seq1 = pF1KB0499.tfa, 2262 bp
seq2 = pF1KB0499/gi568815590r_89837026.tfa (gi568815590r:89837026_90082857), 245832 bp

>pF1KB0499 2262
>gi568815590r:89837026_90082857 (Chr8)

(complement)

1-37  (98297-98333)   100% ->
38-171  (100003-100136)   99% ->
172-320  (101335-101483)   100% ->
321-480  (101965-102124)   100% ->
481-584  (104535-104638)   99% ->
585-702  (111568-111685)   100% ->
703-896  (112301-112494)   100% ->
897-994  (118351-118448)   100% ->
995-1124  (124004-124133)   100% ->
1125-1397  (127303-127575)   99% ->
1398-1845  (129167-129614)   100% ->
1846-1914  (134966-135034)   100% ->
1915-2070  (136563-136718)   99% ->
2071-2184  (139492-139605)   100% ->
2185-2234  (145783-145832)   100% ->
2235-2262  (147246-147273)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTGGAAACTGCTGCCCGCCGCGGGCCCGGCAGGAG         GAGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
  98297 ATGTGGAAACTGCTGCCCGCCGCGGGCCCGGCAGGAGGTA...CAGGAGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 ACCATACAGACTTTTGACTGGCGTTGAGTACGTTGTTGGAAGGAAAAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100007 ACCATACAGACTTTTGACTGGCGTTGAGTACGTTGTTGGAAGGAAAAACT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GTGCCATTCTAATTGAAAATGATCAGTCGATCAGCCGAAATCATGCTGTG
        |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100057 GTGCCATTCTGATTGAAAATGATCAGTCGATCAGCCGAAATCATGCTGTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TTAACTGCTAACTTTTCTGTAACCAACCTG         AGTCAAACAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 100107 TTAACTGCTAACTTTTCTGTAACCAACCTGGTA...CAGAGTCAAACAGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TGAAATCCCTGTATTGACATTAAAAGATAATTCTAAGTATGGTACCTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101346 TGAAATCCCTGTATTGACATTAAAAGATAATTCTAAGTATGGTACCTTTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TTAATGAGGAAAAAATGCAGAATGGCTTTTCCCGAACTTTGAAGTCGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101396 TTAATGAGGAAAAAATGCAGAATGGCTTTTCCCGAACTTTGAAGTCGGGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GATGGTATTACTTTTGGAGTGTTTGGAAGTAAATTCAG         AAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 101446 GATGGTATTACTTTTGGAGTGTTTGGAAGTAAATTCAGGTA...CAGAAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 AGAGTATGAGCCTTTGGTTGCATGCTCTTCTTGTTTAGATGTCTCTGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101968 AGAGTATGAGCCTTTGGTTGCATGCTCTTCTTGTTTAGATGTCTCTGGGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AAACTGCTTTAAATCAAGCTATATTGCAACTTGGAGGATTTACTGTAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102018 AAACTGCTTTAAATCAAGCTATATTGCAACTTGGAGGATTTACTGTAAAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 AATTGGACAGAAGAATGCACTCACCTTGTCATGGTATCAGTGAAAGTTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102068 AATTGGACAGAAGAATGCACTCACCTTGTCATGGTATCAGTGAAAGTTAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CATTAAA         ACAATATGTGCACTCATTTGTGGACGTCCAATTG
