Result of SIM4 for
pF1KB0496
seq1 = pF1KB0496.tfa, 3126 bp
seq2 = pF1KB0496/gi568815593f_55208014.tfa (gi568815593f:55208014_55524769), 316756 bp
>pF1KB0496 3126
>gi568815593f:55208014_55524769 (Chr5)
1-134 (100001-100134) 100% ->
135-272 (114314-114451) 100% ->
273-339 (116119-116185) 100% ->
340-402 (119703-119765) 100% ->
403-515 (120686-120798) 100% ->
516-690 (131997-132171) 100% ->
691-781 (133668-133758) 100% ->
782-906 (135318-135442) 100% ->
907-1005 (136509-136607) 100% ->
1006-1108 (137081-137183) 100% ->
1109-1240 (139000-139131) 100% ->
1241-1320 (141560-141639) 100% ->
1321-1431 (142906-143016) 100% ->
1432-1533 (145155-145256) 100% ->
1534-1659 (150560-150685) 100% ->
1660-1810 (158712-158862) 100% ->
1811-1983 (170301-170473) 100% ->
1984-2052 (171114-171182) 100% ->
2053-2181 (179961-180089) 100% ->
2182-2292 (189403-189513) 100% ->
2293-2481 (192220-192408) 100% ->
2482-2645 (197412-197575) 100% ->
2646-2751 (202511-202616) 100% ->
2752-2808 (206169-206225) 100% ->
2809-2971 (207957-208119) 100% ->
2972-3076 (214865-214969) 100% ->
3077-3126 (216707-216756) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGGCGGACGCATTCGGAGATGAGCTGTTCAGCGTGTTCGAGGGCGACTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100001 ATGGCGGACGCATTCGGAGATGAGCTGTTCAGCGTGTTCGAGGGCGACTC
50 . : . : . : . : . :
51 GACCACTGCGGCGGGAACCAAAAAAGACAAGGAAAAGGACAAGGGGAAAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100051 GACCACTGCGGCGGGAACCAAAAAAGACAAGGAAAAGGACAAGGGGAAAT
100 . : . : . : . : . :
101 GGAAGGGGCCTCCAGGGTCTGCAGACAAGGCAGG GAAACGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
100101 GGAAGGGGCCTCCAGGGTCTGCAGACAAGGCAGGGTA...CAGGAAACGT
150 . : . : . : . : . :
142 TTTGATGGTAAATTACAATCAGAATCAACTAATAATGGAAAAAATAAGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
114321 TTTGATGGTAAATTACAATCAGAATCAACTAATAATGGAAAAAATAAGAG
200 . : . : . : . : . :
192 AGATGTAGATTTCGAAGGTACAGATGAACCCATTTTTGGAAAGAAGCCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
114371 AGATGTAGATTTCGAAGGTACAGATGAACCCATTTTTGGAAAGAAGCCCA
250 . : . : . : . : . :
242 GGATAGAAGAGTCAATAACTGAAGACTTAAG TTTGGCAGAC
|||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
114421 GGATAGAAGAGTCAATAACTGAAGACTTAAGGTA...AAGTTTGGCAGAC
300 . : . : . : . : . :
283 CTGATGCCCAGAGTCAAGGTACAATCAGTTGAAACTGTTGAAGGGTGTAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
116129 CTGATGCCCAGAGTCAAGGTACAATCAGTTGAAACTGTTGAAGGGTGTAC
350 . : . : . : . : . :
333 ACATGAG GTTGCACTTCCTGCAGAAGAGGATTATTTACCAC
|||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
116179 ACATGAGGTA...CAGGTTGCACTTCCTGCAGAAGAGGATTATTTACCAC
400 . : . : . : . : . :
374 TTAAACCACGAGTTGGAAAAGCTGCTAAG GAATACCCGTTC
|||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
