seq1 = pF1KB0927.tfa, 399 bp
seq2 = pF1KB0927/gi568815585f_31852580.tfa (gi568815585f:31852580_32052978), 200399 bp

>pF1KB0927 399
>gi568815585f:31852580_32052978 (Chr13)

1-399  (100001-100399)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTACAAACTTTCTAGTAGGTGAGAAGATCTGGTTCCACAAGTTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTACAAACTTTCTAGTAGGTGAGAAGATCTGGTTCCACAAGTTCAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ATATGGCGATGCAGAAAGGAGATTCTACGAACAGATGAACGGGCCTGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 ATATGGCGATGCAGAAAGGAGATTCTACGAACAGATGAACGGGCCTGTGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCGGCGCCTCCCTCCAGGAGGCCAGCATGATCCTCCATGATATTGCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCGGCGCCTCCCTCCAGGAGGCCAGCATGATCCTCCATGATATTGCCAGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCCAGAGAGAACATCCCGAAATCCCTGGCCGGAAGCTTAGGCCCAGGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GCCAGAGAGAACATCCCGAAATCCCTGGCCGGAAGCTTAGGCCCAGGGGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GTCTAGCGGCCCCAGCGGAGACCACAGCGAGCTCGTCGTCCGGATCGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GTCTAGCGGCCCCAGCGGAGACCACAGCGAGCTCGTCGTCCGGATCGCCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GTCTGGAAGTGGACAACCAGAGAGACCTGGCTGAACGTGCTGGAGAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GTCTGGAAGTGGACAACCAGAGAGACCTGGCTGAACGTGCTGGAGAAGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTTGCCCGGCCACTGGGCCACAGCCCCGCAGACCCAGCACATGTCTCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTTGCCCGGCCACTGGGCCACAGCCCCGCAGACCCAGCACATGTCTCCCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    351 TGCGCCAAGTGGAGCCCCCGGCCAAGAAGCTAGCCACACCAGCAGAGGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TGCGCCAAGTGGAGCCCCCGGCCAAGAAGCTAGCCACACCAGCAGAGGA