seq1 = pF1KB0912.tfa, 951 bp
seq2 = pF1KB0912/gi568815586r_56106450.tfa (gi568815586r:56106450_56314047), 207598 bp

>pF1KB0912 951
>gi568815586r:56106450_56314047 (Chr12)

(complement)

1-90  (100001-100090)   100% ->
91-362  (103480-103751)   100% ->
363-498  (105750-105885)   100% ->
499-602  (106299-106402)   100% ->
603-951  (107250-107598)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGGTATGATGTAACCCGTTTCCAGGGGGATGTTGACGAAGATCTTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGGTATGATGTAACCCGTTTCCAGGGGGATGTTGACGAAGATCTTAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTGCCCTATTTGCAGTGGAGTCTTGGAGGAGCCAGTACAG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 100051 CTGCCCTATTTGCAGTGGAGTCTTGGAGGAGCCAGTACAGGTG...TAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CACCTCATTGTGAACATGCTTTCTGCAACGCCTGCATCACCCAGTGGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103481 CACCTCATTGTGAACATGCTTTCTGCAACGCCTGCATCACCCAGTGGTTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TCTCAGCAACAGACATGTCCAGTGGACCGTAGTGTTGTGACGGTCGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103531 TCTCAGCAACAGACATGTCCAGTGGACCGTAGTGTTGTGACGGTCGCCCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TCTGCGCCCAGTACCTCGGATCATGCGGAACATGTTGTCAAAGCTGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103581 TCTGCGCCCAGTACCTCGGATCATGCGGAACATGTTGTCAAAGCTGCAGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TTGCCTGTGACAACGCTGTGTTCGGCTGTAGTGCCGTTGTCCGGCTTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103631 TTGCCTGTGACAACGCTGTGTTCGGCTGTAGTGCCGTTGTCCGGCTTGAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 AACCTCATGTCTCACCTCAGCGACTGTGAGCACAACCCGAAGCGGCCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103681 AACCTCATGTCTCACCTCAGCGACTGTGAGCACAACCCGAAGCGGCCTGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GACCTGTGAACAGGGCTGTGG         CCTGGAGATGCCCAAAGATG
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 103731 GACCTGTGAACAGGGCTGTGGGTG...CAGCCTGGAGATGCCCAAAGATG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 AGCTGCCCAACCATAACTGCATTAAGCACCTGCGCTCAGTGGTACAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105770 AGCTGCCCAACCATAACTGCATTAAGCACCTGCGCTCAGTGGTACAGCAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CAGCAGACACGCATCGCAGAGCTGGAGAAGACGTCAGCTGAACACAAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105820 CAGCAGACACGCATCGCAGAGCTGGAGAAGACGTCAGCTGAACACAAACA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CCAGCTGGCGGAGCAG         AAGCGAGACATCCAGCTGCTAAAGG
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 105870 CCAGCTGGCGGAGCAGGTA...CAGAAGCGAGACATCCAGCTGCTAAAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 CATACATGCGTGCAATCCGCAGTGTCAACCCCAACCTTCAGAACCTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106324 CATACATGCGTGCAATCCGCAGTGTCAACCCCAACCTTCAGAACCTGGAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GAGACAATTGAATACAACGAGATCCTAGA         GTGGGTGAACTC
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 106374 GAGACAATTGAATACAACGAGATCCTAGAGTG...CAGGTGGGTGAACTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CCTTCAGCCAGCAAGAGTGACCCGCTGGGGAGGGATGATCTCGACTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107262 CCTTCAGCCAGCAAGAGTGACCCGCTGGGGAGGGATGATCTCGACTCCTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 ATGCTGTGCTCCAGGCTGTAATCAAGCGCTCCCTGGTGGAGAGTGGCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107312 ATGCTGTGCTCCAGGCTGTAATCAAGCGCTCCCTGGTGGAGAGTGGCTGT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 CCTGCTTCTATTGTCAACGAGCTGATTGAAAATGCCCACGAGCGTAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107362 CCTGCTTCTATTGTCAACGAGCTGATTGAAAATGCCCACGAGCGTAGCTG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 GCCCCAGGGTCTGGCCACACTAGAGACTAGACAGATGAACCGACGCTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107412 GCCCCAGGGTCTGGCCACACTAGAGACTAGACAGATGAACCGACGCTACT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 ATGAGAACTACGTGGCCAAGCGCATCCCTGGCAAGCAGGCTGTTGTCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107462 ATGAGAACTACGTGGCCAAGCGCATCCCTGGCAAGCAGGCTGTTGTCGTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 ATGGCCTGTGAGAACCAGCACATGGGGGATGACATGGTGCAAGAGCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107512 ATGGCCTGTGAGAACCAGCACATGGGGGATGACATGGTGCAAGAGCCAGG

    950     .    :    .    :    .    :    .
    915 CCTTGTCATGATATTTGCGCATGGCGTGGAAGAGATA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107562 CCTTGTCATGATATTTGCGCATGGCGTGGAAGAGATA