seq1 = pF1KB0966.tfa, 1281 bp
seq2 = pF1KB0966/gi568815579f_57519469.tfa (gi568815579f:57519469_57721400), 201932 bp

>pF1KB0966 1281
>gi568815579f:57519469_57721400 (Chr19)

1-40  (100001-100040)   100% ->
41-1281  (100692-101932)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACTCTAGTCACAGCAGGAGGGGCTTGGACAGGCCCTG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 100001 ATGACTCTAGTCACAGCAGGAGGGGCTTGGACAGGCCCTGGTG...CAGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 TTGTTGGCATGAAGTGAAGGATGAAGAGTCATCTTCTGAACAGAGCATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100693 TTGTTGGCATGAAGTGAAGGATGAAGAGTCATCTTCTGAACAGAGCATTT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CTATAGCAGTGTCACATGTTAATACTTCCAAGGCAGGTTTGCCCGCACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100743 CTATAGCAGTGTCACATGTTAATACTTCCAAGGCAGGTTTGCCCGCACAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ACGGCTCTCCCTTGTGACATATGTGGCCCCATCTTGAAAGATATTTTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100793 ACGGCTCTCCCTTGTGACATATGTGGCCCCATCTTGAAAGATATTTTGCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CCTGGATGAACACCAGGGTACACACCATGGACTGAAACTTCACACATGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100843 CCTGGATGAACACCAGGGTACACACCATGGACTGAAACTTCACACATGTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GGGCATGTGGGAGACAATTCTGGTTCAGTGCAAACCTTCATCAGTACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100893 GGGCATGTGGGAGACAATTCTGGTTCAGTGCAAACCTTCATCAGTACCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 AAGTGTTACAGTATAGAGCAACCCTTAAGAAGGGATAAAAGTGAGGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100943 AAGTGTTACAGTATAGAGCAACCCTTAAGAAGGGATAAAAGTGAGGCCTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 AATTGTGAAGAACTGCACAGTTAGCAAAGAACCTCATCCGTCAGAGAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100993 AATTGTGAAGAACTGCACAGTTAGCAAAGAACCTCATCCGTCAGAGAAGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 CCTTTACGTGTAAGGAGGAGCAGAAAAACTTCCAGGCTACTTTGGGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101043 CCTTTACGTGTAAGGAGGAGCAGAAAAACTTCCAGGCTACTTTGGGTGGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 TGCCAACAAAAGGCCATCCACAGTAAGAGGAAGACACACAGGAGCACTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101093 TGCCAACAAAAGGCCATCCACAGTAAGAGGAAGACACACAGGAGCACTGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 GAGTGGGGATGCATTTCATGGTGAACAAATGCATTACAAGTGCAGTGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101143 GAGTGGGGATGCATTTCATGGTGAACAAATGCATTACAAGTGCAGTGAAT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 GTGGGAAAGCTTTCAGCCGCAAAGACACACTTGTCCAGCACCAGAGAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101193 GTGGGAAAGCTTTCAGCCGCAAAGACACACTTGTCCAGCACCAGAGAATT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 CATAGTGGAGAGAAGCCTTATGAGTGCAGCGAATGTGGGAAAGCCTTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101243 CATAGTGGAGAGAAGCCTTATGAGTGCAGCGAATGTGGGAAAGCCTTCAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 CCGCAAAGCTACACTTGTCCAGCATCAGAGAATCCATACTGGAGAAAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101293 CCGCAAAGCTACACTTGTCCAGCATCAGAGAATCCATACTGGAGAAAGGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 CTTATGAATGCAGCGAATGTGGAAAAACCTTCAGTCGAAAAGACAACCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101343 CTTATGAATGCAGCGAATGTGGAAAAACCTTCAGTCGAAAAGACAACCTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 ACTCAGCACAAGAGAATCCACACTGGAGAAATGCCTTATAAGTGCAATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101393 ACTCAGCACAAGAGAATCCACACTGGAGAAATGCCTTATAAGTGCAATGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 ATGTGGGAAATATTTTAGCCATCACTCCAATCTAATTGTACACCAGAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101443 ATGTGGGAAATATTTTAGCCATCACTCCAATCTAATTGTACACCAGAGAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 TTCACAATGGAGCAAGGCCTTATAAGTGCAGTGATTGTGGGAAAGTCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101493 TTCACAATGGAGCAAGGCCTTATAAGTGCAGTGATTGTGGGAAAGTCTTC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 AGACACAAATCTACACTTGTTCAGCATGAGAGTATTCACACTGGAGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101543 AGACACAAATCTACACTTGTTCAGCATGAGAGTATTCACACTGGAGAAAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 TCCTTATGATTGCAGTGATTGTGGGAAATCCTTTGGCCACAAATACACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101593 TCCTTATGATTGCAGTGATTGTGGGAAATCCTTTGGCCACAAATACACCC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 TCATTAAACATCAGCGAATTCACACTGAGTCAAAGCCGTTTGAGTGCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101643 TCATTAAACATCAGCGAATTCACACTGAGTCAAAGCCGTTTGAGTGCATT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1042 GAATGCGGGAAATTCTTTAGTCGAAGTTCTGACTATATTGCACACCAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101693 GAATGCGGGAAATTCTTTAGTCGAAGTTCTGACTATATTGCACACCAGAG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1092 GGTTCACACTGGTGAAAGGCCTTTTGTGTGCAGTAAATGTGGGAAAGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101743 GGTTCACACTGGTGAAAGGCCTTTTGTGTGCAGTAAATGTGGGAAAGACT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1142 TTATCAGAACCTCCCACCTTGTTCGACACCAAAGAGTTCACACTGGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101793 TTATCAGAACCTCCCACCTTGTTCGACACCAAAGAGTTCACACTGGAGAA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1192 AGGCCATATGAGTGCAGTGAATGTGGGAAGGCCTACAGCTTAAGCTCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101843 AGGCCATATGAGTGCAGTGAATGTGGGAAGGCCTACAGCTTAAGCTCCCA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :
   1242 CCTCAATCGGCACCAGAAAGTTCACACTGCAGGCAGGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101893 CCTCAATCGGCACCAGAAAGTTCACACTGCAGGCAGGCTT