119737 TTAAACCACGAGTTGGAAAAGCTGCTAAGGTC...TAGGAATACCCGTTC
450 . : . : . : . : . :
415 ATTCTTGATGCTTTTCAAAGAGAGGCCATTCAGTGTGTTGACAATAATCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
120698 ATTCTTGATGCTTTTCAAAGAGAGGCCATTCAGTGTGTTGACAATAATCA
500 . : . : . : . : . :
465 GTCTGTTCTAGTATCTGCACATACCTCAGCGGGAAAAACAGTATGCGCCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
120748 GTCTGTTCTAGTATCTGCACATACCTCAGCGGGAAAAACAGTATGCGCCG
550 . : . : . : . : . :
515 A GTATGCCATTGCATTGGCCTTAAGGGAAAAGCAGCGTGTA
|>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
120798 AGTG...TAGGTATGCCATTGCATTGGCCTTAAGGGAAAAGCAGCGTGTA
600 . : . : . : . : . :
556 ATATTTACCAGCCCAATTAAGGCTCTGAGTAACCAAAAATACCGTGAAAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
132037 ATATTTACCAGCCCAATTAAGGCTCTGAGTAACCAAAAATACCGTGAAAT
650 . : . : . : . : . :
606 GTATGAAGAATTTCAAGATGTTGGTTTGATGACTGGTGATGTTACTATTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
132087 GTATGAAGAATTTCAAGATGTTGGTTTGATGACTGGTGATGTTACTATTA
700 . : . : . : . : . :
656 ATCCTACGGCATCTTGTCTTGTTATGACCACAGAG ATTTTG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
132137 ATCCTACGGCATCTTGTCTTGTTATGACCACAGAGGTA...TAGATTTTG
750 . : . : . : . : . :
697 AGAAGTATGCTTTACAGAGGTTCCGAAGTTATGAGAGAAGTTGCTTGGGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
133674 AGAAGTATGCTTTACAGAGGTTCCGAAGTTATGAGAGAAGTTGCTTGGGT
800 . : . : . : . : . :
747 TATATTTGATGAAATTCATTATATGAGAGATTCAG AACGTG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
133724 TATATTTGATGAAATTCATTATATGAGAGATTCAGGTA...CAGAACGTG
850 . : . : . : . : . :
788 GTGTAGTATGGGAAGAAACTATTATTTTGCTTCCTGATAACGTCCACTAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
135324 GTGTAGTATGGGAAGAAACTATTATTTTGCTTCCTGATAACGTCCACTAT
900 . : . : . : . : . :
838 GTCTTTCTTTCGGCTACTATTCCAAATGCCCGACAGTTTGCTGAATGGAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
135374 GTCTTTCTTTCGGCTACTATTCCAAATGCCCGACAGTTTGCTGAATGGAT
950 . : . : . : . : . :
888 TTGCCATTTACATAAACAG CCTTGTCATGTTATTTACACAG
|||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
135424 TTGCCATTTACATAAACAGGTA...CAGCCTTGTCATGTTATTTACACAG
1000 . : . : . : . : . :
929 ATTATCGGCCCACTCCATTGCAACACTACATTTTTCCAGCAGGGGGAGAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
136531 ATTATCGGCCCACTCCATTGCAACACTACATTTTTCCAGCAGGGGGAGAT
1050 . : . : . : . : . :
979 GGCCTGCATCTTGTGGTTGATGAAAAT GGTGACTTCAGAGA
|||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
136581 GGCCTGCATCTTGTGGTTGATGAAAATGTA...CAGGGTGACTTCAGAGA
1100 . : . : . : . : . :
1020 AGATAATTTTAATACTGCAATGCAAGTGCTTCGAGATGCAGGTGATTTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
137095 AGATAATTTTAATACTGCAATGCAAGTGCTTCGAGATGCAGGTGATTTGG
1150 . : . : . : . : . :
1070 CCAAAGGAGACCAGAAAGGGCGGAAAGGAGGAACAAAAG GA
