seq1 = pF1KB0929.tfa, 408 bp
seq2 = pF1KB0929/gi568815585f_71575066.tfa (gi568815585f:71575066_71775471), 200406 bp

>pF1KB0929 408
>gi568815585f:71575066_71775471 (Chr13)

1-408  (99999-100406)   98%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTCGTACAAAGCAGACTGCCCGCAAATCGACCGGTGGTAAAGCACC
        | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99999 ACGGCTCGTACAAAGCAGACTGCCCGCAAATCGACCGGTGGTAAAGCACC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAGGAAGCAACTGGCTACAAAAGCCGCTCGCAAGAGTGCGCCCTCTACTG
        ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100049 CAGGAAGTAACTGGCTACAAAAGCCGCTCGCAAGAGTGCGCCCTCTACTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GAGGGGTGAAGAAACCTCATCGTTACAGGCCTGGTACTGTGGCGCTCCGT
        ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
 100099 GAGGGGTGAAGAAACCTCATCGTAACAGGCCTGGTACTGTGGCGCTCCGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GAAATTAGACGTTATCAGAAGTCCACTGAACTTCTGATTCGCAAACTTCC
        ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
 100149 GAAGTTAGACGTTATCAGAAGTCCACTGAACTTCTGATTCGCAGACTTCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTTCCAGCGTCTGGTGCGAGAAATTGCTCAGGACTTTAAAACAGATCTGC
        ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
 100199 CTTCCAGAGTCTGGTGCGAGAAATTGCTCAGTACTTTAAAACAGATCTGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCTTCCAGAGCGCAGCTATCGGTGCTTTGCAGGAGGCAAGTGAGGCCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100249 GCTTCCAGAGCGCAGCTATCGGTGCTTTGCAGGAGGCAAGTGAGGCCTAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTGGTTGGCCTTTTTGAAGACACCAACCTGTGTGCTATCCATGCCAAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100299 CTGGTTGGCCTTTTTGAAGACACCAACCTGTGTGCTATCCATGCCAAACG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TGTAACAATTATGCCAAAAGACATCCAGCTAGCACGCCGCATACGTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100349 TGTAACAATTATGCCAAAAGACATCCAGCTAGCACGCCGCATACGTGGAG

    400     .
    401 AACGTGCT
        ||||||||
 100399 AACGTGCT