seq1 = pF1KB0986.tfa, 1362 bp
seq2 = pF1KB0986/gi568815582r_22246968.tfa (gi568815582r:22246968_22474309), 227342 bp

>pF1KB0986 1362
>gi568815582r:22246968_22474309 (Chr16)

(complement)

1-79  (100001-100079)   100% ->
80-192  (109296-109408)   100% ->
193-341  (124461-124609)   100% ->
342-506  (124867-125031)   100% ->
507-1362  (126487-127342)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTGGCGGAAAACCTGGTAGAGGAGTTTGAGATGAAGGAGGACGAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCTGGCGGAAAACCTGGTAGAGGAGTTTGAGATGAAGGAGGACGAGCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GTGGTACGACCACCAGGACCTCCAGCAAG         ATCTTCAACTTG
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 100051 GTGGTACGACCACCAGGACCTCCAGCAAGGTG...TAGATCTTCAACTTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CTGCTGAGCTTGGGAAGACATTACTGGATCGGAACACAGAGTTGGAGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109308 CTGCTGAGCTTGGGAAGACATTACTGGATCGGAACACAGAGTTGGAGGAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TCTGTTCAGCAGATGTATACAACCAATCAGGAGCAGTTACAGGAAATTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109358 TCTGTTCAGCAGATGTATACAACCAATCAGGAGCAGTTACAGGAAATTGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 G         TATCTGACGAAGCAAGTGGAACTTCTACGGCAGATGAACG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109408 GGTA...CAGTATCTGACGAAGCAAGTGGAACTTCTACGGCAGATGAACG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AACAACATGCAAAGGTTTATGAACAATTAGACGTCACAGCAAGGGAACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124501 AACAACATGCAAAGGTTTATGAACAATTAGACGTCACAGCAAGGGAACTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GAAGAAACAAATCAAAAGCTAGTTGCTGACAGCAAGGCCTCACAGCAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124551 GAAGAAACAAATCAAAAGCTAGTTGCTGACAGCAAGGCCTCACAGCAAAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GATTCTGAG         CCTGACTGAAACGATTGAATGCCTGCAAACCA
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 124601 GATTCTGAGGTA...CAGCCTGACTGAAACGATTGAATGCCTGCAAACCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 ACATTGATCACCTCCAGAGCCAAGTGGAGGAGCTGAAGTCATCTGGCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124899 ACATTGATCACCTCCAGAGCCAAGTGGAGGAGCTGAAGTCATCTGGCCAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GGGAGAAGGAGCCCGGGAAAGTGTGACCAGGAGAAACCGGCACCCAGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124949 GGGAGAAGGAGCCCGGGAAAGTGTGACCAGGAGAAACCGGCACCCAGCTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TGCATGTCTGAAGGAGCTGTATGACCTCCGCCA         ACACTTCG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 124999 TGCATGTCTGAAGGAGCTGTATGACCTCCGCCAGTA...TAGACACTTCG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TGTATGATCATGTGTTCGCTGAGAAGATCACTTCCTTGCAAGGTCAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126495 TGTATGATCATGTGTTCGCTGAGAAGATCACTTCCTTGCAAGGTCAGCCA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 AGCCCTGATGAAGAGGAAAATGAGCACTTGAAAAAAACAGTGACAATGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126545 AGCCCTGATGAAGAGGAAAATGAGCACTTGAAAAAAACAGTGACAATGTT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GCAGGCCCAGCTGAGCCTGGAGCGGCAGAAGCGGGTGACTATGGAGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126595 GCAGGCCCAGCTGAGCCTGGAGCGGCAGAAGCGGGTGACTATGGAGGAGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 AATATGGGCTCGTGTTAAAGGAGAACAGTGAACTGGAGCAGCAGCTGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126645 AATATGGGCTCGTGTTAAAGGAGAACAGTGAACTGGAGCAGCAGCTGGGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 GCCACAGGTGCCTACCGAGCACGGGCGCTGGAACTAGAGGCCGAGGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126695 GCCACAGGTGCCTACCGAGCACGGGCGCTGGAACTAGAGGCCGAGGTGGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 AGAGATGCGACAGATGTTGCAGTCAGAGCATCCATTTGTGAATGGAGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126745 AGAGATGCGACAGATGTTGCAGTCAGAGCATCCATTTGTGAATGGAGTTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 AGAAGCTGGTGCCAGACTCTCTGTATGTTCCTTTCAAAGAGCCCAGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126795 AGAAGCTGGTGCCAGACTCTCTGTATGTTCCTTTCAAAGAGCCCAGCCAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 AGCCTGCTGGAAGAGATGTTCCTGACTGTGCCGGAATCACATAGAAAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126845 AGCCTGCTGGAAGAGATGTTCCTGACTGTGCCGGAATCACATAGAAAGCC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 TCTCAAGCGCAGCAGCAGTGAGACGATCCTCAGCAGCTTGGCAGGGAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126895 TCTCAAGCGCAGCAGCAGTGAGACGATCCTCAGCAGCTTGGCAGGGAGTG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 ACATCGTGAAGGGCCACGAGGAGACCTGCATCAGGAGGGCCAAGGCTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126945 ACATCGTGAAGGGCCACGAGGAGACCTGCATCAGGAGGGCCAAGGCTGTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1015 AAACAGAGGGGCATCTCCCTTCTGCACGAAGTGGACACGCAGTACAGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126995 AAACAGAGGGGCATCTCCCTTCTGCACGAAGTGGACACGCAGTACAGCGC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1065 CCTGAAGGTGAAGTATGAAGAGTTGCTGAAGAAGTGCCAAGAGGAACAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127045 CCTGAAGGTGAAGTATGAAGAGTTGCTGAAGAAGTGCCAAGAGGAACAGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1115 ACTCCCTGTCACACAAGGCTGTGCAGACCTCCAGGGCTGCAGCCAAGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127095 ACTCCCTGTCACACAAGGCTGTGCAGACCTCCAGGGCTGCAGCCAAGGAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1165 CTGACTGGAGTGAACGCCCAGTCTGAGCCTGTTGCCAGCGGCTGGGAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127145 CTGACTGGAGTGAACGCCCAGTCTGAGCCTGTTGCCAGCGGCTGGGAACT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1215 GGCCTCTGTCAACCCAGAGCCCGTGAGTTCCCCTACAACACCTCCAGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127195 GGCCTCTGTCAACCCAGAGCCCGTGAGTTCCCCTACAACACCTCCAGAAT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1265 ACAAAGCGTTGTTTAAGGAGATCTTTAGTTGCATCAAGAAAACTAAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127245 ACAAAGCGTTGTTTAAGGAGATCTTTAGTTGCATCAAGAAAACTAAGCAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1315 GAAATAGATGAACAGAGAACAAAATACCGATCACTCTCCTCTCATTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127295 GAAATAGATGAACAGAGAACAAAATACCGATCACTCTCCTCTCATTCT