seq1 = pF1KB0998.tfa, 690 bp
seq2 = pF1KB0998/gi568815575f_106828229.tfa (gi568815575f:106828229_107028918), 200690 bp

>pF1KB0998 690
>gi568815575f:106828229_107028918 (ChrX)

1-690  (100001-100690)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCTCTCTTGGCCTCCAACTTGTGGGCTACATCCTAGGCCTTCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCTCTCTTGGCCTCCAACTTGTGGGCTACATCCTAGGCCTTCTGGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCTTTTGGGCACACTGGTTGCCATGCTGCTCCCCAGCTGGAAAACAAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCTTTTGGGCACACTGGTTGCCATGCTGCTCCCCAGCTGGAAAACAAGTT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CTTATGTCGGTGCCAGCATTGTGACAGCAGTTGGCTTCTCCAAGGGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CTTATGTCGGTGCCAGCATTGTGACAGCAGTTGGCTTCTCCAAGGGCCTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TGGATGGAATGTGCCACACACAGCACAGGCATCACCCAGTGTGACATCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TGGATGGAATGTGCCACACACAGCACAGGCATCACCCAGTGTGACATCTA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TAGCACCCTTCTGGGCCTGCCCGCTGACATCCAGGCTGCCCAGGCCATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TAGCACCCTTCTGGGCCTGCCCGCTGACATCCAGGCTGCCCAGGCCATGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGGTGACATCCAGTGCAATCTCCTCCCTGGCCTGCATTATCTCTGTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGGTGACATCCAGTGCAATCTCCTCCCTGGCCTGCATTATCTCTGTGGTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GGCATGAGATGCACAGTCTTCTGCCAGGAATCCCGAGCCAAAGACAGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GGCATGAGATGCACAGTCTTCTGCCAGGAATCCCGAGCCAAAGACAGAGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GGCGGTAGCAGGTGGAGTCTTTTTCATCCTTGGAGGCCTCCTGGGATTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GGCGGTAGCAGGTGGAGTCTTTTTCATCCTTGGAGGCCTCCTGGGATTCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TTCCTGTTGCCTGGAATCTTCATGGGATCCTACGGGACTTCTACTCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TTCCTGTTGCCTGGAATCTTCATGGGATCCTACGGGACTTCTACTCACCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CTGGTGCCTGACAGCATGAAATTTGAGATTGGAGAGGCTCTTTACTTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CTGGTGCCTGACAGCATGAAATTTGAGATTGGAGAGGCTCTTTACTTGGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CATTATTTCTTCCCTGTTCTCCCTGATAGCTGGAATCATCCTCTGCTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CATTATTTCTTCCCTGTTCTCCCTGATAGCTGGAATCATCCTCTGCTTTT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CCTGCTCATCCCAGAGAAATCGCTCCAACTACTACGATGCCTACCAAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CCTGCTCATCCCAGAGAAATCGCTCCAACTACTACGATGCCTACCAAGCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CAACCTCTTGCCACAAGGAGCTCTCCAAGGCCTGGTCAACCTCCCAAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CAACCTCTTGCCACAAGGAGCTCTCCAAGGCCTGGTCAACCTCCCAAAGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CAAGAGTGAGTTCAATTCCTACAGCCTGACAGGGTATGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CAAGAGTGAGTTCAATTCCTACAGCCTGACAGGGTATGTG