seq1 = pF1KB1986.tfa, 3309 bp
seq2 = pF1KB1986/gi568815575f_96585059.tfa (gi568815575f:96585059_97569739), 984681 bp

>pF1KB1986 3309
>gi568815575f:96585059_97569739 (ChrX)

1-132  (100001-100132)   100% ->
133-165  (150700-150732)   100% ->
166-342  (153528-153704)   100% ->
343-447  (173096-173200)   100% ->
448-468  (178042-178062)   100% ->
469-608  (296521-296660)   100% ->
609-683  (327270-327344)   100% ->
684-753  (327425-327494)   100% ->
754-890  (331380-331516)   100% ->
891-999  (333451-333559)   100% ->
1000-1110  (345675-345785)   100% ->
1111-1229  (352175-352293)   100% ->
1230-1346  (354208-354324)   100% ->
1347-1465  (356960-357078)   100% ->
1466-1530  (360469-360533)   100% ->
1531-1635  (363877-363981)   100% ->
1636-1956  (372770-373090)   100% ->
1957-2071  (380035-380149)   100% ->
2072-2173  (487883-487984)   100% ->
2174-2268  (490109-490203)   100% ->
2269-2370  (514636-514737)   100% ->
2371-2610  (529668-529907)   100% ->
2611-2740  (556607-556736)   100% ->
2741-2867  (662657-662783)   99% ->
2868-3030  (763060-763222)   100% ->
3031-3166  (798851-798986)   100% ->
3167-3262  (844592-844687)   100% ->
3263-3309  (884636-884681)   97%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGCAGCCCGGGGCGGCGGCGTCGGGAGCGGGAGGCGGCAGCGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGCAGCCCGGGGCGGCGGCGTCGGGAGCGGGAGGCGGCAGCGAGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ACCCGGTGGGGGCCGGAGCAACAAGCGGAGCGCGGGGAACCGGGCCGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 ACCCGGTGGGGGCCGGAGCAACAAGCGGAGCGCGGGGAACCGGGCCGCCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ATGAAGAGGAAACGAAAAACAAACCCAAATTG         AACATTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 100101 ATGAAGAGGAAACGAAAAACAAACCCAAATTGGTG...TAGAACATTCAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ATAAAAACTTTGGCAGATGATGTG         CGTGACCGAATTACAAG
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 150709 ATAAAAACTTTGGCAGATGATGTGGTA...CAGCGTGACCGAATTACAAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TTTTAGAAAATCTACTGTCAAAAAAGAAAAACCTCTTATTCAACATCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153545 TTTTAGAAAATCTACTGTCAAAAAAGAAAAACCTCTTATTCAACATCCTA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TTGATTCTCAAGTCGCGATGAGTGAGTTTCCTGCAGCTCAGCCATTATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153595 TTGATTCTCAAGTCGCGATGAGTGAGTTTCCTGCAGCTCAGCCATTATAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GATGAACGATCTTTGAATTTGTCAGAAAAGGAAGTATTGGATCTCTTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153645 GATGAACGATCTTTGAATTTGTCAGAAAAGGAAGTATTGGATCTCTTTGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 AAAAATGATG         GAGGACATGAACCTTAACGAAGAGAAAAAAG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 153695 AAAAATGATGGTA...CAGGAGGACATGAACCTTAACGAAGAGAAAAAAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CTCCTTTACGAAACAAAGACTTTACCACCAAACGTGAGATGGTTGTCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 173127 CTCCTTTACGAAACAAAGACTTTACCACCAAACGTGAGATGGTTGTCCAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 TATATTTCTGCCACTGCCAAATCT         ATAGTTGGAAGTAAAGT
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 173177 TATATTTCTGCCACTGCCAAATCTGTA...CAGATAGTTGGAAGTAAAGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 TACG         GGTGGGCTGAAAAACAGCAAACATGAATGCACCCTGT
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 178059 TACGGTG...TAGGGTGGGCTGAAAAACAGCAAACATGAATGCACCCTGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 CTTCACAAGAATATGTTCATGAATTACGATCGGGTATATCAGATGAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 296558 CTTCACAAGAATATGTTCATGAATTACGATCGGGTATATCAGATGAGAAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 CTTCTTAATTGCCTAGAATCCCTCAGGGTTTCTTTAACCAGCAATCCGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 296608 CTTCTTAATTGCCTAGAATCCCTCAGGGTTTCTTTAACCAGCAATCCGGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 CAG         CTGGGTTAACAACTTTGGCCATGAAGGTCTTGGACTCT
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 296658 CAGGTA...CAGCTGGGTTAACAACTTTGGCCATGAAGGTCTTGGACTCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 TATTGGATGAGCTGGAAAAGCTTCTGGACAAAAAACA         GCAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 327308 TATTGGATGAGCTGGAAAAGCTTCTGGACAAAAAACAGTA...TAGGCAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    688 GAAAATATTGACAAGAAGAATCAGTATAAACTTATTCAATGCCTCAAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 327429 GAAAATATTGACAAGAAGAATCAGTATAAACTTATTCAATGCCTCAAAGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 ATTTATGAATAATAAG         TTTGGATTACAAAGGATTCTAGGAG
