seq1 = pF1KB0979.tfa, 690 bp
seq2 = pF1KB0979/gi568815587r_10414919.tfa (gi568815587r:10414919_10634158), 219240 bp

>pF1KB0979 690
>gi568815587r:10414919_10634158 (Chr11)

(complement)

1-143  (100001-100143)   100% ->
144-252  (103408-103516)   100% ->
253-434  (108786-108967)   100% ->
435-542  (115018-115125)   100% ->
543-690  (119093-119240)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGACAGCAAATTTCGGATCAGACACAGTTGGTTATTAACAAGTTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGACAGCAAATTTCGGATCAGACACAGTTGGTTATTAACAAGTTACC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGAAAAAGTAGCAAAACATGTTACGTTGGTTCGAGAGAGTGGCTCCTTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AGAAAAAGTAGCAAAACATGTTACGTTGGTTCGAGAGAGTGGCTCCTTAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CTTATGAAGAATTTCTTGGGAGAGTAGCTGAGCTTAATGATGT       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 100101 CTTATGAAGAATTTCTTGGGAGAGTAGCTGAGCTTAATGATGTGTA...C

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    144   AACGGCTAAAGTGGCTTCTGGCCAGGAAAAACATCTTCTCTTTGAGGT
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103406 AGAACGGCTAAAGTGGCTTCTGGCCAGGAAAAACATCTTCTCTTTGAGGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 ACAACCTGGGTCTGATTCCTCTGCTTTTTGGAAAGTGGTTGTACGGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103456 ACAACCTGGGTCTGATTCCTCTGCTTTTTGGAAAGTGGTTGTACGGGTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TCTGTACCAAG         ATTAACAAAAGCAGTGGCATTGTGGAGGCA
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 103506 TCTGTACCAAGGTG...TAGATTAACAAAAGCAGTGGCATTGTGGAGGCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TCACGGATCATGAATTTATACCAGTTTATTCAACTTTATAAAGATATCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108816 TCACGGATCATGAATTTATACCAGTTTATTCAACTTTATAAAGATATCAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 AAGTCAAGCAGCAGGAGTATTGGCACAGAGCTCCACCTCTGAAGAACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108866 AAGTCAAGCAGCAGGAGTATTGGCACAGAGCTCCACCTCTGAAGAACCTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ATGAAAACTCATCCTCTGTAACATCTTGTCAGGCTAGTCTTTGGATGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108916 ATGAAAACTCATCCTCTGTAACATCTTGTCAGGCTAGTCTTTGGATGGGA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 AG         GGTGAAGCAGCTGACCGATGAGGAGGAGTGTTGTATCTG
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108966 AGGTA...CAGGGTGAAGCAGCTGACCGATGAGGAGGAGTGTTGTATCTG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TATGGATGGGCGGGCTGACCTCATCCTGCCTTGTGCTCACAGCTTTTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115057 TATGGATGGGCGGGCTGACCTCATCCTGCCTTGTGCTCACAGCTTTTGTC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 AGAAGTGTATTGATAAATG         GAGTGATCGACACAGGAATTGC
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 115107 AGAAGTGTATTGATAAATGGTA...TAGGAGTGATCGACACAGGAATTGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 CCTATTTGTCGCCTACAGATGACTGGAGCAAATGAATCTTGGGTGGTATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119115 CCTATTTGTCGCCTACAGATGACTGGAGCAAATGAATCTTGGGTGGTATC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 AGATGCACCCACTGAAGATGATATGGCTAACTATATTCTTAACATGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119165 AGATGCACCCACTGAAGATGATATGGCTAACTATATTCTTAACATGGCTG

    700     .    :    .    :    .
    665 ATGAGGCAGGCCAGCCCCACAGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||
 119215 ATGAGGCAGGCCAGCCCCACAGGCCA