seq1 = pF1KB0995.tfa, 852 bp
seq2 = pF1KB0995/gi568815592f_96503614.tfa (gi568815592f:96503614_96715769), 212156 bp

>pF1KB0995 852
>gi568815592f:96503614_96715769 (Chr6)

1-159  (100001-100159)   100% ->
160-334  (101137-101311)   100% ->
335-504  (102289-102458)   100% ->
505-691  (106959-107145)   99% ->
692-852  (111996-112156)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACAACTGCTCACTTTTACTGTCAATACTGCACAGCATCACTTCTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACAACTGCTCACTTTTACTGTCAATACTGCACAGCATCACTTCTTGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GAAGAAATATGTACTAAAGGATGACAGTCCATACTGTGTTACATGTTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GAAGAAATATGTACTAAAGGATGACAGTCCATACTGTGTTACATGTTATG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ATCGTGTATTTTCTAACTATTGCGAGGAATGCAAAAAACCAATTGAATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ATCGTGTATTTTCTAACTATTGCGAGGAATGCAAAAAACCAATTGAATCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GATTCTAAG         GATCTTTGTTACAAAGACCGGCACTGGCATGA
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GATTCTAAGGTA...AAGGATCTTTGTTACAAAGACCGGCACTGGCATGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AGGATGCTTCAAGTGCACCAAATGCAATCACTCTTTGGTGGAAAAGCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101169 AGGATGCTTCAAGTGCACCAAATGCAATCACTCTTTGGTGGAAAAGCCTT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TTGCTGCCAAGGATGAGCGCCTGCTGTGCACGGAGTGCTATTCTAACGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101219 TTGCTGCCAAGGATGAGCGCCTGCTGTGCACGGAGTGCTATTCTAACGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TGCTCCTCCAAGTGCTTCCACTGCAAGAGGACCATCATGCCTG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 101269 TGCTCCTCCAAGTGCTTCCACTGCAAGAGGACCATCATGCCTGGTA...C

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    335   GTTCCCGCAAAATGGAATTTAAGGGAAACTACTGGCATGAAACCTGTT
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102287 AGGTTCCCGCAAAATGGAATTTAAGGGAAACTACTGGCATGAAACCTGTT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TTGTGTGTGAGAATTGCCGACAACCTATAGGGACAAAGCCTTTGATCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102337 TTGTGTGTGAGAATTGCCGACAACCTATAGGGACAAAGCCTTTGATCTCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 AAAGAGAGTGGCAATTATTGTGTGCCATGTTTTGAGAAGGAGTTTGCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102387 AAAGAGAGTGGCAATTATTGTGTGCCATGTTTTGAGAAGGAGTTTGCTCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CTACTGCAACTTTTGTAAGAAG         GTGATAACTTCAGGTGGGA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 102437 CTACTGCAACTTTTGTAAGAAGGTA...CAGGTGATAACTTCAGGTGGGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TAACATTTTGTGACCAGCTATGGCATAAAGAGTGTTTTCTGTGTAGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106978 TAACATTTTGTGACCAGCTATGGCATAAAGAGTGTTTTCTGTGTAGTGGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 TGTAGGAAAGATCTCTGTGAAGAACAGTTCATGTCCAGAGACGACTATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107028 TGTAGGAAAGATCTCTGTGAAGAACAGTTCATGTCCAGAGACGACTATCC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 ATTCTGCATGGACTGCTACAACCATCTTTATGCCAACAAGTGTGTAGCCT
        ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107078 ATTCTGCGTGGACTGCTACAACCATCTTTATGCCAACAAGTGTGTAGCCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 GTTCCAAACCCATTAGTG         GTCTCACAGGTGCCAAGTTTATC
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 107128 GTTCCAAACCCATTAGTGGTG...CAGGTCTCACAGGTGCCAAGTTTATC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 TGCTTTCAAGACAGCCAGTGGCATAGCGAATGCTTTAACTGCGGGAAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112019 TGCTTTCAAGACAGCCAGTGGCATAGCGAATGCTTTAACTGCGGGAAATG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 CTCTGTCTCCTTGGTGGGTAAAGGCTTCCTGACCCAGAACAAGGAAATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112069 CTCTGTCTCCTTGGTGGGTAAAGGCTTCCTGACCCAGAACAAGGAAATCT

    850     .    :    .    :    .    :    .
    815 TCTGCCAAAAATGTGGCTCCGGAATGGACACTGACATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112119 TCTGCCAAAAATGTGGCTCCGGAATGGACACTGACATC