Result of SIM4 for
pF1KB0494
seq1 = pF1KB0494.tfa, 3117 bp
seq2 = pF1KB0494/gi568815581r_44272367.tfa (gi568815581r:44272367_44489473), 217107 bp
>pF1KB0494 3117
>gi568815581r:44272367_44489473 (Chr17)
(complement)
1-188 (100001-100188) 100% ->
189-310 (103343-103464) 100% ->
311-408 (103553-103650) 100% ->
409-574 (103758-103923) 100% ->
575-624 (104139-104188) 100% ->
625-670 (104265-104310) 100% ->
671-799 (104398-104526) 100% ->
800-847 (104889-104936) 100% ->
848-891 (105120-105163) 100% ->
892-945 (105336-105389) 100% ->
946-998 (105528-105580) 100% ->
999-1210 (105770-105981) 100% ->
1211-1393 (108413-108595) 100% ->
1394-1439 (108829-108874) 100% ->
1440-1544 (108984-109088) 100% ->
1545-1600 (109173-109228) 100% ->
1601-1752 (109321-109472) 100% ->
1753-1878 (109660-109785) 100% ->
1879-1946 (110764-110831) 100% ->
1947-2094 (110965-111112) 100% ->
2095-2187 (111684-111776) 100% ->
2188-2267 (112386-112465) 100% ->
2268-2348 (113086-113166) 100% ->
2349-2448 (113290-113389) 100% ->
2449-2601 (113489-113641) 100% ->
2602-2727 (113758-113883) 100% ->
2728-2841 (114363-114476) 100% ->
2842-2943 (114714-114815) 100% ->
2944-3060 (115004-115120) 100% ->
3061-3117 (117051-117107) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGGCCAGAGCTTTGTGTCCACTGCAAGCCCTCTGGCTTCTGGAGTGGGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100001 ATGGCCAGAGCTTTGTGTCCACTGCAAGCCCTCTGGCTTCTGGAGTGGGT
50 . : . : . : . : . :
51 GCTGCTGCTCTTGGGACCTTGTGCTGCCCCTCCAGCCTGGGCCTTGAACC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100051 GCTGCTGCTCTTGGGACCTTGTGCTGCCCCTCCAGCCTGGGCCTTGAACC
100 . : . : . : . : . :
101 TGGACCCAGTGCAGCTCACCTTCTATGCAGGCCCCAATGGCAGCCAGTTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100101 TGGACCCAGTGCAGCTCACCTTCTATGCAGGCCCCAATGGCAGCCAGTTT
150 . : . : . : . : . :
151 GGATTTTCACTGGACTTCCACAAGGACAGCCATGGGAG AGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
100151 GGATTTTCACTGGACTTCCACAAGGACAGCCATGGGAGGTG...CAGAGT
200 . : . : . : . : . :
192 GGCCATCGTGGTGGGCGCCCCGCGGACCCTGGGCCCCAGCCAGGAGGAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103346 GGCCATCGTGGTGGGCGCCCCGCGGACCCTGGGCCCCAGCCAGGAGGAGA
250 . : . : . : . : . :
242 CGGGCGGCGTGTTCCTGTGCCCCTGGAGGGCCGAGGGCGGCCAGTGCCCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103396 CGGGCGGCGTGTTCCTGTGCCCCTGGAGGGCCGAGGGCGGCCAGTGCCCC
300 . : . : . : . : . :
292 TCGCTGCTCTTTGACCTCC GTGATGAGACCCGAAATGTAGG
|||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
103446 TCGCTGCTCTTTGACCTCCGTG...CAGGTGATGAGACCCGAAATGTAGG
350 . : . : . : . : . :
333 CTCCCAAACTTTACAAACCTTCAAGGCCCGCCAAGGACTGGGGGCGTCGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103575 CTCCCAAACTTTACAAACCTTCAAGGCCCGCCAAGGACTGGGGGCGTCGG
