Result of SIM4 for
pF1KB2323
seq1 = pF1KB2323.tfa, 3063 bp
seq2 = pF1KB2323/gi568815597f_116901818.tfa (gi568815597f:116901818_117134098), 232281 bp
>pF1KB2323 3063
>gi568815597f:116901818_117134098 (Chr1)
1-43 (100001-100043) 100% ->
44-424 (108033-108413) 100% ->
425-841 (109733-110149) 100% ->
842-1228 (111589-111975) 100% ->
1229-1612 (115273-115656) 100% ->
1613-2017 (116339-116743) 100% ->
2018-2428 (119756-120166) 100% ->
2429-2824 (123692-124087) 100% ->
2825-3063 (132043-132281) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGGCAGGCATCTCATATGTGGCATCTTTCTTTCTCCTTCTGA
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
100001 ATGGCAGGCATCTCATATGTGGCATCTTTCTTTCTCCTTCTGAGTA...A
50 . : . : . : . : . :
44 CTAAGCTCAGCATTGGCCAGAGAGAAGTAACAGTTCAGAAAGGACCAC
>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
108031 AGCTAAGCTCAGCATTGGCCAGAGAGAAGTAACAGTTCAGAAAGGACCAC
100 . : . : . : . : . :
92 TGTTTAGAGCTGAAGGTTACCCAGTCAGCATTGGCTGCAATGTAACTGGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
108081 TGTTTAGAGCTGAAGGTTACCCAGTCAGCATTGGCTGCAATGTAACTGGC
150 . : . : . : . : . :
142 CACCAGGGACCTTCTGAGCAGCATTTCCAGTGGTCTGTTTACCTGCCGAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
108131 CACCAGGGACCTTCTGAGCAGCATTTCCAGTGGTCTGTTTACCTGCCGAC
200 . : . : . : . : . :
192 AAACCCGACCCAGGAAGTCCAGATCATTAGCACCAAGGATGCTGCCTTCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
108181 AAACCCGACCCAGGAAGTCCAGATCATTAGCACCAAGGATGCTGCCTTCT
250 . : . : . : . : . :
242 CTTACGCAGTATATACGCAGCGGGTGCGAAGCGGAGACGTCTACGTGGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
108231 CTTACGCAGTATATACGCAGCGGGTGCGAAGCGGAGACGTCTACGTGGAG
300 . : . : . : . : . :
292 AGGGTCCAGGGCAACTCAGTCTTGTTGCACATCTCAAAACTCCAGATGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
108281 AGGGTCCAGGGCAACTCAGTCTTGTTGCACATCTCAAAACTCCAGATGAA
350 . : . : . : . : . :
342 GGATGCTGGCGAGTATGAGTGTCACACACCAAACACTGATGAGAAATACT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
108331 GGATGCTGGCGAGTATGAGTGTCACACACCAAACACTGATGAGAAATACT
400 . : . : . : . : . :
392 ATGGAAGTTACAGTGCAAAGACTAATCTAATTG TTATTCCA
|||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
108381 ATGGAAGTTACAGTGCAAAGACTAATCTAATTGGTA...CAGTTATTCCA
450 . : . : . : . : . :
433 GATACCCTCTCTGCCACCATGAGTTCTCAGACTCTCGGTAAGGAGGAAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
109741 GATACCCTCTCTGCCACCATGAGTTCTCAGACTCTCGGTAAGGAGGAAGG
500 . : . : . : . : . :
483 TGAGCCATTAGCCCTCACCTGTGAGGCATCCAAAGCCACAGCCCAACATA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
109791 TGAGCCATTAGCCCTCACCTGTGAGGCATCCAAAGCCACAGCCCAACATA
550 . : . : . : . : . :
533 CTCACCTCTCTGTCACCTGGTACCTAACACAGGATGGAGGAGGAAGCCAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
109841 CTCACCTCTCTGTCACCTGGTACCTAACACAGGATGGAGGAGGAAGCCAA
600 . : . : . : . : . :
583 GCCACTGAGATTATTTCTCTCTCCAAAGATTTTATATTGGTCCCTGGGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
109891 GCCACTGAGATTATTTCTCTCTCCAAAGATTTTATATTGGTCCCTGGGCC
650 . : . : . : . : . :
633 CTTGTATACAGAGCGGTTTGCAGCCAGTGACGTACAGCTCAACAAACTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
