seq1 = pF1KB0467.tfa, 1542 bp
seq2 = pF1KB0467/gi568815580r_50127384.tfa (gi568815580r:50127384_50366404), 239021 bp

>pF1KB0467 1542
>gi568815580r:50127384_50366404 (Chr18)

(complement)

1-69  (100001-100069)   100% ->
70-299  (104186-104415)   100% ->
300-473  (105168-105341)   100% ->
474-777  (114621-114924)   100% ->
778-996  (115429-115647)   99% ->
997-1213  (123289-123505)   100% ->
1214-1316  (127700-127802)   100% ->
1317-1542  (138796-139021)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTACAGCCAGCGGTTTGGCACCGTACAGCGGGAGGTTAAGGGCCCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTACAGCCAGCGGTTTGGCACCGTACAGCGGGAGGTTAAGGGCCCCAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCCCAAAGTGGTGATCGTG         AGATCCAAGCCTCCTAAAGGCC
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 100051 CCCCAAAGTGGTGATCGTGGTA...CAGAGATCCAAGCCTCCTAAAGGCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AAGGAGCTGAGCACCATCTAGAAAGAATCCGACGCAGCCATCAGAAGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104208 AAGGAGCTGAGCACCATCTAGAAAGAATCCGACGCAGCCATCAGAAGCAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AATGCTATTTTGGCTTCCATTAAGTCAAGTGAGCGGGATCGCTTGAAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104258 AATGCTATTTTGGCTTCCATTAAGTCAAGTGAGCGGGATCGCTTGAAAGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TGAGTGGGACCAGCACAATGACTGCAAGATTTTGGACAGCCTTGTGCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104308 TGAGTGGGACCAGCACAATGACTGCAAGATTTTGGACAGCCTTGTGCGAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CAAGAATCAAGGATGCTGTGCAAGGGTTTATCATTAACATTGAAGAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104358 CAAGAATCAAGGATGCTGTGCAAGGGTTTATCATTAACATTGAAGAAAGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CGAAATAA         GCTACGTGAGCTTTTAGCATTAGAAGAAAATGA
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 104408 CGAAATAAGTA...CAGGCTACGTGAGCTTTTAGCATTAGAAGAAAATGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GTATTTTACAGAAATGCAATTGAAGAAAGAAACCATTGAGGAGAAAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105201 GTATTTTACAGAAATGCAATTGAAGAAAGAAACCATTGAGGAGAAAAAAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ATAGGATGAGAGAGAAAACTAAATTACTAAAAGAGAAGAATGAAAAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105251 ATAGGATGAGAGAGAAAACTAAATTACTAAAAGAGAAGAATGAAAAAGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 AGGCAGGATTTTGTGGCTGAAAAGCTAGACCAGCAATTCAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 105301 AGGCAGGATTTTGTGGCTGAAAAGCTAGACCAGCAATTCAGGTA...CAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GGAACGCTGTGAGGAGCTCCGTGTTGAATTGTTATCTATCCATCAGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114621 GGAACGCTGTGAGGAGCTCCGTGTTGAATTGTTATCTATCCATCAGAAGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 AGGTGTGTGAGGAGCGGAAAGCACAGATTGCATTTAATGAGGAGCTGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114671 AGGTGTGTGAGGAGCGGAAAGCACAGATTGCATTTAATGAGGAGCTGAGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 AGGCAAAAGCTGGTGGAAGAGCAGATGTTCTCCAAACTCTGGGAGGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114721 AGGCAAAAGCTGGTGGAAGAGCAGATGTTCTCCAAACTCTGGGAGGAAGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 CCGATTAGCCAAGGAAAAGCGAGAAGCCCAAGAGGCGAGGAGACAGAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114771 CCGATTAGCCAAGGAAAAGCGAGAAGCCCAAGAGGCGAGGAGACAGAAAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 AGCTGATGGAGAACACACGCCTGGGGCTGAATGCCCAGATCACCAGCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114821 AGCTGATGGAGAACACACGCCTGGGGCTGAATGCCCAGATCACCAGCATC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 AAGGCACAAAGGCAGGCGACACAGCTGCTGAAGGAAGAGGAGGCACGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114871 AAGGCACAAAGGCAGGCGACACAGCTGCTGAAGGAAGAGGAGGCACGCCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 TGTG         GAAAGTAACAACGCACAGATTAAACATGAGAATGAAC