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
137145 CCAAAGGAGACCAGAAAGGGCGGAAAGGAGGAACAAAAGGTA...CAGGA
1200 . : . : . : . : . :
1111 CCATCAAATGTTTTCAAAATTGTGAAGATGATTATGGAAAGAAATTTCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
139002 CCATCAAATGTTTTCAAAATTGTGAAGATGATTATGGAAAGAAATTTCCA
1250 . : . : . : . : . :
1161 ACCTGTGATTATTTTCAGTTTTAGTAAGAAAGATTGTGAAGCCTATGCAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
139052 ACCTGTGATTATTTTCAGTTTTAGTAAGAAAGATTGTGAAGCCTATGCAC
1300 . : . : . : . : . :
1211 TTCAAATGACCAAATTAGATTTCAACACAG ATGAAGAAAAG
||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
139102 TTCAAATGACCAAATTAGATTTCAACACAGGTA...TAGATGAAGAAAAG
1350 . : . : . : . : . :
1252 AAGATGGTTGAAGAAGTATTCAGTAATGCAATTGATTGCTTATCCGATGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
141571 AAGATGGTTGAAGAAGTATTCAGTAATGCAATTGATTGCTTATCCGATGA
1400 . : . : . : . : . :
1302 AGATAAAAAACTCCCTCAG GTAGAACATGTACTTCCTCTTT
|||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
141621 AGATAAAAAACTCCCTCAGGTG...CAGGTAGAACATGTACTTCCTCTTT
1450 . : . : . : . : . :
1343 TGAAGAGGGGAATTGGTATTCACCATGGTGGTTTACTTCCTATTTTGAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
142928 TGAAGAGGGGAATTGGTATTCACCATGGTGGTTTACTTCCTATTTTGAAA
1500 . : . : . : . : . :
1393 GAAACTATAGAAATTCTCTTTTCTGAAGGATTGATAAAG GC
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
142978 GAAACTATAGAAATTCTCTTTTCTGAAGGATTGATAAAGGTA...TAGGC
1550 . : . : . : . : . :
1434 CTTATTTGCCACGGAGACCTTTGCTATGGGAATTAACATGCCAGCTAGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
145157 CTTATTTGCCACGGAGACCTTTGCTATGGGAATTAACATGCCAGCTAGAA
1600 . : . : . : . : . :
1484 CTGTTTTATTTACAAATGCCCGCAAATTTGATGGGAAGGATTTCCGATGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
145207 CTGTTTTATTTACAAATGCCCGCAAATTTGATGGGAAGGATTTCCGATGG
1650 . : . : . : . : . :
1534 ATTTCTTCTGGTGAATACATTCAGATGTCTGGTCGTGCTGG
>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
145257 GTA...CAGATTTCTTCTGGTGAATACATTCAGATGTCTGGTCGTGCTGG
1700 . : . : . : . : . :
1575 AAGGAGAGGAATGGATGATAGAGGAATTGTAATTCTTATGGTAGATGAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
150601 AAGGAGAGGAATGGATGATAGAGGAATTGTAATTCTTATGGTAGATGAAA
1750 . : . : . : . : . :
1625 AGATGAGCCCAACAATTGGAAAACAATTACTTAAG GGCTCC
|||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
150651 AGATGAGCCCAACAATTGGAAAACAATTACTTAAGGTA...TAGGGCTCC
1800 . : . : . : . : . :
1666 GCTGATCCTCTAAATAGTGCTTTCCATTTGACCTACAACATGGTTTTGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
158718 GCTGATCCTCTAAATAGTGCTTTCCATTTGACCTACAACATGGTTTTGAA
1850 . : . : . : . : . :
1716 CTTACTACGTGTAGAAGAAATTAATCCTGAGTACATGTTGGAAAAATCCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
158768 CTTACTACGTGTAGAAGAAATTAATCCTGAGTACATGTTGGAAAAATCCT
1900 . : . : . : . : . :