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 327479 ATTTATGAATAATAAGGTA...TAGTTTGGATTACAAAGGATTCTAGGAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    779 ATGAAAGAAGTCTTTTACTATTGGCAAGAGCAATTGACCCCAAACAACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 331405 ATGAAAGAAGTCTTTTACTATTGGCAAGAGCAATTGACCCCAAACAACCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 AACATGATGACTGAAATAGTAAAAATACTTTCTGCTATTTGCATTGTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 331455 AACATGATGACTGAAATAGTAAAAATACTTTCTGCTATTTGCATTGTTGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 AGAAGAGAACAT         TCTAGATAAACTTTTAGGGGCTATAACAA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 331505 AGAAGAGAACATGTA...CAGTCTAGATAAACTTTTAGGGGCTATAACAA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    920 CAGCAGCAGAAAGAAATAACAGGGAACGATTTTCACCAATTGTGGAAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 333480 CAGCAGCAGAAAGAAATAACAGGGAACGATTTTCACCAATTGTGGAAGGT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 TTAGAAAATCAGGAAGCCTTGCAATTACAG         GTGGCCTGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 333530 TTAGAAAATCAGGAAGCCTTGCAATTACAGGTG...CAGGTGGCCTGCAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1011 GCAGTTTATAAATGCCCTTGTCACTTCTCCTTATGAGCTTGATTTTCGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 345686 GCAGTTTATAAATGCCCTTGTCACTTCTCCTTATGAGCTTGATTTTCGAA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1061 TACATTTAAGGAATGAATTCCTCCGTTCAGGACTAAAAACAATGTTACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 345736 TACATTTAAGGAATGAATTCCTCCGTTCAGGACTAAAAACAATGTTACCA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1111          GATCTAAAAGAAAAAGAGAATGATGAGCTTGATATTCAGTT
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 345786 GTA...TAGGATCTAAAAGAAAAAGAGAATGATGAGCTTGATATTCAGTT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1152 GAAAGTATTTGATGAAAACAAAGAAGATGACCTAACTGAATTATCACACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 352216 GAAAGTATTTGATGAAAACAAAGAAGATGACCTAACTGAATTATCACACC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1202 GTCTCAATGACATTCGAGCAGAAATGGA         TGATATGAATGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 352266 GTCTCAATGACATTCGAGCAGAAATGGAATA...TACTGATATGAATGAA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1243 GTCTACCATCTTCTATATAATATGCTGAAGGACACTGCTGCTGAAAATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 354221 GTCTACCATCTTCTATATAATATGCTGAAGGACACTGCTGCTGAAAATTA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1293 CTTCTTATCTATTCTACAACATTTTTTGCTTATCAGAAATGATTATTATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 354271 CTTCTTATCTATTCTACAACATTTTTTGCTTATCAGAAATGATTATTATA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1343 TCAG         GCCACAATATTATAAAATAATTGAGGAATGTGTTTCA
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 354321 TCAGGTA...CAGGCCACAATATTATAAAATAATTGAGGAATGTGTTTCA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1384 CAGATAGTGCTACACTGCAGTGGTATGGATCCAGACTTCAAATACAGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 356997 CAGATAGTGCTACACTGCAGTGGTATGGATCCAGACTTCAAATACAGGCA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1434 AAGATTAGACATCGATTTAACTCATCTGATAG         ATTCTTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 357047 AAGATTAGACATCGATTTAACTCATCTGATAGGTA...TAGATTCTTGTG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1475 TGAACAAGGCGAAAGTTGAAGAAAGTGAACAAAAAGCTGCAGAGTTTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 360478 TGAACAAGGCGAAAGTTGAAGAAAGTGAACAAAAAGCTGCAGAGTTTTCA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1525 AAGAAG         TTCGATGAAGAATTCACAGCTCGACAGGAAGCTCA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 360528 AAGAAGGTA...CAGTTCGATGAAGAATTCACAGCTCGACAGGAAGCTCA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1566 AGCAGAGCTTCAAAAAAGAGATGAGAAAATCAAAGAACTTGAAGCAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 363912 AGCAGAGCTTCAAAAAAGAGATGAGAAAATCAAAGAACTTGAAGCAGAAA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1616 TCCAGCAACTTCGAACCCAG         GCACAAGTACTCTCAAGTTCA
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 363962 TCCAGCAACTTCGAACCCAGGTA...CAGGCACAAGTACTCTCAAGTTCA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1657 TCAGGAATTCCAGGTCCTCCTGCAGCACCTCCATTGCCAGGTGTAGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 372791 TCAGGAATTCCAGGTCCTCCTGCAGCACCTCCATTGCCAGGTGTAGGGCC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1707 GCCTCCACCACCACCCGCGCCACCTCTACCCGGAGGAGCTCCTCTTCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 372841 GCCTCCACCACCACCCGCGCCACCTCTACCCGGAGGAGCTCCTCTTCCTC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1757 CTCCACCACCTCCTTTACCTGGAATGATGGGGATACCACCACCACCCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 372891 CTCCACCACCTCCTTTACCTGGAATGATGGGGATACCACCACCACCCCCA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1807 CCACCACTTTTATTTGGGGGACCTCCTCCACCACCACCCCTTGGAGGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 372941 CCACCACTTTTATTTGGGGGACCTCCTCCACCACCACCCCTTGGAGGAGT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1857 TCCTCCTCCCCCAGGAATATCACTTAATCTACCTTATGGAATGAAGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 372991 TCCTCCTCCCCCAGGAATATCACTTAATCTACCTTATGGAATGAAGCAGA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1907 AAAAAATGTATAAACCTGAAGTGTCCATGAAGAGAATCAATTGGTCAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 373041 AAAAAATGTATAAACCTGAAGTGTCCATGAAGAGAATCAATTGGTCAAAG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1957          ATTGAACCCACAGAATTATCTGAGAACTGTTTCTGGTTAAG
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 373091 GTA...CAGATTGAACCCACAGAATTATCTGAGAACTGTTTCTGGTTAAG

