seq1 = pF1KB0972.tfa, 1311 bp
seq2 = pF1KB0972/gi568815587r_62459682.tfa (gi568815587r:62459682_62672743), 213062 bp

>pF1KB0972 1311
>gi568815587r:62459682_62672743 (Chr11)

(complement)

12-171  (100001-100160)   100% ->
172-235  (100843-100906)   100% ->
236-378  (101062-101204)   100% ->
379-522  (101636-101779)   100% ->
523-652  (105216-105345)   100% ->
653-857  (105734-105938)   100% ->
858-1030  (112290-112462)   100% ->
1031-1155  (112551-112675)   100% ->
1156-1311  (112907-113062)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     12 GACCCTGTACACGTATCCTGAAAACTGGAGGGCCTTCAAGGCTCTCATCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 GACCCTGTACACGTATCCTGAAAACTGGAGGGCCTTCAAGGCTCTCATCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     62 CTGCTCAGTACAGCGGGGCTCAGGTCCGCGTGCTCTCCGCACCACCCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTGCTCAGTACAGCGGGGCTCAGGTCCGCGTGCTCTCCGCACCACCCCAC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    112 TTCCATTTTGGCCAAACCAACCGCACCCCTGAATTTCTCCGCAAATTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TTCCATTTTGGCCAAACCAACCGCACCCCTGAATTTCTCCGCAAATTTCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    162 TGCCGGCAAG         GTCCCAGCATTTGAGGGTGATGATGGATTCT
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TGCCGGCAAGGTG...CAGGTCCCAGCATTTGAGGGTGATGATGGATTCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    203 GTGTGTTTGAGAGCAACGCCATTGCCTACTATG         TGAGCAAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 100874 GTGTGTTTGAGAGCAACGCCATTGCCTACTATGGTA...CAGTGAGCAAT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    244 GAGGAGCTGCGGGGAAGTACTCCAGAGGCAGCAGCCCAGGTGGTGCAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101070 GAGGAGCTGCGGGGAAGTACTCCAGAGGCAGCAGCCCAGGTGGTGCAGTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    294 GGTGAGCTTTGCTGATTCCGATATAGTGCCCCCAGCCAGTACCTGGGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101120 GGTGAGCTTTGCTGATTCCGATATAGTGCCCCCAGCCAGTACCTGGGTGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    344 TCCCCACCTTGGGCATCATGCACCACAACAAACAG         GCCACT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 101170 TCCCCACCTTGGGCATCATGCACCACAACAAACAGGTG...TAGGCCACT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    385 GAGAATGCAAAGGAGGAAGTGAGGCGAATTCTGGGGCTGCTGGATGCTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101642 GAGAATGCAAAGGAGGAAGTGAGGCGAATTCTGGGGCTGCTGGATGCTTA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    435 CTTGAAGACGAGGACTTTTCTGGTGGGCGAACGAGTGACATTGGCTGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101692 CTTGAAGACGAGGACTTTTCTGGTGGGCGAACGAGTGACATTGGCTGACA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    485 TCACAGTTGTCTGCACCCTGTTGTGGCTCTATAAGCAG         GTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 101742 TCACAGTTGTCTGCACCCTGTTGTGGCTCTATAAGCAGGTG...CAGGTT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    526 CTAGAGCCTTCTTTCCGCCAGGCCTTTCCCAATACCAACCGCTGGTTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105219 CTAGAGCCTTCTTTCCGCCAGGCCTTTCCCAATACCAACCGCTGGTTCCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    576 CACCTGCATTAACCAGCCCCAGTTCCGGGCTGTCTTGGGCGAAGTGAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105269 CACCTGCATTAACCAGCCCCAGTTCCGGGCTGTCTTGGGCGAAGTGAAAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    626 TGTGTGAGAAGATGGCCCAGTTTGATG         CTAAAAAGTTTGCA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 105319 TGTGTGAGAAGATGGCCCAGTTTGATGGTG...CAGCTAAAAAGTTTGCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    667 GAGACCCAACCTAAAAAGGACACACCACGGAAAGAGAAGGGTTCACGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105748 GAGACCCAACCTAAAAAGGACACACCACGGAAAGAGAAGGGTTCACGGGA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    717 AGAGAAGCAGAAGCCCCAGGCTGAGCGGAAGGAGGAGAAAAAGGCGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105798 AGAGAAGCAGAAGCCCCAGGCTGAGCGGAAGGAGGAGAAAAAGGCGGCTG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    767 CCCCTGCTCCTGAGGAGGAGATGGATGAATGTGAGCAGGCGCTGGCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105848 CCCCTGCTCCTGAGGAGGAGATGGATGAATGTGAGCAGGCGCTGGCTGCT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    817 GAGCCCAAGGCCAAGGACCCCTTCGCTCACCTGCCCAAGAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 105898 GAGCCCAAGGCCAAGGACCCCTTCGCTCACCTGCCCAAGAGGTA...TAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    858 TACCTTTGTGTTGGATGAATTTAAGCGCAAGTACTCCAATGAGGACACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112290 TACCTTTGTGTTGGATGAATTTAAGCGCAAGTACTCCAATGAGGACACAC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    908 TCTCTGTGGCACTGCCATATTTCTGGGAGCACTTTGATAAGGACGGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112340 TCTCTGTGGCACTGCCATATTTCTGGGAGCACTTTGATAAGGACGGCTGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    958 TCCCTGTGGTACTCAGAGTATCGCTTCCCTGAAGAACTCACTCAGACCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112390 TCCCTGTGGTACTCAGAGTATCGCTTCCCTGAAGAACTCACTCAGACCTT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1008 CATGAGCTGCAATCTCATCACTG         GAATGTTCCAGCGACTGG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 112440 CATGAGCTGCAATCTCATCACTGGTA...CAGGAATGTTCCAGCGACTGG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1049 ACAAGCTGAGGAAGAATGCCTTCGCCAGTGTCATCCTTTTTGGAACCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112569 ACAAGCTGAGGAAGAATGCCTTCGCCAGTGTCATCCTTTTTGGAACCAAC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1099 AATAGCAGCTCCATTTCTGGAGTCTGGGTCTTCCGAGGCCAGGAGCTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112619 AATAGCAGCTCCATTTCTGGAGTCTGGGTCTTCCGAGGCCAGGAGCTTGC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1149 CTTTCCG         CTGAGTCCAGATTGGCAGGTGGACTACGAGTCAT
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112669 CTTTCCGGTG...CAGCTGAGTCCAGATTGGCAGGTGGACTACGAGTCAT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1190 ACACATGGCGGAAACTGGATCCTGGCAGCGAGGAGACCCAGACGCTGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112941 ACACATGGCGGAAACTGGATCCTGGCAGCGAGGAGACCCAGACGCTGGTT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1240 CGAGAGTACTTTTCCTGGGAGGGGGCCTTCCAGCATGTGGGCAAAGCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112991 CGAGAGTACTTTTCCTGGGAGGGGGCCTTCCAGCATGTGGGCAAAGCCTT

   1350     .    :    .    :
   1290 CAATCAGGGCAAGATCTTCAAG
        ||||||||||||||||||||||
 113041 CAATCAGGGCAAGATCTTCAAG