seq1 = pF1KB0947.tfa, 534 bp
seq2 = pF1KB0947/gi568815586r_110335158.tfa (gi568815586r:110335158_110545552), 210395 bp

>pF1KB0947 534
>gi568815586r:110335158_110545552 (Chr12)

(complement)

1-106  (99995-100101)   97% ->
107-183  (105165-105241)   100% ->
184-252  (108401-108469)   100% ->
253-379  (108870-108996)   100% ->
380-474  (109349-109443)   100% ->
475-534  (110336-110395)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 A TGCCGGCTTACCACTCTTCTCTCATGGATCCTGATACCAAACTCATCG
        |-| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99995 ATTACAGGCTTACCACTCTTCTCTCATGGATCCTGATACCAAACTCATCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     50 GAAACATGGCACTGTTGCCTATCAGAAGTCAATTCAAAGGACCTGCCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100045 GAAACATGGCACTGTTGCCTATCAGAAGTCAATTCAAAGGACCTGCCCCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    100 AGAGAGA         CAAAAGATACAGATATTGTGGATGAAGCCATCTA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100095 AGAGAGAGTA...TAGCAAAAGATACAGATATTGTGGATGAAGCCATCTA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    141 TTACTTCAAGGCCAATGTCTTCTTCAAAAACTATGAAATTAAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 105199 TTACTTCAAGGCCAATGTCTTCTTCAAAAACTATGAAATTAAGGTA...T

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    184   AATGAAGCTGATAGGACCTTGATATATATAACTCTCTACATTTCTGAA
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108399 AGAATGAAGCTGATAGGACCTTGATATATATAACTCTCTACATTTCTGAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    232 TGTCTGAAGAAACTGCAAAAG         TGCAATTCCAAAAGCCAAGG
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 108449 TGTCTGAAGAAACTGCAAAAGGTA...CAGTGCAATTCCAAAAGCCAAGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    273 TGAGAAAGAAATGTATACGCTGGGAATCACTAATTTTCCCATTCCTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108890 TGAGAAAGAAATGTATACGCTGGGAATCACTAATTTTCCCATTCCTGGAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    323 AGCCTGGTTTTCCACTTAACGCAATTTATGCCAAACCTGCAAACAAACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108940 AGCCTGGTTTTCCACTTAACGCAATTTATGCCAAACCTGCAAACAAACAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    373 GAAGATG         AAGTGATGAGAGCCTATTTACAACAGCTAAGGCA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108990 GAAGATGGTA...TAGAAGTGATGAGAGCCTATTTACAACAGCTAAGGCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    414 AGAGACTGGACTGAGACTTTGTGAGAAAGTTTTCGACCCTCAGAATGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109383 AGAGACTGGACTGAGACTTTGTGAGAAAGTTTTCGACCCTCAGAATGATA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    464 AACCCAGCAAG         TGGTGGACTTGCTTTGTGAAGAGACAGTTC
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 109433 AACCCAGCAAGGTA...TAGTGGTGGACTTGCTTTGTGAAGAGACAGTTC

    550     .    :    .    :    .    :
    505 ATGAACAAGAGTCTTTCAGGACCTGGACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||
 110366 ATGAACAAGAGTCTTTCAGGACCTGGACAG