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102118 CATTAAAGTA...TAGACAATATGTGCACTCATTTGTGGACGTCCAATTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TAAAGCCAGAATATTTTACTGAATTCCTGAAAGCAGTTCAGTCCAAGAAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
 104569 TAAAGCCAGAATATTTTACTGAATTCCTGAAAGCAGTTGAGTCCAAGAAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 CAGCCTCCACAAATTGAAAG         TTTTTACCCACCTCTTGATGA
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 104619 CAGCCTCCACAAATTGAAAGGTA...CAGTTTTTACCCACCTCTTGATGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 ACCATCTATTGGAAGTAAAAATGTTGATCTGTCAGGACGGCAGGAAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111589 ACCATCTATTGGAAGTAAAAATGTTGATCTGTCAGGACGGCAGGAAAGAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 AACAAATCTTCAAAGGGAAAACATTTATATTTTTGAATGCCAAACAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 111639 AACAAATCTTCAAAGGGAAAACATTTATATTTTTGAATGCCAAACAGGTA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    703       CATAAGAAATTGAGTTCCGCAGTTGTCTTTGGAGGTGGGGAAGC
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111689 ...TAGCATAAGAAATTGAGTTCCGCAGTTGTCTTTGGAGGTGGGGAAGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 TAGGTTGATAACAGAAGAGAATGAAGAAGAACATAATTTCTTTTTGGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112345 TAGGTTGATAACAGAAGAGAATGAAGAAGAACATAATTTCTTTTTGGCTC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 CGGGAACGTGTGTTGTTGATACAGGAATAACAAACTCACAGACCTTAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112395 CGGGAACGTGTGTTGTTGATACAGGAATAACAAACTCACAGACCTTAATT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 CCTGACTGTCAGAAGAAATGGATTCAGTCAATAATGGATATGCTCCAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112445 CCTGACTGTCAGAAGAAATGGATTCAGTCAATAATGGATATGCTCCAAAG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897          GCAAGGTCTTAGACCTATTCCTGAAGCAGAAATTGGATTGG
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112495 GTA...TAGGCAAGGTCTTAGACCTATTCCTGAAGCAGAAATTGGATTGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 CGGTGATTTTCATGACTACAAAGAATTACTGTGATCCTCAGGGCCATCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118392 CGGTGATTTTCATGACTACAAAGAATTACTGTGATCCTCAGGGCCATCCC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 AGTACAG         GATTAAAGACAACAACTCCAGGACCAAGCCTTTC
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118442 AGTACAGGTA...CAGGATTAAAGACAACAACTCCAGGACCAAGCCTTTC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 ACAAGGCGTGTCAGTTGATGAAAAACTAATGCCAAGCGCCCCAGTGAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124038 ACAAGGCGTGTCAGTTGATGAAAAACTAATGCCAAGCGCCCCAGTGAACA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 CTACAACATACGTAGCTGACACAGAATCAGAGCAAGCAGATACATG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 124088 CTACAACATACGTAGCTGACACAGAATCAGAGCAAGCAGATACATGGTA.