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114921 TGTGGTG...TAGGAAAGTAACAACGCACAGATTAAACATGAGAATGAAC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 AGGATATGCTAAAGAAACAGAAGGCAAAGCAGGAAACTAGGACCATTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115466 AGGATATGCTAAAGAAACAGAAGGCAAAGCAGGAAACTAGGACCATTTTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 CAAAAAGCCCTACAAAAGAGGATAGAACATATTCAGCAGGAATACAGAGA
        ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115516 CAAAAAGCCCTACAAGAGAGGATAGAACATATTCAGCAGGAATACAGAGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 CGAACAGGACTTGAACATGAAGCTCGTGCAAAGGGCCCTTCAAGACTTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115566 CGAACAGGACTTGAACATGAAGCTCGTGCAAAGGGCCCTTCAAGACTTAC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 AGGAAGAGGCAGATAAAAAGAAACAAAAAAGA         GAAGATATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 115616 AGGAAGAGGCAGATAAAAAGAAACAAAAAAGAGTA...TAGGAAGATATG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 ATAAGAGAACAGAAGATATACCATAAATATTTGGCACAGAGACGTGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123298 ATAAGAGAACAGAAGATATACCATAAATATTTGGCACAGAGACGTGAGGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 AGAAAAAGCTCAGGAGAAAGAATTTGACAGAATATTAGAGGAAGACAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123348 AGAAAAAGCTCAGGAGAAAGAATTTGACAGAATATTAGAGGAAGACAAGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106 CAAAGAAGTTGGCTGAGAAGGACAAGGAGCTGAGACTTGAAAAGGAGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123398 CAAAGAAGTTGGCTGAGAAGGACAAGGAGCTGAGACTTGAAAAGGAGGCA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1156 AGGAGACAGCTTGTGGATGAGGTCATGTGTACAAGAAAACTTCAAGTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123448 AGGAGACAGCTTGTGGATGAGGTCATGTGTACAAGAAAACTTCAAGTTCA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1206 AGAAAAGT         TGCAACGAGAAGCTAAAGAACAGGAAGAACGTG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 123498 AGAAAAGTGTA...TAGTGCAACGAGAAGCTAAAGAACAGGAAGAACGTG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1247 CTATGGAACAGAAACACATAAATGAAAGTCTTAAAGAACTTAACTGTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127733 CTATGGAACAGAAACACATAAATGAAAGTCTTAAAGAACTTAACTGTGAA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1297 GAGAAGGAGAATTTTGCAAG         ACGCCAACGTTTAGCCCAGGA
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 127783 GAGAAGGAGAATTTTGCAAGGTA...TAGACGCCAACGTTTAGCCCAGGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1338 GTACAGGAAGCAACTTCAGATGCAAATCGCCTACCAGCAGCAGTCCCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138817 GTACAGGAAGCAACTTCAGATGCAAATCGCCTACCAGCAGCAGTCCCAAG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1388 AAGCAGAGAAGGAAGAGAAACGCCGAGAGTTTGAAGCAGGTGTAGCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138867 AAGCAGAGAAGGAAGAGAAACGCCGAGAGTTTGAAGCAGGTGTAGCAGCA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1438 AACAAGATGTGTTTGGACAAGGTCCAGGAGGTCCTGTCCACCCATCAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138917 AACAAGATGTGTTTGGACAAGGTCCAGGAGGTCCTGTCCACCCATCAAGT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1488 GCTGCCTCAAAACATTCATCCCATGCGCAAGGCATGCCCCAGTAAGCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138967 GCTGCCTCAAAACATTCATCCCATGCGCAAGGCATGCCCCAGTAAGCTTC

   1600     .
   1538 CACCG
        |||||
 139017 CACCG