109941 CTTGTATACAGAGCGGTTTGCAGCCAGTGACGTACAGCTCAACAAACTGG
700 . : . : . : . : . :
683 GACCCACTACATTCAGGCTGTCCATAGAGAGGCTCCAGTCCTCAGATCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
109991 GACCCACTACATTCAGGCTGTCCATAGAGAGGCTCCAGTCCTCAGATCAG
750 . : . : . : . : . :
733 GGTCAGCTGTTCTGTGAGGCAACGGAATGGATTCAGGATCCAGATGAAAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
110041 GGTCAGCTGTTCTGTGAGGCAACGGAATGGATTCAGGATCCAGATGAAAC
800 . : . : . : . : . :
783 TTGGATGTTCATCACCAAAAAGCAGACCGATCAAACCACTCTGAGGATCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
110091 TTGGATGTTCATCACCAAAAAGCAGACCGATCAAACCACTCTGAGGATCC
850 . : . : . : . : . :
833 AGCCAGCAG TGAAAGATTTTCAAGTCAACATTACAGCTGAC
|||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
110141 AGCCAGCAGGTA...CAGTGAAAGATTTTCAAGTCAACATTACAGCTGAC
900 . : . : . : . : . :
874 AGCTTGTTTGCTGAAGGGAAACCCTTAGAACTGGTTTGCCTGGTTGTAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111621 AGCTTGTTTGCTGAAGGGAAACCCTTAGAACTGGTTTGCCTGGTTGTAAG
950 . : . : . : . : . :
924 CAGTGGCCGTGACCCACAGCTTCAAGGCATTTGGTTCTTCAATGGGACTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111671 CAGTGGCCGTGACCCACAGCTTCAAGGCATTTGGTTCTTCAATGGGACTG
1000 . : . : . : . : . :
974 AAATTGCTCACATTGATGCTGGTGGAGTCCTGGGCCTGAAGAATGACTAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111721 AAATTGCTCACATTGATGCTGGTGGAGTCCTGGGCCTGAAGAATGACTAC
1050 . : . : . : . : . :
1024 AAAGAGAGAGCAAGTCAAGGAGAGCTCCAGGTTTCAAAGTTAGGCCCCAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111771 AAAGAGAGAGCAAGTCAAGGAGAGCTCCAGGTTTCAAAGTTAGGCCCCAA
1100 . : . : . : . : . :
1074 GGCTTTCTCTCTCAAGATCTTCTCTCTGGGCCCAGAGGATGAAGGCGCCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111821 GGCTTTCTCTCTCAAGATCTTCTCTCTGGGCCCAGAGGATGAAGGCGCCT
1150 . : . : . : . : . :
1124 ACAGATGTGTGGTAGCAGAGGTCATGAAAACACGCACAGGTTCCTGGCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111871 ACAGATGTGTGGTAGCAGAGGTCATGAAAACACGCACAGGTTCCTGGCAG
1200 . : . : . : . : . :
1174 GTGCTTCAGAGAAAGCAGTCACCAGACAGCCACGTGCACCTGAGGAAGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111921 GTGCTTCAGAGAAAGCAGTCACCAGACAGCCACGTGCACCTGAGGAAGCC
1250 . : . : . : . : . :
1224 AGCAG CAAGAAGTGTGGTCATGTCTACCAAGAACAAGCAGC
|||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111971 AGCAGGTA...CAGCAAGAAGTGTGGTCATGTCTACCAAGAACAAGCAGC
1300 . : . : . : . : . :
1265 AAGTTGTGTGGGAAGGAGAGACACTCGCCTTTCTCTGTAAGGCTGGTGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
115309 AAGTTGTGTGGGAAGGAGAGACACTCGCCTTTCTCTGTAAGGCTGGTGGA
1350 . : . : . : . : . :
1315 GCTGAAAGTCCCCTGTCTGTGAGCTGGTGGCACATCCCACGGGACCAGAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
115359 GCTGAAAGTCCCCTGTCTGTGAGCTGGTGGCACATCCCACGGGACCAGAC
1400 . : . : . : . : . :
1365 ACAGCCCGAGTTTGTGGCTGGCATGGGGCAGGATGGCATTGTGCAGCTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
115409 ACAGCCCGAGTTTGTGGCTGGCATGGGGCAGGATGGCATTGTGCAGCTGG
1450 . : . : . : . : . :
1415 GTGCCTCCTATGGGGTACCCAGTTACCATGGCAACACAAGGCTGGAGAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
115459 GTGCCTCCTATGGGGTACCCAGTTACCATGGCAACACAAGGCTGGAGAAA
1500 . : . : . : . : . :