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1998 AGTCAAAGAAGACAAGTTTGAGAATCCAGATCTCTTTGCCAAATTGGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 380076 AGTCAAAGAAGACAAGTTTGAGAATCCAGATCTCTTTGCCAAATTGGCAT

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2048 TGAATTTTGCTACTCAGATAAAAG         TTCAAAAGAACGCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 380126 TGAATTTTGCTACTCAGATAAAAGGTA...CAGTTCAAAAGAACGCAGAA

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2089 GCATTAGAAGAAAAGAAGACTGGGCCTACAAAGAAGAAAGTGAAAGAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 487900 GCATTAGAAGAAAAGAAGACTGGGCCTACAAAGAAGAAAGTGAAAGAACT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2139 GAGAATTTTGGATCCCAAAACAGCTCAGAATCTGT         CCATCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 487950 GAGAATTTTGGATCCCAAAACAGCTCAGAATCTGTGTA...TAGCCATCT

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2180 TTCTGGGATCATATCGCATGCCATATGAAGACATAAGAAACGTTATTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 490115 TTCTGGGATCATATCGCATGCCATATGAAGACATAAGAAACGTTATTCTG

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2230 GAGGTTAATGAAGACATGCTGAGTGAGGCTTTAATTCAG         AA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 490165 GAGGTTAATGAAGACATGCTGAGTGAGGCTTTAATTCAGGTA...TAGAA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2271 CCTTGTGAAACATCTTCCTGAGCAGAAGATACTCAACGAATTAGCAGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 514638 CCTTGTGAAACATCTTCCTGAGCAGAAGATACTCAACGAATTAGCAGAGC

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2321 TTAAGAATGAATATGATGACCTCTGTGAGCCTGAACAATTTGGAGTTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 514688 TTAAGAATGAATATGATGACCTCTGTGAGCCTGAACAATTTGGAGTTGTG

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2371          ATGAGCTCTGTGAAAATGTTACAGCCTCGTCTCAGTAGTAT
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 514738 GTA...CAGATGAGCTCTGTGAAAATGTTACAGCCTCGTCTCAGTAGTAT

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2412 CCTGTTCAAGCTCACATTTGAAGAACACATAAACAACATCAAACCAAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 529709 CCTGTTCAAGCTCACATTTGAAGAACACATAAACAACATCAAACCAAGCA

