seq1 = pF1KB0984.tfa, 1356 bp
seq2 = pF1KB0984/gi568815587r_89698133.tfa (gi568815587r:89698133_89904469), 206337 bp

>pF1KB0984 1356
>gi568815587r:89698133_89904469 (Chr11)

(complement)

1-411  (100001-100411)   100% ->
412-507  (100677-100772)   100% ->
508-738  (102538-102768)   100% ->
739-761  (103482-103504)   100% ->
762-859  (104657-104754)   100% ->
860-1356  (105841-106337)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAATTCTGGAATCTTACAGGTCTTTCAGGGGGAACTCATCTGCCCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAATTCTGGAATCTTACAGGTCTTTCAGGGGGAACTCATCTGCCCCCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GTGCATGAACTACTTCATAGACCCGGTCACCATAGACTGTGGGCACAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GTGCATGAACTACTTCATAGACCCGGTCACCATAGACTGTGGGCACAGCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TTTGCAGGCCTTGTTTCTACCTCAACTGGCAAGACATCCCATTTCTTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TTTGCAGGCCTTGTTTCTACCTCAACTGGCAAGACATCCCATTTCTTGTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CAGTGCTCTGAATGCACAAAGTCAACCGAGCAGATAAACCTCAAAACCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CAGTGCTCTGAATGCACAAAGTCAACCGAGCAGATAAACCTCAAAACCAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CATTCATTTGAAGAAGATGGCTTCTCTTGCCAGAAAAGTCAGTCTCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CATTCATTTGAAGAAGATGGCTTCTCTTGCCAGAAAAGTCAGTCTCTGGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TATTCCTGAGCTCTGAGGAGCAAATGTGTGGCACTCACAGGGAGACAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TATTCCTGAGCTCTGAGGAGCAAATGTGTGGCACTCACAGGGAGACAAAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AAGATATTCTGTGAAGTGGACAGGAGCCTGCTCTGTTTGCTGTGCTCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 AAGATATTCTGTGAAGTGGACAGGAGCCTGCTCTGTTTGCTGTGCTCCAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CTCTCAGGAGCACCGGTATCACAGACACCGTCCCATTGAGTGGGCTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CTCTCAGGAGCACCGGTATCACAGACACCGTCCCATTGAGTGGGCTGCTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AGGAACACCGG         GAGAAGCTTTTACAGAAAATGCAGTCTTTG
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AGGAACACCGGGTA...CAGGAGAAGCTTTTACAGAAAATGCAGTCTTTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 TGGGAAAAAGCTTGTGAAAATCACAGAAACCTGAATGTGGAAACCACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100707 TGGGAAAAAGCTTGTGAAAATCACAGAAACCTGAATGTGGAAACCACCAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 AACCAGATGCTGGAAG         GATTATGTGAATTTAAGGCTAGAAG
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 100757 AACCAGATGCTGGAAGGTT...CAGGATTATGTGAATTTAAGGCTAGAAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 CAATTAGAGCTGAGTATCAGAAGATGCCTGCATTTCATCATGAAGAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102563 CAATTAGAGCTGAGTATCAGAAGATGCCTGCATTTCATCATGAAGAAGAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 AAACATAATTTGGAGATGCTGAAAAAGAAGGGGAAAGAAATTTTTCATCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102613 AAACATAATTTGGAGATGCTGAAAAAGAAGGGGAAAGAAATTTTTCATCG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 ACTTCATTTAAGTAAAGCCAAAATGGCTCATAGGATGGAGATTTTAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102663 ACTTCATTTAAGTAAAGCCAAAATGGCTCATAGGATGGAGATTTTAAGAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 GAATGTATGAGGAGCTGAACGAAATGTGCCATAAACCAGATGTGGAGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102713 GAATGTATGAGGAGCTGAACGAAATGTGCCATAAACCAGATGTGGAGCTA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 CTTCAG         GCTTTTGGAGACATATTACACAG         GAG
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 102763 CTTCAGGTA...CAGGCTTTTGGAGACATATTACACAGGTG...CAGGAG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 TGAGTCCGTGCTGCTGCACATGCCCCAGCCTCTGAATCCAGAGCTCAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104660 TGAGTCCGTGCTGCTGCACATGCCCCAGCCTCTGAATCCAGAGCTCAGTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 CAGGGCCCATCACTGGACTGAGGGACAGGCTCAACCAATTCCGAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 104710 CAGGGCCCATCACTGGACTGAGGGACAGGCTCAACCAATTCCGAGGTA..

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    860     TGCATATTACTCTGCATCATGAAGAAGCCAACAATGATATCTTTCT
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104760 .CAGTGCATATTACTCTGCATCATGAAGAAGCCAACAATGATATCTTTCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 GTATGAAATTTTGAGAAGCATGTGTATTGGATGTGACCATCAAGATGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105887 GTATGAAATTTTGAGAAGCATGTGTATTGGATGTGACCATCAAGATGTAC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 CCTATTTCACTGCAACACCTAGAAGTTTTCTTGCATGGGGTGTTCAGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105937 CCTATTTCACTGCAACACCTAGAAGTTTTCTTGCATGGGGTGTTCAGACT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 TTCACCTCGGGCAAATATTACTGGGAGGTCCATGTAGGGGACTCCTGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105987 TTCACCTCGGGCAAATATTACTGGGAGGTCCATGTAGGGGACTCCTGGAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 TTGGGCTTTTGGTGTCTGTAATATGTATCGGAAAGAGAAGAATCAGAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106037 TTGGGCTTTTGGTGTCTGTAATATGTATCGGAAAGAGAAGAATCAGAATG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106 AGAAGATAGATGGAAAGGCGGGACTCTTTCTTCTTGGGTGTGTTAAGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106087 AGAAGATAGATGGAAAGGCGGGACTCTTTCTTCTTGGGTGTGTTAAGAAT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1156 GACATTCAATGCAGTCTCTTTACCACCTCCCCACTTATGCTGCAATATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106137 GACATTCAATGCAGTCTCTTTACCACCTCCCCACTTATGCTGCAATATAT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1206 CCCAAAACCTACCAGCCGAGTAGGATTATTCCTGGATTGTGAGGCTAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106187 CCCAAAACCTACCAGCCGAGTAGGATTATTCCTGGATTGTGAGGCTAAGA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1256 CTGTGAGCTTTGTTGATGTTAATCAAAGCTCCCTAATATACACCATCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106237 CTGTGAGCTTTGTTGATGTTAATCAAAGCTCCCTAATATACACCATCCCT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1306 AATTGCTCTTTCTCACCTCCTCTCAGGCCTATCTTTTGCTGTATTCACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106287 AATTGCTCTTTCTCACCTCCTCTCAGGCCTATCTTTTGCTGTATTCACTT

   1400 
   1356 C
        |
 106337 C