400 . : . : . : . : . :
383 TCGTCAGCTGGAGCGACGTCATTGTG GCCTGCGCCCCCTGG
||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
103625 TCGTCAGCTGGAGCGACGTCATTGTGGTG...CAGGCCTGCGCCCCCTGG
450 . : . : . : . : . :
424 CAGCACTGGAACGTCCTAGAAAAGACTGAGGAGGCTGAGAAGACGCCCGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103773 CAGCACTGGAACGTCCTAGAAAAGACTGAGGAGGCTGAGAAGACGCCCGT
500 . : . : . : . : . :
474 AGGTAGCTGCTTTTTGGCTCAGCCAGAGAGCGGCCGCCGCGCCGAGTACT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103823 AGGTAGCTGCTTTTTGGCTCAGCCAGAGAGCGGCCGCCGCGCCGAGTACT
550 . : . : . : . : . :
524 CCCCCTGTCGCGGGAACACCCTGAGCCGCATTTACGTGGAAAATGATTTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103873 CCCCCTGTCGCGGGAACACCCTGAGCCGCATTTACGTGGAAAATGATTTT
600 . : . : . : . : . :
574 A GCTGGGACAAGCGTTACTGTGAAGCGGGCTTCAGCTCCGT
|>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103923 AGTA...CAGGCTGGGACAAGCGTTACTGTGAAGCGGGCTTCAGCTCCGT
650 . : . : . : . : . :
615 GGTCACTCAG GCCGGAGAGCTGGTGCTTGGGGCTCCTGGCG
||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
104179 GGTCACTCAGGCG...CAGGCCGGAGAGCTGGTGCTTGGGGCTCCTGGCG
700 . : . : . : . : . :
656 GCTATTATTTCTTAG GTCTCCTGGCCCAGGCTCCAGTTGCG
|||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
104296 GCTATTATTTCTTAGGTA...TAGGTCTCCTGGCCCAGGCTCCAGTTGCG
750 . : . : . : . : . :
697 GATATTTTCTCGAGTTACCGCCCAGGCATCCTTTTGTGGCACGTGTCCTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104424 GATATTTTCTCGAGTTACCGCCCAGGCATCCTTTTGTGGCACGTGTCCTC
800 . : . : . : . : . :
747 CCAGAGCCTCTCCTTTGACTCCAGCAACCCAGAGTACTTCGACGGCTACT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104474 CCAGAGCCTCTCCTTTGACTCCAGCAACCCAGAGTACTTCGACGGCTACT
850 . : . : . : . : . :
797 GGG GGTACTCGGTGGCCGTGGGCGAGTTCGACGGGGATCTC
|||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104524 GGGGTA...CAGGGTACTCGGTGGCCGTGGGCGAGTTCGACGGGGATCTC
900 . : . : . : . : . :
838 AACACTACAG AATATGTCGTCGGTGCCCCCACTTGGAGCTG
||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
104927 AACACTACAGGCA...CAGAATATGTCGTCGGTGCCCCCACTTGGAGCTG
950 . : . : . : . : . :
879 GACCCTGGGAGCG GTGGAAATTTTGGATTCCTACTACCAGA
|||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
105151 GACCCTGGGAGCGGTA...CAGGTGGAAATTTTGGATTCCTACTACCAGA
1000 . : . : . : . : . :
920 GGCTGCATCGGCTGCGCGGAGAGCAG ATGGCGTCGTATTTT
||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
105364 GGCTGCATCGGCTGCGCGGAGAGCAGGTG...CAGATGGCGTCGTATTTT
1050 . : . : . : . : . :
961 GGGCATTCAGTGGCTGTCACTGACGTCAACGGGGATGG GAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
105543 GGGCATTCAGTGGCTGTCACTGACGTCAACGGGGATGGGTG...CAGGAG
1100 . : . : . : . : . :
1002 GCATGATCTGCTGGTGGGCGCTCCACTGTATATGGAGAGCCGGGCAGACC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105773 GCATGATCTGCTGGTGGGCGCTCCACTGTATATGGAGAGCCGGGCAGACC
