seq1 = pF1KB0961.tfa, 579 bp
seq2 = pF1KB0961/gi568815597r_201384716.tfa (gi568815597r:201384716_201596303), 211588 bp

>pF1KB0961 579
>gi568815597r:201384716_201596303 (Chr1)

(complement)

1-112  (100001-100112)   100% ->
113-281  (105960-106128)   100% ->
282-411  (107320-107449)   100% ->
412-505  (110928-111021)   100% ->
506-579  (111515-111588)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCGAACTGGGGAGGAGGCAAGAAATGTGGGGTGTGTCAGAAGACGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCGAACTGGGGAGGAGGCAAGAAATGTGGGGTGTGTCAGAAGACGGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TTACTTTGCCGAAGAGGTTCAGTGCGAAGGCAACAGCTTCCATAAATCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TTACTTTGCCGAAGAGGTTCAGTGCGAAGGCAACAGCTTCCATAAATCCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCTTCCTGTGCA         TGGTCTGCAAGAAGAATCTGGACAGTACC
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCTTCCTGTGCAGTG...CAGTGGTCTGCAAGAAGAATCTGGACAGTACC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ACTGTGGCCGTGCATGGTGAGGAGATTTACTGCAAGTCCTGCTACGGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105989 ACTGTGGCCGTGCATGGTGAGGAGATTTACTGCAAGTCCTGCTACGGCAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GAAGTATGGGCCCAAAGGCTATGGCTACGGGCAGGGCGCAGGCACCCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106039 GAAGTATGGGCCCAAAGGCTATGGCTACGGGCAGGGCGCAGGCACCCTCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GCACTGACAAGGGGGAGTCGCTGGGTATCAAGCACGAGGA         A
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 106089 GCACTGACAAGGGGGAGTCGCTGGGTATCAAGCACGAGGAGTG...CAGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GCCCCTGGCCACAGGCCCACCACCAACCCCAATGCATCCAAATTTGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107321 GCCCCTGGCCACAGGCCCACCACCAACCCCAATGCATCCAAATTTGCCCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GAAGATTGGTGGCTCCGAGCGCTGCCCCCGATGCAGCCAGGCAGTCTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107371 GAAGATTGGTGGCTCCGAGCGCTGCCCCCGATGCAGCCAGGCAGTCTATG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CTGCGGAGAAGGTGATTGGTGCTGGGAAG         TCCTGGCATAAG
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 107421 CTGCGGAGAAGGTGATTGGTGCTGGGAAGGTA...TAGTCCTGGCATAAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GCCTGCTTTCGATGTGCCAAGTGTGGCAAAGGCCTTGAGTCAACCACCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110940 GCCTGCTTTCGATGTGCCAAGTGTGGCAAAGGCCTTGAGTCAACCACCCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GGCAGACAAGGATGGCGAGATTTACTGCAAAG         GATGTTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 110990 GGCAGACAAGGATGGCGAGATTTACTGCAAAGGTG...CAGGATGTTATG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 CTAAAAACTTCGGGCCCAAGGGCTTTGGTTTTGGGCAAGGAGCTGGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111524 CTAAAAACTTCGGGCCCAAGGGCTTTGGTTTTGGGCAAGGAGCTGGGGCC

    600     .    :    .
    565 TTGGTCCACTCTGAG
        |||||||||||||||
 111574 TTGGTCCACTCTGAG