seq1 = pF1KB0483.tfa, 1578 bp
seq2 = pF1KB0483/gi568815592r_134070271.tfa (gi568815592r:134070271_134417460), 347190 bp

>pF1KB0483 1578
>gi568815592r:134070271_134417460 (Chr6)

(complement)

1-69  (100001-100069)   100% ->
70-285  (155313-155528)   100% ->
286-361  (210030-210105)   100% ->
362-437  (242875-242950)   100% ->
438-513  (243381-243456)   100% ->
514-618  (243895-243999)   100% ->
619-702  (244104-244187)   100% ->
703-834  (244307-244438)   100% ->
835-947  (244687-244799)   100% ->
948-1071  (245145-245268)   100% ->
1072-1167  (245729-245824)   100% ->
1168-1323  (246283-246438)   100% ->
1324-1413  (246546-246635)   100% ->
1414-1578  (247026-247190)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGTAAACAAAGACATGAATGGATTCCCAGTCAAGAAATGCTCAGCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGTAAACAAAGACATGAATGGATTCCCAGTCAAGAAATGCTCAGCCTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCAATTTTTTAAGAAGCGG         GTACGAAGGTGGATCAAGAGCC
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 100051 CCAATTTTTTAAGAAGCGGGTA...CAGGTACGAAGGTGGATCAAGAGCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CAATGGTCAGTGTGGACAAGCATCAGAGTCCCAGCCTGAAGTACACCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155335 CAATGGTCAGTGTGGACAAGCATCAGAGTCCCAGCCTGAAGTACACCGGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TCCTCCATGGTGCACATCCCTCCAGGGGAGCCAGACTTCGAGTCTTCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155385 TCCTCCATGGTGCACATCCCTCCAGGGGAGCCAGACTTCGAGTCTTCCTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GTGTCAAACATGCCTGGGTGAACATGCTTTCCAAAGAGGGGTTCTCCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155435 GTGTCAAACATGCCTGGGTGAACATGCTTTCCAAAGAGGGGTTCTCCCTC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AGGAGAACGAGTCATGTTCATGGGAAACTCAATCTGGGTGTGAA      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 155485 AGGAGAACGAGTCATGTTCATGGGAAACTCAATCTGGGTGTGAAGTA...

