seq1 = pF1KB0475.tfa, 1551 bp
seq2 = pF1KB0475/gi568815587r_119564750.tfa (gi568815587r:119564750_119828553), 263804 bp

>pF1KB0475 1551
>gi568815587r:119564750_119828553 (Chr11)

(complement)

1-79  (100001-100079)   100% ->
80-430  (149789-150139)   100% ->
431-733  (150697-150999)   100% ->
734-851  (151335-151452)   100% ->
852-1003  (153244-153395)   100% ->
1004-1551  (163257-163804)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTCGGATGGGGCTTGCGGGCGCCGCTGGACGCTGGTGGGGACTCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTCGGATGGGGCTTGCGGGCGCCGCTGGACGCTGGTGGGGACTCGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TCTCGGCTTGACCGCATTCTTCCTCCCAG         GCGTCCACTCCC
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 100051 TCTCGGCTTGACCGCATTCTTCCTCCCAGGTA...CAGGCGTCCACTCCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AGGTGGTCCAGGTGAACGACTCCATGTATGGCTTCATCGGCACAGACGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149801 AGGTGGTCCAGGTGAACGACTCCATGTATGGCTTCATCGGCACAGACGTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GTTCTGCACTGCAGCTTTGCCAACCCGCTTCCCAGCGTGAAGATCACCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149851 GTTCTGCACTGCAGCTTTGCCAACCCGCTTCCCAGCGTGAAGATCACCCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GGTCACATGGCAGAAGTCCACCAATGGCTCCAAGCAGAACGTGGCCATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149901 GGTCACATGGCAGAAGTCCACCAATGGCTCCAAGCAGAACGTGGCCATCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ACAACCCATCCATGGGCGTGTCCGTGCTGGCTCCCTACCGCGAGCGTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149951 ACAACCCATCCATGGGCGTGTCCGTGCTGGCTCCCTACCGCGAGCGTGTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GAATTCCTGCGGCCCTCCTTCACCGATGGCACTATCCGCCTCTCCCGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150001 GAATTCCTGCGGCCCTCCTTCACCGATGGCACTATCCGCCTCTCCCGCCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GGAGCTGGAGGATGAGGGTGTCTACATCTGCGAGTTTGCTACCTTCCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150051 GGAGCTGGAGGATGAGGGTGTCTACATCTGCGAGTTTGCTACCTTCCCTA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 CGGGCAATCGAGAAAGCCAGCTCAATCTCACGGTGATGG         CC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 150101 CGGGCAATCGAGAAAGCCAGCTCAATCTCACGGTGATGGGTA...CAGCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 AAACCCACCAATTGGATAGAGGGTACCCAGGCAGTGCTTCGAGCCAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150699 AAACCCACCAATTGGATAGAGGGTACCCAGGCAGTGCTTCGAGCCAAGAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GGGGCAGGATGACAAGGTCCTGGTGGCCACCTGCACCTCAGCCAATGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150749 GGGGCAGGATGACAAGGTCCTGGTGGCCACCTGCACCTCAGCCAATGGGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 AGCCTCCCAGTGTGGTATCCTGGGAAACTCGGTTAAAAGGTGAGGCAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150799 AGCCTCCCAGTGTGGTATCCTGGGAAACTCGGTTAAAAGGTGAGGCAGAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 TACCAGGAGATCCGGAACCCCAATGGCACAGTGACGGTCATCAGCCGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150849 TACCAGGAGATCCGGAACCCCAATGGCACAGTGACGGTCATCAGCCGCTA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 CCGCCTGGTGCCCAGCAGGGAAGCCCACCAGCAGTCCTTGGCCTGCATCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150899 CCGCCTGGTGCCCAGCAGGGAAGCCCACCAGCAGTCCTTGGCCTGCATCG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 TCAACTACCACATGGACCGCTTCAAGGAAAGCCTCACTCTCAACGTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150949 TCAACTACCACATGGACCGCTTCAAGGAAAGCCTCACTCTCAACGTGCAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 T         