seq1 = pF1KB0926.tfa, 1068 bp
seq2 = pF1KB0926/gi568815592r_107605203.tfa (gi568815592r:107605203_107849795), 244593 bp

>pF1KB0926 1068
>gi568815592r:107605203_107849795 (Chr6)

(complement)

1-112  (100001-100112)   100% ->
113-313  (102907-103107)   100% ->
314-508  (104653-104847)   100% ->
509-799  (128803-129093)   100% ->
800-945  (141785-141930)   100% ->
946-1068  (144471-144593)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACTCCCTTAGCCCTCTCACCTCCGCGGAGTACCCCAGAGCCCGACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACTCCCTTAGCCCTCTCACCTCCGCGGAGTACCCCAGAGCCCGACCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAGCTCCATCCCTCAGGACGCAGCCACGGTCCCCAGCTTGGCGGCCCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CAGCTCCATCCCTCAGGACGCAGCCACGGTCCCCAGCTTGGCGGCCCCAC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGGCTCTCACAG         TCTGCCTCTACATCAACAAGCAGGCCAAT
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGGCTCTCACAGGTA...CAGTCTGCCTCTACATCAACAAGCAGGCCAAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GCGGGGCCCTATCTGGAGAGGAAGAAGGTGCAGCAGCTCCCGGAGCATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102936 GCGGGGCCCTATCTGGAGAGGAAGAAGGTGCAGCAGCTCCCGGAGCATTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TGGGCCCGAGCGGCCATCGGCGGTGCTGCAGCAGGCCGTCCAAGCCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102986 TGGGCCCGAGCGGCCATCGGCGGTGCTGCAGCAGGCCGTCCAAGCCTGCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TCGACTGCGCCCACCAGCAGAAGCTGGTCTTCTCCCTGGTCAAGCAGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103036 TCGACTGCGCCCACCAGCAGAAGCTGGTCTTCTCCCTGGTCAAGCAGGGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TATGGTGGTGAGATGGTGTCAG         TCTCGGCTTCCTTTGATGG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 103086 TATGGTGGTGAGATGGTGTCAGGTA...CAGTCTCGGCTTCCTTTGATGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CAAACAGCACCTGCGGAGCCTGCCTGTGGTGAACAGCATCGGCTATGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104672 CAAACAGCACCTGCGGAGCCTGCCTGTGGTGAACAGCATCGGCTATGTCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TCCGCTTCCTCGCCAAGCTGTGCCGAAGCCTCCTGTGCGATGACCTCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104722 TCCGCTTCCTCGCCAAGCTGTGCCGAAGCCTCCTGTGCGATGACCTCTTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 AGCCACCAGCCCTTCCCCAGGGGCTGCAGTGCCTCTGAGAAAGTCCAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104772 AGCCACCAGCCCTTCCCCAGGGGCTGCAGTGCCTCTGAGAAAGTCCAGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GAAAGAGGAAGGGAGGATGGAATCAG         TCAAGACAGTCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 104822 GAAAGAGGAAGGGAGGATGGAATCAGGTA...TAGTCAAGACAGTCACCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 CCGAAGAGTACCTGGTGAACCCTGTGGGCATGAACCGCTACAGCGTGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128818 CCGAAGAGTACCTGGTGAACCCTGTGGGCATGAACCGCTACAGCGTGGAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 ACCTCCGCCTCCACCTTTAACCACAGGGGCTCCTTGCACCCCTCCTCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128868 ACCTCCGCCTCCACCTTTAACCACAGGGGCTCCTTGCACCCCTCCTCCTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 GCTGTACTGCAAGAGGCAGAACTCTGGAGACAGCCACCTTGGGGGTGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128918 GCTGTACTGCAAGAGGCAGAACTCTGGAGACAGCCACCTTGGGGGTGGTC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 CTGCTGCCACCGCTGGTGGTCCCCGCACTAGCCCCATGTCTTCTGGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128968 CTGCTGCCACCGCTGGTGGTCCCCGCACTAGCCCCATGTCTTCTGGTGGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 CCCTCGGCACCTGGGCTGAGGCCTCCAGCCTCCAGCCCCAAGAGAAACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129018 CCCTCGGCACCTGGGCTGAGGCCTCCAGCCTCCAGCCCCAAGAGAAACAC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 GACCTCTCTTGAAGGAAACAGATGTG         CCTCAAGCCCTTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 129068 GACCTCTCTTGAAGGAAACAGATGTGGTA...CAGCCTCAAGCCCTTCTC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 AGGATGCGCAGGATGCCAGGCGGCCACGGAGCAGGAACCCCTCCGCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141800 AGGATGCGCAGGATGCCAGGCGGCCACGGAGCAGGAACCCCTCCGCCTGG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 ACTGTGGAGGACGTGGTGTGGTTTGTGAAGGACGCCGACCCACAGGCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141850 ACTGTGGAGGACGTGGTGTGGTTTGTGAAGGACGCCGACCCACAGGCTCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 GGGGCCTCACGTGGAGCTCTTCAGAAAGCAC         GAGATTGATG
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 141900 GGGGCCTCACGTGGAGCTCTTCAGAAAGCACGTA...CAGGAGATTGATG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 GCAACGCTCTGCTGTTGCTGAAGAGTGACATGGTCATGAAGTACCTGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144481 GCAACGCTCTGCTGTTGCTGAAGAGTGACATGGTCATGAAGTACCTGGGC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 CTGAAGCTGGGACCCGCACTGAAACTCTGCTACCACATTGACAAACTGAA
        |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144531 CTGAAGCTGGGACCTGCACTGAAACTCTGCTACCACATTGACAAACTGAA

   1100     .    :
   1056 GCAAGCCAAGTTC
        |||||||||||||
 144581 GCAAGCCAAGTTC