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    286    GTGAGAGAGCCATGTAATCATGCCAACATCCTGACCAAGCCCGATCC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 210027 AAGGTGAGAGAGCCATGTAATCATGCCAACATCCTGACCAAGCCCGATCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 AAGAACCTTCTGGACTAATGATGATCCAG         CTTTCATGAAGC
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 210077 AAGAACCTTCTGGACTAATGATGATCCAGGTA...CAGCTTTCATGAAGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AGAGGAGGATGGGTCTGAACGACTTTATTCAGAAGATTGCCAATAACTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 242887 AGAGGAGGATGGGTCTGAACGACTTTATTCAGAAGATTGCCAATAACTCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 TATGCATGCAAACA         CCCTGAAGTTCAGTCCATCTTGAAGAT
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 242937 TATGCATGCAAACAGTA...CAGCCCTGAAGTTCAGTCCATCTTGAAGAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CTCCCAACCTCAGGAGCCTGAGCTTATGAATGCCAACCCTTCTCCTCCA 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 243408 CTCCCAACCTCAGGAGCCTGAGCTTATGAATGCCAACCCTTCTCCTCCAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    514         CCAAGTCCTTCTCAGCAAATCAACCTTGGCCCGTCGTCCAAT
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 243458 TA...TAGCCAAGTCCTTCTCAGCAAATCAACCTTGGCCCGTCGTCCAAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 CCTCATGCTAAACCATCTGACTTTCACTTCTTGAAAGTGATCGGAAAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 243937 CCTCATGCTAAACCATCTGACTTTCACTTCTTGAAAGTGATCGGAAAGGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 CAGTTTTGGAAAG         GTTCTTCTAGCAAGACACAAGGCAGAAG
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 243987 CAGTTTTGGAAAGGTA...CAGGTTCTTCTAGCAAGACACAAGGCAGAAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 AAGTGTTCTATGCAGTCAAAGTTTTACAGAAGAAAGCAATCCTGAAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 244132 AAGTGTTCTATGCAGTCAAAGTTTTACAGAAGAAAGCAATCCTGAAAAAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 AAAGAG         GAGAAGCATATTATGTCGGAGCGGAATGTTCTGTT
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 244182 AAAGAGGTA...TAGGAGAAGCATATTATGTCGGAGCGGAATGTTCTGTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 GAAGAATGTGAAGCACCCTTTCCTGGTGGGCCTTCACTTCTCTTTCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 244342 GAAGAATGTGAAGCACCCTTTCCTGGTGGGCCTTCACTTCTCTTTCCAGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 CTGCTGACAAATTGTACTTTGTCCTAGACTACATTAATGGTGGAGAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 244392 CTGCTGACAAATTGTACTTTGTCCTAGACTACATTAATGGTGGAGAGGTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    835       TTGTTCTACCATCTCCAGAGGGAACGCTGCTTCCTGGAACCACG
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 244442 ...CAGTTGTTCTACCATCTCCAGAGGGAACGCTGCTTCCTGGAACCACG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 GGCTCGTTTCTATGCTGCTGAAATAGCCAGTGCCTTGGGCTACCTGCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 244731 GGCTCGTTTCTATGCTGCTGAAATAGCCAGTGCCTTGGGCTACCTGCATT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 CACTGAACATCGTTTATAG         AGACTTAAAACCAGAGAATATT
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 244781 CACTGAACATCGTTTATAGGTA...CAGAGACTTAAAACCAGAGAATATT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 TTGCTAGATTCACAGGGACACATTGTCCTTACTGACTTCGGACTCTGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 245167 TTGCTAGATTCACAGGGACACATTGTCCTTACTGACTTCGGACTCTGCAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 GGAGAACATTGAACACAACAGCACAACATCCACCTTCTGTGGCACGCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 245217 GGAGAACATTGAACACAACAGCACAACATCCACCTTCTGTGGCACGCCGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 AG         TATCTCGCACCTGAGGTGCTTCATAAGCAGCCTTATGAC
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 245267 AGGTA...CAGTATCTCGCACCTGAGGTGCTTCATAAGCAGCCTTATGAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1111 AGGACTGTGGACTGGTGGTGCCTGGGAGCTGTCTTGTATGAGATGCTGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 245768 AGGACTGTGGACTGGTGGTGCCTGGGAGCTGTCTTGTATGAGATGCTGTA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1161 TGGCCTG         CCGCCTTTTTATAGCCGAAACACAGCTGAAATGT
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 245818 TGGCCTGGTG...CAGCCGCCTTTTTATAGCCGAAACACAGCTGAAATGT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1202 ACGACAACATTCTGAACAAGCCTCTCCAGCTGAAACCAAATATTACAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 246317 ACGACAACATTCTGAACAAGCCTCTCCAGCTGAAACCAAATATTACAAAT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1252 TCCGCAAGACACCTCCTGGAGGGCCTCCTGCAGAAGGACAGGACAAAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 246367 TCCGCAAGACACCTCCTGGAGGGCCTCCTGCAGAAGGACAGGACAAAGCG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1302 GCTCGGGGCCAAGGATGACTTC         ATGGAGATTAAGAGTCATG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 246417 GCTCGGGGCCAAGGATGACTTCGTG...CAGATGGAGATTAAGAGTCATG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1343 TCTTCTTCTCCTTAATTAACTGGGATGATCTCATTAATAAGAAGATTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 246565 TCTTCTTCTCCTTAATTAACTGGGATGATCTCATTAATAAGAAGATTACT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1393 CCCCCTTTTAACCCAAATGTG         AGTGGGCCCAACGACCTACG
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 246615 CCCCCTTTTAACCCAAATGTGGTG...CAGAGTGGGCCCAACGACCTACG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1434 GCACTTTGACCCCGAGTTTACCGAAGAGCCTGTCCCCAACTCCATTGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 247046 GCACTTTGACCCCGAGTTTACCGAAGAGCCTGTCCCCAACTCCATTGGCA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1484 AATCCCCTGACAGCGTCCTCGTCACAGCCAGCGTCAAGGAAGCTGCCGAG
        | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 247096 AGTCCCCTGACAGCGTCCTCGTCACAGCCAGCGTCAAGGAAGCTGCCGAG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1534 GCTTTCCTAGGCTTTTCCTATGCGCCTCCCACGGACTCTTTCCTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 247146 GCTTTCCTAGGCTTTTCCTATGCGCCTCCCACGGACTCTTTCCTC