ATGAGCCTGAGGTAACCATTGAGGGGTTTGATGGCAACTG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150999 TGTG...CAGATGAGCCTGAGGTAACCATTGAGGGGTTTGATGGCAACTG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 GTACCTGCAGCGGATGGACGTGAAGCTCACCTGCAAAGCTGATGCTAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151375 GTACCTGCAGCGGATGGACGTGAAGCTCACCTGCAAAGCTGATGCTAACC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 CCCCAGCCACTGAGTACCACTGGACCAC         GCTAAATGGCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 151425 CCCCAGCCACTGAGTACCACTGGACCACGTA...CAGGCTAAATGGCTCT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 CTCCCCAAGGGTGTGGAGGCCCAGAACAGAACCCTCTTCTTCAAGGGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153257 CTCCCCAAGGGTGTGGAGGCCCAGAACAGAACCCTCTTCTTCAAGGGACC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 CATCAACTACAGCCTGGCAGGGACCTACATCTGTGAGGCCACCAACCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153307 CATCAACTACAGCCTGGCAGGGACCTACATCTGTGAGGCCACCAACCCCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 TCGGTACACGCTCAGGCCAGGTGGAGGTCAATATCACAG         AA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 153357 TCGGTACACGCTCAGGCCAGGTGGAGGTCAATATCACAGGTA...CAGAA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 TTCCCCTACACCCCGTCTCCTCCCGAACATGGGCGGCGCGCCGGGCCGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163259 TTCCCCTACACCCCGTCTCCTCCCGAACATGGGCGGCGCGCCGGGCCGGT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 GCCCACGGCCATCATTGGGGGCGTGGCGGGGAGCATCCTGCTGGTGTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163309 GCCCACGGCCATCATTGGGGGCGTGGCGGGGAGCATCCTGCTGGTGTTGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106 TTGTGGTCGGCGGGATCGTGGTCGCCCTGCGTCGGCGCCGGCACACCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163359 TTGTGGTCGGCGGGATCGTGGTCGCCCTGCGTCGGCGCCGGCACACCTTC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1156 AAGGGTGACTACAGCACCAAGAAGCACGTGTATGGCAACGGCTACAGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163409 AAGGGTGACTACAGCACCAAGAAGCACGTGTATGGCAACGGCTACAGCAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1206 GGCAGGCATCCCCCAGCACCACCCACCAATGGCACAGAACCTGCAGTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163459 GGCAGGCATCCCCCAGCACCACCCACCAATGGCACAGAACCTGCAGTACC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1256 CCGACGACTCAGACGACGAGAAGAAGGCCGGCCCACTGGGTGGAAGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163509 CCGACGACTCAGACGACGAGAAGAAGGCCGGCCCACTGGGTGGAAGCAGC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1306 TATGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGGCGGTGGAGGGGGCGAGCGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163559 TATGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGGCGGTGGAGGGGGCGAGCGCAA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1356 GGTGGGCGGCCCCCACCCCAAATATGACGAGGACGCCAAGCGGCCCTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163609 GGTGGGCGGCCCCCACCCCAAATATGACGAGGACGCCAAGCGGCCCTACT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1406 TCACCGTGGATGAGGCCGAGGCCCGTCAGGACGGCTACGGGGACCGGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163659 TCACCGTGGATGAGGCCGAGGCCCGTCAGGACGGCTACGGGGACCGGACT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1456 CTGGGCTACCAGTACGACCCTGAGCAGCTGGACTTGGCTGAGAACATGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163709 CTGGGCTACCAGTACGACCCTGAGCAGCTGGACTTGGCTGAGAACATGGT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1506 TTCTCAGAACGACGGGTCTTTCATTTCCAAGAAGGAGTGGTACGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163759 TTCTCAGAACGACGGGTCTTTCATTTCCAAGAAGGAGTGGTACGTG