seq1 = pF1KB0948.tfa, 1206 bp
seq2 = pF1KB0948/gi568815579f_57676540.tfa (gi568815579f:57676540_57879793), 203254 bp

>pF1KB0948 1206
>gi568815579f:57676540_57879793 (Chr19)

1-36  (93304-93339)   100% ->
37-163  (100004-100130)   100% ->
164-1206  (102212-103254)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGCAGCAGCCGCTCTGAGGGCGCCTGCTCAG         AGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
  93304 ATGGCGGCAGCAGCCGCTCTGAGGGCGCCTGCTCAGGTG...CAGAGCAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 TGTGACCTTTGAAGATGTGGCTGTAAACTTTTCCCTGGAGGAATGGAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100009 TGTGACCTTTGAAGATGTGGCTGTAAACTTTTCCCTGGAGGAATGGAGTC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TTCTTAATGAGGCTCAGAGATGCCTGTACCGTGACGTGATGCTGGAGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100059 TTCTTAATGAGGCTCAGAGATGCCTGTACCGTGACGTGATGCTGGAGACC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TTGACACTTATATCCTCCCTGG         GTTGTTGGCATGGAGGGGA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 100109 TTGACACTTATATCCTCCCTGGGTA...TAGGTTGTTGGCATGGAGGGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 AGATGAGGCAGCACCTTCTAAGCAGAGCACGTGTATACATATATACAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102231 AGATGAGGCAGCACCTTCTAAGCAGAGCACGTGTATACATATATACAAAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ACCAGGGAGGTCATAGTGGAGAAAGGCCTTATGAGTGTGGGGAATATAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102281 ACCAGGGAGGTCATAGTGGAGAAAGGCCTTATGAGTGTGGGGAATATAGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AAATTATTTAAGAACAAGTCCTGCCTCACTGAACCCAGAAGAGATCACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102331 AAATTATTTAAGAACAAGTCCTGCCTCACTGAACCCAGAAGAGATCACAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 ACACAGGAATGTTCGCACTGGAGAAAGGCCTTATGAGTGCAGCAAATATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102381 ACACAGGAATGTTCGCACTGGAGAAAGGCCTTATGAGTGCAGCAAATATG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GGAAATTATTTCACCAAAAGCCTACACTCCATATTCATGAGAGATTTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102431 GGAAATTATTTCACCAAAAGCCTACACTCCATATTCATGAGAGATTTCAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 ACTGGGCAAAAGACCTATGAGTGCAGTGAGTGTGGAAAATCATTTCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102481 ACTGGGCAAAAGACCTATGAGTGCAGTGAGTGTGGAAAATCATTTCACCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 AAGCTCTTCACTCTTGCAGCGTCAGACACTTCACACTAGAGAAAGGCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102531 AAGCTCTTCACTCTTGCAGCGTCAGACACTTCACACTAGAGAAAGGCCTT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 ATGAGTGTATTGAATGTGGGAAAGCCTTTGCTGAAAAGTCCAGTCTCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102581 ATGAGTGTATTGAATGTGGGAAAGCCTTTGCTGAAAAGTCCAGTCTCATT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 AACCACAGGAAAGTTCACTCTGGAGCAAAGCGTTATGAATGCAATGAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102631 AACCACAGGAAAGTTCACTCTGGAGCAAAGCGTTATGAATGCAATGAATG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 TGGGAAGTCCTTTGCTTATACATCTAGTCTCATTAAACACAGGAGGATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102681 TGGGAAGTCCTTTGCTTATACATCTAGTCTCATTAAACACAGGAGGATTC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 ACACTGGAGAGAGGCCTTATGAGTGCAGTGAATGTGGGAGATCCTTTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102731 ACACTGGAGAGAGGCCTTATGAGTGCAGTGAATGTGGGAGATCCTTTGCT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 GAAAACTCCAGTCTTATTAAACACTTGAGAGTTCACACAGGAGAAAGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102781 GAAAACTCCAGTCTTATTAAACACTTGAGAGTTCACACAGGAGAAAGGCC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 TTATGAATGCGTTGAGTGTGGAAAATCATTTCGCCGAAGCTCTTCACTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102831 TTATGAATGCGTTGAGTGTGGAAAATCATTTCGCCGAAGCTCTTCACTCT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833 TGCAGCATCAGAGAGTTCACACTAGAGAAAGGCCTTATGAATGTAGTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102881 TGCAGCATCAGAGAGTTCACACTAGAGAAAGGCCTTATGAATGTAGTGAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    883 TGTGGGAAATCCTTTAGCTTAAGGTCCAACCTCATTCACCATCAGCGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102931 TGTGGGAAATCCTTTAGCTTAAGGTCCAACCTCATTCACCATCAGCGAGT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    933 TCATACTGGAGAAAGGCATGAGTGCGGGCAGTGTGGGAAATCCTTTAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102981 TCATACTGGAGAAAGGCATGAGTGCGGGCAGTGTGGGAAATCCTTTAGCC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    983 GAAAATCTAGCCTTATTATACATCTGAGAGTTCACACTGGAGAAAGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103031 GAAAATCTAGCCTTATTATACATCTGAGAGTTCACACTGGAGAAAGGCCT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1033 TATGAGTGCAGTGACTGTGGGAAATCCTTTGCTGAAAACTCCAGCCTTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103081 TATGAGTGCAGTGACTGTGGGAAATCCTTTGCTGAAAACTCCAGCCTTAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1083 TAAACACTTGAGAGTTCACACTGGAGAAAGGCCATATGAATGCATTGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103131 TAAACACTTGAGAGTTCACACTGGAGAAAGGCCATATGAATGCATTGATT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1133 GTGGAAAATCATTTCGCCACAGTTCTTCGTTCCGTCGCCATCAGAGAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103181 GTGGAAAATCATTTCGCCACAGTTCTTCGTTCCGTCGCCATCAGAGAGTT

   1200     .    :    .    :
   1183 CATACTGGAATGAGGCCTTATAAG
        ||||||||||||||||||||||||
 103231 CATACTGGAATGAGGCCTTATAAG