1150 . : . : . : . : . :
1052 GAAAACTGGCCGAAGTGGGGCGTGTGTATTTGTTCCTGCAGCCGCGAGGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105823 GAAAACTGGCCGAAGTGGGGCGTGTGTATTTGTTCCTGCAGCCGCGAGGC
1200 . : . : . : . : . :
1102 CCCCACGCGCTGGGTGCCCCCAGCCTCCTGCTGACTGGCACACAGCTCTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105873 CCCCACGCGCTGGGTGCCCCCAGCCTCCTGCTGACTGGCACACAGCTCTA
1250 . : . : . : . : . :
1152 TGGGCGATTCGGCTCTGCCATCGCACCCCTGGGCGACCTCGACCGGGATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105923 TGGGCGATTCGGCTCTGCCATCGCACCCCTGGGCGACCTCGACCGGGATG
1300 . : . : . : . : . :
1202 GCTACAATG ACATTGCAGTGGCTGCCCCCTACGGGGGTCCC
|||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
105973 GCTACAATGGTG...CAGACATTGCAGTGGCTGCCCCCTACGGGGGTCCC
1350 . : . : . : . : . :
1243 AGTGGCCGGGGCCAAGTGCTGGTGTTCCTGGGTCAGAGTGAGGGGCTGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
108445 AGTGGCCGGGGCCAAGTGCTGGTGTTCCTGGGTCAGAGTGAGGGGCTGAG
1400 . : . : . : . : . :
1293 GTCACGTCCCTCCCAGGTCCTGGACAGCCCCTTCCCCACAGGCTCTGCCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
108495 GTCACGTCCCTCCCAGGTCCTGGACAGCCCCTTCCCCACAGGCTCTGCCT
1450 . : . : . : . : . :
1343 TTGGCTTCTCCCTTCGAGGTGCCGTAGACATCGATGACAACGGATACCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
108545 TTGGCTTCTCCCTTCGAGGTGCCGTAGACATCGATGACAACGGATACCCA
1500 . : . : . : . : . :
1393 G ACCTGATCGTGGGAGCTTACGGGGCCAACCAGGTGGCTGT
|>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
108595 GGTG...TAGACCTGATCGTGGGAGCTTACGGGGCCAACCAGGTGGCTGT
1550 . : . : . : . : . :
1434 GTACAG AGCTCAGCCAGTGGTGAAGGCCTCTGTCCAGCTAC
||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
108869 GTACAGGTG...CAGAGCTCAGCCAGTGGTGAAGGCCTCTGTCCAGCTAC
1600 . : . : . : . : . :
1475 TGGTGCAAGATTCACTGAATCCTGCTGTGAAGAGCTGTGTCCTACCTCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
109019 TGGTGCAAGATTCACTGAATCCTGCTGTGAAGAGCTGTGTCCTACCTCAG
1650 . : . : . : . : . :
1525 ACCAAGACACCCGTGAGCTG CTTCAACATCCAGATGTGTGT
||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
109069 ACCAAGACACCCGTGAGCTGGTG...CAGCTTCAACATCCAGATGTGTGT
1700 . : . : . : . : . :
1566 TGGAGCCACTGGGCACAACATTCCTCAGAAGCTAT CCCTAA
|||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
109194 TGGAGCCACTGGGCACAACATTCCTCAGAAGCTATGTG...CAGCCCTAA
1750 . : . : . : . : . :
1607 ATGCCGAGCTGCAGCTGGACCGGCAGAAGCCCCGCCAGGGCCGGCGGGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
109327 ATGCCGAGCTGCAGCTGGACCGGCAGAAGCCCCGCCAGGGCCGGCGGGTG
1800 . : . : . : . : . :
1657 CTGCTGCTGGGCTCTCAACAGGCAGGCACCACCCTGAACCTGGATCTGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
109377 CTGCTGCTGGGCTCTCAACAGGCAGGCACCACCCTGAACCTGGATCTGGG
1850 . : . : . : . : . :
