seq1 = pF1KB0977.tfa, 564 bp
seq2 = pF1KB0977/gi568815575r_48087634.tfa (gi568815575r:48087634_48295358), 207725 bp

>pF1KB0977 564
>gi568815575r:48087634_48295358 (ChrX)

(complement)

1-69  (100001-100069)   98% ->
70-184  (100505-100619)   100% ->
185-280  (101135-101230)   100% ->
281-330  (103078-103127)   100% ->
331-466  (105091-105226)   99% ->
467-564  (107628-107725)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAACGGAGACGATGCCTTTGTACGGAGACCTAGGGTTGGTTCTCAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAACGGAGACGATGCCTTTGTACGGAGACCTAGGGTTGGTTCTCAAAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ACCACAGAAGATGCAAAAG         GCCTTCGATGATATTGCCAAAT
        |||| ||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 100051 ACCAGAGAAGATGCAAAAGGTG...TAGGCCTTCGATGATATTGCCAAAT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ACTTCTCTGAGAAAGAGTGGGAAAAGATGAAAGCCTCGGAGAAAATCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100527 ACTTCTCTGAGAAAGAGTGGGAAAAGATGAAAGCCTCGGAGAAAATCATC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TATGTGTATATGAAGAGAAAGTATGAGGCCATGACTAAACTAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 100577 TATGTGTATATGAAGAGAAAGTATGAGGCCATGACTAAACTAGGTA...T

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    185   GTTTCAAGGCCACCCTCCCACCTTTCATGCGTAATAAACGGGTCGCAG
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101133 AGGTTTCAAGGCCACCCTCCCACCTTTCATGCGTAATAAACGGGTCGCAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ACTTCCAGGGGAATGATTTTGATAATGACCCTAACCGTGGGAATCAGG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 101183 ACTTCCAGGGGAATGATTTTGATAATGACCCTAACCGTGGGAATCAGGGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    281        TTGAACATCCTCAGATGACTTTCGGCAGGCTCCAGGGAATCTT
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101233 G...CAGTTGAACATCCTCAGATGACTTTCGGCAGGCTCCAGGGAATCTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CCCGAAG         ATCACGCCCGAGAAGCCAGCAGAGGAAGGAAATG
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103121 CCCGAAGGTG...AAGATCACGCCCGAGAAGCCAGCAGAGGAAGGAAATG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 ATTCAAAGGGAGTGCCAGAAGCATCTGGCCCACAGAACAATGGGAAACAG
        |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105125 ATTCGAAGGGAGTGCCAGAAGCATCTGGCCCACAGAACAATGGGAAACAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 CTGCGCCCCTCAGGAAAACTAAATACCTCTGAGAAGGTTAACAAGACATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105175 CTGCGCCCCTCAGGAAAACTAAATACCTCTGAGAAGGTTAACAAGACATC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 TG         GACCCAAAAGGGGGAAACATGCCTGGACCCACAGAGTGC
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105225 TGGTA...TAGGACCCAAAAGGGGGAAACATGCCTGGACCCACAGAGTGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 GTGAGAGAAAGCAACTGGTGATTTATGAAGAGATCAGCGACCCTCAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107667 GTGAGAGAAAGCAACTGGTGATTTATGAAGAGATCAGCGACCCTCAGGAA

    600     .
    556 GATGACGAG
        |||||||||
 107717 GATGACGAG