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2462 TCATAGCAGTAACTCTTGCCTGTGAAGAACTGAAGAAAAGTGAAAGCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 529759 TCATAGCAGTAACTCTTGCCTGTGAAGAACTGAAGAAAAGTGAAAGCTTT

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2512 AACAGACTTTTAGAGTTAGTTCTTCTTGTTGGAAACTACATGAACTCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 529809 AACAGACTTTTAGAGTTAGTTCTTCTTGTTGGAAACTACATGAACTCAGG

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2562 CTCAAGAAATGCCCAGTCTTTGGGATTTAAGATCAACTTCCTTTGTAAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 529859 CTCAAGAAATGCCCAGTCTTTGGGATTTAAGATCAACTTCCTTTGTAAGG

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2611         ATCAGAGATACTAAATCAGCGGATCAAAAAACAACCCTTTTG
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 529909 TA...CAGATCAGAGATACTAAATCAGCGGATCAAAAAACAACCCTTTTG

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2653 CATTTTATTGCCGACATTTGTGAGGAAAAATATCGAGATATCCTAAAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 556649 CATTTTATTGCCGACATTTGTGAGGAAAAATATCGAGATATCCTAAAATT

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2703 TCCTGAAGAACTGGAACACGTAGAAAGTGCAAGCAAAG         TTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 556699 TCCTGAAGAACTGGAACACGTAGAAAGTGCAAGCAAAGGTA...TAGTTT

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2744 CAGCTCAAATTCTCAAGAGCAACCTTGCATCAATGGAACAACAAATTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 662660 CAGCTCAAATTCTCAAGAGCAACCTTGCATCAATGGAACAACAAATTGTT

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2794 CATCTGGAACGTGACATCAAGAAATTCCCCCAAGCAGAAAATCAACACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 662710 CATCTGGAACGTGACATCAAGAAATTCCCCCAAGCAGAAAATCAACACGA

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2844 TAAGTTTGTGGAAAAGATGACCAG         CTTTACAAAGACTGCCC
        ||||||||||||||||||||||| >>>...>>>|||||||||||||||||
 662760 TAAGTTTGTGGAAAAGATGACCATATC...CAGCTTTACAAAGACTGCCC

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2885 GAGAACAGTATGAAAAACTCTCCACCATGCACAACAACATGATGAAGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 763077 GAGAACAGTATGAAAAACTCTCCACCATGCACAACAACATGATGAAGCTC

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2935 TATGAGAATCTTGGAGAATACTTCATTTTTGACTCAAAGACAGTGAGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 763127 TATGAGAATCTTGGAGAATACTTCATTTTTGACTCAAAGACAGTGAGCAT

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2985 AGAAGAGTTCTTTGGTGATCTCAACAACTTCCGAACTTTGTTTTTG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 763177 AGAAGAGTTCTTTGGTGATCTCAACAACTTCCGAACTTTGTTTTTGGTA.

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3031      GAAGCAGTGAGAGAAAACAATAAGAGAAGAGAAATGGAAGAGAAG
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 763227 ..TAGGAAGCAGTGAGAGAAAACAATAAGAGAAGAGAAATGGAAGAGAAG

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3076 ACCAGGAGGGCAAAACTTGCAAAAGAGAAAGCTGAACAAGAAAAGTTAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 798896 ACCAGGAGGGCAAAACTTGCAAAAGAGAAAGCTGAACAAGAAAAGTTAGA

   3350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3126 ACGCCAGAAGAAAAAGAAACAACTCATTGATATAAACAAAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 798946 ACGCCAGAAGAAAAAGAAACAACTCATTGATATAAACAAAGGTA...CAG

   3400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3167 AGGGTGATGAGACTGGTGTGATGGATAATCTTCTAGAAGCCCTACAATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 844592 AGGGTGATGAGACTGGTGTGATGGATAATCTTCTAGAAGCCCTACAATCA

   3450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3217 GGTGCAGCATTCAGAGACCGTCGAAAGCGGATTCCAAGGAATCCAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 844642 GGTGCAGCATTCAGAGACCGTCGAAAGCGGATTCCAAGGAATCCAGGTA.

   3500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3263      TGGTAAATCATCCCTGTGCAACAAGGGCTAATCCAAGATCAGCTA
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 844692 ..CAGTGGTAAATCATCCCTGTGCAACAAGGGCTAATCCAAGATCAGCTA

   3550 
   3308 CG
        |-
 884681 C