seq1 = pF1KB0911.tfa, 444 bp
seq2 = pF1KB0911/gi568815579r_39843238.tfa (gi568815579r:39843238_40043681), 200444 bp

>pF1KB0911 444
>gi568815579r:39843238_40043681 (Chr19)

(complement)

1-444  (100001-100444)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTGGAATCCCAATGCCGGGCAGCCAGGGCCAAATCCATATCCCCCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTGGAATCCCAATGCCGGGCAGCCAGGGCCAAATCCATATCCCCCCAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TATTGGGTGCCCTGGAGGTTCCAATCCTGCCCACCCACCACCTATTAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TATTGGGTGCCCTGGAGGTTCCAATCCTGCCCACCCACCACCTATTAATC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CACCCTTTCCCCCAGGCCCCTGTCCTCCTCCCCCAGGAGCTCCCCATGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CACCCTTTCCCCCAGGCCCCTGTCCTCCTCCCCCAGGAGCTCCCCATGGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AATCCAGCTTTCCCCCCAGGTGGGCCCCCTCATCCTGTGCCACAGCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AATCCAGCTTTCCCCCCAGGTGGGCCCCCTCATCCTGTGCCACAGCCAGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GTATCCAGGATGCCAACCGTTGGGTCCCTACCCTCCTCCATACCCACCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GTATCCAGGATGCCAACCGTTGGGTCCCTACCCTCCTCCATACCCACCGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CTGCCCCTGGAATCCCTCCTGTGAATCCCTTGGCTCCTGGCATGGTTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CTGCCCCTGGAATCCCTCCTGTGAATCCCTTGGCTCCTGGCATGGTTGGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CCAGCAGTGATAGTAGACAAGAAGATGCAGAAGAAAATGAAGAAAGCTCA
        |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CCAGCAGTGATAGTGGACAAGAAGATGCAGAAGAAAATGAAGAAAGCTCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TAAAAAGATGCACAAGCACCAAAAGCACCACAAGTACCACAAGCATGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
 100351 TAAAAAGATGCACAAGCACCAAAAGCACCACAAGTACCACAAGCATGACA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AGCATTCCTCCTCTTCCTCCTCCTCTTCCAGCAGTGATTCTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AGCATTCCTCCTCTTCCTCCTCCTCTTCCAGCAGTGATTCTGAC