seq1 = pF1KB0955.tfa, 561 bp
seq2 = pF1KB0955/gi568815583f_48778177.tfa (gi568815583f:48778177_48978737), 200561 bp

>pF1KB0955 561
>gi568815583f:48778177_48978737 (Chr15)

1-561  (100001-100561)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCGGAAATGGCTGAGTTGTCCGAGCTGTATGAAGAGAGCAGTGACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCGGAAATGGCTGAGTTGTCCGAGCTGTATGAAGAGAGCAGTGACCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCAGATGGATGTGATGCCTGGCGAGGGTGACCTTCCGCAGATGGAGGTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCAGATGGATGTGATGCCTGGCGAGGGTGACCTTCCGCAGATGGAGGTAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCAGCGGGAGCCGGGAGCTATCCCTGCGTCCCTCCCGCAGCGGGGCCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCAGCGGGAGCCGGGAGCTATCCCTGCGTCCCTCCCGCAGCGGGGCCCAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CAGCTCGAGGAGGAAGGCCCAATGGAGGAGGAGGAGGCCCAGCCAATGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CAGCTCGAGGAGGAAGGCCCAATGGAGGAGGAGGAGGCCCAGCCAATGGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGCGCCAGAGGGGAAACGGAGCCTTGCTAACGGGCCCAACGCTGGGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GGCGCCAGAGGGGAAACGGAGCCTTGCTAACGGGCCCAACGCTGGGGAGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGCCAGGCCAGGTGGCGGGCGCAGACTTCGAGAGCGAGGACGAGGGCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 AGCCAGGCCAGGTGGCGGGCGCAGACTTCGAGAGCGAGGACGAGGGCGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GAATTTGATGACTGGGAGGACGACTACGACTATCCCGAAGAGGAGCAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GAATTTGATGACTGGGAGGACGACTACGACTATCCCGAAGAGGAGCAGCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CAGTGGTGCCGGCTACAGAGTATCAGCCGCTCTTGAAGAAGCCGACAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CAGTGGTGCCGGCTACAGAGTATCAGCCGCTCTTGAAGAAGCCGACAAGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGTTTCTGAGAACAAGAGAACCAGCCCTGGATGGCGGGTTTCAGATGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TGTTTCTGAGAACAAGAGAACCAGCCCTGGATGGCGGGTTTCAGATGCAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TATGAGAAGACCCCGTTTGATCAGTTAGCTTTTATCGAAGAGCTTTTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TATGAGAAGACCCCGTTTGATCAGTTAGCTTTTATCGAAGAGCTTTTTTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 ACTGATGGTTGTCAATCGTCTGACCGAAGAACTCGGCTGTGATGAGATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 ACTGATGGTTGTCAATCGTCTGACCGAAGAACTCGGCTGTGATGAGATTA

    550     .    :
    551 TTGATAGAGAG
        |||||||||||
 100551 TTGATAGAGAG