1766 TCTACCAGTTTCAGCATTATAGAGCAATTCCAGGAGTAGTAGAGA
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
158818 TCTACCAGTTTCAGCATTATAGAGCAATTCCAGGAGTAGTAGAGAGTA..
1950 . : . : . : . : . :
1811 AGGTAAAGAATTCAGAAGAACAGTATAATAAAATAGTAATTCCCAA
.>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
158868 .CAGAGGTAAAGAATTCAGAAGAACAGTATAATAAAATAGTAATTCCCAA
2000 . : . : . : . : . :
1857 TGAAGAAAGTGTGGTTATCTATTATAAGATTAGACAGCAGCTTGCCAAAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
170347 TGAAGAAAGTGTGGTTATCTATTATAAGATTAGACAGCAGCTTGCCAAAT
2050 . : . : . : . : . :
1907 TGGGTAAAGAAATTGAAGAATATATTCACAAACCAAAATACTGCTTACCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
170397 TGGGTAAAGAAATTGAAGAATATATTCACAAACCAAAATACTGCTTACCT
2100 . : . : . : . : . :
1957 TTTCTACAACCAGGTCGTTTGGTAAAG GTAAAGAATGAAGG
|||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
170447 TTTCTACAACCAGGTCGTTTGGTAAAGGTA...TAGGTAAAGAATGAAGG
2150 . : . : . : . : . :
1998 AGATGACTTTGGCTGGGGAGTAGTGGTGAATTTCTCAAAAAAGTCAAATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
171128 AGATGACTTTGGCTGGGGAGTAGTGGTGAATTTCTCAAAAAAGTCAAATG
2200 . : . : . : . : . :
2048 TTAAG CCTAACTCTGGTGAACTGGATCCTTTGTATGTAGTA
|||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
171178 TTAAGGTA...TAGCCTAACTCTGGTGAACTGGATCCTTTGTATGTAGTA
2250 . : . : . : . : . :
2089 GAAGTACTTCTGCGCTGTAGCAAAGAGAGCTTGAAAAATTCAGCTACAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
179997 GAAGTACTTCTGCGCTGTAGCAAAGAGAGCTTGAAAAATTCAGCTACAGA
2300 . : . : . : . : . :
2139 AGCTGCAAAACCAGCTAAACCTGATGAGAAAGGAGAGATGCAG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
180047 AGCTGCAAAACCAGCTAAACCTGATGAGAAAGGAGAGATGCAGGTT...T
2350 . : . : . : . : . :
2182 GTTGTCCCAGTTTTGGTGCATCTCCTGTCTGCTATCAGCAGTGTTAGG
>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
189401 AGGTTGTCCCAGTTTTGGTGCATCTCCTGTCTGCTATCAGCAGTGTTAGG
2400 . : . : . : . : . :
2230 CTTTACATTCCTAAAGACCTTCGGCCGGTGGACAATAGACAGAGTGTTTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
189451 CTTTACATTCCTAAAGACCTTCGGCCGGTGGACAATAGACAGAGTGTTTT
2450 . : . : . : . : . :
2280 AAAATCAATACAG GAAGTTCAGAAACGTTTTCCTGACGGCA
|||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
189501 AAAATCAATACAGGTA...CAGGAAGTTCAGAAACGTTTTCCTGACGGCA
2500 . : . : . : . : . :
2321 TCCCCTTATTAGACCCTATTGATGATATGGGCATTCAAGATCAAGGGCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
192248 TCCCCTTATTAGACCCTATTGATGATATGGGCATTCAAGATCAAGGGCTG
2550 . : . : . : . : . :
2371 AAAAAAGTCATTCAGAAAGTAGAAGCTTTTGAGCATCGAATGTATTCTCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
192298 AAAAAAGTCATTCAGAAAGTAGAAGCTTTTGAGCATCGAATGTATTCTCA
2600 . : . : . : . : . :
2421 TCCACTTCACAATGATCCAAATTTGGAAACTGTGTATACGCTTTGTGAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
