGCGGGCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ACTGCAGTTCCCGCGGCGGCAGGGCCAGCGACCATCCCGGTGGCGGCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ACTGCAGTTCCCGCGGCGGCAGGGCCAGCGACCATCCCGGTGGCGGCCGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GAGTTCTTCTTCGACCGGCACCCGGGCGTCTTCGCCTATGTGCTCAATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GAGTTCTTCTTCGACCGGCACCCGGGCGTCTTCGCCTATGTGCTCAATTA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CTACCGCACCGGCAAGCTGCACTGCCCCGCAGACGTGTGCGGGCCGCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CTACCGCACCGGCAAGCTGCACTGCCCCGCAGACGTGTGCGGGCCGCTCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TCGAGGAGGAGCTGGCCTTCTGGGGCATCGACGAGACCGACGTGGAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TCGAGGAGGAGCTGGCCTTCTGGGGCATCGACGAGACCGACGTGGAGCCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TGCTGCTGGATGACCTACCGGCAGCACCGCGACGCCGAGGAGGCGCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TGCTGCTGGATGACCTACCGGCAGCACCGCGACGCCGAGGAGGCGCTGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CATCTTCGAGACCCCCGACCTCATTGGCGGCGACCCCGGCGACGACGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CATCTTCGAGACCCCCGACCTCATTGGCGGCGACCCCGGCGACGACGAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 ACCTGGCGGCCAAGAGGCTGGGCATCGAGGACGCGGCGGGGCTCGGGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 ACCTGGCGGCCAAGAGGCTGGGCATCGAGGACGCGGCGGGGCTCGGGGGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CCCGACGGCAAATCTGGCCGCTGGAGGAGGCTGCAGCCCCGCATGTGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CCCGACGGCAAATCTGGCCGCTGGAGGAGGCTGCAGCCCCGCATGTGGGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CCTCTTCGAAGACCCCTACTCGTCCAGAGCCGCCAGG         TTTA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 100651 CCTCTTCGAAGACCCCTACTCGTCCAGAGCCGCCAGGGTA...CAGTTTA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 TTGCTTTTGCTTCTTTATTCTTCATCCTGGTTTCAATTACAACTTTTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 256671 TTGCTTTTGCTTCTTTATTCTTCATCCTGGTTTCAATTACAACTTTTTGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 CTGGAAACACATGAAGCTTTCAATATTGTTAAAAACAAGACAGAACCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 256721 CTGGAAACACATGAAGCTTTCAATATTGTTAAAAACAAGACAGAACCAGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 CATCAATGGCACAAGTGTTGTTCTACAGTATGAAATTGAAACGGATCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 256771 CATCAATGGCACAAGTGTTGTTCTACAGTATGAAATTGAAACGGATCCTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 CCTTGACGTATGTAGAAGGAGTGTGTGTGGTGTGGTTTACTTTTGAATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 256821 CCTTGACGTATGTAGAAGGAGTGTGTGTGGTGTGGTTTACTTTTGAATTT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 TTAGTCCGTATTGTTTTTTCATCCAATAAACTTGAATTCATCAAAAATCT
        ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
 256871 TTAGTCCGTATTGTTTTTTCACCCAATAAACTTGAATTCATCAAAAATCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 CTTGAATATCATTGACTTTGTGGCCATCCTACCTTTCTACTTAGAGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 256921 CTTGAATATCATTGACTTTGTGGCCATCCTACCTTTCTACTTAGAGGTGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 GACTCAGTGGGCTGTCATCCAAAGCTGCTAAAGATGTGCTTGGCTTCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 256971 GACTCAGTGGGCTGTCATCCAAAGCTGCTAAAGATGTGCTTGGCTTCCTC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1042 AGGGTGGTAAGGTTTGTGAGGATCCTGAGAATTTTCAAGCTCACCCGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 257021 AGGGTGGTAAGGTTTGTGAGGATCCTGAGAATTTTCAAGCTCACCCGCCA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1092 