1707 CGGAAAGCACAGCCCCATCTGCCACACCACCATGGCCTTCCTTCGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
109427 CGGAAAGCACAGCCCCATCTGCCACACCACCATGGCCTTCCTTCGAGTA.
1900 . : . : . : . : . :
1753 GATGAGGCAGACTTCCGGGACAAGCTGAGCCCCATTGTGCTCAGC
..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
109477 ..TAGGATGAGGCAGACTTCCGGGACAAGCTGAGCCCCATTGTGCTCAGC
1950 . : . : . : . : . :
1798 CTCAATGTGTCCCTACCGCCCACGGAGGCTGGAATGGCCCCTGCTGTCGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
109705 CTCAATGTGTCCCTACCGCCCACGGAGGCTGGAATGGCCCCTGCTGTCGT
2000 . : . : . : . : . :
1848 GCTGCATGGAGACACCCATGTGCAGGAGCAG ACACGAATCG
|||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
109755 GCTGCATGGAGACACCCATGTGCAGGAGCAGGTA...TAGACACGAATCG
2050 . : . : . : . : . :
1889 TCCTGGACTGTGGGGAAGATGACGTATGTGTGCCCCAGCTTCAGCTCACT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
110774 TCCTGGACTGTGGGGAAGATGACGTATGTGTGCCCCAGCTTCAGCTCACT
2100 . : . : . : . : . :
1939 GCCAGCGT GACGGGCTCCCCGCTCCTAGTTGGGGCAGATAA
||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
110824 GCCAGCGTGTG...CAGGACGGGCTCCCCGCTCCTAGTTGGGGCAGATAA
2150 . : . : . : . : . :
1980 TGTCCTGGAGCTGCAGATGGACGCAGCCAACGAGGGCGAGGGGGCCTATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
110998 TGTCCTGGAGCTGCAGATGGACGCAGCCAACGAGGGCGAGGGGGCCTATG
2200 . : . : . : . : . :
2030 AAGCAGAGCTGGCCGTGCACCTGCCCCAGGGCGCCCACTACATGCGGGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111048 AAGCAGAGCTGGCCGTGCACCTGCCCCAGGGCGCCCACTACATGCGGGCC
2250 . : . : . : . : . :
2080 CTAAGCAATGTCGAG GGCTTTGAGAGACTCATCTGTAATCA
|||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
111098 CTAAGCAATGTCGAGGTA...AAGGGCTTTGAGAGACTCATCTGTAATCA
2300 . : . : . : . : . :
2121 GAAGAAGGAGAATGAGACCAGGGTGGTGCTGTGTGAGCTGGGCAACCCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111710 GAAGAAGGAGAATGAGACCAGGGTGGTGCTGTGTGAGCTGGGCAACCCCA
2350 . : . : . : . : . :
2171 TGAAGAAGAACGCCCAG ATAGGAATCGCGATGTTGGTGAGC
|||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
111760 TGAAGAAGAACGCCCAGGTG...CAGATAGGAATCGCGATGTTGGTGAGC
2400 . : . : . : . : . :
2212 GTGGGGAATCTGGAAGAGGCTGGGGAGTCTGTGTCCTTCCAGCTGCAGAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
112410 GTGGGGAATCTGGAAGAGGCTGGGGAGTCTGTGTCCTTCCAGCTGCAGAT
2450 . : . : . : . : . :
2262 ACGGAG CAAGAACAGCCAGAATCCAAACAGCAAGATTGTGC
||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
112460 ACGGAGGTA...TAGCAAGAACAGCCAGAATCCAAACAGCAAGATTGTGC
2500 . : . : . : . : . :