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1125      GGATTTGAGTGAAAGGCCAAAAGAAATCAAAGTCTCCAAAATGGA
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124138 ..CAGGGATTTGAGTGAAAGGCCAAAAGAAATCAAAGTCTCCAAAATGGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 ACAAAAATTCAGAATGCTTTCACAAGACGCACCCACTGTAAAGGAGTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
 127348 ACAAAAATTCAGAATGCTTTCACAAGATGCACCCACTGTAAAGGAGTCCT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 GCAAAACAAGCTCTAATAATAATAGTATGGTATCAAATACTTTGGCTAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127398 GCAAAACAAGCTCTAATAATAATAGTATGGTATCAAATACTTTGGCTAAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 ATGAGAATCCCAAACTATCAGCTTTCACCAACTAAATTGCCAAGTATAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127448 ATGAGAATCCCAAACTATCAGCTTTCACCAACTAAATTGCCAAGTATAAA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 TAAAAGTAAAGATAGGGCTTCTCAGCAGCAGCAGACCAACTCCATCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127498 TAAAAGTAAAGATAGGGCTTCTCAGCAGCAGCAGACCAACTCCATCAGAA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 ACTACTTTCAGCCGTCTACCAAAAAAAG         GGAAAGGGATGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 127548 ACTACTTTCAGCCGTCTACCAAAAAAAGGTC...AAGGGAAAGGGATGAA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1411 GAAAATCAAGAAATGTCTTCATGCAAATCAGCAAGAATAGAAACGTCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129180 GAAAATCAAGAAATGTCTTCATGCAAATCAGCAAGAATAGAAACGTCTTG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1461 TTCTCTTTTAGAACAAACACAACCTGCTACACCCTCATTGTGGAAAAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129230 TTCTCTTTTAGAACAAACACAACCTGCTACACCCTCATTGTGGAAAAATA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1511 AGGAGCAGCATCTATCTGAGAATGAGCCTGTGGACACAAACTCAGACAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129280 AGGAGCAGCATCTATCTGAGAATGAGCCTGTGGACACAAACTCAGACAAT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1561 AACTTATTTACAGATACAGATTTAAAATCTATTGTGAAAAATTCTGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129330 AACTTATTTACAGATACAGATTTAAAATCTATTGTGAAAAATTCTGCCAG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1611 TAAATCTCATGCTGCAGAAAAGCTAAGATCAAATAAAAAAAGGGAAATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129380 TAAATCTCATGCTGCAGAAAAGCTAAGATCAAATAAAAAAAGGGAAATGG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1661 ATGATGTGGCCATAGAAGATGAAGTATTGGAACAGTTATTCAAGGACACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129430 ATGATGTGGCCATAGAAGATGAAGTATTGGAACAGTTATTCAAGGACACA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1711 AAACCAGAGTTAGAAATTGATGTGAAAGTTCAAAAACAGGAGGAAGATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129480 AAACCAGAGTTAGAAATTGATGTGAAAGTTCAAAAACAGGAGGAAGATGT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1761 CAATGTTAGAAAAAGGCCAAGGATGGATATAGAAACAAATGACACTTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129530 CAATGTTAGAAAAAGGCCAAGGATGGATATAGAAACAAATGACACTTTCA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1811 GTGATGAAGCAGTACCAGAAAGTAGCAAAATATCT         CAAGAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 129580 GTGATGAAGCAGTACCAGAAAGTAGCAAAATATCTGTA...TAGCAAGAA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1852 AATGAAATTGGGAAGAAACGTGAACTCAAGGAAGACTCACTATGGTCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134972 AATGAAATTGGGAAGAAACGTGAACTCAAGGAAGACTCACTATGGTCAGC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1902 TAAAGAAATATCT         AACAATGACAAACTTCAGGATGATAGTG
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 135022 TAAAGAAATATCTGTG...AAGAACAATGACAAACTTCAGGATGATAGTG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1943 AGATGCTTCCAAAAAAGCTGTTATTGACTGAATTTAGATCACTGGTGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136591 AGATGCTTCCAAAAAAGCTGTTATTGACTGAATTTAGATCACTGGTGATT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1993 AAAAACTCTACTTCCAGAAATCCGTCTGGCATAAATGATGATTATGGTCA
        ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
 136641 AAAAACTCTACTTCCAGAAATCCATCTGGCATAAATGATGATTATGGTCA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2043 ACTAAAAAATTTCAAGAAATTCAAAAAG         GTCACATATCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 136691 ACTAAAAAATTTCAAGAAATTCAAAAAGGTA...TAGGTCACATATCCTG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2084 GAGCAGGAAAACTTCCACACATCATTGGAGGATCAGATCTAATAGCTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139505 GAGCAGGAAAACTTCCACACATCATTGGAGGATCAGATCTAATAGCTCAT

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2134 CATGCTCGAAAGAATACAGAACTAGAAGAGTGGCTAAGGCAGGAAATGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139555 CATGCTCGAAAGAATACAGAACTAGAAGAGTGGCTAAGGCAGGAAATGGA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2184 G         GTACAAAATCAACATGCAAAAGAAGAGTCTCTTGCTGATG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139605 GGTT...CAGGTACAAAATCAACATGCAAAAGAAGAGTCTCTTGCTGATG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   2225 ATCTTTTTAG         ATACAATCCTTATTTAAAAAGGAGAAGA
        ||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 145823 ATCTTTTTAGGTA...CAGATACAATCCTTATTTAAAAAGGAGAAGA