seq1 = pF1KB0481.tfa, 1563 bp
seq2 = pF1KB0481/gi568815583r_74237975.tfa (gi568815583r:74237975_74467585), 229611 bp

>pF1KB0481 1563
>gi568815583r:74237975_74467585 (Chr15)

(complement)

1-269  (100001-100269)   100% ->
270-425  (119531-119686)   100% ->
426-625  (122343-122542)   100% ->
626-829  (123594-123797)   100% ->
830-990  (124449-124609)   100% ->
991-1157  (127833-127999)   100% ->
1158-1236  (128271-128349)   100% ->
1237-1434  (128818-129015)   100% ->
1435-1563  (129483-129611)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTGGCCAAGGGTCTTCCCCCACGCTCAGTCCTGGTCAAAGGCTGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCTGGCCAAGGGTCTTCCCCCACGCTCAGTCCTGGTCAAAGGCTGCCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GACCTTTCTGAGTGCCCCCAGGGAGGGGCTGGGGCGTCTCAGGGTGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GACCTTTCTGAGTGCCCCCAGGGAGGGGCTGGGGCGTCTCAGGGTGCCCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CTGGCGAGGGAGCTGGCATCTCCACCCGCAGTCCTCGCCCCTTCAATGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CTGGCGAGGGAGCTGGCATCTCCACCCGCAGTCCTCGCCCCTTCAATGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ATCCCCTCTCCTGGTGACAATGGCTGGCTAAACCTGTACCATTTCTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ATCCCCTCTCCTGGTGACAATGGCTGGCTAAACCTGTACCATTTCTGGAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGAGACGGGCACACACAAAGTCCACCTTCACCATGTCCAGAATTTCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GGAGACGGGCACACACAAAGTCCACCTTCACCATGTCCAGAATTTCCAGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGTATGGCCCGATTTACAG         GGAGAAGCTCGGCAACGTGGAG
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 100251 AGTATGGCCCGATTTACAGGTA...CAGGGAGAAGCTCGGCAACGTGGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TCGGTTTATGTCATCGACCCTGAAGATGTGGCCCTTCTCTTTAAGTCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119553 TCGGTTTATGTCATCGACCCTGAAGATGTGGCCCTTCTCTTTAAGTCCGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GGGCCCCAACCCAGAACGATTCCTCATCCCGCCCTGGGTCGCCTATCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119603 GGGCCCCAACCCAGAACGATTCCTCATCCCGCCCTGGGTCGCCTATCACC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 AGTATTACCAGAGACCCATAGGAGTCCTGTTGAA         GAAGTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 119653 AGTATTACCAGAGACCCATAGGAGTCCTGTTGAAGTG...CAGGAAGTCG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GCAGCCTGGAAGAAAGACCGGGTGGCCCTGAACCAGGAGGTGATGGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122350 GCAGCCTGGAAGAAAGACCGGGTGGCCCTGAACCAGGAGGTGATGGCTCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 AGAGGCCACCAAGAACTTTTTGCCCCTGTTGGATGCAGTGTCTCGGGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122400 AGAGGCCACCAAGAACTTTTTGCCCCTGTTGGATGCAGTGTCTCGGGACT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 TCGTCAGTGTCCTGCACAGGCGCATCAAGAAGGCGGGCTCCGGAAATTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122450 TCGTCAGTGTCCTGCACAGGCGCATCAAGAAGGCGGGCTCCGGAAATTAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 TCGGGGGACATCAGTGATGACCTGTTCCGCTTTGCCTTTGAGT       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 122500 TCGGGGGACATCAGTGATGACCTGTTCCGCTTTGCCTTTGAGTGTA...C