2303 TGCTGGACGTGCCGGTCCGGGCAGAGGCCCAAGTGGAGCTGCGAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
113121 TGCTGGACGTGCCGGTCCGGGCAGAGGCCCAAGTGGAGCTGCGAGGGTG.
2550 . : . : . : . : . :
2349 GAACTCCTTTCCAGCCTCCCTGGTGGTGGCAGCAGAAGAAGGTGA
..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
113171 ..CAGGAACTCCTTTCCAGCCTCCCTGGTGGTGGCAGCAGAAGAAGGTGA
2600 . : . : . : . : . :
2394 GAGGGAGCAGAACAGCTTGGACAGCTGGGGACCCAAAGTGGAGCACACCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
113335 GAGGGAGCAGAACAGCTTGGACAGCTGGGGACCCAAAGTGGAGCACACCT
2650 . : . : . : . : . :
2444 ATGAG CTCCACAACAATGGCCCTGGGACTGTGAATGGTCTT
|||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
113385 ATGAGGTA...CAGCTCCACAACAATGGCCCTGGGACTGTGAATGGTCTT
2700 . : . : . : . : . :
2485 CACCTCAGCATCCACCTTCCGGGACAGTCCCAGCCCTCCGACCTGCTCTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
113525 CACCTCAGCATCCACCTTCCGGGACAGTCCCAGCCCTCCGACCTGCTCTA
2750 . : . : . : . : . :
2535 CATCCTGGATATACAGCCCCAGGGGGGCCTTCAGTGCTTCCCACAGCCTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
113575 CATCCTGGATATACAGCCCCAGGGGGGCCTTCAGTGCTTCCCACAGCCTC
2800 . : . : . : . : . :
2585 CTGTCAACCCTCTCAAG GTGGACTGGGGGCTGCCCATCCCC
|||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
113625 CTGTCAACCCTCTCAAGGTA...CAGGTGGACTGGGGGCTGCCCATCCCC
2850 . : . : . : . : . :
2626 AGCCCCTCCCCCATTCACCCGGCCCATCACAAGCGGGATCGCAGACAGAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
113782 AGCCCCTCCCCCATTCACCCGGCCCATCACAAGCGGGATCGCAGACAGAT
2900 . : . : . : . : . :
2676 CTTCCTGCCAGAGCCCGAGCAGCCCTCGAGGCTTCAGGATCCAGTTCTCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
113832 CTTCCTGCCAGAGCCCGAGCAGCCCTCGAGGCTTCAGGATCCAGTTCTCG
2950 . : . : . : . : . :
2726 TA AGCTGCGACTCGGCGCCCTGTACTGTGGTGCAGTGTGAC
||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
113882 TAGTG...CAGAGCTGCGACTCGGCGCCCTGTACTGTGGTGCAGTGTGAC
3000 . : . : . : . : . :
2767 CTGCAGGAGATGGCGCGCGGGCAGCGGGCCATGGTCACGGTGCTGGCCTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
114402 CTGCAGGAGATGGCGCGCGGGCAGCGGGCCATGGTCACGGTGCTGGCCTT
3050 . : . : . : . : . :
2817 CCTGTGGCTGCCCAGCCTCTACCAG AGGCCTCTGGATCAGT
|||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
114452 CCTGTGGCTGCCCAGCCTCTACCAGGTG...CAGAGGCCTCTGGATCAGT
3100 . : . : . : . : . :
2858 TTGTGCTGCAGTCGCACGCATGGTTCAACGTGTCCTCCCTCCCCTATGCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
114730 TTGTGCTGCAGTCGCACGCATGGTTCAACGTGTCCTCCCTCCCCTATGCG
3150 . : . : . : . : . :
2908 GTGCCCCCGCTCAGCCTGCCCCGAGGGGAAGCTCAG GTGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
114780 GTGCCCCCGCTCAGCCTGCCCCGAGGGGAAGCTCAGGTG...CAGGTGTG
3200 . : . : . : . : . :
2949 GACACAGCTGCTCCGGGCCTTGGAGGAGAGGGCCATTCCAATCTGGTGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
115009 GACACAGCTGCTCCGGGCCTTGGAGGAGAGGGCCATTCCAATCTGGTGGG
3250 . : . : . : . : . :
2999 TGCTGGTGGGTGTGCTGGGTGGCCTGCTGCTGCTCACCATCCTGGTCCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
115059 TGCTGGTGGGTGTGCTGGGTGGCCTGCTGCTGCTCACCATCCTGGTCCTG
3300 . : . : . : . : . :
3049 GCCATGTGGAAG GTCGGCTTCTTCAAGCGGAACCGGCCACC
||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
115109 GCCATGTGGAAGGTG...CAGGTCGGCTTCTTCAAGCGGAACCGGCCACC
3350 . : . : .
3090 CCTGGAAGAAGATGATGAAGAGGGGGAG
||||||||||||||||||||||||||||
117080 CCTGGAAGAAGATGATGAAGAGGGGGAG