1465 ATGGACTGGGCCACCTTCCAGCTGGAGATCACCTTCACTGCCATCACAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
115509 ATGGACTGGGCCACCTTCCAGCTGGAGATCACCTTCACTGCCATCACAGA
1550 . : . : . : . : . :
1515 CAGTGGCACATATGAGTGCAGAGTATCTGAGAAGTCTCGGAACCAGGCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
115559 CAGTGGCACATATGAGTGCAGAGTATCTGAGAAGTCTCGGAACCAGGCCA
1600 . : . : . : . : . :
1565 GAGATCTGAGCTGGACTCAGAAGATTTCAGTTACTGTAAAGTCTCTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
115609 GAGATCTGAGCTGGACTCAGAAGATTTCAGTTACTGTAAAGTCTCTGGGT
1650 . : . : . : . : . :
1613 AGTCAAGTTTACAAGTTAGTCTGATGAGCCGTCAGCCGCAAGT
>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
115659 A...TAGAGTCAAGTTTACAAGTTAGTCTGATGAGCCGTCAGCCGCAAGT
1700 . : . : . : . : . :
1656 GATGTTAACCAACACCTTTGACCTGTCCTGTGTCGTGAGGGCCGGTTACT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
116382 GATGTTAACCAACACCTTTGACCTGTCCTGTGTCGTGAGGGCCGGTTACT
1750 . : . : . : . : . :
1706 CTGACCTCAAGGTGCCACTCACTGTGACGTGGCAGTTCCAGCCAGCTAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
116432 CTGACCTCAAGGTGCCACTCACTGTGACGTGGCAGTTCCAGCCAGCTAGC
1800 . : . : . : . : . :
1756 TCTCACATCTTCCACCAGCTTATTCGAATCACCCACAATGGCACTATTGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
116482 TCTCACATCTTCCACCAGCTTATTCGAATCACCCACAATGGCACTATTGA
1850 . : . : . : . : . :
1806 ATGGGGGAATTTCCTATCCCGGTTCCAAAAGAAGACGAAAGTGTCGCAGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
116532 ATGGGGGAATTTCCTATCCCGGTTCCAAAAGAAGACGAAAGTGTCGCAGT
1900 . : . : . : . : . :
1856 CTTTATTTCGTTCACAACTCCTAGTCCATGATGCCACTGAGGAAGAGACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
116582 CTTTATTTCGTTCACAACTCCTAGTCCATGATGCCACTGAGGAAGAGACA
1950 . : . : . : . : . :
1906 GGAGTGTATCAGTGTGAAGTAGAAGTTTATGACAGAAATTCCCTATACAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
116632 GGAGTGTATCAGTGTGAAGTAGAAGTTTATGACAGAAATTCCCTATACAA
2000 . : . : . : . : . :
1956 CAACCGCCCCCCGAGGGCTTCTGCCATCTCTCACCCACTGAGGATAGCCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
116682 CAACCGCCCCCCGAGGGCTTCTGCCATCTCTCACCCACTGAGGATAGCCG
2050 . : . : . : . : . :
2006 TCACTTTACCAG AGAGCAAGCTAAAAGTGAATTCAAGGAGT
||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
116732 TCACTTTACCAGGTA...TAGAGAGCAAGCTAAAAGTGAATTCAAGGAGT
2100 . : . : . : . : . :
2047 CAAGTCCAAGAGCTCTCCATCAACTCCAACACTGATATAGAATGTAGCAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
119785 CAAGTCCAAGAGCTCTCCATCAACTCCAACACTGATATAGAATGTAGCAT
2150 . : . : . : . : . :
2097 CTTGTCCCGGTCCAATGGAAACCTTCAGTTAGCCATTATTTGGTATTTTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
119835 CTTGTCCCGGTCCAATGGAAACCTTCAGTTAGCCATTATTTGGTATTTTT
2200 . : . : . : . : . :
2147 CTCCTGTTTCCACTAATGCCTCTTGGCTAAAGATCCTGGAGATGGACCAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
119885 CTCCTGTTTCCACTAATGCCTCTTGGCTAAAGATCCTGGAGATGGACCAA
2250 . : . : . : . : . :
2197 ACCAATGTTATAAAAACTGGGGATGAGTTTCACACCCCACAGAGAAAACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
119935 ACCAATGTTATAAAAACTGGGGATGAGTTTCACACCCCACAGAGAAAACA
2300 . : . : . : . : . :
2247 AAAATTTCATACTGAGAAGGTTTCCCAAGACTTATTTCAGCTGCACATTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