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    626   CCATCACTAACGTCATTTTTGGGGAGCGCCAGGGGATGCTGGAGGAAG
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123592 AGCCATCACTAACGTCATTTTTGGGGAGCGCCAGGGGATGCTGGAGGAAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 TAGTGAACCCCGAGGCCCAGCGATTCATTGATGCCATCTACCAGATGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123642 TAGTGAACCCCGAGGCCCAGCGATTCATTGATGCCATCTACCAGATGTTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 CACACCAGCGTCCCCATGCTCAACCTTCCCCCAGACCTGTTCCGTCTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123692 CACACCAGCGTCCCCATGCTCAACCTTCCCCCAGACCTGTTCCGTCTGTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 CAGGACCAAGACCTGGAAGGACCATGTGGCTGCATGGGACGTGATTTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123742 CAGGACCAAGACCTGGAAGGACCATGTGGCTGCATGGGACGTGATTTTCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 GTAAAG         CTGACATATACACCCAGAACTTCTACTGGGAATTG
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123792 GTAAAGGTG...CAGCTGACATATACACCCAGAACTTCTACTGGGAATTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 AGACAGAAAGGAAGTGTTCACCACGATTACCGTGGCATCCTCTACAGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124484 AGACAGAAAGGAAGTGTTCACCACGATTACCGTGGCATCCTCTACAGACT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 CCTGGGAGACAGCAAGATGTCCTTCGAGGACATCAAGGCCAACGTCACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124534 CCTGGGAGACAGCAAGATGTCCTTCGAGGACATCAAGGCCAACGTCACAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 AGATGCTGGCAGGAGGGGTGGACACG         ACGTCCATGACCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 124584 AGATGCTGGCAGGAGGGGTGGACACGGTG...CAGACGTCCATGACCCTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 CAGTGGCACTTGTATGAGATGGCACGCAACCTGAAGGTGCAGGATATGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127848 CAGTGGCACTTGTATGAGATGGCACGCAACCTGAAGGTGCAGGATATGCT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 GCGGGCAGAGGTCTTGGCTGCGCGGCACCAGGCCCAGGGAGACATGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127898 GCGGGCAGAGGTCTTGGCTGCGCGGCACCAGGCCCAGGGAGACATGGCCA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106 CGATGCTACAGCTGGTCCCCCTCCTCAAAGCCAGCATCAAGGAGACACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127948 CGATGCTACAGCTGGTCCCCCTCCTCAAAGCCAGCATCAAGGAGACACTA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1156 AG         ACTTCACCCCATCTCCGTGACCCTGCAGAGATATCTTGT
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127998 AGGCA...CAGACTTCACCCCATCTCCGTGACCCTGCAGAGATATCTTGT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1197 AAATGACTTGGTTCTTCGAGATTACATGATTCCTGCCAAG         A
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 128310 AAATGACTTGGTTCTTCGAGATTACATGATTCCTGCCAAGGTA...CAGA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 CACTGGTGCAAGTGGCCATCTATGCTCTGGGCCGAGAGCCCACCTTCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128819 CACTGGTGCAAGTGGCCATCTATGCTCTGGGCCGAGAGCCCACCTTCTTC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1288 TTCGACCCGGAAAATTTTGACCCAACCCGATGGCTGAGCAAAGACAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128869 TTCGACCCGGAAAATTTTGACCCAACCCGATGGCTGAGCAAAGACAAGAA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1338 CATCACCTACTTCCGGAACTTGGGCTTTGGCTGGGGTGTGCGGCAGTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128919 CATCACCTACTTCCGGAACTTGGGCTTTGGCTGGGGTGTGCGGCAGTGTC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1388 TGGGACGGCGGATCGCTGAGCTAGAGATGACCATCTTCCTCATCAAT   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 128969 TGGGACGGCGGATCGCTGAGCTAGAGATGACCATCTTCCTCATCAATGTG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1435       ATGCTGGAGAACTTCAGAGTTGAAATCCAACACCTCAGCGATGT
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129019 ...CAGATGCTGGAGAACTTCAGAGTTGAAATCCAACACCTCAGCGATGT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1479 GGGCACCACATTCAACCTCATTCTGATGCCTGAAAAGCCCATCTCCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129527 GGGCACCACATTCAACCTCATTCTGATGCCTGAAAAGCCCATCTCCTTCA

   1600     .    :    .    :    .    :    .
   1529 CCTTCTGGCCCTTTAACCAGGAAGCAACCCAGCAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129577 CCTTCTGGCCCTTTAACCAGGAAGCAACCCAGCAG