seq1 = pF1KB0949.tfa, 540 bp
seq2 = pF1KB0949/gi568815577r_44751584.tfa (gi568815577r:44751584_44973616), 222033 bp

>pF1KB0949 540
>gi568815577r:44751584_44973616 (Chr21)

(complement)

1-115  (100001-100115)   100% ->
116-168  (108170-108222)   100% ->
169-277  (112346-112454)   100% ->
278-449  (117253-117424)   100% ->
450-496  (118361-118407)   100% ->
497-540  (121990-122033)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGCCCGGAGTGGCCCGCGGGCCGACGCCGTACTGGAGGTTGCGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGCCCGGAGTGGCCCGCGGGCCGACGCCGTACTGGAGGTTGCGCCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGGTGGCGCCGCGCTGCTCCTGCTGCTCATCCCGGTGGCCGCCGCGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGGTGGCGCCGCGCTGCTCCTGCTGCTCATCCCGGTGGCCGCCGCGCAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGCCTCCCGGAGCTG         CTTGTTCTCAGAACACAAACAAAACC
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGCCTCCCGGAGCTGGTG...CAGCTTGTTCTCAGAACACAAACAAAACC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TGTGAAGAGTGCCTGAAGAACGTCTCC         TGTCTTTGGTGCAA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 108196 TGTGAAGAGTGCCTGAAGAACGTCTCCGTA...CAGTGTCTTTGGTGCAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CACTAACAAGGCTTGTCTGGACTACCCAGTTACAAGCGTCTTGCCACCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112360 CACTAACAAGGCTTGTCTGGACTACCCAGTTACAAGCGTCTTGCCACCGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CTTCCCTTTGTAAATTGAGCTCTGCACGCTGGGGAGTTTGTTGGG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 112410 CTTCCCTTTGTAAATTGAGCTCTGCACGCTGGGGAGTTTGTTGGGGTA..

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    278     TGAACTTTGAGGCGCTGATCATCACCATGTCGGTAGTCGGGGGAAC
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112460 .CAGTGAACTTTGAGGCGCTGATCATCACCATGTCGGTAGTCGGGGGAAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CCTCCTCCTGGGCATTGCCATCTGCTGCTGCTGCTGCTGCAGGAGGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117299 CCTCCTCCTGGGCATTGCCATCTGCTGCTGCTGCTGCTGCAGGAGGAAGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 GGAGCCGGAAGCCGGACAGGAGTGAGGAGAAGGCCATGCGTGAGCGGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117349 GGAGCCGGAAGCCGGACAGGAGTGAGGAGAAGGCCATGCGTGAGCGGGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GAGAGGCGGATACGGCAGGAGGAACG         GAGAGCAGAGATGAA
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 117399 GAGAGGCGGATACGGCAGGAGGAACGGTG...TAGGAGAGCAGAGATGAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GACAAGACATGATGAAATCAGAAAAAAATATG         GCCTGTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 118376 GACAAGACATGATGAAATCAGAAAAAAATATGGTA...CAGGCCTGTTTA

    550     .    :    .    :    .    :    .
    506 AAGAAGAAAACCCGTATGCTAGATTTGAAAACAAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121999 AAGAAGAAAACCCGTATGCTAGATTTGAAAACAAC