119985 AAAATTTCATACTGAGAAGGTTTCCCAAGACTTATTTCAGCTGCACATTC
2350 . : . : . : . : . :
2297 TGAATGTGGAAGACAGCGATCGGGGCAAATATCACTGTGCTGTGGAGGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
120035 TGAATGTGGAAGACAGCGATCGGGGCAAATATCACTGTGCTGTGGAGGAA
2400 . : . : . : . : . :
2347 TGGCTCCTGTCTACAAATGGCACTTGGCACAAGCTTGGAGAAAAGAAGTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
120085 TGGCTCCTGTCTACAAATGGCACTTGGCACAAGCTTGGAGAAAAGAAGTC
2450 . : . : . : . : . :
2397 AGGACTAACAGAATTGAAACTCAAGCCCACAG GAAGTAAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
120135 AGGACTAACAGAATTGAAACTCAAGCCCACAGGTA...TAGGAAGTAAGG
2500 . : . : . : . : . :
2438 TACGTGTCTCCAAAGTGTACTGGACCGAAAATGTGACTGAGCACAGAGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
123701 TACGTGTCTCCAAAGTGTACTGGACCGAAAATGTGACTGAGCACAGAGAA
2550 . : . : . : . : . :
2488 GTGGCCATCCGCTGCAGCCTGGAGAGTGTAGGCAGCTCAGCCACTCTGTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
123751 GTGGCCATCCGCTGCAGCCTGGAGAGTGTAGGCAGCTCAGCCACTCTGTA
2600 . : . : . : . : . :
2538 CTCTGTGATGTGGTACTGGAACAGAGAAAACTCTGGAAGTAAATTGCTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
123801 CTCTGTGATGTGGTACTGGAACAGAGAAAACTCTGGAAGTAAATTGCTGG
2650 . : . : . : . : . :
2588 TGCACTTGCAACATGATGGCTTGCTGGAGTATGGGGAAGAGGGGCTCAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
123851 TGCACTTGCAACATGATGGCTTGCTGGAGTATGGGGAAGAGGGGCTCAGG
2700 . : . : . : . : . :
2638 AGGCACCTGCACTGTTACCGTTCATCCTCTACAGACTTTGTCCTGAAGCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
123901 AGGCACCTGCACTGTTACCGTTCATCCTCTACAGACTTTGTCCTGAAGCT
2750 . : . : . : . : . :
2688 TCATCAGGTGGAGATGGAGGATGCAGGAATGTACTGGTGTAGGGTGGCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
123951 TCATCAGGTGGAGATGGAGGATGCAGGAATGTACTGGTGTAGGGTGGCAG
2800 . : . : . : . : . :
2738 AGTGGCAGCTCCATGGACACCCAAGCAAGTGGATTAATCAAGCATCCGAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
124001 AGTGGCAGCTCCATGGACACCCAAGCAAGTGGATTAATCAAGCATCCGAT
2850 . : . : . : . : . :
2788 GAGTCACAGCGGATGGTGCTCACGGTGCTGCCTTCAG AGCC
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
124051 GAGTCACAGCGGATGGTGCTCACGGTGCTGCCTTCAGGTA...CAGAGCC
2900 . : . : . : . : . :
2829 CACGCTTCCTTCCAGGATCTGCTCCTCGGCCCCTTTACTCTATTTCCTGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
132047 CACGCTTCCTTCCAGGATCTGCTCCTCGGCCCCTTTACTCTATTTCCTGT
2950 . : . : . : . : . :
2879 TCATCTGTCCCTTCGTCCTGCTCCTCCTTCTGCTCATCTCCCTCCTCTGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
132097 TCATCTGTCCCTTCGTCCTGCTCCTCCTTCTGCTCATCTCCCTCCTCTGC
3000 . : . : . : . : . :
2929 TTATACTGGAAGGCCAGGAAGTTGTCAACACTGCGTTCCAACACACGGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
132147 TTATACTGGAAGGCCAGGAAGTTGTCAACACTGCGTTCCAACACACGGAA
3050 . : . : . : . : . :
2979 AGAAAAAGCTCTCTGGGTGGACTTGAAAGAGGCTGGAGGTGTGACCACAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
132197 AGAAAAAGCTCTCTGGGTGGACTTGAAAGAGGCTGGAGGTGTGACCACAA
3100 . : . : . : .
3029 ATAGGAGGGAAGACGAGGAGGAAGATGAAGGCAAC
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
132247 ATAGGAGGGAAGACGAGGAGGAAGATGAAGGCAAC