seq1 = pF1KB0941.tfa, 507 bp
seq2 = pF1KB0941/gi568815595r_169049624.tfa (gi568815595r:169049624_169763372), 713749 bp

>pF1KB0941 507
>gi568815595r:169049624_169763372 (Chr3)

(complement)

1-37  (100001-100037)   100% ->
38-375  (381849-382186)   99% ->
376-507  (613618-613749)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGATCCAAAGGCAGGGCAAGGAAACTGGCCACAA         ATAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 100001 ATGAGATCCAAAGGCAGGGCAAGGAAACTGGCCACAAGTA...CAGATAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 TGAGTGTGTATATGGCAACTACCCTGAAATACCTTTGGAAGAAATGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 381853 TGAGTGTGTATATGGCAACTACCCTGAAATACCTTTGGAAGAAATGCCAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ATGCAGATGGAGTAGCCAGCACTCCCTCCCTCAATATTCAAGAGCCATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 381903 ATGCAGATGGAGTAGCCAGCACTCCCTCCCTCAATATTCAAGAGCCATGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TCTCCTGCCACATCCAGTGAAGCATTCACTCCAAAGGAGGGTTCTCCTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 381953 TCTCCTGCCACATCCAGTGAAGCATTCACTCCAAAGGAGGGTTCTCCTTA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CAAAGCCCCCATCTACATCCCTGATGATATCCCCATTCCTGCTGAGTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 382003 CAAAGCCCCCATCTACATCCCTGATGATATCCCCATTCCTGCTGAGTTTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AACTTCGAGAGTCAAATATGCCTGGGGCAGGACTAGGAATATGGACCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 382053 AACTTCGAGAGTCAAATATGCCTGGGGCAGGACTAGGAATATGGACCAAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 AGGAAGATCGAAGTAGGTGAAAAGTTTGGGCCTTATGTGGGAGAGCAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 382103 AGGAAGATCGAAGTAGGTGAAAAGTTTGGGCCTTATGTGGGAGAGCAGAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GTCAAACCTGAAAGACTCCAGTTATGGATGGGAG         GTACATC
        |||||||||||||||| |||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 382153 GTCAAACCTGAAAGACCCCAGTTATGGATGGGAGGTA...TAGGTACATC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TTCCAAGGTCTCGGAGGGTAAGCGTTCACTCTTGGTTGTATTTGGGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 613625 TTCCAAGGTCTCGGAGGGTAAGCGTTCACTCTTGGTTGTATTTGGGGAAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 AGAAGCTCAGACGTAGGAATAGCCTTCTCTCAGGCTGATGTCTACATGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 613675 AGAAGCTCAGACGTAGGAATAGCCTTCTCTCAGGCTGATGTCTACATGCC

    500     .    :    .    :    .
    483 TGGACTGCAGTGTGCCTTCCTCTCG
        |||||||||||||||||||||||||
 613725 TGGACTGCAGTGTGCCTTCCTCTCG