192348 TCCACTTCACAATGATCCAAATTTGGAAACTGTGTATACGCTTTGTGAAA
2650 . : . : . : . : . :
2471 AAAAAGCACAG ATTGCAATAGATATTAAATCTGCAAAGCGA
|||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
192398 AAAAAGCACAGGTA...TAGATTGCAATAGATATTAAATCTGCAAAGCGA
2700 . : . : . : . : . :
2512 GAACTGAAGAAAGCAAGAACAGTCCTACAAATGGATGAACTCAAATGTCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
197442 GAACTGAAGAAAGCAAGAACAGTCCTACAAATGGATGAACTCAAATGTCG
2750 . : . : . : . : . :
2562 CAAACGTGTTTTAAGAAGGTTGGGATTTGCTACTTCTTCTGATGTAATAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
197492 CAAACGTGTTTTAAGAAGGTTGGGATTTGCTACTTCTTCTGATGTAATAG
2800 . : . : . : . : . :
2612 AGATGAAAGGACGAGTGGCTTGTGAGATAAGCAG TGCTGAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
197542 AGATGAAAGGACGAGTGGCTTGTGAGATAAGCAGGTA...TAGTGCTGAT
2850 . : . : . : . : . :
2653 GAGCTCCTTCTAACTGAGATGATGTTTAATGGCCTTTTCAATGACCTTTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
202518 GAGCTCCTTCTAACTGAGATGATGTTTAATGGCCTTTTCAATGACCTTTC
2900 . : . : . : . : . :
2703 TGCAGAACAGGCAACAGCATTATTAAGCTGCTTTGTGTTTCAAGAGAAT
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
202568 TGCAGAACAGGCAACAGCATTATTAAGCTGCTTTGTGTTTCAAGAGAATG
2950 . : . : . : . : . :
2752 TCTAGTGAGATGCCCAAATTAACAGAACAATTAGCAGGACCA
>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
202618 TA...TAGTCTAGTGAGATGCCCAAATTAACAGAACAATTAGCAGGACCA
3000 . : . : . : . : . :
2794 CTTCGTCAAATGCAG GAATGTGCTAAAAGAATTGCAAAAGT
|||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
206211 CTTCGTCAAATGCAGGTA...AAGGAATGTGCTAAAAGAATTGCAAAAGT
3050 . : . : . : . : . :
2835 TTCAGCAGAAGCCAAATTGGAAATTGATGAGGAAACTTATCTAAGCTCAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
207983 TTCAGCAGAAGCCAAATTGGAAATTGATGAGGAAACTTATCTAAGCTCAT
3100 . : . : . : . : . :
2885 TTAAACCTCACTTAATGGATGTAGTATATACCTGGGCAACTGGAGCTACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
208033 TTAAACCTCACTTAATGGATGTAGTATATACCTGGGCAACTGGAGCTACA
3150 . : . : . : . : . :
2935 TTTGCCCATATCTGCAAAATGACAGATGTCTTTGAAG GCAG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
208083 TTTGCCCATATCTGCAAAATGACAGATGTCTTTGAAGGTA...CAGGCAG
3200 . : . : . : . : . :
2976 CATAATTCGTTGTATGAGGCGCCTGGAAGAATTGCTTCGACAAATGTGTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
214869 CATAATTCGTTGTATGAGGCGCCTGGAAGAATTGCTTCGACAAATGTGTC
3250 . : . : . : . : . :
3026 AAGCAGCAAAAGCCATTGGAAACACTGAGCTGGAAAATAAATTTGCAGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
214919 AAGCAGCAAAAGCCATTGGAAACACTGAGCTGGAAAATAAATTTGCAGAA
3300 . : . : . : . : . :
3076 G GAATCACCAAAATCAAGAGAGATATTGTGTTTGCTGCCAG
|>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
214969 GGTC...TAGGAATCACCAAAATCAAGAGAGATATTGTGTTTGCTGCCAG
3350 . :
3117 CCTCTACTTG
||||||||||
216747 CCTCTACTTG