TTTTGTAGGTCTGAGGGTGCTTGGACATACTCTTCGAGCTAGTACTAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 257071 TTTTGTAGGTCTGAGGGTGCTTGGACATACTCTTCGAGCTAGTACTAATG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1142 AATTTTTGCTGCTGATAATTTTCCTGGCTCTAGGAGTTTTGATATTTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 257121 AATTTTTGCTGCTGATAATTTTCCTGGCTCTAGGAGTTTTGATATTTGCT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1192 ACCATGATCTACTATGCCGAGAGAGTGGGAGCTCAACCTAACGACCCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 257171 ACCATGATCTACTATGCCGAGAGAGTGGGAGCTCAACCTAACGACCCTTC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1242 AGCTAGTGAGCACACACAGTTCAAAAACATTCCCATTGGGTTCTGGTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 257221 AGCTAGTGAGCACACACAGTTCAAAAACATTCCCATTGGGTTCTGGTGGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1292 CTGTAGTGACCATGACTACCCTGGGTTATGGGGATATGTACCCCCAAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 257271 CTGTAGTGACCATGACTACCCTGGGTTATGGGGATATGTACCCCCAAACA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1342 TGGTCAGGCATGCTGGTGGGAGCCCTGTGTGCTCTGGCTGGAGTGCTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 257321 TGGTCAGGCATGCTGGTGGGAGCCCTGTGTGCTCTGGCTGGAGTGCTGAC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1392 AATAGCCATGCCAGTGCCTGTCATTGTCAATAATTTTGGAATGTACTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 257371 AATAGCCATGCCAGTGCCTGTCATTGTCAATAATTTTGGAATGTACTACT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1442 CCTTGGCAATGGCAAAGCAGAAACTTCCAAGGAAAAGAAAGAAGCACATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 257421 CCTTGGCAATGGCAAAGCAGAAACTTCCAAGGAAAAGAAAGAAGCACATC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1492 CCTCCTGCTCCTCAGGCAAGCTCACCTACTTTTTGCAAGACAGAATTAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 257471 CCTCCTGCTCCTCAGGCAAGCTCACCTACTTTTTGCAAGACAGAATTAAA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1542 TATGGCCTGCAATAGTACACAGAGTGACACATGTCTGGGCAAAGACAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 257521 TATGGCCTGCAATAGTACACAGAGTGACACATGTCTGGGCAAAGACAATC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1592 GACTTCTGGAACATAACAGATCAG         TGTTATCAGGTGACGAC
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 257571 GACTTCTGGAACATAACAGATCAGGTA...CAGTGTTATCAGGTGACGAC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1633 AGTACAGGAAGTGAGCCGCCACTATCACCCCCAGAAAGGCTCCCCATCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 259684 AGTACAGGAAGTGAGCCGCCACTATCACCCCCAGAAAGGCTCCCCATCAG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1683 ACGCTCTAGTACCAGAGACAAAAACAGAAGAGGGGAAACATGTTTCCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 259734 ACGCTCTAGTACCAGAGACAAAAACAGAAGAGGGGAAACATGTTTCCTAC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1733 TGACGACAGGTGATTACACGTGTGCTTCTGATGGAGGGATCAGGAAAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 259784 TGACGACAGGTGATTACACGTGTGCTTCTGATGGAGGGATCAGGAAAGGT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1781        GATATGAAAAATCCCGAAGCTTAAACAACATAGCGGGCTTGGC
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 259834 A...AAGGATATGAAAAATCCCGAAGCTTAAACAACATAGCGGGCTTGGC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1824 AGGCAATGCTCTGAGGCTCTCTCCAGTAACATCACCCTACAACTCTCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 264786 AGGCAATGCTCTGAGGCTCTCTCCAGTAACATCACCCTACAACTCTCCTT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :
   1874 GTCCTCTGAGGCGCTCTCGATCTCCCATCCCATCTATCTTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 264836 GTCCTCTGAGGCGCTCTCGATCTCCCATCCCATCTATCTTG